Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Smoc1

SPARC related modular calcium binding 1

Andergassen et al. eLife, 6: e25125. 2017

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SMOC1 OAS  14q24.2  Imprinted Maternal
Mus musculus Smoc1 S, SRG, AI848508, 2600002F22Rik  12  Imprinted Paternal
1      cccgcatccaacctgctgtcgccgcggccacgccgagcgcagcaggcgccacgcgcagag     60
       ............................................................
61     cacacgctcgcactccagctccgggcctccgccgttcatgaccgtgaccccgggcgcagg    120
       ............................................................
121    ctcctccagcccctgccgctggctcttcggccactcccagctgctgcaagggtccccacc    180
       ............................................................
181    tccccaagtgctttgaagctagcctgagcccccctgcccgctgcccgctcgtggctgccc    240
       ............................................................
241    ggctccgctggcaccATGCTGCCCGCGCGCGTCCGTCTGCTCACGCCCCACTTGCTGCTC    300
       ...............M--L--P--A--R--V--R--L--L--T--P--H--L--L--L--
301    GTGTTGGTGCAGCTGTCCCCGGCCGGCGGCCACCGCACCACCGGCCCCAGGTTCCTAATA    360
       V--L--V--Q--L--S--P--A--G--G--H--R--T--T--G--P--R--F--L--I--
361    AGTGACCGTGACCCTCCGTGCAACCCACACTGTCCCAGGACTCAGCCCAAGCCCATCTGC    420
       S--D--R--D--P--P--C--N--P--H--C--P--R--T--Q--P--K--P--I--C--
421    GCCTCTGACGGCAGGTCCTACGAGTCCATGTGTGAGTACCAGAGAGCCAAGTGCCGAGAC    480
       A--S--D--G--R--S--Y--E--S--M--C--E--Y--Q--R--A--K--C--R--D--
481    CCAGCCCTGGCCGTGGTCCATCGAGGTCGATGCAAAGATGCTGGCCAGAGCAAGTGTCGC    540
       P--A--L--A--V--V--H--R--G--R--C--K--D--A--G--Q--S--K--C--R--
541    CTGGAGAGGGCTCAGGCCTTGGAACAGGCCAAGAAGCCTCAGGAGGCTGTGTTTGTCCCA    600
       L--E--R--A--Q--A--L--E--Q--A--K--K--P--Q--E--A--V--F--V--P--
601    GAGTGTGGCGAGGATGGTTCCTTCACACAGGTGCAGTGCCATACGTACACAGGGTACTGC    660
       E--C--G--E--D--G--S--F--T--Q--V--Q--C--H--T--Y--T--G--Y--C--
661    TGGTGTGTCACCCCAGATGGCAAGCCCATCAGTGGTTCTTCCGTGCAGAATAAAACTCCT    720
       W--C--V--T--P--D--G--K--P--I--S--G--S--S--V--Q--N--K--T--P--
721    GTATGTTCAGGTCCAGTTACCGACAAGCCCTTGAGCCAGGGTAATTCAGGAAGAAAAGAT    780
       V--C--S--G--P--V--T--D--K--P--L--S--Q--G--N--S--G--R--K--D--
781    GATGGCTCTAAACCCACGCCCACGATGGAGACCCAACCTGTGTTCGATGGAGATGAAATC    840
       D--G--S--K--P--T--P--T--M--E--T--Q--P--V--F--D--G--D--E--I--
841    ACAGCCCCCACCTTATGGATTAAGCACTTGGTAATCAAAGACTCCAAGTTGAATAACACC    900
       T--A--P--T--L--W--I--K--H--L--V--I--K--D--S--K--L--N--N--T--
901    AACGTAAGAAATTCAGAGAAAGTCCATTCCTGTGACCAGGAAAGACAGAGTGCCCTGGAA    960
       N--V--R--N--S--E--K--V--H--S--C--D--Q--E--R--Q--S--A--L--E--
961    GAGGCGCGGCAGAATCCCCGAGAGGGCATTGTGATCCCCGAGTGTGCTCCTGGTGGGCTC   1020
       E--A--R--Q--N--P--R--E--G--I--V--I--P--E--C--A--P--G--G--L--
1021   TATAAGCCGGTGCAATGCCACCAATCCACAGGCTACTGTTGGTGCGTCCTAGTAGACACA   1080
       Y--K--P--V--Q--C--H--Q--S--T--G--Y--C--W--C--V--L--V--D--T--
1081   GGGCGCCCATTGCCGGGGACTTCCACACGCTATGTGATGCCAAGTTGCGAGAGTGACGCC   1140
       G--R--P--L--P--G--T--S--T--R--Y--V--M--P--S--C--E--S--D--A--
1141   AGAGCCAAGAGCATAGAGGCCGATGACCCTTTCAAGGACAGGGAGTTGCCAGGTTGTCCT   1200
       R--A--K--S--I--E--A--D--D--P--F--K--D--R--E--L--P--G--C--P--
1201   GAAGGGAAGAAGATGGAATTTATTACCAGCCTGCTGGATGCCCTCACCACAGACATGGTT   1260
       E--G--K--K--M--E--F--I--T--S--L--L--D--A--L--T--T--D--M--V--
1261   CAGGCCATTAACTCAGCAGCGCCCACTGGAGGTGGGAGGTTCTCAGAGCCAGACCCCAGC   1320
       Q--A--I--N--S--A--A--P--T--G--G--G--R--F--S--E--P--D--P--S--
1321   CACACCCTGGAGGAGCGAGTGGCACACTGGTACTTCAGCCAGCTGGATAGCAACAGCAGC   1380
       H--T--L--E--E--R--V--A--H--W--Y--F--S--Q--L--D--S--N--S--S--
1381   GATGACATTAACAAGCGGGAGATGAAGCCGTTCAAGCGCTATGTAAAGAAGAAAGCCAAG   1440
       D--D--I--N--K--R--E--M--K--P--F--K--R--Y--V--K--K--K--A--K--
1441   CCCAAGAAATGTGCCCGGCGCTTCACCGACTACTGCGACCTGAACAAGGATAAGGTCATC   1500
       P--K--K--C--A--R--R--F--T--D--Y--C--D--L--N--K--D--K--V--I--
1501   TCACTGCCTGAGCTGAAGGGCTGCCTGGGTGTTAGCAAAGAAGGTGGTAGCCTTGGCAGC   1560
       S--L--P--E--L--K--G--C--L--G--V--S--K--E--G--G--S--L--G--S--
1561   TTCCCTCAGGGAAAACGAGCAGGCACAAACCCGTTCATCGGACGCCTTGTCTAAagagtg   1620
       F--P--Q--G--K--R--A--G--T--N--P--F--I--G--R--L--V--***......
1621   gaaaaagcaaaaggcccatggaaactccgaggagacaggactgaccgtcagacacctaac   1680
       ............................................................
