Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Smoc2

SPARC related modular calcium binding 2

Andergassen et al. eLife, 6: e25125. 2017

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Smoc2 Smo, Smoc2l, 1700056C05Rik, 5430426J21Rik  17 8.95 cM  Imprinted Maternal
1      ggggaaactagggctgtttgacagcagcagcggcagttcggggagcgccggccagagcgc     60
       ............................................................
61     acggaggggccgtgcggtctccaccagcggccataggaccgcggagcagttctagcccgc    120
       ............................................................
121    tcgcccgcacgttcgcacaccggatcttcgccgagtgccagggcgcagcgcgtggggcgt    180
       ............................................................
181    ctgcctcgcttggtcccctccagcgtcaccATGCTGCCGCCACAGCTGTGCTGGCTGCCG    240
       ..............................M--L--P--P--Q--L--C--W--L--P--
241    CTGCTCGCTGCCTTGCTGCCGCCGGTGCCCGCGCAGAAGTTCTCAGCGCTCACGTTCTTG    300
       L--L--A--A--L--L--P--P--V--P--A--Q--K--F--S--A--L--T--F--L--
301    AGAGTCGATCAAGACAAAGACAGAGACTGCAGCCTGGACTGCCCAAGCTCCCCTCAGAAG    360
       R--V--D--Q--D--K--D--R--D--C--S--L--D--C--P--S--S--P--Q--K--
361    CCACTCTGTGCCTCGGACGGGAGGACCTTCCTGTCCCGATGTGAGTTCCAGCGGGCCAAG    420
       P--L--C--A--S--D--G--R--T--F--L--S--R--C--E--F--Q--R--A--K--
421    TGCAAAGATCCACAGCTGGAGATCGCTCACCGTGGGAATTGCAAAGATGTGTCCAGGTGT    480
       C--K--D--P--Q--L--E--I--A--H--R--G--N--C--K--D--V--S--R--C--
481    GTGGCTGAGAGGAAGTATACCCAGGAGCAGGCCCGGAAGGAGTTCCAGCAAGTGTTCATT    540
       V--A--E--R--K--Y--T--Q--E--Q--A--R--K--E--F--Q--Q--V--F--I--
541    CCAGAATGCAATGATGACGGCACCTACAGTCAGGTCCAGTGTCACAGCTACACAGGATAC    600
       P--E--C--N--D--D--G--T--Y--S--Q--V--Q--C--H--S--Y--T--G--Y--
601    TGTTGGTGTGTTACACCAAATGGAAGACCCATCAGTGGCACTGCTGTGGCCCACAAGACA    660
       C--W--C--V--T--P--N--G--R--P--I--S--G--T--A--V--A--H--K--T--
661    CCCAGGTGCCCCGGTTCAATAAATGAAAAGGTGCCGCAGCGGGAAGGAGCAGGGAAAGCA    720
       P--R--C--P--G--S--I--N--E--K--V--P--Q--R--E--G--A--G--K--A--
721    GATGATGCTGCAGCCCCAGCATTGGAGACTCAGCCCCAAGGAGATGAAGAAGATATTGCC    780
       D--D--A--A--A--P--A--L--E--T--Q--P--Q--G--D--E--E--D--I--A--
781    TCACGCTACCCTACACTCTGGACCGAGCAAGTTAAGAGTCGGCAGAACAAGACCAATAAA    840
       S--R--Y--P--T--L--W--T--E--Q--V--K--S--R--Q--N--K--T--N--K--
841    AATTCAGCATCCTCCTGTGATCAGGAGCATCAGTCAGCTCTTGAGGAAGCCAAGCAGCCC    900
       N--S--A--S--S--C--D--Q--E--H--Q--S--A--L--E--E--A--K--Q--P--
901    AAGAATGACAATGTAGTGATCCCCGAGTGTGCACATGGTGGTCTCTACAAGCCAGTGCAA    960
       K--N--D--N--V--V--I--P--E--C--A--H--G--G--L--Y--K--P--V--Q--
961    TGCCATCCATCCACCGGATACTGCTGGTGTGTGCTAGTGGACACTGGACGGCCCATTCCC   1020
       C--H--P--S--T--G--Y--C--W--C--V--L--V--D--T--G--R--P--I--P--
1021   GGGACCTCCACAAGGTATGAGCAACCTAAGTGTGACAACACAGCCCGAGCTCACCCAGCG   1080
       G--T--S--T--R--Y--E--Q--P--K--C--D--N--T--A--R--A--H--P--A--
1081   AAGGCCCGGGACCTGTACAAGAACAGGCCACTGCAGGGTTGTCCTGGTGCCAAAAAGCAC   1140
       K--A--R--D--L--Y--K--N--R--P--L--Q--G--C--P--G--A--K--K--H--
1141   GAGTTTCTGACAAGTGTCCTGGATGCGCTCTCCACAGACATGGTTCATGCCGTCTCTGAC   1200
       E--F--L--T--S--V--L--D--A--L--S--T--D--M--V--H--A--V--S--D--
1201   CCCTCTTCCTCTTCTGGCAGGCTGTCAGAGCCAGACCCCAGCCACACCCTGGAGGAGAGG   1260
       P--S--S--S--S--G--R--L--S--E--P--D--P--S--H--T--L--E--E--R--
1261   GTTGTACATTGGTACTTCAAGCTGCTTGATAAGAACTCTAGTGGAGACATTGGCAAGAAG   1320
       V--V--H--W--Y--F--K--L--L--D--K--N--S--S--G--D--I--G--K--K--
1321   GAGATCAAACCCTTTAAGAGGTTCCTGCGAAAGAAATCCAAGCCCAAAAAGTGTGTGAAG   1380
       E--I--K--P--F--K--R--F--L--R--K--K--S--K--P--K--K--C--V--K--
