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Rattus norvegicus: Sfmbt2

Scm-like with four mbt domains 2

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SFMBT2   10p14  Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Sfmbt2 D2Wsu23e, D330030P06Rik  2 6.0 cM  Imprinted Paternal
Bos taurus SFMBT2   13  Not Imprinted Biallelic
Rattus norvegicus Sfmbt2   17q12.3  Imprinted Paternal
1      agtctggaattccaactgcaagttcctgcaaggtttcctgctaagcaccaggtcgctttg     60
       ............................................................
61     acagaggacatccatctctgaagatcccgagaggagtttgatgaattaagggagctcgag    120
       ............................................................
121    gcatagtcaacagcATGGAGAGACGTTTGCCAGTTTTGAAGATCCGCACCTCATCCTCCT    180
       ..............M--E--R--R--L--P--V--L--K--I--R--T--S--S--S--S
181    CTCTGGAAAGGATTACCAGCCCAGAAAATGGGAATGGGAGTCTTGACACAGAGGAAGATT    240
       --L--E--R--I--T--S--P--E--N--G--N--G--S--L--D--T--E--E--D--S
241    CCAGGCAGGAGGAAACTGAGTTCAGCTGGGGAGACTATTTGGATGAGACGGGTGCCAGAG    300
       --R--Q--E--E--T--E--F--S--W--G--D--Y--L--D--E--T--G--A--R--A
301    CGGTACCACACGTGTGCTTCAGACATGTGGAGATCAGCATTCAGAGTAACTTCCAGCCAG    360
       --V--P--H--V--C--F--R--H--V--E--I--S--I--Q--S--N--F--Q--P--G
361    GAATGAAGTTGGAGGTGGCCAACAAGAACCATCCAGACACTTACTGGGTGGCCACGATCA    420
       --M--K--L--E--V--A--N--K--N--H--P--D--T--Y--W--V--A--T--I--I
421    TCACCACCTGTGGACAGCTGCTGCTCCTGCGTTACTGTGGTTATGGGGAGGACCGAAGGG    480
       --T--T--C--G--Q--L--L--L--L--R--Y--C--G--Y--G--E--D--R--R--A
481    CTGACTTCTGGTGTGATGTCATCATAGCAGATCTGCACCCTGTGGGGTGGTGTACTCAGA    540
       --D--F--W--C--D--V--I--I--A--D--L--H--P--V--G--W--C--T--Q--N
541    ACAACAAGGTGTTGAGGCCCCCGGATGCTATCAAAGAGAAGTATGCCGACTGGGAGGAAT    600
       --N--K--V--L--R--P--P--D--A--I--K--E--K--Y--A--D--W--E--E--F
601    TCCTCATACATGAATTGACTGGTTCTCGGACAGCACCTGCAAGCCTTCTGGAAGGTCCTC    660
       --L--I--H--E--L--T--G--S--R--T--A--P--A--S--L--L--E--G--P--L
661    TGCGAGGGAAAGGCCCAATAGACCTCATTACAGTTGATTCCTTAATAGAGCTGCAGGACT    720
       --R--G--K--G--P--I--D--L--I--T--V--D--S--L--I--E--L--Q--D--S
721    CTCAGAATCCCTTTCAGTACTGGATAGTTAGTGTGATTGAAAATGTCGGAGGAAGATTAC    780
       --Q--N--P--F--Q--Y--W--I--V--S--V--I--E--N--V--G--G--R--L--R
781    GCCTTCGCTATGTGGGATTGGAGCACACTGAATCCTATGACCGGTGGTTATTTTACTTGG    840
       --L--R--Y--V--G--L--E--H--T--E--S--Y--D--R--W--L--F--Y--L--D
841    ATTACAGACTTCGACCAATTGGTTGGTGTCAAGAAAAAAAATACAGAATGGATCCACCTT    900
       --Y--R--L--R--P--I--G--W--C--Q--E--K--K--Y--R--M--D--P--P--S
901    CAGAACTTTATTATCTGAAGTTGCCTTTTGAATGGAAATGTGCACTAGAAAAAGCCTTGC    960
       --E--L--Y--Y--L--K--L--P--F--E--W--K--C--A--L--E--K--A--L--L
961    TTGCCGCTGCAGAGTGTCCCCTTCCAATGGAAGTATTTAAGGACCATGCAGACTTGGGAA   1020
       --A--A--A--E--C--P--L--P--M--E--V--F--K--D--H--A--D--L--G--S
1021   GCCATTTCTTTACAGTTGGGATGCGGCTGGAGACATTGCACATCAATGATCCCTTTCATA   1080
       --H--F--F--T--V--G--M--R--L--E--T--L--H--I--N--D--P--F--H--I
