Rattus norvegicus: Trpm5
Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 5
Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023
Species | Gene | Aliases | Location | Status | Expressed Allele |
---|---|---|---|---|---|
Homo sapiens | TRPM5 | MTR1, LTRPC5 | 11p15.5 | Provisional Data | Paternal |
Rattus norvegicus | Trpm5 | 1q42 | Imprinted | Maternal | |
Mus musculus | Trpm5 | Mtr1, Ltrpc5, 9430099A16Rik | 7 F5 | Not Imprinted | Biallelic |
- Ensembl
- NCBI Databases [ Gene | cDNA | SNPs ]
- Pubmed [ PubMed Central ]
Export
1 gcaagggaggaacacagcctgaagtaggtgagtggctcccacattcagtaccagcagcta 60 ............................................................ 61 catgccaggagtctggaaggaacagacaggtttccaggagaccctctgcaaaagcctctg 120 ............................................................ 121 gagagctgtgtcgagggtgttggaatccagATGCCCGGAGTTCGAAAAGTCACAATGCCG 180 ..............................M--P--G--V--R--K--V--T--M--P-- 181 ATGGCCCAGAGCTCTTGTCCTGGAAGCCCCCCAGATACTGGGGATGGATGGGAGCCAGTC 240 M--A--Q--S--S--C--P--G--S--P--P--D--T--G--D--G--W--E--P--V-- 241 CTATGCAAGGGAGAGGTCAACTTCGGAGGGTCTGGGAAAAAGCGAAGCAAGTTTGTGAAG 300 L--C--K--G--E--V--N--F--G--G--S--G--K--K--R--S--K--F--V--K-- 301 GTGCCAAGCAATGTGGCCCCCTCCATGCTCTTTGAACTCCTGCTCACCGAGTGGCACCTG 360 V--P--S--N--V--A--P--S--M--L--F--E--L--L--L--T--E--W--H--L-- 361 CCAGCCCCCAACCTGGTGGTGTCCCTGGTGGGCGAGGAACGGCTTTTTGCTATGAAGTCC 420 P--A--P--N--L--V--V--S--L--V--G--E--E--R--L--F--A--M--K--S-- 421 TGGCTTCGGGATGTCTTGCGCAAGGGGCTGGTGAAAGCAGCTCAGAGCACAGGTGCCTGG 480 W--L--R--D--V--L--R--K--G--L--V--K--A--A--Q--S--T--G--A--W-- 481 ATCCTGACCAGTGCCCTCCATGTGGGCCTGGCACGCCATGTTGGACAGGCTGTACGTGAT 540 I--L--T--S--A--L--H--V--G--L--A--R--H--V--G--Q--A--V--R--D-- 541 CACTCTCTGGCTAGCACGTCCACCAAGGTCCGTGTGGTGGCCATCGGAATGGCCTCTCTG 600 H--S--L--A--S--T--S--T--K--V--R--V--V--A--I--G--M--A--S--L-- 601 GACCGAATCCTTCACCGCCAACTTCTAGATGGTGTCCAGGAGGATACTCCCATCCACTAC 660 D--R--I--L--H--R--Q--L--L--D--G--V--Q--E--D--T--P--I--H--Y-- 661 CCAGCAGATGAGGGCAGCACTCAGGGACCCCTCTGCCCTCTGGACAGCAATCTCTCCCAC 720 P--A--D--E--G--S--T--Q--G--P--L--C--P--L--D--S--N--L--S--H-- 721 TTCATCCTCGTGGAGCCAGGCACCCTTGGGAGTGGGAACGACGGACTGGCAGAGCTGCAG 780 F--I--L--V--E--P--G--T--L--G--S--G--N--D--G--L--A--E--L--Q-- 781 CTGAGCCTGGAGAAGCACATCTCTCAGCAGAGGACAGGTTATGGGGGTACCAGCAGCATC 840 