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Mus musculus: U2af1-rs1

U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor 1, related sequence 1

Hatada et al. Nucleic Acids Res 21: 5577-5582, 1993; Hayashizaki et al. Nat Genet 6: 33-40, 1994

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus U2af1-rs1 SP2, 35kDa, Irlgs2, D11Ncvs75, U2afbp-rs  11 12.0 cM  Imprinted Paternal
1      gcagatcagacatactgcggataactgcagatacctggatgactgcgcaggcggaccgta     60
       ............................................................
61     ctgcagataaccacccgcaactgcgcaggccggtcggtaaggcagataaccactgttcca    120
       ............................................................
121    gctgtaccatggataaccgggtaactacgtaggctgatcatactacggataaccaggtaa    180
       ............................................................
181    ctgcgcaggccggccatgccacggaggctggccttaaagcggataaccgggtaactgcac    240
       ............................................................
241    aggccagctgtgccatgcataaccagtaactgcataggctggccgtaccacagataacca    300
       ............................................................
301    cggatacctgggtaactgcgcaggcaggccgtactgcggatagccaggtaactgcgcagg    360
       ............................................................
361    ctggctgtaccacggataatcgcggataattggtaactgcggccgccccacagataattg    420
       ............................................................
421    ggtaactgcgcaggcaggccataccacggataactggatagacggataactgcgcaagcc    480
       ............................................................
481    ggccataccggcccggccgggtaactgcatgggcaggcctatgtactgcggataaacgga    540
       ............................................................
541    taaccgggtgactgcccaggcaggccgtactgcggataactggataatcgggtaactgcg    600
       ............................................................
601    cagaccatccgtacctccgaaaactgggtaactgcgcaggcctaccacggataagtgggt    660
       ............................................................
661    aactgcgtgggataactggataatcgggtcactgcgcaggcaggctgtgccacggataac    720
       ............................................................
721    cggacaaccgggtaactgcacggataggctttatcacgggtaactggataaccgggtaat    780
       ............................................................
781    tgcgcaggctggcagtaccacggataaccggataactgcgcaggcaggcctacgtactgc    840
       ............................................................
841    ggataaccgagtgactgcgcaggtaggcggtacagcccacattccaacgcaaacactggc    900
       ............................................................
901    cttcgactgcgcatgcgcacattcaactactggttgctgcattgcgcaaacacgccggtg    960
       ............................................................
961    actcagctggttcaagctttctaggctggtggaaaggaaagtcaactgggctgaatggtg   1020
       ............................................................
1021   ccaccctgaagttgctgtccaggaaggtaacgaacattaaacagcagaacaacttagcag   1080
       ............................................................
1081   cgggcgacattttcaatccacagcgtgagaaaaagagattatcgcgagatccgggaagag   1140
       ............................................................
1141   cccccccccccccccccccccccccccccccccgctctgcggtaaaATGGCATCACGGCA   1200
       ..............................................M--A--S--R--Q-
1201   GACCGCGATTCCTGAGAAACTCAGCCGAAAACAATACAAGGCGGCAATGAAGAAGGAGAA   1260
       -T--A--I--P--E--K--L--S--R--K--Q--Y--K--A--A--M--K--K--E--K-
1261   ACGCAAGAAACGTCGGCAGAAAATGGCTCGGCTGAGAGCTCTGGAAGCCCCACCAGAGGA   1320
       -R--K--K--R--R--Q--K--M--A--R--L--R--A--L--E--A--P--P--E--E-
1321   GGACGATGATGTTTCTGCTAACGAAGAACTTGCAGAGCGATTACTGGAGATAGAGCGGCA   1380
