Imprinted Gene Databases

Bos taurus: RTL1

Retrotransposon Gag like 1

Chen et al. Epigenetics, 11: 501–516, 2016

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens RTL1 MART1, PEG11, LOC388015  14q32.31  Imprinted Paternal
Gallus gallus RTL1   Gene Not Present  Unknown Unknown
Rattus norvegicus Rtl1   6q32  Imprinted Paternal
Bos taurus RTL1 PEG11  21  Imprinted Paternal
Mus musculus Rtl1 Mar, Mor1, Mart1, 6430411K18Rik  12 F1  Imprinted Paternal
Ovis aries RTL1 PEG11  18  Imprinted Paternal
1      ATGATGGAACCCTCTGAAGACTCATTTGAGACGATGATGGAGCGTAAGAATCCATCATCA     60
       M--M--E--P--S--E--D--S--F--E--T--M--M--E--R--K--N--P--S--S--
61     AAACAAATGGAGTCCTCCGAGGGCTCATCCAACACCACCGTGGAGACACCACCAGGCGGC    120
       K--Q--M--E--S--S--E--G--S--S--N--T--T--V--E--T--P--P--G--G--
121    AGAGTGGAGGCGGCGGGGCTGGCCAGCGGCCTGGCCCAGGAAATGGGAGAGCAGTCCATT    180
       R--V--E--A--A--G--L--A--S--G--L--A--Q--E--M--G--E--Q--S--I--
181    GACCTCCGCCAAGACATGGAGGAGCCATCCAGTGGCCCACATAGGGAAATAAAGGATCCA    240
       D--L--R--Q--D--M--E--E--P--S--S--G--P--H--R--E--I--K--D--P--
241    CCCAATGACCTACTCCAAGACTTGGAGGAGTCATGCGAGGGTTCTCATCTGGAAGAGGGG    300
       P--N--D--L--L--Q--D--L--E--E--S--C--E--G--S--H--L--E--E--G--
301    GGTCCATTCGGTGGGGCACCTGGTGAAATGGAAGAAGAAGAGGACAACCCATGGGAGTCC    360
       G--P--F--G--G--A--P--G--E--M--E--E--E--E--D--N--P--W--E--S--
361    CAGGAAGACCAAGACTACTACACTGACCTGGCTGAATCAGAAGAAGACGAGAGTCCCGAA    420
       Q--E--D--Q--D--Y--Y--T--D--L--A--E--S--E--E--D--E--S--P--E--
421    GAGCCAGATAGCTCAACGGTGGAGGTCATGGGCATGGTGAGGTCCATCATCTCTCTGTAT    480
       E--P--D--S--S--T--V--E--V--M--G--M--V--R--S--I--I--S--L--Y--
481    TTCCGGATGCAAGACCTCAGAGAGCAGCAGCGAGTGGCGGAAGAGATCCTGATGAACGCG    540
       F--R--M--Q--D--L--R--E--Q--Q--R--V--A--E--E--I--L--M--N--A--
541    ATCAACAAAGGCCAACTGCCGAACCCGAAGCAATTCTCAGGCGATCGCAGAGAATACCAT    600
       I--N--K--G--Q--L--P--N--P--K--Q--F--S--G--D--R--R--E--Y--H--
601    GAGTTCATCGTGCTCTGCCAGCTGATCTTACAGAGCTACCCAAGAGTGTTCTGCAATGAC    660
       E--F--I--V--L--C--Q--L--I--L--Q--S--Y--P--R--V--F--C--N--D--
661    CGCCTGCGAGTGGGGTACATCATCAGTCACCTCTCGGGCATGGCTATGGAATGGGCCGGT    720
       R--L--R--V--G--Y--I--I--S--H--L--S--G--M--A--M--E--W--A--G--
721    GACCTGCTGGAGAGAGAAAGCTCCGTGATTGACGACTTCCCGGCCTTCCTGGAAGCCATG    780
       D--L--L--E--R--E--S--S--V--I--D--D--F--P--A--F--L--E--A--M--
781    AACGACACGTTTGAGTACCGCCAGGCCCTGCGGGTAGCAGAAGATGCCATGTTCAACCTC    840
       N--D--T--F--E--Y--R--Q--A--L--R--V--A--E--D--A--M--F--N--L--
