Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Rtl1

Retrotransposon-like 1

Seitz et al. Nat Genet 34: 261-262, 2003

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens RTL1 MART1, PEG11, LOC388015  14q32.31  Imprinted Paternal
Gallus gallus RTL1   Gene Not Present  Unknown Unknown
Rattus norvegicus Rtl1   6q32  Imprinted Paternal
Bos taurus RTL1 PEG11  21  Imprinted Paternal
Mus musculus Rtl1 Mar, Mor1, Mart1, 6430411K18Rik  12 F1  Imprinted Paternal
Ovis aries RTL1 PEG11  18  Imprinted Paternal
1      ATGATAGAACCCTCTGAAGACTCATTTGAGACGATGATGGAGCTTAAGAATCCATCATCA     60
       M--I--E--P--S--E--D--S--F--E--T--M--M--E--L--K--N--P--S--S--
61     AAACAAATGGAGTCCTCCGAGGGCTCATCCAACACCGTTGAAGAGACACCAGGCAGCAGT    120
       K--Q--M--E--S--S--E--G--S--S--N--T--V--E--E--T--P--G--S--S--
121    GGAGCCCAGGCGGGGGCCCAGGCAGGGGCCCAGGCGGAGGCCCAGGCGGAGACCCAGGTG    180
       G--A--Q--A--G--A--Q--A--G--A--Q--A--E--A--Q--A--E--T--Q--V--
181    GAGGCCCAGGCGGAGGCTCAGGCTGAAGCCCAGGTTGAGGCCCAGGTTGAGGCCCAGGCG    240
       E--A--Q--A--E--A--Q--A--E--A--Q--V--E--A--Q--V--E--A--Q--A--
241    GGCTCAGATAGTGGCCCAGCCCAGGAAGAAAAGGAGCCACCCAGTGGCCCCCTCAAGGAA    300
       G--S--D--S--G--P--A--Q--E--E--K--E--P--P--S--G--P--L--K--E--
301    ATGCAAGAGCTGCCCACTAATCTACTCCAAGAAGTGGAGGAGCCATCCAGTGGCCCCCAC    360
       M--Q--E--L--P--T--N--L--L--Q--E--V--E--E--P--S--S--G--P--H--
361    CAGGAAATGCAAGAGCTGCCCACTGATCTACTCCAAGAAGTGGAGGAGCCATCCAGTGGC    420
       Q--E--M--Q--E--L--P--T--D--L--L--Q--E--V--E--E--P--S--S--G--
421    CCCCACCAGGAAATGCAAGAGCTACCCACTGATCTACTCCGGGAAGTGGAGGAGCCATCC    480
       P--H--Q--E--M--Q--E--L--P--T--D--L--L--R--E--V--E--E--P--S--
481    AGTGGCCCCTACCAGGAAATGCAAGAGCTACCCACTGATCTACTCCGGGAAGTGGAGGAG    540
       S--G--P--Y--Q--E--M--Q--E--L--P--T--D--L--L--R--E--V--E--E--
541    CCATCCAGTGGCCCCTACCAGGAAATGCAAGAGCTACCCACTGATCTACTCCGGGAAGTG    600
       P--S--S--G--P--Y--Q--E--M--Q--E--L--P--T--D--L--L--R--E--V--
601    GAGGAGCCATCCAGTGGCCCCTACCAGGAAATGCAAGAGCTACCCACTGATCTACTCCGG    660
       E--E--P--S--S--G--P--Y--Q--E--M--Q--E--L--P--T--D--L--L--R--
661    GAAGTGGAGGAGCCATCCAGTGGCCCCTACCAGGAAATGCAAGAGCTACCCACTGATCTA    720
       E--V--E--E--P--S--S--G--P--Y--Q--E--M--Q--E--L--P--T--D--L--
721    CTCCGGGAAGTGGAGGAGCCATCCAGCGACCCCTGTGAGGCATCATCTAACGATCTACCC    780
       L--R--E--V--E--E--P--S--S--D--P--C--E--A--S--S--N--D--L--P--
781    CAAGACATGGAGGAATCAAGTGATGATGGTTCGAACCAGGAGTCGAGTGATGGTTCAAAC    840
       Q--D--M--E--E--S--S--D--D--G--S--N--Q--E--S--S--D--G--S--N--
841    CACGAATTAAGTAATGGTTCAAACCATGAGTCGAGCTTTGGTTCAAACCCAGAGTCGAGC    900
       H--E--L--S--N--G--S--N--H--E--S--S--F--G--S--N--P--E--S--S--