L--S--L--E--K--H--I--S--Q--Q--R--T--G--Y--G--G--T--S--S--I-- 841 CAGATACCTGTCCTTTGCTTGCTAGTCAATGGTGACCCCAGCACCCTAGAGAGGATGTCC 900 Q--I--P--V--L--C--L--L--V--N--G--D--P--S--T--L--E--R--M--S-- 901 AGGGCAGTGGAGCAGGCTGCCCCATGGCTGATCCTGGCAGGTTCTGGGGGCATTGCTGAT 960 R--A--V--E--Q--A--A--P--W--L--I--L--A--G--S--G--G--I--A--D-- 961 GTACTCGCTGCCCTGGTGGGCCAGCCTCATCTCCTGGTGCCCCAGGTGACCGAGAAGCAG 1020 V--L--A--A--L--V--G--Q--P--H--L--L--V--P--Q--V--T--E--K--Q-- 1021 TTCAGAGAGAAATTCCCAAGCGAGTGTTTCTCTTGGGAAGCCATTGTACACTGGACAGAG 1080 F--R--E--K--F--P--S--E--C--F--S--W--E--A--I--V--H--W--T--E-- 1081 CTGCTACAGAACATTGCTGCACACCCCCACCTGCTCACAGTGTACGACTTTGAGCAGGAG 1140 L--L--Q--N--I--A--A--H--P--H--L--L--T--V--Y--D--F--E--Q--E-- 1141 GGTTCCGAGGACCTGGACACCGTCATCCTCAAGGCACTTGTGAAAGCCTGCAAGAGTCAC 1200 G--S--E--D--L--D--T--V--I--L--K--A--L--V--K--A--C--K--S--H-- 1201 AGCCGAGACGCACAAGACTACCTAGATGAGCTCAAGTTAGCAGTGGCCTGGGATCGCGTG 1260 S--R--D--A--Q--D--Y--L--D--E--L--K--L--A--V--A--W--D--R--V-- 1261 GACATTGCCAAGAGTGAAATCTTCAATGGGGACGTGGAGTGGAAGTCCTGTGACTTGGAA 1320 D--I--A--K--S--E--I--F--N--G--D--V--E--W--K--S--C--D--L--E-- 1321 GAGGTGATGACAGATGCCCTAGTGAGCAACAAGCCTGACTTCGTGCGCCTCTTTGTGGAC 1380 E--V--M--T--D--A--L--V--S--N--K--P--D--F--V--R--L--F--V--D-- 1381 AGTGGTGCTGACATGGCCGAGTTCTTGACCTATGGGCGGCTGCAGCAGCTTTACCACTCT 1440 S--G--A--D--M--A--E--F--L--T--Y--G--R--L--Q--Q--L--Y--H--S-- 1441 GTGTCCCCCAAGAGCCTCCTCTTTGAACTGCTGGAGCGTAAGCATGAGGAGGGTCGGCTG 1500 V--S--P--K--S--L--L--F--E--L--L--E--R--K--H--E--E--G--R--L-- 1501 ACACTGGCTGGCCTGGGTGCCCAGCAGACCCGGGAGCTGCCCGTTGGTCTGCCTGCCTTT 1560 T--L--A--G--L--G--A--Q--Q--T--R--E--L--P--V--G--L--P--A--F-- 1561 TCACTCCATGAGGTCTCCCGAGTTCTCAAAGATTTCCTGCATGACGCCTGCCGTGGCTTC 1620 S--L--H--E--V--S--R--V--L--K--D--F--L--H--D--A--C--R--G--F-- 1621 TACCAGGATGGGCGCAGGATGGAGGAGAGAGGGCCACCCAAGCGGCCTGCAGGCCAGAAA 1680 Y--Q--D--G--R--R--M--E--E--R--G--P--P--K--R--P--A--G--Q--K-- 1681 TGGCTGCCGGACCTCAGTCGGAAGAGTGAAGACCCATGGAGGGACCTGTTCCTTTGGGCT 1740 W--L--P--D--L--S--R--K--S--E--D--P--W--R--D--L--F--L--W--A-- 1741 GTGCTGCAGAACCGTTATGAGATGGCCACATACTTCTGGGCCATGGGCCGGGAGGGTGTG 1800 V--L--Q--N--R--Y--E--M--A--T--Y--F--W--A--M--G--R--E--G--V-- 1801 GCTGCTGCTCTGGCGGCCTGCAAGATCATCAAGGAAATGTCCCACCTGGAGAAAGAGGCA 1860 A--A--A--L--A--A--C--K--I--I--K--E--M--S--H--L--E--K--E--A-- 1861 