Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Prkn

Parkin RBR E3 ubiquitin protein ligase

Andergassen et al. eLife, 6: e25125. 2017

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Prkn P, Pa, Park2  17 7.8 cM  Imprinted Maternal
1      gcgaggggaagggggaggaggcctggatgactaaacctgacagaaacgctggtgggaggc     60
       ............................................................
61     tcgggcgggcgccagtgcccgcgtaggtccttctcgacccgcagccaccacccgcccggt    120
       ............................................................
121    gaccATGATAGTGTTTGTCAGGTTCAACTCCAGCTATGGCTTCCCAGTGGAGGTCGATTC    180
       ....M--I--V--F--V--R--F--N--S--S--Y--G--F--P--V--E--V--D--S-
181    TGACACCAGCATCTTGCAGCTCAAGGAAGTGGTTGCTAAGCGACAGGGGGTTCCAGCTGA    240
       -D--T--S--I--L--Q--L--K--E--V--V--A--K--R--Q--G--V--P--A--D-
241    CCAGCTGCGTGTGATTTTTGCCGGGAAGGAGCTTCCGAATCACCTGACGGTTCAAAACTG    300
       -Q--L--R--V--I--F--A--G--K--E--L--P--N--H--L--T--V--Q--N--C-
301    TGACCTGGAACAACAGAGTATTGTACACATAGTACAGAGACCACGGAGGAGAAGTCATGA    360
       -D--L--E--Q--Q--S--I--V--H--I--V--Q--R--P--R--R--R--S--H--E-
361    AACAAATGCATCTGGAGGGGACGAACCCCAGAGCACCTCAGAGGGCTCCATATGGGAGTC    420
       -T--N--A--S--G--G--D--E--P--Q--S--T--S--E--G--S--I--W--E--S-
421    CAGGAGCTTGACACGAGTGGACCTGAGCAGCCATACCCTGCCGGTGGACTCTGTGGGGCT    480
       -R--S--L--T--R--V--D--L--S--S--H--T--L--P--V--D--S--V--G--L-
481    GGCGGTCATTCTGGACACAGACAGTAAGAGGGATTCAGAAGCAGCCAGAGGTCCAGTTAA    540
       -A--V--I--L--D--T--D--S--K--R--D--S--E--A--A--R--G--P--V--K-
541    ACCCACCTACAACAGCTTTTTCATCTACTGCAAAGGCCCCTGCCACAAGGTCCAGCCTGG    600
       -P--T--Y--N--S--F--F--I--Y--C--K--G--P--C--H--K--V--Q--P--G-
601    AAAGCTCCGAGTTCAGTGTGGCACCTGCAAACAAGCAACCCTCACCTTGGCCCAGGGCCC    660
       -K--L--R--V--Q--C--G--T--C--K--Q--A--T--L--T--L--A--Q--G--P-
661    ATCTTGCTGGGACGATGTCTTAATTCCAAACCGGATGAGTGGTGAGTGCCAGTCTCCAGA    720
       -S--C--W--D--D--V--L--I--P--N--R--M--S--G--E--C--Q--S--P--D-
721    CTGCCCTGGAACCAGAGCTGAATTTTTCTTTAAATGTGGAGCACACCCAACCTCAGACAA    780
       -C--P--G--T--R--A--E--F--F--F--K--C--G--A--H--P--T--S--D--K-
781    GGACACGTCGGTAGCTTTGAACCTGATCACCAGCAACAGGCGCAGCATCCCTTGCATAGC    840
       -D--T--S--V--A--L--N--L--I--T--S--N--R--R--S--I--P--C--I--A-
841    GTGCACAGATGTCAGGAGCCCTGTCCTGGTCTTCCAGTGTAACCACCGTCACGTGATCTG    900
       -C--T--D--V--R--S--P--V--L--V--F--Q--C--N--H--R--H--V--I--C-
901    TTTGGACTGTTTCCACTTGTATTGTGTCACAAGACTCAACGATCGGCAGTTTGTCCACGA    960
       -L--D--C--F--H--L--Y--C--V--T--R--L--N--D--R--Q--F--V--H--D-
961    TGCTCAACTTGGCTACTCCCTGCCGTGTGTAGCTGGCTGTCCCAACTCCCTGATTAAAGA   1020
       -A--Q--L--G--Y--S--L--P--C--V--A--G--C--P--N--S--L--I--K--E-
1021   GCTCCATCACTTCAGGATCCTTGGAGAAGAGCAGTACACTAGGTACCAGCAGTATGGGGC   1080
       -L--H--H--F--R--I--L--G--E--E--Q--Y--T--R--Y--Q--Q--Y--G--A-
1081   CGAGGAATGCGTGCTGCAAATGGGAGGTGTGCTGTGCCCCCGTCCTGGCTGTGGAGCTGG   1140
       -E--E--C--V--L--Q--M--G--G--V--L--C--P--R--P--G--C--G--A--G-
1141   ACTGCTACCTGAACAGGGCCAGAGGAAAGTCACCTGCGAAGGGGGCAACGGCCTGGGCTG   1200
       -L--L--P--E--Q--G--Q--R--K--V--T--C--E--G--G--N--G--L--G--C-
1201   CGGGTTTGTTTTCTGCCGGGACTGTAAGGAAGCATACCATGAAGGGGATTGCGACTCACT   1260
       -G--F--V--F--C--R--D--C--K--E--A--Y--H--E--G--D--C--D--S--L-
1261   GCTCGAACCCTCAGGAGCCACTTCTCAGGCCTACAGGGTGGACAAAAGAGCCGCTGAGCA   1320
       -L--E--P--S--G--A--T--S--Q--A--Y--R--V--D--K--R--A--A--E--Q-
1321   AGCTCGCTGGGAGGAGGCCTCCAAGGAAACCATCAAGAAGACCACCAAGCCTTGTCCTCG   1380
       -A--R--W--E--E--A--S--K--E--T--I--K--K--T--T--K--P--C--P--R-
1381   CTGCAACGTGCCAATTGAAAAAAACGGAGGATGTATGCACATGAAGTGTCCTCAGCCCCA   1440
       -C--N--V--P--I--E--K--N--G--G--C--M--H--M--K--C--P--Q--P--Q-
1441   GTGCAAGCTGGAGTGGTGCTGGAACTGTGGCTGTGAGTGGAACCGAGCCTGCATGGGAGA   1500
       -C--K--L--E--W--C--W--N--C--G--C--E--W--N--R--A--C--M--G--D-
1501   TCACTGGTTTGACGTGTAGagagagatgtcacttggccctggacgcacaacctcaaggga   1560
       -H--W--F--D--V--***.........................................
