Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Slc38a4

Solute carrier family 38, member 4

Mizuno et al. Biochem Biophys Res Commun, 290: 1499-505, 2002; Smith et al. Genome Res, 13: 558–569, 2003

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SLC38A4 ATA3, NAT3, PAAT, FLJ10191, MGC126876  12q13  Unknown Unknown
Mus musculus Slc38a4 At, SN, Ata3, SNAT4, mATA3, mNAT3, 1110012E16Rik, 1700012A18Rik  15  Imprinted Paternal
Rattus norvegicus Slc38a4 Ata3  7q35  Imprinted Paternal
Sus scrofa SLC38A4   Imprinted Isoform Dependent
Bos taurus SLC38A4 Ata3  Not Imprinted Biallelic
1      actctttgggaagccaatagagaagacggaagggtctcccggtctaacccttgccgccac     60
       ............................................................
61     atccattggattccaacccgaagagggtagacagaaaggcgggaaagggctgtgaggtca    120
       ............................................................
121    aATGGACCCCATGGAACTGAACAACGTCAGCATCGAACCCGACGGAGACAGCTGCAGCGG    180
       .M--D--P--M--E--L--N--N--V--S--I--E--P--D--G--D--S--C--S--G-
181    GGACAGTATTCAGGACAGCTACACCGGCATGGAAAACTCCGACAAGGACGCCATGAACAG    240
       -D--S--I--Q--D--S--Y--T--G--M--E--N--S--D--K--D--A--M--N--S-
241    CCAATTTGCTAATGAAGATGCCGAAAGTCAGAAGTTCCTGACAAATGGGTTTTTAGGGAA    300
       -Q--F--A--N--E--D--A--E--S--Q--K--F--L--T--N--G--F--L--G--K-
301    GAAGAAGCTAGCCGATTACGCGGATGAGCATCACCCTGGAATGACTTCCTTTGGAATGTC    360
       -K--K--L--A--D--Y--A--D--E--H--H--P--G--M--T--S--F--G--M--S-
361    CTCATTTAACCTGAGCAACGCCATCATGGGCAGTGGGATCTTAGGCTTGTCCTATGCCAT    420
       -S--F--N--L--S--N--A--I--M--G--S--G--I--L--G--L--S--Y--A--M-
421    GGCCAACACCGGGATCATCCTTTTTATAATCATGCTGCTTACTGTGGCAATACTCTCGCT    480
       -A--N--T--G--I--I--L--F--I--I--M--L--L--T--V--A--I--L--S--L-
481    CTACTCGGTTCACCTTTTGCTGAAGACAGCCAAGGAAGGAGGGTCTCTAATCTATGAAAA    540
       -Y--S--V--H--L--L--L--K--T--A--K--E--G--G--S--L--I--Y--E--K-
541    ATTGGGCGAGAAAGCATTTGGATGGCCTGGGAAAATTGGAGCCTTCATCTCTATTACAAT    600
       -L--G--E--K--A--F--G--W--P--G--K--I--G--A--F--I--S--I--T--M-
601    GCAGAACATTGGAGCCATGTCAAGCTACCTCTTCATCATTAAGTACGAACTGCCTGAAGT    660
       -Q--N--I--G--A--M--S--S--Y--L--F--I--I--K--Y--E--L--P--E--V-
661    AATCAGAGCATTCATGGGACTTGAAGAAAACACTGGGGAATGGTACCTCAACGGCAACTA    720
       -I--R--A--F--M--G--L--E--E--N--T--G--E--W--Y--L--N--G--N--Y-
721    CCTCGTCTTATTTGTGTCCGTGGGGATCATCCTCCCGCTCTCTCTCCTTAAAAATTTAGG    780
       -L--V--L--F--V--S--V--G--I--I--L--P--L--S--L--L--K--N--L--G-
781    CTACCTTGGCTACACCAGTGGATTTTCTCTCTCCTGCATGGTGTTTTTCGTCAGTGTGGT    840
       -Y--L--G--Y--T--S--G--F--S--L--S--C--M--V--F--F--V--S--V--V-
841    GATTTACAAAAAATTCCAAATTCCCTGCCCTCTGCCTGCTCTGGATCACAACAACGGAAA    900