1081   TCTATCCTGCAACAGTGACCAAGGTTTTTAACAGTCAGTTTTTCCAAGTGGCCATTGATG   1140
       --Y--P--A--T--V--T--K--V--F--N--S--Q--F--F--Q--V--A--I--D--D
1141   ACTTAAGAGCCGAGACTAATGGACTCACAATGCTGTGCCACGCAGATTCTTTGGGGATTT   1200
       --L--R--A--E--T--N--G--L--T--M--L--C--H--A--D--S--L--G--I--L
1201   TGCCAGTACAGTGGTGCCTTAAAAATGGAGTCAACCTCGCTCCTCCCAAAGGTTACTCAG   1260
       --P--V--Q--W--C--L--K--N--G--V--N--L--A--P--P--K--G--Y--S--G
1261   GCCAGGATTTTAACTGGGTGGATTATCACAAGCAGCGCGAGGCCGAAGGAGCCCCTCCTT   1320
       --Q--D--F--N--W--V--D--Y--H--K--Q--R--E--A--E--G--A--P--P--Y
1321   ACTGCTTCAAAAATACATTTGCTCGGGGCTTTGCAAAGAACATGAAGCTTGAAGCTGTGA   1380
       --C--F--K--N--T--F--A--R--G--F--A--K--N--M--K--L--E--A--V--N
1381   ACCCCAAGAATCCAGGAGAGGTGTGCGTGGCCACTGTGATCAGCGTGAGAGGGAGTTTGT   1440
       --P--K--N--P--G--E--V--C--V--A--T--V--I--S--V--R--G--S--L--L
1441   TATGGCTCCGTTTAGAAGGTGTGGAGACACCGATGCCAGAGATCATTGTGGATATAGATT   1500
       --W--L--R--L--E--G--V--E--T--P--M--P--E--I--I--V--D--I--D--S
1501   CCATGGACATCTTCCCCGTAGGCTGGTGTGAAGCGAATTCTTACCCTTTGACCACACCAT   1560
       --M--D--I--F--P--V--G--W--C--E--A--N--S--Y--P--L--T--T--P--Y
1561   ACAAGTCGTCCTCAAAAAGCAAGAAAAAACCGATCACTGTACCTCCGGAAAAACCATCGT   1620
       --K--S--S--S--K--S--K--K--K--P--I--T--V--P--P--E--K--P--S--L
1621   TACCCCCAGTGCCTGTTGAGAATATACCTCAAGAGCTTTGCCTGCCCCCTCAGACGGACA   1680
       --P--P--V--P--V--E--N--I--P--Q--E--L--C--L--P--P--Q--T--D--T
1681   CCGCAGCAGGAGCCGCCAATGAGAAGTACTACTGCCCACAGCTGTTCGTCAACCACCGGT   1740
       --A--A--G--A--A--N--E--K--Y--Y--C--P--Q--L--F--V--N--H--R--C
1741   GTTTCTCAGGCCCGTTCCTGAACAAAGGAAGGATTTCAGAACTACCTCAGTCCGTGGGAC   1800
       --F--S--G--P--F--L--N--K--G--R--I--S--E--L--P--Q--S--V--G--P
1801   CTGGCAAGTGCGTGCTGGTGCTTAAAGAGATTCTTACCATGATTACCAATGCAGCCTACA   1860
       --G--K--C--V--L--V--L--K--E--I--L--T--M--I--T--N--A--A--Y--K
1861   AGCCCGGGAGGGTGTTGAGAGAGTTACAGCTGGTAGAAGATCCAGAGTGGGATTTCCAGG   1920
       --P--G--R--V--L--R--E--L--Q--L--V--E--D--P--E--W--D--F--Q--E
1921   AGGAGGTGCTCAAGGCAAAATACCGAGGCAAAATATACAGGGCCGTGGTCAAGATCGTGC   1980
       --E--V--L--K--A--K--Y--R--G--K--I--Y--R--A--V--V--K--I--V--R
1981   GGACAGCAGACCAAGTAACAAGCTTCTGCCAGCAAGTTTGTGCCAAACTGGAGTGCTGTC   2040
       --T--A--D--Q--V--T--S--F--C--Q--Q--V--C--A--K--L--E--C--C--P
2041   CGAACTTATTCAGTCCCCTGCTGATCTCTGAAAACTGCCCGGAGAATTGTTCCATCCGCA   2100
       --N--L--F--S--P--L--L--I--S--E--N--C--P--E--N--C--S--I--R--T
2101   CCAAAACCAAATACACCTATTACTATGGGAAAAGGAAGAGGATCATTAAACCTCCACTCG   2160
       --K--T--K--Y--T--Y--Y--Y--G--K--R--K--R--I--I--K--P--P--L--G
2161   GAGAAAGCAACACTGAAAGCGCACCAAAACCCACCAGGAGAAGGAAACGAAGAAAATCAA   2220
       --E--S--N--T--E--S--A--P--K--P--T--R--R--R--K--R--R--K--S--I
2221   TCTATGTGCAGAAGAAACGGAAATCCTCTGCGGTGGCCATGCCAGCGACCTCGGCACAGG   2280
       --Y--V--Q--K--K--R--K--S--S--A--V--A--M--P--A--T--S--A--Q--E
2281   AAACTGAAGAGGACGATCCAGAGGCCCTGGACACTGCAAGCGAGGAAACTGGTTACGTGG   2340
       --T--E--E--D--D--P--E--A--L--D--T--A--S--E--E--T--G--Y--V--V
