Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: SGCE

Sarcoglycan epsilon

Bischoff et al. Biol Reprod, 81: 906-920, 2009

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Equus caballus SGCE   4  Imprinted Paternal
Homo sapiens SGCE ESG, DYT11  7q21-q22  Imprinted Paternal
Sus scrofa SGCE   9  Imprinted Paternal
Bos taurus SGCE   4  Imprinted Paternal
Rattus norvegicus Sgce   4q21  Imprinted Paternal
Macropus eugenii SGCE     Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Sgce e-SG  6 1.0 cM  Imprinted Paternal 
1      ccaggccaagaaagcaattgccccggtggtgggagctgggagacccttgtgcttggacgg     60
       ............................................................
61     gacagggtcgggggacacccaggATGAGCCCCGCGACCACTGGCACCTTCTTGCTGACAG    120
       .......................M--S--P--A--T--T--G--T--F--L--L--T--V
121    TGTACACTATTTTCTCCAAGGTGCACTCTGATCGGAATGTCTACCCATCTGCAGGTGTCC    180
       --Y--T--I--F--S--K--V--H--S--D--R--N--V--Y--P--S--A--G--V--L
181    TCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAGTATTTTAAAGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAAC    240
       --F--V--H--V--L--E--R--E--Y--F--K--G--E--F--P--P--Y--P--K--P
241    CAGGTGAGATAAGTAATGATCCAATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACC    300
       --G--E--I--S--N--D--P--I--T--F--N--T--N--L--M--G--Y--P--D--R
301    GTCCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCTTATAGTGATGGAGTTCTATATGGGT    360
       --P--G--W--L--R--Y--I--Q--R--T--P--Y--S--D--G--V--L--Y--G--S
361    CTCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAACCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAATAGGC    420
       --P--T--A--E--N--V--G--K--P--T--I--I--E--I--T--A--Y--N--R--R
421    GTACCTTTGAGACTGCGAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCAGCAGAAGACTTCC    480
       --T--F--E--T--A--R--H--N--L--I--I--N--I--M--S--A--E--D--F--P
481    CGTTACCATACCAAGCAGAATTCTTCATTAAAAATATGAATGTAGAAGAAATGTTGGCCA    540
       --L--P--Y--Q--A--E--F--F--I--K--N--M--N--V--E--E--M--L--A--S
541    GCGAGGTTCTCGGAGACTTTCTTGGGGCGGTGAAAAATGTGTGGCAGCCTGAGCGTCTGA    600
       --E--V--L--G--D--F--L--G--A--V--K--N--V--W--Q--P--E--R--L--N
601    ACGCCATCAACATCACGTCGGCCCTAGACAGGGGCGGCAGGGTTCCGCTTCCCATTAATG    660
       --A--I--N--I--T--S--A--L--D--R--G--G--R--V--P--L--P--I--N--D
661    ACATGAAGGAGGGCGTTTATGTTATGGTTGGTGCCGACGTCCCATTTTCTTCTTGTTTAC    720
       --M--K--E--G--V--Y--V--M--V--G--A--D--V--P--F--S--S--C--L--R
721    GAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGCAGTCAAGAGATGGAGCCTGTAATAA    780
       --E--V--E--N--P--Q--N--Q--L--R--C--S--Q--E--M--E--P--V--I--T
781    CATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAGTTTTACATTGACTGGTGCAAAATTTCATTGGTTG    840
       --C--D--K--K--F--R--T--Q--F--Y--I--D--W--C--K--I--S--L--V--D
841    ATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAAGGGATTTTACCTG    900
       --K--T--K--Q--V--S--T--Y--Q--E--V--I--R--G--E--G--I--L--P--D
901    ATGGTGGAGAGTACAAACCCCCTTCCGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGGATT    960
       --G--G--E--Y--K--P--P--S--D--S--L--K--S--R--D--Y--Y--T--D--F
961    TCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTAGCATTGGTCCTTTTTCTAATACTTGCTT   1020
       --L--I--T--L--A--V--P--S--A--V--A--L--V--L--F--L--I--L--A--Y
1021   ATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCC   1080
       --I--M--C--C--R--R--E--G--V--E--K--R--N--M--Q--T--P--D--I--Q
1081   AACTGGTTCATCATAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAAGAACTCCGTGACATGTCCAAGA   1140
       --L--V--H--H--S--A--I--Q--K--S--T--K--E--L--R--D--M--S--K--N
1141   ATAGAGAGATAGCGTGGCCGCTGTCAACACTCCCTGTGTTTCACCCAGTAACTGGGGAAA   1200
       --R--E--I--A--W--P--L--S--T--L--P--V--F--H--P--V--T--G--E--I
1201   TCATGCCTCCTCTACATGCAGACAATTATGAGAGCACTAATATGCCGTTGATGCAAACGC   1260
       --M--P--P--L--H--A--D--N--Y--E--S--T--N--M--P--L--M--Q--T--Q
1261   AGCAGAACTTGCCACACCAGACTCAGATTCCCCAACCGCAGACTACAGGTAAATGGTATC   1320
       --Q--N--L--P--H--Q--T--Q--I--P--Q--P--Q--T--T--G--K--W--Y--P
1321   CCTGAagaaagaaaactgactgaagcaatgaatttgtaatcagacaatatagcacttata   1380
       --***.......................................................
1381   tcttattttttctctcttccagtaatgcatgagcttttctgacatatggtatgcatgttg   1440
       ............................................................
1441   acagtattaagtatatactaaataatacagtataacattcattttactaatgta         1500
       ......................................................