841    AGGCAGGGGGACCGCGCCGCCATCGAATACATCAACGAGTTCCAGAGCCTGGTACCCACC    900
       R--Q--G--D--R--A--A--I--E--Y--I--N--E--F--Q--S--L--V--P--T--
901    TTGGGCTGGCCGGACGAAGTCCTCCAGGCCCACCTGTGCCAGGGGCTCAAGGAAGACATC    960
       L--G--W--P--D--E--V--L--Q--A--H--L--C--Q--G--L--K--E--D--I--
961    AGGCAGTATCTGTTCCGCATCCCACAGCCGAATTCGCTGGAAAACCTGATCACGCTGGTC   1020
       R--Q--Y--L--F--R--I--P--Q--P--N--S--L--E--N--L--I--T--L--V--
1021   CTGCAGATAGAGGACAAGCTGGCTGAGAGAAGGGCGATACTCAGGCTTCTCCCGGAGTCC   1080
       L--Q--I--E--D--K--L--A--E--R--R--A--I--L--R--L--L--P--E--S--
1081   CGCCCACGGCACCTGACCTGGCTCGACTCACCTGTTCCCGAGAGGTGGACCGTGAGCACC   1140
       R--P--R--H--L--T--W--L--D--S--P--V--P--E--R--W--T--V--S--T--
1141   TGGCTGCCCAACGAGTTCCACCCTGGCATCAAACGCAACCACCTTTTCCTGCTGCTCCTG   1200
       W--L--P--N--E--F--H--P--G--I--K--R--N--H--L--F--L--L--L--L--
1201   GTGAGGGTGAACCCCTACCACAGCGTGGCGGTCCAGGCCCTGGTCGACTCAGGAGCGACC   1260
       V--R--V--N--P--Y--H--S--V--A--V--Q--A--L--V--D--S--G--A--T--
1261   AGCAACTACATGGATGAAGGGTTCGCCCAAGAGCACTACGTGGAGCTCTACCAGAAGCCC   1320
       S--N--Y--M--D--E--G--F--A--Q--E--H--Y--V--E--L--Y--Q--K--P--
1321   TACGCAGAGTCGGTCCAGACCGCGGACGGCTCGCTGGTCGGCAACGAACCCGTCTGGCTC   1380
       Y--A--E--S--V--Q--T--A--D--G--S--L--V--G--N--E--P--V--W--L--
1381   TACACCGAACCCCTGGTGTGTTTGCACCAGAACCACCAGGAGTCCCTGGAATTCGACATC   1440
       Y--T--E--P--L--V--C--L--H--Q--N--H--Q--E--S--L--E--F--D--I--
1441   GTTGCTTCATCCAAATTCTCCGTGGTCCTAGGCATCAAGTGGCTCCAGCTCCACGCCCCC   1500
       V--A--S--S--K--F--S--V--V--L--G--I--K--W--L--Q--L--H--A--P--
1501   GAAATCGACTGGGTCAAAGGCCGCTGCACCTTCCACTCTCCCTACTGCCTGAAGAACTGC   1560
       E--I--D--W--V--K--G--R--C--T--F--H--S--P--Y--C--L--K--N--C--
1561   TTCCGCCCGCCCCCACCATGCATAGCTCTGGAACACCATGCCGTAAGCCTGCTGCCCGGA   1620
       F--R--P--P--P--P--C--I--A--L--E--H--H--A--V--S--L--L--P--G--
1621   TTGCCACACCAATACTCCGACCTGGCCGACGTGTTTAACCCGAAGGAAGCAGATGAGGAG   1680
       L--P--H--Q--Y--S--D--L--A--D--V--F--N--P--K--E--A--D--E--E--
1681   ACTTCCGACCAGCCAAGCTCAGACGGATCCGATGATCTTTCTGAATCAGAGCCCTCTGAG   1740
       T--S--D--Q--P--S--S--D--G--S--D--D--L--S--E--S--E--P--S--E--
1741   CTTCAGCAGGCTGGAGACAGTGATCAAAGCGAGGAGACCTTTTACGACTGCGCCTCCACC   1800
       L--Q--Q--A--G--D--S--D--Q--S--E--E--T--F--Y--D--C--A--S--T--
1801   GCGCCGTGGGAACCTGTGGGTGCCGGGACGCAAGAAAAAGCCAAGCAGGAGGAATTCTGG   1860
       A--P--W--E--P--V--G--A--G--T--Q--E--K--A--K--Q--E--E--F--W--
1861   GACCCGAAGGACATGCTGACCAGCAGGCATGACTACGTACAGATGATTCCAGAACTGTTC   1920