       -D--D--D--V--S--A--N--E--E--L--A--E--R--L--L--E--I--E--R--Q-
1381   AAGATTACATGAAGAGTGGCTGCTGAGGGAGGAGAAGGCGCAAGAAGAATTCAGAATAAA   1440
       -R--L--H--E--E--W--L--L--R--E--E--K--A--Q--E--E--F--R--I--K-
1441   GAAGAAAAAGGAAGAGGCCGCTAGAAAACAGAAGGAAGAACAGGAGAGACAAATAAAGGC   1500
       -K--K--K--E--E--A--A--R--K--Q--K--E--E--Q--E--R--Q--I--K--A-
1501   CGAGTGGGAAGAACAACAGAAAAAACAGAGAGAGGAGGAGGAGCAGAAGCTACAGGAGAA   1560
       -E--W--E--E--Q--Q--K--K--Q--R--E--E--E--E--Q--K--L--Q--E--K-
1561   GAGAGAGAGGGAGGAAGCGGTGCAGAAAATGCTGGACCAGGCTGAAAATGAGCGCATTTG   1620
       -R--E--R--E--E--A--V--Q--K--M--L--D--Q--A--E--N--E--R--I--W-
1621   GCAGAACCCGGAACCACCCAAGGATTTAAGGCTGGAGAAATATCGACCCAGTTGTCCCTT   1680
       -Q--N--P--E--P--P--K--D--L--R--L--E--K--Y--R--P--S--C--P--F-
1681   CTACAATAAAACGGGAGCGTGCAGATTTGGTAACAGATGTTCACGGAAACACGACTTTCC   1740
       -Y--N--K--T--G--A--C--R--F--G--N--R--C--S--R--K--H--D--F--P-
1741   CACGTCAAGTCCCACCCTTCTTGTGAAGAGTATGTTTACAACGTTTGGAATGGAGCAGTG   1800
       -T--S--S--P--T--L--L--V--K--S--M--F--T--T--F--G--M--E--Q--C-
1801   CAGAAGGGATGACTATGACTCAGACGCAAACCTGGAGTACAGTGAGGAGGAGACCTACCA   1860
       -R--R--D--D--Y--D--S--D--A--N--L--E--Y--S--E--E--E--T--Y--Q-
1861   GCAGTTCTTGGATTTCTACCATGACGTGCTGCCGGAGTTCAAGAACGTGGGAAAGGTGAT   1920
       -Q--F--L--D--F--Y--H--D--V--L--P--E--F--K--N--V--G--K--V--I-
1921   TCAGTTCAAAGTAAGCTGCAACCTGGAACCTCATCTGCGGGGCAATGTGTATGTTCAGTA   1980
       -Q--F--K--V--S--C--N--L--E--P--H--L--R--G--N--V--Y--V--Q--Y-
1981   CCAGTCGGAAGAAGAATGCCAAGCAGCCCTCTCTCTCTTTAATGGAAGATGGTACGCAGG   2040
       -Q--S--E--E--E--C--Q--A--A--L--S--L--F--N--G--R--W--Y--A--G-
2041   ACGACAGCTCCAGTGTGAATTCTGTCCAGTGACCCGGTGGAAGGTTGCAATTTGTGGTTT   2100
       -R--Q--L--Q--C--E--F--C--P--V--T--R--W--K--V--A--I--C--G--L-
2101   ATTCGAAATGCAAAAGTGTCCAAAAGGAAAGCACTGCAACTTCCTTCATGTGTTCAGAAA   2160
       -F--E--M--Q--K--C--P--K--G--K--H--C--N--F--L--H--V--F--R--N-
2161   TCCCAACAACGAATTTAGAGAAGCTAACAGAGACATCTACATGTCTCCTCCGGCTTGGAC   2220
       -P--N--N--E--F--R--E--A--N--R--D--I--Y--M--S--P--P--A--W--T-
2221   TGGCTCCTCTGGTAAAAACTCAGACAGGAGGGAAAGGAAGGACCATCATGAGGAATACTA   2280
       -G--S--S--G--K--N--S--D--R--R--E--R--K--D--H--H--E--E--Y--Y-
2281   TAGCAAGTCAAGAAGCTACCACTCTGGTTCATACCACTCCTCCAAGAGAAACAGGGAGTC   2340
       -S--K--S--R--S--Y--H--S--G--S--Y--H--S--S--K--R--N--R--E--S-
2341   CGAGAGGAAGAGTCCTCACAGGTGGAAGAAATCTCACAAACAGACAACGAAGAGTCATGA   2400
       -E--R--K--S--P--H--R--W--K--K--S--H--K--Q--T--T--K--S--H--E-
2401   GAGGCACAGTTCAAGAAGAGGAAGAGAAGAGGACAGCAGTCCAGGTCCACAAAGCCAGAG   2460
       -R--H--S--S--R--R--G--R--E--E--D--S--S--P--G--P--Q--S--Q--S-
2461   CCACAGAACCTGAgcccagctaaggcagcaccacttggacccaagactgatatcaggctt   2520
       -H--R--T--***...............................................
2521   ggcaagggagttcattttacaaatgaacaaaacttcattacagaataaaaacctaacaca   2580
       ............................................................
2581   gtatccttcagattccccaaaatattcaaaacgaaactgattacaaaggaaaggcatggt   2640
       ............................................................
2641   gactccatctaattcccaaccaagttacaaaaccttgtggctttaagaaacagaaacagg   2700
       ............................................................
2701   tattcagtatttctttgtctgttataatgcttataatgctgttataatgcttagtatcat   2760
       ............................................................
2761   gttattgatgttattttccatacagtttaagctggcttcccatgttgttttcctgtaata   2820
       ............................................................
2821   actttacattgtgatgctttgtcattaatatatttattaacatcgtt                2880
       ...............................................