Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: NECD

Necdin

Bischoff et al. Biol. Reprod 81: 906-920, 2007

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Sus scrofa NECD NDN  1  Imprinted Paternal 
1      ATGTCCGAACAAAGTAAGGACGTGTGTGACCCCAACTTTGCAGCCGATGCCTCCCACTCC     60
       M--S--E--Q--S--K--D--V--C--D--P--N--F--A--A--D--A--S--H--S--
61     GAGGTGCACAGCAGCCCTGGGGTGGCCGGGGGGCCCTCTCCGCCTGCGTCCCAGGCCGCG    120
       E--V--H--S--S--P--G--V--A--G--G--P--S--P--P--A--S--Q--A--A--
121    ACCCTCGCAGGGCCAGAGATCCCTCCTGTAGGCCCACCCGACGCCCCTCTGGCCTCGCCG    180
       T--L--A--G--P--E--I--P--P--V--G--P--P--D--A--P--L--A--S--P--
181    CCGCCCCAGGCCCTGAGCGAAGAGGGAGACCCAAAGGCTCTACAGCAGGCCGCGGAGGAA    240
       P--P--Q--A--L--S--E--E--G--D--P--K--A--L--Q--Q--A--A--E--E--
241    GGCCGCGCCCACCAGGCCCGGAGCACAGCCCAGCCCAGCCCAGCGCCGCCGGCCCCGGCC    300
       G--R--A--H--Q--A--R--S--T--A--Q--P--S--P--A--P--P--A--P--A--
301    CAGCTGGTGCAGAAGGCACATGAGCTCATGTGGTACGTGCTGGTCAAGGACCAGAAAAGG    360
       Q--L--V--Q--K--A--H--E--L--M--W--Y--V--L--V--K--D--Q--K--R--
361    ATGATCATCTGGTTCCCAGACATGGTGAAAGATGTCATCGGCAGTTACAAGAAGTGGTGC    420
       M--I--I--W--F--P--D--M--V--K--D--V--I--G--S--Y--K--K--W--C--
421    AGAAGCATCCTGAGGCGCACCAGCCTCATCCTCGCCCGAGTGTTCGGGCTGCACCTGAGG    480
       R--S--I--L--R--R--T--S--L--I--L--A--R--V--F--G--L--H--L--R--
481    CTGACCAGCCTGCACACCATGGAGTTCTCGCTGGTCAAAGCTCTGGCGCCTGAGGAGCTG    540
       L--T--S--L--H--T--M--E--F--S--L--V--K--A--L--A--P--E--E--L--
541    GACAGGGTTGCTCTGAGCAACCGCATGCCTATGACAGGCCTCCTGCTGATGATCCTGAGC    600
       D--R--V--A--L--S--N--R--M--P--M--T--G--L--L--L--M--I--L--S--
601    CTCATCTACGTAAAGGGTCGCGGTGCCCGTGAGAGTGCTGTGTGGAACGTGCTGCGCATC    660
       L--I--Y--V--K--G--R--G--A--R--E--S--A--V--W--N--V--L--R--I--
661    CTGGGGCTGAGGCCCTGGAAGAAGCACTCCACCTTTGGAGATGTGAGAAAGCTTATCACT    720
       L--G--L--R--P--W--K--K--H--S--T--F--G--D--V--R--K--L--I--T--
721    GAGGAGTTCGTACAGCAGAACTACCTGAAGTACCAGCGCGTCCCCCACGTCGAGCCCCCT    780
       E--E--F--V--Q--Q--N--Y--L--K--Y--Q--R--V--P--H--V--E--P--P--
781    GAGTATGAGTTCTTCTGGGGCTCCCGTGCCAGCCGTGAAATCACCAAGATGCAAATCATG    840
       E--Y--E--F--F--W--G--S--R--A--S--R--E--I--T--K--M--Q--I--M--
841    GAGTTCCTGGCCAGGGTCTTTAAGAAAGACCCCCAGGCCTGGCCTTCCCGCTACAGGGAA    900
       E--F--L--A--R--V--F--K--K--D--P--Q--A--W--P--S--R--Y--R--E--
901    GCTCTGGAAGAGGCCAGAGCCCTGCGGGAGGCCAACCCCACTGCCCACTGCCCCCGCAAC    960
       A--L--E--E--A--R--A--L--R--E--A--N--P--T--A--H--C--P--R--N--
961    AGTGTCTCCGAGGACTAG                                             1020
       S--V--S--E--D--***