       D--P--K--D--M--L--T--S--R--H--D--Y--V--Q--M--I--P--E--L--F--
1921   GACCAGTTACACGGAGCTACATGGTTCACCAAGCTGGAGCTGCGTGGGACCATCGTGGAG   1980
       D--Q--L--H--G--A--T--W--F--T--K--L--E--L--R--G--T--I--V--E--
1981   GAAAGCATGAGCATACACCAGACAGAAGATGTATGGAAAGTGGCATTTGGTTTGGAGCTC   2040
       E--S--M--S--I--H--Q--T--E--D--V--W--K--V--A--F--G--L--E--L--
2041   CAAGACATGGCGAGCTACCAGCCCTTCCTGATCTGTGCAGACCCGATCATCCCCCAGGGC   2100
       Q--D--M--A--S--Y--Q--P--F--L--I--C--A--D--P--I--I--P--Q--G--
2101   GTGATCCACTTCATCCTAAAGGACATGATCGGCCTCTTTGTCGTCTCCTACGGGCAGGAC   2160
       V--I--H--F--I--L--K--D--M--I--G--L--F--V--V--S--Y--G--Q--D--
2161   GTCCTGGTCTACTCCATGAGCCAGGAGGAGCACTACCACCATGTGCGCCAGGTCCTCGTG   2220
       V--L--V--Y--S--M--S--Q--E--E--H--Y--H--H--V--R--Q--V--L--V--
2221   CGCTTCCGCTACCACTACGTCTACTGCTCCCTGCAGAGGAGCCAGTTCCACCGGCACACT   2280
       R--F--R--Y--H--Y--V--Y--C--S--L--Q--R--S--Q--F--H--R--H--T--
2281   GCCGAGTTCCTGGGCTTTGTCGTGACCCCCAAGGGGGTGAAGCTCAACAAGAGCATCGTC   2340
       A--E--F--L--G--F--V--V--T--P--K--G--V--K--L--N--K--S--I--V--
2341   AGCACGATCACGGGGTACCCCACCCCGGGCTCGAGGAAGTCCCTGCGAAACCTCATGGAG   2400
       S--T--I--T--G--Y--P--T--P--G--S--R--K--S--L--R--N--L--M--E--
2401   TTCGCCTTCCCCTACCGGCACTTCGTGGAGCGGTTCGCCGACATCACAGAGCCCCTGGTG   2460
       F--A--F--P--Y--R--H--F--V--E--R--F--A--D--I--T--E--P--L--V--
2461   CGGCAGCTCCAGGCCGACCTGCCTTTCTACTGGGGGGACGAGGAGCAGGAGGCCTTCGTG   2520
       R--Q--L--Q--A--D--L--P--F--Y--W--G--D--E--E--Q--E--A--F--V--
2521   GGCCTGAAGCGGGCGTTCCGCAAGGCGCCCCTCCTCTACCACCCCAAGCCCCAGAACCAG   2580
       G--L--K--R--A--F--R--K--A--P--L--L--Y--H--P--K--P--Q--N--Q--
2581   TTCTACTTGCAGACGGGCGTCACCAAGACGTCCCTGCACGCCAGCCTGATCCAAATGGAC   2640
       F--Y--L--Q--T--G--V--T--K--T--S--L--H--A--S--L--I--Q--M--D--
2641   AAGCGGACGGGCAAGAAAGTCTGCTGCGCTTTCTACTCTCGCAACATCTCCCCGATGGAG   2700
       K--R--T--G--K--K--V--C--C--A--F--Y--S--R--N--I--S--P--M--E--
2701   GTGGAGGCCTCGCCGGCGGAGATGAAGATCCTTCCAATCCGGGCTGCCTTCATGGTGTGG   2760
       V--E--A--S--P--A--E--M--K--I--L--P--I--R--A--A--F--M--V--W--
2761   TGCCGCTACCTGGAGAACACCGAGGAGCCCATCATGATCCTTCTCAACAAGGAGGATCTA   2820
       C--R--Y--L--E--N--T--E--E--P--I--M--I--L--L--N--K--E--D--L--
2821   GCCTCTCTGAACAATGACAGGCTCACCGTACTTCTCCCCGGCCACTGGGTCTTCTTCTTC   2880
       A--S--L--N--N--D--R--L--T--V--L--L--P--G--H--W--V--F--F--F--
2881   ACCCACTTCAACTTCGACGTCATGGAGATGCCGAGCTCGGAGGATGACCAGCCCCTGCCC   2940
       T--H--F--N--F--D--V--M--E--M--P--S--S--E--D--D--Q--P--L--P--