901    GATGTTTCCAACCTGGAGTCAAGCGGTGGTTCAAACCAGGAGTCCAGCGATGGTTCACAA    960
       D--V--S--N--L--E--S--S--G--G--S--N--Q--E--S--S--D--G--S--Q--
961    AAGGAGTCAAGCTATGATTCAAACCCGGAGTTAAGTGATAATTCAAACCAGGAGTTAAGC   1020
       K--E--S--S--Y--D--S--N--P--E--L--S--D--N--S--N--Q--E--L--S--
1021   GATAATTCGAACCAGGAGTCAAGCGACAGTTCAAACCAGTCAAGTGATATTTCAAACCAG   1080
       D--N--S--N--Q--E--S--S--D--S--S--N--Q--S--S--D--I--S--N--Q--
1081   GAAGGGTCGGAACCACTCAGTGAGGCATCCGATTATAGCATGGATGAAACAATCAACTCA   1140
       E--G--S--E--P--L--S--E--A--S--D--Y--S--M--D--E--T--I--N--S--
1141   TCCGAGACCCAGTCAGACCAAGATGATACTGACCTGGGAGATGACGAGGAAGAGGAGGAA   1200
       S--E--T--Q--S--D--Q--D--D--T--D--L--G--D--D--E--E--E--E--E--
1201   GAGGAAGGTGGTGAAGAGGAAGGTCAGCCCAAGAACTCTCCAGAAGAAGTCGTGGCCACC   1260
       E--E--G--G--E--E--E--G--Q--P--K--N--S--P--E--E--V--V--A--T--
1261   ATGGGGAACGTCATCTCGCTGTTCCTCCGGATGCAAGACCTAAAAGAACAACAGAGAGTG   1320
       M--G--N--V--I--S--L--F--L--R--M--Q--D--L--K--E--Q--Q--R--V--
1321   GCAGAAAGGCTCATGATGCAGGCTATCAACGAAGGTCGCCTGCCCTCCCTCAGGCCCTTC   1380
       A--E--R--L--M--M--Q--A--I--N--E--G--R--L--P--S--L--R--P--F--
1381   TCTGGAGATCGCAGAGACTACCATGAGTTTGTCGTGCTCTGCCAGATGACAATGCAGAAC   1440
       S--G--D--R--R--D--Y--H--E--F--V--V--L--C--Q--M--T--M--Q--N--
1441   TACCCAAGTATGCTATACAATGATGAGCTGCGGGTGAAATTCGTCATCCGCCACCTGACT   1500
       Y--P--S--M--L--Y--N--D--E--L--R--V--K--F--V--I--R--H--L--T--
1501   GACCTAGCCTTGGAATGGGCCAACGACCTCGTAGAGCAGAACAGCCCAGTGATAAACAAC   1560
       D--L--A--L--E--W--A--N--D--L--V--E--Q--N--S--P--V--I--N--N--
1561   TTCTCAGCCTTCCTGGAGGCCATGTCAGAAAAGTTTGAGTATCGGCAGACCCTGCGTGTG   1620
       F--S--A--F--L--E--A--M--S--E--K--F--E--Y--R--Q--T--L--R--V--
1621   GCGGAAGACGCCATGTTCAACATCAGGCAGGGGAACCGCTGTGCGGCCGATTACATCAAT   1680
       A--E--D--A--M--F--N--I--R--Q--G--N--R--C--A--A--D--Y--I--N--
1681   GAGTTCCGGGGTCTGATACCCACCTTAGGCTGGCCAGATGAAGTCCTGCAGGCCCACCTG   1740
       E--F--R--G--L--I--P--T--L--G--W--P--D--E--V--L--Q--A--H--L--
1741   TGCCAGGGGCTCAACGAAGAGATCAGGCACTATCTGTTCCGGATCCCTCAGCCGAATTCC   1800
       C--Q--G--L--N--E--E--I--R--H--Y--L--F--R--I--P--Q--P--N--S--
1801   CTAGACAACCTGATTGTACTTGTCCTGCAACTTGAAGAAAAGCTGGCAGAGAGAAGAGCA   1860
       L--D--N--L--I--V--L--V--L--Q--L--E--E--K--L--A--E--R--R--A--
1861   TTACTCAGGCTGCCACCTGAGTCGCGCCCAAGAAGCGTAGCCTGGATGGATGCTCCCGCC   1920
       L--L--R--L--P--P--E--S--R--P--R--S--V--A--W--M--D--A--P--A--
1921   CCAGAGAAGTGGAGGGTAAGCAGCTGGCTGCCCAATGAGTTCCACCCAGACATTGATCGC   1980
       P--E--K--W--R--V--S--S--W--L--P--N--E--F--H--P--D--I--D--R--
1981   GATCACCTCTTCTTACTGCTCTTGGTGAGAGTGGACCCCTACCACAGTGTCGCAGTGCGG   2040