1381   AAGTTTGTGGAGTACTGCGACATGAACAATGACAAGTCCATCACCGTGCAGGAGCTCATG   1440
       K--F--V--E--Y--C--D--M--N--N--D--K--S--I--T--V--Q--E--L--M--
1441   GGCTGCTTGGGTGTCACCAGAGAGGAGGGTAAAGCCAACACCAGGAAGCGCCACACCCCC   1500
       G--C--L--G--V--T--R--E--E--G--K--A--N--T--R--K--R--H--T--P--
1501   AGAGGAAATGCTGAAAGTTCTTCTTCTAATAGACAGCCCAGGAAACAAGGATGAacggct   1560
       R--G--N--A--E--S--S--S--S--N--R--Q--P--R--K--Q--G--***......
1561   gactactcaagacagttcctagacatgtgggaattttccctcaccaaagagcaattaaaa   1620
       ............................................................
1621   acaaaaaacatatagtatttgcactttgtactttaaatgtaaattcactttgtagaaatg   1680
       ............................................................
1681   agatatttaaacggactgttgtgatctgtgaaaacggaaggctggcttcgggaaattaat   1740
       ............................................................
1741   cacatacaatgtatgtgtccttgtttgaccttcaagatctgtgctggtggggtgggtttt   1800
       ............................................................
1801   aaatgcatttcaacttcacttcctcgtccctctgtggagggcctggtttattcccttgcc   1860
       ............................................................
1861   ctttcctctgcctgcagtctccgttggcttgctctccgtgctcttgatgccagccagagc   1920
       ............................................................
1921   ctaccgtatccttagaagcttgcagtggttgcctgtttcataaagttttgctctctagag   1980
       ............................................................
1981   atgtcactcacaccatgggtcacacaggcactagctcaggcatagccttaacttccagta   2040
       ............................................................
2041   gcccctgcttgagactatgctgttaggctccagttttagcttctgcttgagccaacccta   2100
       ............................................................
2101   ctgttaaatccccggggagctgaatggacaagcagccagagagtcctctttcagagagca   2160
       ............................................................
2161   catctaactctggcctgccgactccatctcattggcccaggaaggatccagtctacctgc   2220
       ............................................................
2221   ctcacttctgagtgcctgggccatcctgctagggtccactggaaaggaaaaatgccttct   2280
       ............................................................
2281   acagagatcatggaccacatcctgaggaaggcacagctagactacatcgtcccaagagtg   2340
       ............................................................
2341   ctgaacaacaggcagctgagaatgtcaatttcattttgtggaggcatcgggtttgaggga   2400
       ............................................................
2401   attcacccaaggccactatgggatgaaggttatgaactggatgaccatactgtgagagac   2460
       ............................................................
2461   tgaactagattgggtgtatggctggctgtcactttctgacctaggtcagtctgtactctc   2520
       ............................................................
2521   tgttctcaaggaacagtggcagatgggaggagagctggggcaattctttcagattgtggt   2580
       ............................................................
2581   ttatatgggaaattgttcatggtccccagcctctcaatgtatgtctgtagatgcattgtg   2640
       ............................................................
2641   aacgcatgctgcagaaggcctttgctcatttgaactgtgtagaggcaagaagtgaccggc   2700
       ............................................................
2701   tcatgtcaatgctgtctacaaacgagtatgatcctaactgttttggataatcttttatat   2760
       ............................................................
2761   ttctgaactctgaatttaatcattttattagattaaaatatgcgattaaattgtgtgagt   2820
       ............................................................
2821   cttcttttcagc                                                   2880
       ............