2941   CGCCGGCAGAGACTCGGCGAGAGGGCCCAGCAGCGCCGTGTCGCCACCACCACCAGGCCA   3000
       R--R--Q--R--L--G--E--R--A--Q--Q--R--R--V--A--T--T--T--R--P--
3001   ACGATGCTTGTCACCATGCCGGCCCCCACTGGGGATCAGTCCCCAGAATCAGAGGACGAA   3060
       T--M--L--V--T--M--P--A--P--T--G--D--Q--S--P--E--S--E--D--E--
3061   GAGGAGAGTGAAGGTGCCCTTCACCCAGACGAGCCCAACGGGCAGAACCTCCAGCAGGGG   3120
       E--E--S--E--G--A--L--H--P--D--E--P--N--G--Q--N--L--Q--Q--G--
3121   TACCTGGCGCTGATACCCGTGGACCAGATATTCAACAGCTTCCTAGCCCACTTCAGCATG   3180
       Y--L--A--L--I--P--V--D--Q--I--F--N--S--F--L--A--H--F--S--M--
3181   GCCCAGATCAGGGCAGTCCTGCTGCACTTCTACCGAAGCCTCCTGTTCTGGAAGAACCTC   3240
       A--Q--I--R--A--V--L--L--H--F--Y--R--S--L--L--F--W--K--N--L--
3241   CTGGCCATGGCCGCGCTCCTCGTGATGCTGCGGTTCAGGAGGCGCCTGGCCCTGCTGCCC   3300
       L--A--M--A--A--L--L--V--M--L--R--F--R--R--R--L--A--L--L--P--
3301   GCGCCTGCCGCGGACCCAGCCCGGCCGCCCCAACGGCGCTCTCTTCGCCTCTTCCTGGAC   3360
       A--P--A--A--D--P--A--R--P--P--Q--R--R--S--L--R--L--F--L--D--
3361   GCGTCCCTCCTCACCAGCAGCGGCATCGCCACCGCTGTCACCCAGCTGTTCACCCAGATG   3420
       A--S--L--L--T--S--S--G--I--A--T--A--V--T--Q--L--F--T--Q--M--
3421   CCACCTCTCGTGGGCACTAATGCCCTCCCGGCCGAGGAGCTGGCTGAGCTGTTCCTGGGC   3480
       P--P--L--V--G--T--N--A--L--P--A--E--E--L--A--E--L--F--L--G--
3481   CCCGGGCCCTGGCAGCTCAACGCCCTGCGGGGCTTGCAGATGACGCCCAGGTTCTGGCAG   3540
       P--G--P--W--Q--L--N--A--L--R--G--L--Q--M--T--P--R--F--W--Q--
3541   ATGCTGTGCCAGTTCTTCGGCATCAGGGGGCGTGCCCTCGAGGGCACCCAGACCCACCCG   3600
       M--L--C--Q--F--F--G--I--R--G--R--A--L--E--G--T--Q--T--H--P--
3601   AGTCCACACCAGTCCCTGGCACCGCACGTCGAGGGTGATGAATATGTCGTCTTGCGAGAA   3660
       S--P--H--Q--S--L--A--P--H--V--E--G--D--E--Y--V--V--L--R--E--
3661   GCCCTGCAAGACGACCTGCAACGTTTCCGTCAGTGTGGCCTGCATGACGGCCTGCAAGAC   3720
       A--L--Q--D--D--L--Q--R--F--R--Q--C--G--L--H--D--G--L--Q--D--
3721   ACCTCGCAGGACGCGCAGGATGACGTGTGGGCCCTCAGGCCCCGCCAGCACCTGCCCACT   3780
       T--S--Q--D--A--Q--D--D--V--W--A--L--R--P--R--Q--H--L--P--T--
3781   GAGGCCGAGGTCCTGGCCCGCCTGACCTACATCCGCAGCACCCAAGGGGGCTCCGTCGTG   3840
       E--A--E--V--L--A--R--L--T--Y--I--R--S--T--Q--G--G--S--V--V--
3841   ATCCACCGGGAGCTGACGGCCAGAGACCTGATCGACTTCCTGGCAAGTGTCTACACCCAG   3900
       I--H--R--E--L--T--A--R--D--L--I--D--F--L--A--S--V--Y--T--Q--
3901   GCTCTGCCCACCCTGGTCGAGGCAAGCCCACCCAGAGAAGGAGCCACGCTGGAGGAACTG   3960
       A--L--P--T--L--V--E--A--S--P--P--R--E--G--A--T--L--E--E--L--
3961   CCCAGCGACGCCGATGAGGATGCTGGCCTCGACTGA                           4020
       P--S--D--A--D--E--D--A--G--L--D--***