       -I--Y--K--K--F--Q--I--P--C--P--L--P--A--L--D--H--N--N--G--N-
901    TCTGACGTTCAACAACACACTTCCGATTCACATGATCTCGCTGCCTAATGACTCGGAGAG    960
       -L--T--F--N--N--T--L--P--I--H--M--I--S--L--P--N--D--S--E--S-
961    CTCGGGTGTGAACTTCATGATGGATTACGCTCACCACAACCCAGCTGGGCTGGATGAGAA   1020
       -S--G--V--N--F--M--M--D--Y--A--H--H--N--P--A--G--L--D--E--K-
1021   GCAGGTCGCAGGCCCTCTTCACAGCAATGGCGTGGAGTACGAAGCCCAGGGTGCTGAGAA   1080
       -Q--V--A--G--P--L--H--S--N--G--V--E--Y--E--A--Q--G--A--E--K-
1081   ATGCCAACCAAAATACTTTGTGTTCAATTCCCGGACGGCCTATGCAATCCCAATCCTGGC   1140
       -C--Q--P--K--Y--F--V--F--N--S--R--T--A--Y--A--I--P--I--L--A-
1141   TTTTGCTTTTGTCTGCCACCCTGAGGTCCTTCCCATCTACAGCGAGCTTAAAGATCGATC   1200
       -F--A--F--V--C--H--P--E--V--L--P--I--Y--S--E--L--K--D--R--S-
1201   CCGCAGAAAGATGCAGACGGTGTCCAACATTTCCATCTCAGGCATGCTCGTCATGTACCT   1260
       -R--R--K--M--Q--T--V--S--N--I--S--I--S--G--M--L--V--M--Y--L-
1261   TCTTGCGGCCCTCTTTGGTTATCTGAGCTTCTACGGGGACGTTGAAGACGAGCTGCTGCA   1320
       -L--A--A--L--F--G--Y--L--S--F--Y--G--D--V--E--D--E--L--L--H-
1321   TGCTTACAGCAAGGTCTACACATTTGATACGGCTCTTCTCATGGTGCGCCTGGCAGTCCT   1380
       -A--Y--S--K--V--Y--T--F--D--T--A--L--L--M--V--R--L--A--V--L-
1381   GGTGGCAGTGACACTGACCGTGCCCATCGTGCTGTTCCCGATCCGTACTTCGGTGATCAC   1440
       -V--A--V--T--L--T--V--P--I--V--L--F--P--I--R--T--S--V--I--T-
1441   ACTGCTGTTTCCAAGGAAACCCTTCAGCTGGCTGAAGCATTTCGGGATCGCTGCAATCAT   1500
       -L--L--F--P--R--K--P--F--S--W--L--K--H--F--G--I--A--A--I--I-
1501   CATCGCACTCAACAACATCCTGGTCATCCTCGTGCCTACCATCAAATACATCTTTGGATT   1560
       -I--A--L--N--N--I--L--V--I--L--V--P--T--I--K--Y--I--F--G--F-
1561   CATAGGGGCTTCTTCTGCCACTATGCTGATTTTCATTCTTCCGGCTGCGTTTTATCTCAA   1620
       -I--G--A--S--S--A--T--M--L--I--F--I--L--P--A--A--F--Y--L--K-
1621   GCTCGTCAAGAAAGAACCTCTAAGATCACCCCAGAAGATTGGGGCTTTGGTCTTCCTTGT   1680
       -L--V--K--K--E--P--L--R--S--P--Q--K--I--G--A--L--V--F--L--V-
1681   GACTGGAATTATTTTCATGATGGGAAGCATGGCGCTCATTATACTCGACTGGATCTACAA   1740
       -T--G--I--I--F--M--M--G--S--M--A--L--I--I--L--D--W--I--Y--N-
1741   CCCGCCGAATCCCAATCACCACTAAtcccggggagacgcgtctccactggaaacagctga   1800
       -P--P--N--P--N--H--H--***...................................
1801   aattgtctgaaggacattttagttgtcttgattgggatgttagtctgaggaattagcaag   1860
       ............................................................
1861   attccaaagacgtttttctagctctatcatgggatacttgtggaagagaaaattatgggt   1920
       ............................................................
1921   tttgttgggaatggttttgttgggaatggtgaaggatgcattaaaaattctgtggcacac   1980
       ............................................................
