Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Sgce

Sarcoglycan, epsilon

Piras et al. Mol Cell Biol 20: 3308-3315, 2000; Monk et al. Genome Res 18: 1270-1281, 2008

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Equus caballus SGCE   Imprinted Paternal
Homo sapiens SGCE ESG, DYT11  7q21-q22  Imprinted Paternal
Sus scrofa SGCE   Imprinted Paternal
Bos taurus SGCE   Imprinted Paternal
Rattus norvegicus Sgce   4q21  Imprinted Paternal
Macropus eugenii SGCE     Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Sgce e-SG  6 1.0 cM  Imprinted Paternal
1      ccacgcgtcgggcaggccaagaatgctattattctggtggtgggagctgggagacccttg     60
       ............................................................
61     tgcttggacgggaaagggtcgggggacactcaagATGAGCCCCGCGACCACTGGCACATT    120
       ..................................M--S--P--A--T--T--G--T--F-
121    CTTACTGACAGTGTACACTCTTTTCTCCAAGGTGCACTCTGACCGGAACGTGTACCCATC    180
       -L--L--T--V--Y--T--L--F--S--K--V--H--S--D--R--N--V--Y--P--S-
181    TGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTGTTGGAGAGAGAGTATTTTAAGGGTGAATTTCCACC    240
       -A--G--V--L--F--V--H--V--L--E--R--E--Y--F--K--G--E--F--P--P-
241    TTATCCAAAGCCTGGGGAGGTTAGTAATGATCCCATAACATTTAACACAAATTTAATGGG    300
       -Y--P--K--P--G--E--V--S--N--D--P--I--T--F--N--T--N--L--M--G-
301    CTACCCAGATAGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACCCCGTACAGTGATGGAGT    360
       -Y--P--D--R--P--G--W--L--R--Y--I--Q--R--T--P--Y--S--D--G--V-
361    CCTGTATGGGTCTCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAACCAACTATTATTGAGATAACTGC    420
       -L--Y--G--S--P--T--A--E--N--V--G--K--P--T--I--I--E--I--T--A-
421    CTACAATAGACGTACCTTTGAGACTGCAAGGCATAACTTGATAATTAATATAATGTCAGC    480
       -Y--N--R--R--T--F--E--T--A--R--H--N--L--I--I--N--I--M--S--A-
481    AGAAGAATTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATCAAAAATATGAATGTGGAAGA    540
       -E--E--F--P--L--P--Y--Q--A--E--F--F--I--K--N--M--N--V--E--E-
541    AATGTTGGCCAGCGAGGTTCTTGGAGACTTTCTCGGGGCTGTAAAAAATGTGTGGCAGCC    600
       -M--L--A--S--E--V--L--G--D--F--L--G--A--V--K--N--V--W--Q--P-
601    AGAGCGCCTCAACGCCATAAACATCACGTCAGCCCTGGACAGGGGTGGCAGAGTGCCGCT    660
       -E--R--L--N--A--I--N--I--T--S--A--L--D--R--G--G--R--V--P--L-
661    TCCTATTAATGACATGAAGGAGGGTGTTTATGTCATGGTTGGTGCCGATGTTGCATTTTC    720
       -P--I--N--D--M--K--E--G--V--Y--V--M--V--G--A--D--V--A--F--S-
721    TTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAGTTAAGATGCAGTCAAGAAATGGA    780
       -S--C--L--R--E--V--E--N--P--Q--N--Q--L--R--C--S--Q--E--M--E-
781    GCCTGTGATAACATGCGACAAAAAGTTCCGAACTCACTTTCATATCGACTGGTGCAAGAT    840
       -P--V--I--T--C--D--K--K--F--R--T--H--F--H--I--D--W--C--K--I-
841    TTCACTGGTTGACAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTAGTTCGTGGCGAGGG    900
       -S--L--V--D--K--T--K--Q--V--S--T--Y--Q--E--V--V--R--G--E--G-
901    CATTTTGCCCGACGGCGGGGAGTACAAGCCCCCTTCGGATTCTTTGAAAAGCCGAGACTA    960
       -I--L--P--D--G--G--E--Y--K--P--P--S--D--S--L--K--S--R--D--Y-
961    TTACACGGATTTCCTCGTTACCCTGGCTGTGCCCTCGGCGGTAGCACTGGTGCTTTTCCT   1020
       -Y--T--D--F--L--V--T--L--A--V--P--S--A--V--A--L--V--L--F--L-
1021   AATACTCGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGAGTGGAAAAGAGAGACATGCAAAC   1080
       -I--L--A--Y--I--M--C--C--R--R--E--G--V--E--K--R--D--M--Q--T-
1081   CCCAGATATCCAGCTTGTCCATCACAGCTCGATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGA   1140
       -P--D--I--Q--L--V--H--H--S--S--I--Q--K--S--T--K--E--L--R--D-
1141   CATGTCCAAAAACAGAGAGATTGCATGGCCCCTGTCTACCCTGCCTGTGTTCCACCCTGT   1200
       -M--S--K--N--R--E--I--A--W--P--L--S--T--L--P--V--F--H--P--V-
1201   AACTGGGGAGGTTATACCTCCCATGCACACAGACAACTACGACAGCACCAACATGCCGTT   1260
       -T--G--E--V--I--P--P--M--H--T--D--N--Y--D--S--T--N--M--P--L-
1261   GATGCAGGCACAGCAGAACTTGCCACACCAGACTCAGATCCCTCAACCGCAGACTACAGG   1320
       -M--Q--A--Q--Q--N--L--P--H--Q--T--Q--I--P--Q--P--Q--T--T--G-
1321   TAAATGGTATCCCTGAagaaagaaagctgacagaagcaatgagtttataatcagcactgc   1380
       -K--W--Y--P--***............................................
1381   tgcagccgtgtctcacccctttcccttccaataatgcatgagctttcctgacatcggtta   1440
       ............................................................
1441   cgcatgcccactgtgttgagaaccaaataccatgacacatctctcacttactaatgcatt   1500
       ............................................................
1501   ttttttgtacttaaagcatttttgaaaatttataagacatcaacgactttatatttgtta   1560
       ............................................................
1561   caataaaaagtgaactttaaaataaatattaatggagcctaaaaaaaaaaaaaaaa       1620
       ........................................................