2341   TCCAGAATTACAAGACACAGCATGTACCAGTAGAGATGCCCTTTACCCGTTCACAGAGGG   2400
       --Q--N--Y--K--T--Q--H--V--P--V--E--M--P--F--T--R--S--Q--R--A
2401   CTATGATCCTGAGGAAACATTCAGGGGCTGTAAAGCACCCTCCAGTGGAAAGGGCACGGA   2460
       --M--I--L--R--K--H--S--G--A--V--K--H--P--P--V--E--R--A--R--R
2461   GGGTCCGCTCAGTGCACTCTACTGCCTCTTCTAATAACAGAAACAAGGTTCCACTTGTCA   2520
       --V--R--S--V--H--S--T--A--S--S--N--N--R--N--K--V--P--L--V--R
2521   GGATTGAGAAATCAGAGGACCCAAGGCAGTCGGAGGAGGAGAAACTGATTCTTGAGAGCA   2580
       --I--E--K--S--E--D--P--R--Q--S--E--E--E--K--L--I--L--E--S--N
2581   ATCCGCTGGAGTGGTCCGTCACAGATGTGGTGCGATTCATTAAGCTGACTGACTGTGCAC   2640
       --P--L--E--W--S--V--T--D--V--V--R--F--I--K--L--T--D--C--A--P
2641   CTTTGGCCAGGATCTTTCAAGAGCAGGACATCGATGGCCAGGCTCTCCTCCTGCTCACTC   2700
       --L--A--R--I--F--Q--E--Q--D--I--D--G--Q--A--L--L--L--L--T--L
2701   TCCCAACAGTGCAGGAGTGCATGGAGCTGAAGCTAGGACCTGCGATCAAATTATGCCATC   2760
       --P--T--V--Q--E--C--M--E--L--K--L--G--P--A--I--K--L--C--H--Q
2761   AGATCGAGAGAGTGAAAGTGGCTTTCTACGCCCAGTACGCCAATTAGctcacccttcccg   2820
       --I--E--R--V--K--V--A--F--Y--A--Q--Y--A--N--***.............
2821   agtgggcatcgcctgattctgattatgctgtgtttgttgtaaaggttttcaggaccgagg   2880
       ............................................................
2881   ccttgatttcctgggctttgtgaaatggcacaatccattgggggtctccaaaaagccaga   2940
       ............................................................
2941   agcccaggacctctttcttgcaccagcctatttggtagtcctatgtttttaaagcacacg   3000
       ............................................................
3001   gaaggaacaccagcagtgtattgtgaacgttctgagacagaccttccctggctcagggcc   3060
       ............................................................
3061   tccgattccctttttttctcccactcaaagcaggtagttttatggaagtcaggtctcctt   3120
       ............................................................
3121   acactgaggtctaggttcctgggaaactcagatggattaggtgtatcctagcagaacccc   3180
       ............................................................
3181   cgtctagctgccatttttgcctgactcagcctcaagctctcttacagctctgtctgacgc   3240
       ............................................................
3241   acacacgcacgcacgctaccgtggtttagagtcacctcctattccatttggtctcactta   3300
       ............................................................
3301   agctccattctcccatacaactctggactccattcagctccgtcctctgtcagaggtgcc   3360
       ............................................................
3361   ttttcacaagtatggcagcttgccacgagcccgctaccgtgtaagcaaagcctagaacac   3420
       ............................................................
3421   tctatgtagtctcctccagaaccatagcttcaatgttttaagatcactgtgacccatcag   3480
       ............................................................
3481   gaggaggctgctttagggaagttatcaaattctgtattgaagaaacattttcagggagca   3540
       ............................................................
3541   agtataggaaaagactttggggacagtgcttctcgtgagctagctgtatccacttagaat   3600
       ............................................................
