Imprinted Gene Databases

Sus scrofa: GATM

Glycine amidinotransferase

Zhou et al. Genes Genet Syst 82: 265-269, 2007

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Ovis aries GATM   Imprinted Maternal
Sus scrofa GATM AGAT  Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Gatm AT, AI314789, 1810003P21Rik  2 69.0 cM  Imprinted Maternal
Homo sapiens GATM AT, AGAT  15q21.1  Unknown Unknown
1      ggaggcacagggagacgctgccgagcgctgggcactatcggctcgtggatcagctgggcg     60
       ............................................................
61     tggggcgATGCTGCGGGTGCGGTGTCTGCGCGGTGGAAGCCGCGGTGCCGAAGCGCTGCA    120
       .......M--L--R--V--R--C--L--R--G--G--S--R--G--A--E--A--L--H-
121    CTACATCGGGTCACGGCTTGGAAGAACTGTAACAGGATGGGTGCAGCGAACTTTCCAGAG    180
       -Y--I--G--S--R--L--G--R--T--V--T--G--W--V--Q--R--T--F--Q--S-
181    CACCCAGGCAGCTACAGCTTCCTCCGGGAATTCATGTGCAGCTGATGACAAGGCCACTGA    240
       -T--Q--A--A--T--A--S--S--G--N--S--C--A--A--D--D--K--A--T--D-
241    TCCTCTGCCCAAGGACTGCCCTGTCTCCTCTTACAACGAATGGGACCCTTAGAGGAAGTG    300
       -P--L--P--K--D--C--P--V--S--S--Y--N--E--W--D--P--L--E--E--V-
301    ATAGTGGGTCGAGCTGAAAATGCCTGTGTCCCACCATTCACTGTGGAGGTGAAGGCCAAC    360
       -I--V--G--R--A--E--N--A--C--V--P--P--F--T--V--E--V--K--A--N-
361    ACATATGAAAAGTACTGGCCTTTTTACCAGAAGTATGGGGGCCATTATTTTCCCAAAGAT    420
       -T--Y--E--K--Y--W--P--F--Y--Q--K--Y--G--G--H--Y--F--P--K--D-
421    CATTTGAAAAAGGCTGTTGCCGAAATTGAAGAAATGTGCAATATTTTAAAAATGGAAGGC    480
       -H--L--K--K--A--V--A--E--I--E--E--M--C--N--I--L--K--M--E--G-
481    GTGACAGTGAGGAGGCCTGACCCCATTGACTGGTCAGTGAAGTATAAAACTCCTGATTTT    540
       -V--T--V--R--R--P--D--P--I--D--W--S--V--K--Y--K--T--P--D--F-
541    GAGTCTACGGGTTTATATGGTGCGATGCCTCGAGACATCCTGATCGTTGTGGGAAATGAG    600
       -E--S--T--G--L--Y--G--A--M--P--R--D--I--L--I--V--V--G--N--E-
601    ATTATCGAGGCTCCAATGGCCTGGCGCGCTCGATTCTTTGAGTACCGCGCATACAGATCG    660
       -I--I--E--A--P--M--A--W--R--A--R--F--F--E--Y--R--A--Y--R--S-
661    ATTATCAAAGACTACTTCCGCCGTGGGGCCAAGTGGACAACGGCTCCTAAGCCCACAATG    720
       -I--I--K--D--Y--F--R--R--G--A--K--W--T--T--A--P--K--P--T--M-
721    GCTGATGAGCTTTATGACCAAGATTACCCCATCTATTCTGTAGAAGACAGACACAAATTG    780
       -A--D--E--L--Y--D--Q--D--Y--P--I--Y--S--V--E--D--R--H--K--L-
781    GCTGCTCAGGGAAAATTTGTGACGACTGAGTTCGAGCCATGCTTTGATGCTGCTGACTTC    840
       -A--A--Q--G--K--F--V--T--T--E--F--E--P--C--F--D--A--A--D--F-
841    ATTCGAGCTGGAAGAGATATCTTTGCACAGAGAAGCCAGGTTACAAACTACATGGGCATT    900
       -I--R--A--G--R--D--I--F--A--Q--R--S--Q--V--T--N--Y--M--G--I-
901    GAATGGATGCGTAAGCATCTCGCTCCTGACTACCGAGTGCACATCATCTCCTTTAAAGAC    960
       -E--W--M--R--K--H--L--A--P--D--Y--R--V--H--I--I--S--F--K--D-
961    CCCAATCCAATGCACATTGATGCCACCTTCAATATCATTGGGCCTGGTCTTGTACTTTCC   1020
       -P--N--P--M--H--I--D--A--T--F--N--I--I--G--P--G--L--V--L--S-