       D--H--L--F--L--L--L--L--V--R--V--D--P--Y--H--S--V--A--V--R--
2041   GCCCTGGTGGACTCAGGAGCAGAAGGGAACTACATGGATGAGAGGTTTGCCCAGGAACAC   2100
       A--L--V--D--S--G--A--E--G--N--Y--M--D--E--R--F--A--Q--E--H--
2101   TATGTGGAACTCTATGAGAAGCCTTATCCACAGATAATCCAAGGTGTGGATGGCATCCCA   2160
       Y--V--E--L--Y--E--K--P--Y--P--Q--I--I--Q--G--V--D--G--I--P--
2161   ATTGGCAATGAACCCGTCTGGCTGTGCACCGAGCCCCTGGTATGTGTCCACCAGAAGCAT   2220
       I--G--N--E--P--V--W--L--C--T--E--P--L--V--C--V--H--Q--K--H--
2221   TATGAGTACATCGAATTTGACATCTTACCTTCGCCCAACTTCTCCATCGTCTTAGGCATG   2280
       Y--E--Y--I--E--F--D--I--L--P--S--P--N--F--S--I--V--L--G--M--
2281   AAGTGGCTCCGAACCCATGCCCCTGAAGTCGACTGGATGAGAGGCCGGTGTACCTTCCAC   2340
       K--W--L--R--T--H--A--P--E--V--D--W--M--R--G--R--C--T--F--H--
2341   TCTCCCTACTGTCTGCGGAATTGCTTCACCCCACCTCCACCATGCATCGCACTAGAGACA   2400
       S--P--Y--C--L--R--N--C--F--T--P--P--P--P--C--I--A--L--E--T--
2401   TACAGCATAAGCCTACTGCCCGGATTGCCACACACATACTCAGACCTGGCCGACGTGTTT   2460
       Y--S--I--S--L--L--P--G--L--P--H--T--Y--S--D--L--A--D--V--F--
2461   AACCCGAGGGAGGCAGATGATGAGACTTCCGACCAGCCAAGCTCAGACGGATCCGATGAT   2520
       N--P--R--E--A--D--D--E--T--S--D--Q--P--S--S--D--G--S--D--D--
2521   CTTTCTGAATCAGAGCCCTCTGAGCTTCAGCAGGCTGGAGACAGTGATCAAAGCGGCGTC   2580
       L--S--E--S--E--P--S--E--L--Q--Q--A--G--D--S--D--Q--S--G--V--
2581   TTTTACGAGTCTGGGGCCCGAGAGACTTTGGAACCTGTGAGCGCCAGGATGCAAGAGAAA   2640
       F--Y--E--S--G--A--R--E--T--L--E--P--V--S--A--R--M--Q--E--K--
2641   GCCAGGCAGCAAGAGAAAGCCAGGGAGCAAGAGGAATACTGGATACTGTATGACATGCTG   2700
       A--R--Q--Q--E--K--A--R--E--Q--E--E--Y--W--I--L--Y--D--M--L--
2701   ACTGACAGACAAGACTACACGCAGATGGTACCAGAGCTATTCGACCAGCTACATGGAGCG   2760
       T--D--R--Q--D--Y--T--Q--M--V--P--E--L--F--D--Q--L--H--G--A--
2761   GCATGGTTCACAAAACTGGAGCTGCTTGGGATTAAGGAAAGTGAGATGAGGCACACGGTC   2820
       A--W--F--T--K--L--E--L--L--G--I--K--E--S--E--M--R--H--T--V--
2821   ACACACACGGAAGACACTTGGAGAGCATCGTTCGGTTTCGGCCTTCACCAGATGAGATGC   2880
       T--H--T--E--D--T--W--R--A--S--F--G--F--G--L--H--Q--M--R--C--
2881   TACCGGCCCTTCACAATGAACTCATACTCTGACGAAGGGAACAACATTGTTCACTTCATC   2940
       Y--R--P--F--T--M--N--S--Y--S--D--E--G--N--N--I--V--H--F--I--
2941   CTAAAAGACATCCTAGGGTTGTTTGTGATTTGCCATGGCAGAGAGGTCCTGGTCTACTCA   3000
       L--K--D--I--L--G--L--F--V--I--C--H--G--R--E--V--L--V--Y--S--
3001   ATGAGCCAGGAGGAACACTCCCAGCATGTCCGCCAAGTCCTGGTCCGCTTTCGGTATCAC   3060
       M--S--Q--E--E--H--S--Q--H--V--R--Q--V--L--V--R--F--R--Y--H--
3061   AACATCTACTGTTCACTGGACAAAACTCAGTTCCATCGCCAGACCGCTGAAATCTTGGGC   3120