GAGGTGGCCCGCACTATGCGTGAGGCCAAGTATGAGCAGCTGGCCCTCGATCTTTTCTCA 1920 E--V--A--R--T--M--R--E--A--K--Y--E--Q--L--A--L--D--L--F--S-- 1921 GAGTGCTACAGCAACAGTGAGGACCGTGCCTTTGCCCTGTTGGTGCGCAGGAACCACAGC 1980 E--C--Y--S--N--S--E--D--R--A--F--A--L--L--V--R--R--N--H--S-- 1981 TGGAGCAGGACCACCTGCCTGCACCTGGCCACTGAGGCCGATGCCAAGGCCTTCTTTGCC 2040 W--S--R--T--T--C--L--H--L--A--T--E--A--D--A--K--A--F--F--A-- 2041 CATGATGGTGTGCAAGCATTCCTGACGAAGATCTGGTGGGGAGACATGGCCACAGGCACA 2100 H--D--G--V--Q--A--F--L--T--K--I--W--W--G--D--M--A--T--G--T-- 2101 CCCATCTTACGACTTCTGGGTGCCTTCACCTGCCCAGCCCTCATCTACACAAATCTCATC 2160 P--I--L--R--L--L--G--A--F--T--C--P--A--L--I--Y--T--N--L--I-- 2161 TCCTTCAGTGAGGATGCCCCGCAGAGGATGGACCTGGAAGATCTGCAGGAGCCAGACAGT 2220 S--F--S--E--D--A--P--Q--R--M--D--L--E--D--L--Q--E--P--D--S-- 2221 TTGGATATGGAAAAGAGCTTCCTGTGCAGCCATGGTGGCCAATTGGAGAAGTTAACAGAG 2280 L--D--M--E--K--S--F--L--C--S--H--G--G--Q--L--E--K--L--T--E-- 2281 GCGCCAAGGGCTCCTGGCGATCTAGGCCCACAAGCTGCCTTCCTGCTCACACGGTGGAGG 2340 A--P--R--A--P--G--D--L--G--P--Q--A--A--F--L--L--T--R--W--R-- 2341 AAGTTCTGGGGCGCTCCTGTGACTGTGTTCTTGGGGAATGTGGTCATGTACTTTGCATTC 2400 K--F--W--G--A--P--V--T--V--F--L--G--N--V--V--M--Y--F--A--F-- 2401 CTCTTCCTATTCTCCTACGTCCTGCTGGTGGATTTCAGGCCACCACCCCAGGGGCCATCT 2460 L--F--L--F--S--Y--V--L--L--V--D--F--R--P--P--P--Q--G--P--S-- 2461 GGGTCGGAAGTTACCCTGTATTTCTGGGTCTTCACACTGGTGCTGGAGGAAATCCGACAG 2520 G--S--E--V--T--L--Y--F--W--V--F--T--L--V--L--E--E--I--R--Q-- 2521 GGATTCTTCACAAACGAGGACACCCGTCTGGTGAAGAAGTTCACTCTGTACGTAGAAGAC 2580 G--F--F--T--N--E--D--T--R--L--V--K--K--F--T--L--Y--V--E--D-- 2581 AACTGGAACAAATGTGACATGGTGGCCATCTTCCTGTTCATTGTTGGTGTCACCTGTAGA 2640 N--W--N--K--C--D--M--V--A--I--F--L--F--I--V--G--V--T--C--R-- 2641 ATGGTGCCCTCCGTGTTTGAGGCTGGCCGGACTGTTCTGGCCATTGACTTCATGGTGTTC 2700 M--V--P--S--V--F--E--A--G--R--T--V--L--A--I--D--F--M--V--F-- 2701 ACACTTCGGCTCATCCACATCTTTGCTATTCACAAGCAGCTGGGTCCTAAGATCATCATT 2760 T--L--R--L--I--H--I--F--A--I--H--K--Q--L--G--P--K--I--I--I-- 2761 GTAGAGCGGATGATGAAAGATGTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCCTGAGCGTGTGGCTCGTG 2820 V--E--R--M--M--K--D--V--F--F--F--L--F--F--L--S--V--W--L--V-- 2821 GCCTATGGCGTGACCACTCAGGCCCTGCTGCACCCCCACGATGGCCGTCTGGAGTGGATT 2880 A--Y--G--V--T--T--Q--A--L--L--H--P--H--D--G--R--L--E--W--I-- 2881 TTCCGCCGTGTGCTCTACAGGCCTTACCTGCAGATCTTTGGGCAAATCCCTCTGGATGAA 