1021   AACCCTGACCGACCCTGTCACCAGATTGATCTTTTCAAGAAAGCAGGATGGACCATAGTT   1080
       -N--P--D--R--P--C--H--Q--I--D--L--F--K--K--A--G--W--T--I--V-
1081   ACTCCTCCAATACCAGTTATCCCAGATGATCACCCACTGTGGATGTCGTCCAAGTGGCTT   1140
       -T--P--P--I--P--V--I--P--D--D--H--P--L--W--M--S--S--K--W--L-
1141   TCCATGAATGTCTTAATGCTGGACGAAAAGCGTGTTATGGTGGATGCCAACGAGGTCCCG   1200
       -S--M--N--V--L--M--L--D--E--K--R--V--M--V--D--A--N--E--V--P-
1201   ATCCAAAAGATGTTTGAAAAGCTGGGTATCAGTACCATCAAGATTAGCATTCGTAACGCC   1260
       -I--Q--K--M--F--E--K--L--G--I--S--T--I--K--I--S--I--R--N--A-
1261   AATTCTCTGGGAGGAGGCTTCCACTGCTGGACCTGCGACGTCCGGCGCCGAGGCACCCTG   1320
       -N--S--L--G--G--G--F--H--C--W--T--C--D--V--R--R--R--G--T--L-
1321   CAGTCCTACTTTGACTGACtgggcctgtgggggcttggggctcagcctcaaataaactta   1380
       -Q--S--Y--F--D--***.........................................
1381   ggaagcttagggataaggttcattctcctgctttaaaacatgcatgaactttagtgcttt   1440
       ............................................................
1441   aaacaatcatatctttaataggggttttaagtctggtttatttttatcacttttcttgga   1500
       ............................................................
1501   taaaaggaagataacttgtactagatcttactctctactcctaaattttttaccgtttgg   1560
       ............................................................
1561   cttcaagcataaaaatctggtgaatgtcaaccaaaacaaaaagtactcatttaagtaact   1620
       ............................................................
1621   tggccactaatgtatttaaccatctacctctatttttaattttctttccaaaaggcagct   1680
       ............................................................
1681   tgagatgttgatcctaatctttttttttcctttttgctagacttgtgaatgtttgtatca   1740
       ............................................................
1741   cttcttttttctaaataaaagacttaagatgtacagagatcttaagtagaaccagataat   1800
       ............................................................
1801   agtttctttttctaattaaaatttttggtcattttaaattttttgttttaaaaaataacc   1860
       ............................................................
1861   tagactatgcaaacatttaagtgaattttttcatgaatgtttttaatactctcatctcaa   1920
       ............................................................
1921   cactggtgatatttgctataaaaacctcttcatataacttacctcatttcaagtgattga   1980
       ............................................................
1981   ttttaatcttttttcttctacatccaaaattttccagaaatatttagtgcaataggatat   2040
       ............................................................
2041   aaccatcagttcccactcctaaattttgatgttcagtatctaatagatacattgcatctt   2100
       ............................................................
2101   tggtcatctaagatttgtttacagatgtgcaagttatttaaagcacagaactttaaaagc   2160
       ............................................................
2161   attaaaaaaaaactaatggaggtaaaacctacatgcgatgtgaaa                  2220
       .............................................