Imprinted Gene Databases

Rattus norvegicus: Sgce

Sarcoglycan, epsilon

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Equus caballus SGCE   Imprinted Paternal
Homo sapiens SGCE ESG, DYT11  7q21-q22  Imprinted Paternal
Sus scrofa SGCE   Imprinted Paternal
Bos taurus SGCE   Imprinted Paternal
Rattus norvegicus Sgce   4q21  Imprinted Paternal
Macropus eugenii SGCE     Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Sgce e-SG  6 1.0 cM  Imprinted Paternal
1      gggaggggaggatcgaggacggacggcttaggcaggccaagaATGCTATTATTCTGGTGG     60
       ..........................................M--L--L--F--W--W--
61     TGGGAGCTGGGAGACCCTTGTGCTTGGACGGGAAAGGGTCGGGGGACACTCAAGATGAGC    120
       W--E--L--G--D--P--C--A--W--T--G--K--G--R--G--T--L--K--M--S--
121    CCCGCGACCACTGGCACATTCTTACTGACAGTGTACACTCTTTTCTCCAAGGTGCACTCT    180
       P--A--T--T--G--T--F--L--L--T--V--Y--T--L--F--S--K--V--H--S--
181    GACCGGAACGTCTACCCATCTGCGGGTGTCCTCTTTGTCCATGTGCTGGAGAGAGAGTAT    240
       D--R--N--V--Y--P--S--A--G--V--L--F--V--H--V--L--E--R--E--Y--
241    TTTAAGGGGGAATTTCCACCTTATCCAAAGCCTGGTGAGGTTAGTAATGATCCCATAACA    300
       F--K--G--E--F--P--P--Y--P--K--P--G--E--V--S--N--D--P--I--T--
301    TTTAACACAAATTTAATGGGCTATCCAGACAGACCTGGATGGCTTCGGTACATCCAAAGA    360
       F--N--T--N--L--M--G--Y--P--D--R--P--G--W--L--R--Y--I--Q--R--
361    ACACCATACAGCGATGGAGTCCTGTATGGGTCTCCAACAGCCGAAAACGTGGGGAAACCA    420
       T--P--Y--S--D--G--V--L--Y--G--S--P--T--A--E--N--V--G--K--P--
421    ACTATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGACGTACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTG    480
       T--I--I--E--I--T--A--Y--N--R--R--T--F--E--T--A--R--H--N--L--
481    ATAATCAATATAATGTCAGCAGAAGAATTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATC    540
       I--I--N--I--M--S--A--E--E--F--P--L--P--Y--Q--A--E--F--F--I--
541    AAAAATATGAATGTGGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTCGGGGCT    600
       K--N--M--N--V--E--E--M--L--A--S--E--V--L--G--D--F--L--G--A--
601    GTAAAGAATGTGTGGCAGCCGGAACGCCTCAATGCTATCAACATCACATCGGCCCTAGAC    660
       V--K--N--V--W--Q--P--E--R--L--N--A--I--N--I--T--S--A--L--D--
661    AGGGGCGGTAGGGTGCCACTTCCTATTAAAGACATGAAGGAGGGTGTTTATGTCATGGTT    720
       R--G--G--R--V--P--L--P--I--K--D--M--K--E--G--V--Y--V--M--V--
721    GGTGCCGACGTTGCATTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAGTTA    780
       G--A--D--V--A--F--S--S--C--L--R--E--V--E--N--P--Q--N--Q--L--
781    AGGTGCAGTCAAGAAATGGAACCTGTGATAACATGCGATAAAAAGTTCCGAACTCAGTTT    840
       R--C--S--Q--E--M--E--P--V--I--T--C--D--K--K--F--R--T--Q--F--
841    TACATTGACTGGTGCAAGATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAG    900
       Y--I--D--W--C--K--I--S--L--V--D--K--T--K--Q--V--S--T--Y--Q--
901    GAAGTGGTTCGTGGCGAGGGCATTTTGCCCGATGGTGGGGAGTACAAGCCCCCTTCGGAT    960
       E--V--V--R--G--E--G--I--L--P--D--G--G--E--Y--K--P--P--S--D--
961    TCTTTGAAAAGCCGAGACTATTACACGGATTTCCTCGTTACCCTGGCTGTGCCCTCGGCA   1020
       S--L--K--S--R--D--Y--Y--T--D--F--L--V--T--L--A--V--P--S--A--
1021   GTAGCACTAGTTCTTTTCCTAATACTCGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGAGTG   1080
       V--A--L--V--L--F--L--I--L--A--Y--I--M--C--C--R--R--E--G--V--
1081   GAAAAGAGAAACATGCAAACCCCAGATATCCAACTTGTCCATCACAGCTCTATTCAGAAA   1140
       E--K--R--N--M--Q--T--P--D--I--Q--L--V--H--H--S--S--I--Q--K--
1141   TCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAAAACAGAGAGATTGCATGGCCCCTGTCAACA   1200
       S--T--K--E--L--R--D--M--S--K--N--R--E--I--A--W--P--L--S--T--
1201   CTCCCCGTGTTTCACCCAGTGACTGGGGAGATCATACCTCCCATGCACACGGACAACTAC   1260
       L--P--V--F--H--P--V--T--G--E--I--I--P--P--M--H--T--D--N--Y--
1261   GACAGTACCAACATGCCCTTGATGCAGACACAGCCGAACTTGCCACACCAGACTCAGATC   1320
       D--S--T--N--M--P--L--M--Q--T--Q--P--N--L--P--H--Q--T--Q--I--
1321   CCCCAACAGCAGACTACAGGTAAATGGTATCCCTGAagaaagaaagctgacggaagccat   1380
       P--Q--Q--Q--T--T--G--K--W--Y--P--***........................
1381   gagtttataatcagcagcacagcaatcacgtctcccccccctttcacctccaatcgtgca   1440
       ............................................................
1441   tgagctttcctgacatcattgtgcatgtcaactatattacatccataccaaatactatca   1500
       ............................................................
1501   cctagctctctcatttactaatgtattttttttgtacttaaagcatttttgaaaatttat   1560
       ............................................................
1561   aagacatcaatgactttatatttgttacaataaaaagtgaactttaaaataaatattaat   1620
       ............................................................
1621   gaagcctaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                          1680
       .....................................