       N--I--Y--C--S--L--D--K--T--Q--F--H--R--Q--T--A--E--I--L--G--
3121   TTCAACATATCCCCCAAAGGGGTGAAACTGAACAAGAACCTTATGAACCTCATCGTGGGG   3180
       F--N--I--S--P--K--G--V--K--L--N--K--N--L--M--N--L--I--V--G--
3181   TGCCCTGTCCCTGGCAGCAGGAGGTGTCTTCAAAGTGTGATTGACCTTGTCTATCCCTAT   3240
       C--P--V--P--G--S--R--R--C--L--Q--S--V--I--D--L--V--Y--P--Y--
3241   CGCCACTTCGTGGAGAACTTCGCTGTCATCGCAGCACCCCTAGTGAGACAACTGCTGAGT   3300
       R--H--F--V--E--N--F--A--V--I--A--A--P--L--V--R--Q--L--L--S--
3301   TCAGAGCCCTACTACTGGGGAGAAGAGGAGCAGGAGGCCTTGGAATCCCTGAAGAGGGCT   3360
       S--E--P--Y--Y--W--G--E--E--E--Q--E--A--L--E--S--L--K--R--A--
3361   TTCCGCAAGTCGCCCGTTCTCTATCACCCTAAGCCTCAGAACCCATTCTACTTGGAAACA   3420
       F--R--K--S--P--V--L--Y--H--P--K--P--Q--N--P--F--Y--L--E--T--
3421   GACATCACTGGGTCATTCCTGTCTGCCTCCCTGGTCCAAACCGACGACGAAACTGGCAAG   3480
       D--I--T--G--S--F--L--S--A--S--L--V--Q--T--D--D--E--T--G--K--
3481   AAATCTACCTGTGCTTTCTATTCAAGACCCCTCTCTACAATGGAGGTGGAGTACCCTCGA   3540
       K--S--T--C--A--F--Y--S--R--P--L--S--T--M--E--V--E--Y--P--R--
3541   GTGGAGATGAGGATCCTTCCAATCCGGGCTGCCTTCATGGTGTGGTGCCGCTACCTGGAG   3600
       V--E--M--R--I--L--P--I--R--A--A--F--M--V--W--C--R--Y--L--E--
3601   AACACCGAGGAGCCCATCATGATCCTTCTCAACACAGAGGATCTAGCCTCTCTGAATAAT   3660
       N--T--E--E--P--I--M--I--L--L--N--T--E--D--L--A--S--L--N--N--
3661   GACAGGCTCACCGTACTTCTCCCCGGGCATTGGGTCTTCTTCTTCTCACACTTCAATTTT   3720
       D--R--L--T--V--L--L--P--G--H--W--V--F--F--F--S--H--F--N--F--
3721   GGTGTTATGGAGATGCCAGCTGAAGGTGACACACAAGCACTCTTCCGCAGATGTTGGAAC   3780
       G--V--M--E--M--P--A--E--G--D--T--Q--A--L--F--R--R--C--W--N--
3781   CAGAGAGGCTTCAGAGCAAGGTTTCTGCGCCCACTGCTGCTTATGTCCATTAGGGCAAAT   3840
       Q--R--G--F--R--A--R--F--L--R--P--L--L--L--M--S--I--R--A--N--
3841   CTAAGGTACTTTGACAGATCCTCTGAGACTGAGGATAAAGAGGATGATGAAGAAGAGGAG   3900
       L--R--Y--F--D--R--S--S--E--T--E--D--K--E--D--D--E--E--E--E--
3901   GAGGAAGATGGTGAAGAAGAAGAAGGGGAGGAGGAGGAAGATGGTGAAGAAGAAGAAGGG   3960
       E--E--D--G--E--E--E--E--G--E--E--E--E--D--G--E--E--E--E--G--
3961   GAGGAGGAGGAAGATGGTGAAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGATGATGAAGAAGAAGAA   4020
       E--E--E--E--D--G--E--E--E--E--E--E--E--E--D--D--E--E--E--E--
4021   GGGGAGGAGGAGGAAGATGGTGAAGAAGAAGAAGGGGAGGAGGAGGAAGATGGTGAAGAA   4080
       G--E--E--E--E--D--G--E--E--E--E--G--E--E--E--E--D--G--E--E--
4081   GAAGAAGGGGAGGAGGAGGAAGATGGTGAAGAAGAAGAAGGGGAGGAGGAGGGAGAGGAG   4140
       E--E--G--E--E--E--E--D--G--E--E--E--E--G--E--E--E--G--E--E--
4141   GAGGAAGAAGGAGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAGGATGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAA   4200