2940 F--R--R--V--L--Y--R--P--Y--L--Q--I--F--G--Q--I--P--L--D--E-- 2941 ATTGATGAGGCCCGTGTGAACTGCTCTCTTCACCCGTTGCTGCTGGACAGCTCAGCTTCC 3000 I--D--E--A--R--V--N--C--S--L--H--P--L--L--L--D--S--S--A--S-- 3001 TGCCCTAATCTCTATGCCAACTGGCTGGTCATTCTCCTGCTGGTTACCTTCCTCCTCGTC 3060 C--P--N--L--Y--A--N--W--L--V--I--L--L--L--V--T--F--L--L--V-- 3061 ACTAATGTGCTACTTATGAACCTTCTGATCGCCATGTTCAGCTACACATTCCAGGTGGTG 3120 T--N--V--L--L--M--N--L--L--I--A--M--F--S--Y--T--F--Q--V--V-- 3121 CAGGGCAATGCAGACATGTTCTGGAAGTTTCAACGCTACCACCTCATCGTTGAATACCAC 3180 Q--G--N--A--D--M--F--W--K--F--Q--R--Y--H--L--I--V--E--Y--H-- 3181 GGAAGGCCGGCTCTGGCCCCGCCCTTCATCCTGCTCAGCCACCTGAGCCTGGTGCTCAAG 3240 G--R--P--A--L--A--P--P--F--I--L--L--S--H--L--S--L--V--L--K-- 3241 CAGGTCTTCAGGAAGGAAGCCCAGCACAAACAGCAACACCTGGAGAGAGACTTGCCTGAC 3300 Q--V--F--R--K--E--A--Q--H--K--Q--Q--H--L--E--R--D--L--P--D-- 3301 CCCGTGGACCAGAAGATCATTACCTGGGAAACAGTTCAAAAGGAGAACTTCCTGAGTACC 3360 P--V--D--Q--K--I--I--T--W--E--T--V--Q--K--E--N--F--L--S--T-- 3361 ATGGAGAAACGGAGGAGGGACAGTGAGGAGGAGGTGCTGAGGAAAACGGCACACAGAGTG 3420 M--E--K--R--R--R--D--S--E--E--E--V--L--R--K--T--A--H--R--V-- 3421 GACTTGATTGCCAAATACATCGGGGGTCTGAGAGAGCAAGAAAAGAGGATCAAGTGTCTG 3480 D--L--I--A--K--Y--I--G--G--L--R--E--Q--E--K--R--I--K--C--L-- 3481 GAGTCACAGGCCAACTACTGTATGCTCCTCTTGTCCTCCATGACTGACACACTGGCTCCT 3540 E--S--Q--A--N--Y--C--M--L--L--L--S--S--M--T--D--T--L--A--P-- 3541 GGAGGCACCTACTCAAGTTCTCAAAACTGTGGTCGCAGGAGTCAGCCAGCCTCTGCTAGA 3600 G--G--T--Y--S--S--S--Q--N--C--G--R--R--S--Q--P--A--S--A--R-- 3601 GACAGGGAGTACCTAGAGGCTGGCTTGCCACACTCAGACACCTGAaatggagaaaccact 3660 D--R--E--Y--L--E--A--G--L--P--H--S--D--T--***............... 3661 tgccctagagctccagacctggccagattgaggttttgggtcacatcaaccttcccctgc 3720 ............................................................ 3721 cccagcagccccgagaccttgccgcagaccatgtcttggacacctcttcctatgaaaatg 3780 ............................................................ 3781 agactcatgtctttggcatctatctgggagccccaggcgtcctctccagcaggggaagtt 3840 ............................................................ 3841 ttctcatgtcctacctaaaactttcaccagctaagactggacagctggaactggccaagt 3900 ............................................................ 3901 cccacatgggataccatctgcctggatggggctacttacgtc 3960 ..........................................