Imprinted Gene Databases

Rattus norvegicus: Spp1

Secreted phosphoprotein 1

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Rattus norvegicus Spp1 OSP  14p22  Imprinted Maternal 
1      gagccaccagcagcaggactgaaggagctaagcctcagcatccttggctttgcagtctcc     60
       ............................................................
61     tgcggcaagcattctcgaggaagccagccaaggaccaactacaaccATGAGACTGGCAGT    120
       ..............................................M--R--L--A--V-
121    GGTTTGCTTTTGCCTGTTCGGCCTTGCCTCCTGTCTCCCGGTGAAAGTGGCTGAGTTTGG    180
       -V--C--F--C--L--F--G--L--A--S--C--L--P--V--K--V--A--E--F--G-
181    CAGCTCAGAGGAGAAGGCGCATTACAGCAAACACTCAGATGCTGTAGCCACTTGGCTGAA    240
       -S--S--E--E--K--A--H--Y--S--K--H--S--D--A--V--A--T--W--L--K-
241    GCCTGACCCATCTCAGAAGCAGAATCTTCTAGCCCCACAGAATTCTGTGTCCTCTGAAGA    300
       -P--D--P--S--Q--K--Q--N--L--L--A--P--Q--N--S--V--S--S--E--E-
301    AACGGATGACTTTAAGCAAGAAACTCTTCCAAGCAACTCCAATGAAAGCCATGACCACAT    360
       -T--D--D--F--K--Q--E--T--L--P--S--N--S--N--E--S--H--D--H--M-
361    GGACGATGATGACGACGACGATGACGACGGAGACCATGCAGAGAGCGAGGATTCTGTGAA    420
       -D--D--D--D--D--D--D--D--D--G--D--H--A--E--S--E--D--S--V--N-
421    CTCGGATGAATCTGACGAATCTCACCATTCCGATGAATCTGATGAGTCCTTCACTGCCAG    480
       -S--D--E--S--D--E--S--H--H--S--D--E--S--D--E--S--F--T--A--S-
481    CACACAAGCAGACGTTTTGACTCCAATCGCCCCCACAGTCGATGTCCCTGACGGCCGAGG    540
       -T--Q--A--D--V--L--T--P--I--A--P--T--V--D--V--P--D--G--R--G-
541    TGATAGCTTGGCTTACGGACTGAGGTCAAAGTCCAGGAGTTTCCCTGTTTCTGATGAACA    600
       -D--S--L--A--Y--G--L--R--S--K--S--R--S--F--P--V--S--D--E--Q-
601    GTATCCCGATGCCACAGATGAGGACCTCACCTCCCGCATGAAGAGCCAGGAGTCCGATGA    660
       -Y--P--D--A--T--D--E--D--L--T--S--R--M--K--S--Q--E--S--D--E-
661    GGCTATCAAGGTCATCCCAGTTGCCCAGCGTCTGAGCGTGCCCTCTGATCAGGACAGCAA    720
       -A--I--K--V--I--P--V--A--Q--R--L--S--V--P--S--D--Q--D--S--N-
721    CGGGAAGACCAGCCATGAGTCAAGTCAGCTGGATGAACCAAGCGTGGAAACACACAGCCT    780
       -G--K--T--S--H--E--S--S--Q--L--D--E--P--S--V--E--T--H--S--L-
781    GGAGCAGTCCAAGGAGTATAAGCAGAGGGCCAGCCACGAGAGCACTGAGCAGTCGGATGC    840
       -E--Q--S--K--E--Y--K--Q--R--A--S--H--E--S--T--E--Q--S--D--A-
841    GATCGATAGTGCCGAGAAGCCGGATGCAATCGATAGTGCGGAGCGGTCGGATGCTATCGA    900
       -I--D--S--A--E--K--P--D--A--I--D--S--A--E--R--S--D--A--I--D-
901    CAGTCAGGCGAGTTCCAAAGCCAGCCTGGAACATCAGAGCCACGAGTTTCACAGCCATGA    960
       -S--Q--A--S--S--K--A--S--L--E--H--Q--S--H--E--F--H--S--H--E-
961    GGACAAGCTAGTCCTAGACCCTAAGAGTAAGGAAGATGATAGGTATCTGAAATTCCGCAT   1020
       -D--K--L--V--L--D--P--K--S--K--E--D--D--R--Y--L--K--F--R--I-
1021   TTCTCATGAATTAGAGAGTTCATCTTCTGAGGTCAATTAAagaagaggcaaaaccacagt   1080
       -S--H--E--L--E--S--S--S--S--E--V--N--***....................
1081   tccttactttgctttaaataaaaacaaaaagtaaattccaacaagcaggaatactaactg   1140
       ............................................................
1141   cttgtttctcagttcagtggatacatgtatgtggagaaagaaatagatagtgttttgggc   1200
       ............................................................
1201   cctgagcttagttcgttgtttcatgcagacaccactgtaacctagaagtttcagcatttt   1260
       ............................................................
1261   gcttctgttctttctgtgcaagaaatgcaaatggccactgcattttaatgattgctattc   1320
       ............................................................
1321   ttttatgaataaaatgtatgtagaggcaggcaaacttacaggaacagcaaaattaaaaga   1380
       ............................................................
1381   gaaactgtaatagtctgtgtcactataatcttttggttttataattagtgtatattttgt   1440
       ............................................................
1441   tgtgattatttttgttggtgtgaataaatcttgtatcttgaatgtaaaaaaaaaaaaaaa   1500
       ............................................................
1501   aaa                                                            1560
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