       E--E--E--G--E--E--E--E--E--E--E--E--D--E--E--E--E--E--E--E--
4201   GAGGAAGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAG   4260
       E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--E--
4261   GAGGAGGAAGATGAGGAAGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAGATGAGGAGGTGCCCAGCATG   4320
       E--E--E--D--E--E--E--E--D--E--E--E--E--D--E--E--V--P--S--M--
4321   GTGCGGGAGCTACTGGCTGCCATCCCGATGGACCATATCCTCAATGGCTTACTGGCTCAC   4380
       V--R--E--L--L--A--A--I--P--M--D--H--I--L--N--G--L--L--A--H--
4381   TTCAGTGTGGCCCAGATCCGGGCCGTTGTCCTAAACTTCTTCCGTGGCCTGCTCTACTGG   4440
       F--S--V--A--Q--I--R--A--V--V--L--N--F--F--R--G--L--L--Y--W--
4441   AAGAGTCTCCTGGGTGTGGCAGCTGTCCTGGTGATGTTGAGAGCAAGGCAGCCCCTCTCC   4500
       K--S--L--L--G--V--A--A--V--L--V--M--L--R--A--R--Q--P--L--S--
4501   CCAGTGCCTGCCCCTAATTTGGAAGTGGCCAGGCCTCAGCACCGGCACACACTCCGACTC   4560
       P--V--P--A--P--N--L--E--V--A--R--P--Q--H--R--H--T--L--R--L--
4561   ATCCTGGACTCGACCCTCATTGCGAGTAGTGGCATGGCCACAGCCATCGCTCAGTTGCTC   4620
       I--L--D--S--T--L--I--A--S--S--G--M--A--T--A--I--A--Q--L--L--
4621   AGCCAGATGCCCCCTCTAGTGGGTGCCAACACCCTCCCAGCTCGAGAGCTGGCTGAGCTT   4680
       S--Q--M--P--P--L--V--G--A--N--T--L--P--A--R--E--L--A--E--L--
4681   TTCCTGGGCCCAAGGTGCTGGCATCGGAATGCTCTGCATTCCCAGCCTCCACGGGGGATG   4740
       F--L--G--P--R--C--W--H--R--N--A--L--H--S--Q--P--P--R--G--M--
4741   CGCTTCACCCCTGGGTTCTGGTTGACCCTGTGTGAGTTCTTTGGGGTCAGAGTCAACCCT   4800
       R--F--T--P--G--F--W--L--T--L--C--E--F--F--G--V--R--V--N--P--
4801   GAGGATGACGTCTTTCCTGACCCTTACCAGCACCGGTACTTGGAACTGCACGTCGTTGGG   4860
       E--D--D--V--F--P--D--P--Y--Q--H--R--Y--L--E--L--H--V--V--G--
4861   GATGAAGATGTCGTCTTGCGAGAAGCCCTGCAAGACGACCTGCAACGTTACCGTCAGTGT   4920
       D--E--D--V--V--L--R--E--A--L--Q--D--D--L--Q--R--Y--R--Q--C--
4921   GGCCTGCATGACGGCCTGCAAGACACCTCGCAGGACGCGCAGGACAACGACGTGCAAGAG   4980
       G--L--H--D--G--L--Q--D--T--S--Q--D--A--Q--D--N--D--V--Q--E--
4981   GACCTGTTTGGCGACCAGGAAGCGGTCACCTTCAGACCACGAAATCTTTTGGACCCAGAG   5040
       D--L--F--G--D--Q--E--A--V--T--F--R--P--R--N--L--L--D--P--E--
5041   GTCCTAGATTTCCTCAACAACCGGCTACTCTACACCCTGGGCACCGATGGCCGCCTTACT   5100
       V--L--D--F--L--N--N--R--L--L--Y--T--L--G--T--D--G--R--L--T--
5101   CTGCTTAGCAGAGATCAGGTGGCCCAGGCCCTCACACGATTCCTGGCCATGGCCTCCAGA   5160
       L--L--S--R--D--Q--V--A--Q--A--L--T--R--F--L--A--M--A--S--R--
5161   ATGGCGCTGCCTTCCCCAGCCAGGGAACAGGCAAGGCTAGAAGAGCTATCAGACTCAGAT   5220
       M--A--L--P--S--P--A--R--E--Q--A--R--L--E--E--L--S--D--S--D--
5221   GATGAACTTGACTGA                                                5280
       D--E--L--D--***