1561   aactccgaagattcctaccttccttagccatttcttcttctcgatgcatataagcacata   1620
       ............................................................
1621   aatgcgcacacacaaacacaggctgcagattacagaagcagcccctagatcctttccagg   1680
       ............................................................
1681   gcacccacagaaaaccacagcacccgctggccccagggggaggaggcactttcagcctct   1740
       ............................................................
1741   ggctcactcgaatgtcagagcttagatgagggtgcacctttggtttggattctgtagaag   1800
       ............................................................
1801   ccatgagtgaggtgggaagtgttttccagggttgttgccacgccctgggtaagtaacacc   1860
       ............................................................
1861   tctgaggattctcagaagcacacttgagatctgaggaacgctgctctcatgtagtaatca   1920
       ............................................................
1921   tctattcccaaagggccccctgcagtagtcaaaactatttgtttatccccccaaatccta   1980
       ............................................................
1981   tctttacaaatggtgctgatgagattacaacccctctgtgtactaatcagcttatcaacc   2040
       ............................................................
2041   aagtgagaacctaggaaagctaattggatggcagactgcttaaatcgcagggaggactca   2100
       ............................................................
2101   gaagccaaacctacttccgttcgtttcattatctgcaactttagaaagaaatgatctttt   2160
       ............................................................
2161   tttccccctgaaaagataacaaagtctgcaatttggtttggagtattcctactgcagcct   2220
       ............................................................
2221   ggaagtttagcttcactgtgaatttaacagagaaagtgcctataaagggggcgtttttaa   2280
       ............................................................
2281   gagacaatcccatgatgctgcgccaatgctaacaacagggtcaagaaacacaatgtttat   2340
       ............................................................
2341   agaaggagcatccctcgaccatctgaatgagagtatgcctgaccccttccaccacaagtg   2400
       ............................................................
2401   gggacacctctgcatatctgctccctcctctgctgttaagccccagggagccccatccac   2460
       ............................................................
2461   ccagtggtcctacagacagggcaatacacacacaccaagatagccttcagatcaacatgc   2520
       ............................................................
2521   atcacactcaagtgttaatctttcaaggttttcttttctttttcctgttttttatttgtt   2580
       ............................................................
2581   ttgcttttgctttttttttttttttttttttggtggtggtggggctaccaaacttgaggc   2640
       ............................................................
2641   ctagagctaaaaatcatatagaaatgatgttatcttgtggtgtgaggaaaggccagctgg   2700
       ............................................................
2701   cctaagttcacacttttgtcccagtggccctagactccacccagccagctcccaaaatga   2760
       ............................................................
2761   aaagaccacctgtcaagcagcagtcaggagtctgatgtcacccatcactattttttttcc   2820
       ............................................................
2821   atcattgtgcttgcctctgcctccttccacacccgtgtgacgtaatcgcattgggaagcc   2880
       ............................................................
2881   aggacaatgtttgctgttctgctttgggtaaagggactccctgaagctctgtggctctcc   2940
       ............................................................
2941   agtatggtcccttttccttcctaacagatgcatatgttttcttcagaatacaatagtgat   3000
       ............................................................
3001   tcttaaaataacccaaaagacaggcatccacagtgtgtgagcatgaatcacagcctgcat   3060
       ............................................................
3061   tgtgtgagtgtgaatagtgggataaaagtggatgtcagaagagtggaaatcaaacctctg   3120
       ............................................................
3121   caaagcaatctttctctttctgtgaagtgtattaagaaatacctgaagtctgtgtgtgtg   3180
       ............................................................
3181   gtggtacccagactgtcaatcaataaagacccagactgtcaatgaaagaatc           3240
       ....................................................