1681   cctcagcgctgcccgtggcccagccacagtctgtgtaacataagtggtgcccgccatgtt   1740
       ............................................................
1741   tgcacttttaataactcttacgtgtgtggtttgtttctggttccatttgtaaacaccaat   1800
       ............................................................
1801   tatctaataccatagcaggaacaggaaagggaagaaaagctgtttattctctcttttatt   1860
       ............................................................
1861   gttaaggttttttggatctgctactgacatcttttaggttggggggggcgagggacgggg   1920
       ............................................................
1921   tcgagaagaaagagatttatatactgtatataaatatatatgtaaattgtatagatcttt   1980
       ............................................................
1981   tgtacaggcatcgacatcgctgtttgtccctcccttctacttcctctggactcccagtcc   2040
       ............................................................
2041   aggtctctccttagcttccccaagtttcactgtatatggactctgagagaatagatggga   2100
       ............................................................
2101   gccctgtgcttgtgctgtggatagcatgttttcttctggtgggaagagggtactggtcca   2160
       ............................................................
2161   ttagctgtcaaagtccagtcacttggccattggctgggtaggaggggagcccagttcctg   2220
       ............................................................
2221   tgctggccagcatggatttcagatctccggtggcccacatgtccatgctatccagatccc   2280
       ............................................................
2281   ttggcagtctacagtgaataatggagcaatctctacctgaaggggctggatttggctgct   2340
       ............................................................
2341   ttaaacatctctacccatgtttagcatgtcccccgtgtaggacatgagaggtgagacccc   2400
       ............................................................
2401   aagcatgtgaggaaaaggacacccagcaccagcagggttctcctgcagcagcaggtgttg   2460
       ............................................................
2461   ggcatctgaggagatggtgaagaggactgaagacctgaaccagcccttctgcaaacccac   2520
       ............................................................
2521   aagagagcctccacaagcatgtagctcccaacactagagtccaactaggttttactttcg   2580
       ............................................................
2581   tgctctccctccatctcttggatcctcaccgattgggtcagccaccttgttggccaatcc   2640
       ............................................................
2641   cggagttgctcttattcctctggcttttctcatggacttccagaattgttgaattgacgt   2700
       ............................................................
2701   ggcgtcccttacttctgcttcctcagaggaataggagcgatgatccagctatagggaact   2760
       ............................................................
2761   ctaggcttttgcacagagtgtcaccggaattgcaccagggcagatgagcaactttttctg   2820
       ............................................................
2821   tctaggtgacatgctgattcagaggtccttcagtcagagcagcaagtgatacttagcagc   2880
       ............................................................
2881   tcttccatggtcagccatgatggcagtgagggaggccaggactggttcttttgctggctt   2940
       ............................................................
2941   gctctcctcaacctgccttccctgggtttccatctcagtatcctgtaaatgcatccaccc   3000
       ............................................................
3001   tggtaaaccctgctctattttgggtctggaaggcatggaccacataatgctgcccacatg   3060
       ............................................................
3061   tggggaacatagccttctcggagcttgattcgatgaagtctcagctccagaaggttcccg   3120
       ............................................................
3121   ctgtcctggtggaagtcacacatgctgtcccatgatgaccagtaaccctgtcctgcatgg   3180
       ............................................................
3181   taaggtgggaagaacaccttctcttggagccttgaacagaaacaccgcacgcagcaggct   3240
       ............................................................
3241   ggagctggatggccctcccagcagactccagtcccatttcctggccagaaggaaatgtgc   3300
       ............................................................
3301   acagagaagccacctttatgtaggagtttagaatctgaccagccaacttctctctcacag   3360
       ............................................................
3361   atgggcgtaggctgtgctgtgtggttttcccttggggaggcgggagcaagaaaaagtatt   3420
       ............................................................
3421   tgtagcttgttttataaaaaataaaaatgggtaaacttgggca                    3480
       ...........................................