1981   attttaacccaggccgtgcagtgcagtgtgtgatgcccgagttgtgtttgcagcagctgt   2040
       ............................................................
2041   gcaagctgaagcctgttggctgcgtgtgttggtcagcagacaatagcctgtccccccatg   2100
       ............................................................
2101   gtcactccacttctctccacccccagattaacaggtaattctactctcagaacatcagac   2160
       ............................................................
2161   aaagacctcctggttggcgaagctatcatcagttacggccatctctcactctacaccaac   2220
       ............................................................
2221   actaagggtcggttgactagctgaggcagggggatatcttgggagctgtccctgtgagga   2280
       ............................................................
2281   tcatgaatgacggttgccagtatagagtacttcatttcaatactcaaggaatagtttgcc   2340
       ............................................................
2341   caacctgcttattacaccgagttagtgaattttcattctttttattttttggtatggcaa   2400
       ............................................................
2401   atgttcaaacatctcactaaacatagaggggggttatttagtttatcatgaaacaactac   2460
       ............................................................
2461   caaaaagtaatggtttttaacatctgccttttcatgttgtttctgatatctttgttccac   2520
       ............................................................
2521   tttgtctttgaacaaggcttcccctctcgtcttccgttctcactcttcgtaattttcaga   2580
       ............................................................
2581   agaccacagtccgtgtggagacacactacccagtattgtttgatacatctctatttgata   2640
       ............................................................
2641   aacattcagtgcaggaaactgtgattttgctatatgtttgtgtacataatctcattctgc   2700
       ............................................................
2701   agttatcagaacgttgacatatgggacattggatttttattttttacatatgtaggtttt   2760
       ............................................................
2761   tttttcttcacagacaaaatgtttatatcatcagggtggggcagggaattaagctggtgg   2820
       ............................................................
2821   gctcaaaaatccatgggtacttatctgtccattggagacatctaaaaattaaagtcaaag   2880
       ............................................................
2881   ttgtgcatagttcagtaatgctcttcactgtttacaagactataatcatctcagcaaagt   2940
       ............................................................
2941   agcgaaggaagggtttgtaaataattttcagtgctaacaatggtctttgaatttaacatg   3000
       ............................................................
3001   tctagaatagggtttagttcattttagtttacatcggaacttggtgacattcatttgcca   3060
       ............................................................
3061   ttaatagaacatcgtgtggttaggaataaatgcaccaacatgacccaaaaccacattgct   3120
       ............................................................
3121   cacatccatggacgcttacacgggatggagttcagactccgcccactgcctagaatctct   3180
       ............................................................
3181   ggcattgacttctttttttcaattactggttgtatattttacatttcagtaaaaagccaa   3240
       ............................................................
3241   gtctgaaatgcaagtatcctacaggtagtgatagtactgtcacaccaaagcagtttttca   3300
       ............................................................
3301   acagtgtgcctaagaaacatatatttgtttactgtgtcattttctggaccttaagactat   3360
       ............................................................
3361   acaatggtgtgctttgtgatagaaattgagcattactagaaactaccataacttcggagt   3420
       ............................................................
3421   tattatcatttgggagggaaaaaaatcaccaaataggatctttaagatgtctttctattt   3480
       ............................................................
3481   tcattcatccaagaaataaatcaagatagaaagcagaaagggtgtgctgcaaatattaaa   3540
       ............................................................
3541   tatattttatctgaacatattaaatgtgaatataaaagattaatccaaaaatattggaaa   3600
       ............................................................
3601   cctgtgaaatctgtacgtatttcgaatctttacacttagagcagctaacctggaagtatc   3660
       ............................................................
3661   cacttgtgtagttagatattcaagagcaatatcacagtgccaaagacttcattcacacag   3720
       ............................................................
3721   caccgatcatttgtgtggccgttttcaggattagagttcacacagactccagggcagata   3780
       ............................................................
3781   ctcagaataccgttttctggtaaatttaacccatttgtaaacagatacaaattttatttt   3840
       ............................................................
3841   cttacatcatttataagacggttcaatgtactggggggattttttttattacagactgtg   3900
       ............................................................
3901   tattggtatataataaataaacttttcaaatg                               3960
       ................................