Imprinted Gene Databases

Rattus norvegicus: Ascl2

Achaete-scute family bHLH transcription factor 2

Albert et al, Genome Biol, 24: 48, 2023

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Rattus norvegicus Ascl2   1q41  Imprinted Maternal
Ovis aries ASCL2 SASH2  21  Imprinted Maternal
Mus musculus Ascl2 Mash2, 2410083I15Rik  7 69.3 cM  Imprinted Maternal
Bos taurus ASCL2 MASH2  29  Imprinted Maternal
Sus scrofa ASCL2   Not Imprinted Biallelic
Homo sapiens ASCL2 ASH2, HASH2, MASH2, bHLHa45  11p15.5  Not Imprinted Biallelic
1      gtgcaaccctagggggtcgcgctcttctacctctttggccaccgcaaagcctagtccgtt     60
       ............................................................
61     cttcacccggctgcaagcgctaggtgtacggagacctggcagctcttggggcttaaggac    120
       ............................................................
121    tgagcaccagagccggtggaggttcctgtggagtacattcggaccctctcacagcccccg    180
       ............................................................
181    agagtgcgggacgtgcggagcgcagttcgggatctgcactcgaggacttgtcgaggacgc    240
       ............................................................
241    attaagctaagcatctgctcggagcATGGAATCGCACTTTAACTGGTACGGGGTCCCAAG    300
       .........................M--E--S--H--F--N--W--Y--G--V--P--R-
301    GCTCCAGAAGGCTAGCGACGCGTGCCCTAGGGAATCCTGCAGCAGTGCCCTGCCTGAGGC    360
       -L--Q--K--A--S--D--A--C--P--R--E--S--C--S--S--A--L--P--E--A-
361    CCGTGAAGGTGCGAACGTCCACTTCCCACCGCACCCGGTTCCTCGCGAGCACTTTTCCTG    420
       -R--E--G--A--N--V--H--F--P--P--H--P--V--P--R--E--H--F--S--C-
421    TGGCGCACCGAAACCCGTAGCGGGGGCCCCGGCGCTGAATGCAAGCTTGATGGACGGCGG    480
       -G--A--P--K--P--V--A--G--A--P--A--L--N--A--S--L--M--D--G--G-
481    CGCGCTGCCCAGACTCGTGCCCACCTCGTCTGGAGTCGCTGGAGCCTGCACTGCTCGGCG    540
       -A--L--P--R--L--V--P--T--S--S--G--V--A--G--A--C--T--A--R--R-
541    GAGACCCCCGTCCCCGGAACTGCTTCGCTGCAGCCGACGGCGGCGATCGGGAGCAACGGA    600
       -R--P--P--S--P--E--L--L--R--C--S--R--R--R--R--S--G--A--T--E-
601    GGCCAGCAGCAGCTCGGCGGCCGTGGCACGCCGCAATGAGCGTGAGCGCAACCGCGTAAA    660
       -A--S--S--S--S--A--A--V--A--R--R--N--E--R--E--R--N--R--V--K-
661    GCTGGTAAACTTGGGCTTCCAGGCGCTGCGGCAGCACGTGCCGCACGGCGGCGCCAACAA    720
       -L--V--N--L--G--F--Q--A--L--R--Q--H--V--P--H--G--G--A--N--K-
721    GAAGCTGAGTAAGGTGGAGACGCTGCGCTCCGCGGTAGAGTACATCCGTGCGCTGCAGCG    780
       -K--L--S--K--V--E--T--L--R--S--A--V--E--Y--I--R--A--L--Q--R-
781    GCTGCTAGCAGAGCACGACGCGGTGCGTGCTGCGCTCTCTGGGGGTCTATTAACACCCGC    840
       -L--L--A--E--H--D--A--V--R--A--A--L--S--G--G--L--L--T--P--A-
841    TACTCGGCCGTCCGATGTGTGCACGCAGCCCTCCGCCTCCCCTGCCAGCGCGTCTCTGTC    900
       -T--R--P--S--D--V--C--T--Q--P--S--A--S--P--A--S--A--S--L--S-
901    CTGCACCTCTACATCCCCAGACCGCCTAGGCTGCTCCGAGCCTGCCTCTCCGCGCTCCGC    960
       -C--T--S--T--S--P--D--R--L--G--C--S--E--P--A--S--P--R--S--A-
961    CTACTCGTCGGAGGACAGCAGCTGCGAGGGAGAGACTTACCCGATGGGGCAGATGTTTGA   1020
       -Y--S--S--E--D--S--S--C--E--G--E--T--Y--P--M--G--Q--M--F--D-
1021   CTTTTCCAATTGGTTAGGGGGCTACTGAgcaccccacacccctaagctgcgtccctgggt   1080
       -F--S--N--W--L--G--G--Y--***................................
1081   gtcccctggtggacctacctgcgtttcttgcccaggaaacctgggcccatgccttaccca   1140
       ............................................................
1141   tgctgtctagtgcagcctgaccaaatgccaagtactgacctctgctcggcctccacgccg   1200
       ............................................................
1201   cggaatgacatcttccatctcccagtccttgccgaaccaggacttggaaatttctcagga   1260
       ............................................................
1261   gaaagaattttacaatgacaatctgctttttatcaattaacttgaactgctggaggactc   1320
       ............................................................
1321   tgctgaaaatatgaagaattatttttatacaaaggatccttaagcttggagcacaataaa   1380
       ............................................................
1381   gatgacctctgtctctcacccccactgtctagaactttccaacctggccaaagtgtggac   1440
       ............................................................
1441   gggtcgggccctgagggcaagatgcctggctgcacccttcttcctcttccgaagcctatc   1500
       ............................................................
1501   ctgacgctgatgtttggccagtgtgggaaccctgctattgcaaagtgtactattctataa   1560
       ............................................................
1561   aagttgtttttcattggtg                                            1620
       ...................