Imprinted Gene Databases

Bos taurus: CDKN1C

Cyclin dependent kinase inhibitor 1C

Chen et al. Epigenetics, 11: 501–516, 2016

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens CDKN1C BWS, WBS, p57, BWCR, KIP2  11p15.5  Imprinted Maternal
Macropus eugenii CDKN1C     Not Imprinted Biallelic
Sus scrofa CDKN1C   Imprinted Maternal
Bos taurus CDKN1C   29  Imprinted Maternal
Macaca fascicularis CDKN1C p57, KIP2  14  Imprinted Maternal
Ovis aries CDKN1C CDKN1C  21  Imprinted Maternal
Mus musculus Cdkn1c CDKI, Kip2, p57Kip2, AL024410, p57(kip2)  7 69.49 cM  Imprinted Maternal
1      acaggccaagtgctctgcgctcggtgggtgccagccaggccagagccagccgaacgagcg     60
       ............................................................
61     aggacaggcacagagggggcgcggccgccggtcggacgacaccgcaaacgagcctcagga    120
       ............................................................
121    gcagtcagctgcccgacagccagcacattggcaATGGAGCGCCTGGTCGCCCGCCGCACC    180
       .................................M--E--R--L--V--A--R--R--T--
181    TTTCCCATGATCGCGCGCACCAGCGCCTGCCGCAGCCTCTTCGGGCCCGTGGACCACGAG    240
       F--P--M--I--A--R--T--S--A--C--R--S--L--F--G--P--V--D--H--E--
241    GAGCTGGGCCGCGAGCTGCAGATGCGCCTGGCCGAGCTGAGCGCCGAGGACCAGCGTCGC    300
       E--L--G--R--E--L--Q--M--R--L--A--E--L--S--A--E--D--Q--R--R--
301    TGGGACTACAACTTCCAGCTGGATATGCCACTGCGAGGCCCCGGTCGCCTGCAGTGGACC    360
       W--D--Y--N--F--Q--L--D--M--P--L--R--G--P--G--R--L--Q--W--T--
361    GAGGTGGACAGCGACTCCGTGCCCGCCTTCTACCGCGAGACGGTGCAGGTGGGGCGCTGT    420
       E--V--D--S--D--S--V--P--A--F--Y--R--E--T--V--Q--V--G--R--C--
421    CGCCTGCTTCTGGCGCCTCGTCCCCGCCCGGACGGCGCGGTCAATAACCCGCCTCCCGGG    480
       R--L--L--L--A--P--R--P--R--P--D--G--A--V--N--N--P--P--P--G--
481    CCGCCGGCCGATGAGTCTGTCGACGGCCTCGGGGAGGCGCCGGCGTCGCCGTCCAGCGGC    540
       P--P--A--D--E--S--V--D--G--L--G--E--A--P--A--S--P--S--S--G--
541    CCGGCCGTAGTGCCTGCCCAGGCCGCGGCCCCGGCGCCTCAGGAGGGCTCCGAGCTGGAG    600
       P--A--V--V--P--A--Q--A--A--A--P--A--P--Q--E--G--S--E--L--E--
601    GCGGTCCCGCCGCCGCGCAGCCAGGAGCCCCAGGCCGAGCCGCCGCACTCAGGGATTTCG    660
       A--V--P--P--P--R--S--Q--E--P--Q--A--E--P--P--H--S--G--I--S--
661    GGGCGCCCCGCGCCGGGCACTGCGGCCGCTGCCACCAGCGCCGCCGCTGCTGCCACCACT    720
       G--R--P--A--P--G--T--A--A--A--A--T--S--A--A--A--A--A--T--T--
721    GCCGCCGCCGGAGGCGCCGCGATCAAGAAGCTGTCCGGGCCTCTCATCTCCGACTTCTTC    780
       A--A--A--G--G--A--A--I--K--K--L--S--G--P--L--I--S--D--F--F--
781    GCCAAGCGCAAGAGACCCTCGCCCGAAGCCAAGGCGTCGAACGAGGTTCCTGGGGGATGC    840
       A--K--R--K--R--P--S--P--E--A--K--A--S--N--E--V--P--G--G--C--
841    GCCGCGCCTGGCGCCGCTCCAGCCGTCGGCTCGGCTGAGCAAACCCCGCGCAAGCGGCTG    900
       A--A--P--G--A--A--P--A--V--G--S--A--E--Q--T--P--R--K--R--L--
901    CGATGAgagcctcgtgctcaaagagccctgacggagcccgttgggcagtggacaggagag    960
       R--***......................................................
961    gagcgctgggcctcggctgggaccgtccatgtagcagcaacccgcggcagctgccgcgag   1020
       ............................................................
1021   cagcgttcggtttcgtgtttaaagtttgacaactgtgcaatgtattaataacgtctttta   1080
       ............................................................
1081   tatctaaatgtattctgcccaaggagtacactggccccaaggtgtaaagctttaagagtc   1140
       ............................................................
1141   atttatataaaatgtttaatctctgctgaaactcagtgcaaaaaaaaaaaaaaaa        1200
       .......................................................