3601   gttaacacagatggttgctacaagcaaacccctccgagcctctcttccgctagtgcctag   3660
       ............................................................
3661   cttgccacatggaaaggaatcccaggggagcaacataagatagcagagcaaatactggat   3720
       ............................................................
3721   ctggatccagtgggtttccatccattgtctagtggccaacttcatgtccttgggtaactt   3780
       ............................................................
3781   gccaccaccctggaccccaagttcccattgagaagtaaggtagacattcactagagaggc   3840
       ............................................................
3841   actgagggcacctttcccctgctcccgctagagaggagtctaggtagaccataatgagag   3900
       ............................................................
3901   aaagaatgtggcctcagagtttaaccctccatcttctgcctttcactctcttttggggtt   3960
       ............................................................
3961   gcttgtgaaatgtcatctgtagcctaatcagtgattataaaatctggctgataccagcac   4020
       ............................................................
4021   tcacctgtattttcctgtgatcttgcaaacccaaaggagctgaggcacattataacgtgg   4080
       ............................................................
4081   aggtcacctccatgtcttttggaaaccaggcagggaaaccagcctttcattctgcttagg   4140
       ............................................................
4141   agtgcctcactttggaagcttaacttcccacctatccgggccttactggtttactttgtg   4200
       ............................................................
4201   gtttcccatagttttttcataatcacatttccttcatctgttgtccttgactagaaccac   4260
       ............................................................
4261   aactgtcccagagcatgggatgacagctgatagctgcttgtcctttggctgaggtttaag   4320
       ............................................................
4321   gcagggtagcccatcagcccgtgaaagctctggttgcctatgttaggcacccattctcgg   4380
       ............................................................
4381   cacggtcatggttgcaggtggaattggaaagcgaattgtgtgtggctgagacactttagt   4440
       ............................................................
4441   cttccctgaagctggttctctacgtcaagcctgtaggccgttggcaaatgggtgtgccta   4500
       ............................................................
4501   gggacaagtggtgttggactgtgtcctctggagctgtaaggatggagccactcctgtcgg   4560
       ............................................................
4561   tgtctgtgtggttgccttgcagttagatttctctcttctaaactacatgttgaaccttcc   4620
       ............................................................
4621   ttgcttcatctgccttctcagccacacacttttggccataaatactcagtctaccggttg   4680
       ............................................................
4681   gaaagggtatctatttcaagatgggggggtgacatttctcctgtatcgactccttgattc   4740
       ............................................................
4741   ttcactgtggtcttttcaagctgagctatttcttttgcatctgaaatgggatgtggctat   4800
       ............................................................
4801   ggcatcgctagaacacgatttgctttcagaacaaatgtcactttctcatgccatttcccg   4860
       ............................................................
4861   taatgacacagaggaggaggcgttgccccataacatgaggatttcctagaggtctcctga   4920
       ............................................................
4921   gcccacagaaagccagaaaagcactgacagaaaagtctgtcaggacatgtccaccattgg   4980
       ............................................................
4981   tcagaaacccttcttctgtggatccaaatgttccagcccctctccatgcttcagccttgc   5040
       ............................................................
5041   agtttagcgttggtcttcctctgcagtgtcagctcccccagccttgctttggcaaggaag   5100
       ............................................................
5101   aggtgacagtaatcttaccaggggctactctcatcatagtggctgtcaacccgcaagcca   5160
       ............................................................
5161   tccccccaacccccgtgagacttgagaagtatcttgatgaccaaagaggatgatttttct   5220
       ............................................................
5221   cagagaaaggtgccagtgtcgtcctccggagctttgatccaggatggtgtgctcacgtgc   5280
       ............................................................
5281   gcaatgcaattttgtcaccagattgtaatgtgggttttgtctctctctacccttgcctct   5340
       ............................................................
5341   cactgtgtttgtctgagtcacagaactgatttccactgtgtttgtctgaatcacaaagct   5400
       ............................................................
5401   gatttccaaggattgattgggaagaaatagatggatttttatacacgtacaccaaaaata   5460
       ............................................................
5461   ttctgccctaagtaccatggaatgatgcccttgcctcattacttccttgttggtatcatt   5520
       ............................................................
5521   tccttatctctttgattatcttctgggaccagtgtccgctcctccaagcacccacccttt   5580
       ............................................................
5581   gggtgcatcactccattcatggcatgaccagtccatgccatatgactgaggagtggaagt   5640
       ............................................................
5641   gccacctcaacttcagtgatgacagtctgtcatttatgcccaccttaaaatgtagggagc   5700
       ............................................................
5701   ttgtttcagcccccaatttctggagtatatttgttctgtgttatataaaaaaaaaa       5760
       ........................................................