Imprinted Gene Databases

Rattus norvegicus: Cd81

Cd81 molecule

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens CD81 S5.7, TAPA1, TSPAN28  11p15.5  Not Imprinted Biallelic
Bos taurus CD81   29  Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Cd81 Tapa1, Tapa-1, Tspan28  7 69.3 cM  Imprinted Maternal
Sus scrofa CD81   Not Imprinted Biallelic
Rattus norvegicus Cd81 Tapa1  1q41-q42  Imprinted Maternal
1      cggtctataaagagtgaagagctcggcgcgcgcccggtctgagcgagcgcgcccttgctt     60
       ............................................................
61     caaagcggtagcgactctagcgcctccggctaggcctccaacccttctctaccctacgtc    120
       ............................................................
121    tcaatagccgcaccgcagttctccggccctcaagcgacccaggctatcttccagtcccgg    180
       ............................................................
181    actccggtactgcgtccccagaccgcccgctccaggaccaacccaagctccgcaggccgc    240
       ............................................................
241    gcgccgccATGGGGGTGGAAGGCTGCACCAAATGCATCAAATACCTGCTCTTCGTCTTCA    300
       ........M--G--V--E--G--C--T--K--C--I--K--Y--L--L--F--V--F--N
301    ATTTCGTCTTCTGGCTGGCTGGAGGTGTGATCCTAGGTGTAGCTCTGTGGTTGCGCCATG    360
       --F--V--F--W--L--A--G--G--V--I--L--G--V--A--L--W--L--R--H--D
361    ATCCACAAACCACCAGCCTTCTCTACCTGGAACTGGGAGACAAACCAGCACCTAGCACCT    420
       --P--Q--T--T--S--L--L--Y--L--E--L--G--D--K--P--A--P--S--T--F
421    TCTATGTGGGCATCTACATTCTCATTGCTGTGGGAGCTGTGATGATGTTTGTAGGCTTCC    480
       --Y--V--G--I--Y--I--L--I--A--V--G--A--V--M--M--F--V--G--F--L
481    TGGGGTGCTATGGGGCCATCCAGGAGTCCCAGTGCCTGCTGGGGACGTTCTTCACTTGCC    540
       --G--C--Y--G--A--I--Q--E--S--Q--C--L--L--G--T--F--F--T--C--L
541    TTGTGATCCTGTTTGCCTGTGAGGTAGCTGCGGGCATCTGGGGCTTTGTAAACAAAGACC    600
       --V--I--L--F--A--C--E--V--A--A--G--I--W--G--F--V--N--K--D--Q
601    AGATCGCCAAGGATGTGAAGCAGTTCTACGACCAGGCCCTTCAGCAGGCTGTGATGGATG    660
       --I--A--K--D--V--K--Q--F--Y--D--Q--A--L--Q--Q--A--V--M--D--D
661    ATGATGCCAACAATGCCAAGGCAGTGGTGAAGACCTTCCATGAGACGCTCAACTGTTGTG    720
       --D--A--N--N--A--K--A--V--V--K--T--F--H--E--T--L--N--C--C--G
721    GCTCCAATACGCTGACCACACTGACCACCACCGTGCTGAGGAACAGCCTGTGTCCCTCAA    780
       --S--N--T--L--T--T--L--T--T--T--V--L--R--N--S--L--C--P--S--S
781    GCAGCAACTCATTCACTCAGCTTCTGAAGGAAGACTGCCATCAGAAAATCGATGAGCTCT    840
       --S--N--S--F--T--Q--L--L--K--E--D--C--H--Q--K--I--D--E--L--F
841    TTTCTGGGAAGCTGTACCTCATTGGAATTGCAGCCATTGTGGTAGCTGTCATTATGATCT    900
       --S--G--K--L--Y--L--I--G--I--A--A--I--V--V--A--V--I--M--I--F
901    TCGAGATGATTCTGAGCATGGTGCTGTGCTGTGGCATCCGGAACAGCTCCGTGTACTAAg    960
       --E--M--I--L--S--M--V--L--C--C--G--I--R--N--S--S--V--Y--***.
961    gcccttcgcttcgcaccagagggtccctggaatgaccagaggccaccttgggggccatgg   1020
       ............................................................
1021   cctgtgtatatactatttctgtattactctgctacacttagcctttttacttttgagtct   1080
       ............................................................
1081   tttttgttctgaacttttcctgtcaccttttggagccgacaccacacataggtggcgtat   1140
       ............................................................
1141   gtggggacgtagaggtggagctggccctagctggcagggccctgtacttctgggacccct   1200
       ............................................................
1201   ggagagttctgcctgctgagccaaacctcctccatagctacttgtccagaggccacatag   1260
       ............................................................
1261   ccaagctagaaggccatgtccacccactctgcccactgtgggtcacatcgctcccatctt   1320
       ............................................................
1321   tttaatccttgtccctttcctgcctccatttcaagagctgggtttgtaagcactcttatg   1380
       ............................................................
1381   ccttcaatgcacttattctttctaacgtgtcaccttcaactgtaattaaatcttgaaaca   1440
       ............................................................
1441   gtcatttaataaaggaggaaaaaatcaggcatgctaaaaa                       1500
       ........................................