Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Ndn

Necdin

MacDonald & Wevrick Hum Mol Genet 6: 1873-1878, 1997

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Sus scrofa NECD NDN  1  Imprinted Paternal
Mus musculus Ndn Peg6, AI528698  7 28.0 cM  Imprinted Paternal
Equus caballus NDN   1  Imprinted Paternal
Macaca fascicularis NDN   7  Imprinted Paternal
Homo sapiens NDN HsT16328  15q11.2-q12  Imprinted Paternal
Ovis aries NDN   18  Imprinted Paternal 
1      cggacgcgtgggcgctccaagagctccaagccgcatcggtcctgctctgatccgaaggcg     60
       ............................................................
61     cagacATGTCGGAACAAAGTAAGGACCTGAGCGACCCTAACTTTGCAGCCGAGGTCCCCG    120
       .....M--S--E--Q--S--K--D--L--S--D--P--N--F--A--A--E--V--P--D
121    ACTGTGAGATGCAGGACAGCGATGCCGTTCCGGTGGGGATCCCTCCTCCCGCTTCTCTGG    180
       --C--E--M--Q--D--S--D--A--V--P--V--G--I--P--P--P--A--S--L--A
181    CCGCTAACCTCGCAGGGCCACCGTGCGCTCCCGAAGGCCCTATGGCAGCCCAACAGGCCT    240
       --A--N--L--A--G--P--P--C--A--P--E--G--P--M--A--A--Q--Q--A--S
241    CGCCACCGCCCGAAGAACGGATAGAAGATGTTGACCCTAAAATCCTGCAGCAGGCCGCAG    300
       --P--P--P--E--E--R--I--E--D--V--D--P--K--I--L--Q--Q--A--A--E
301    AGGAGGGCCGCGCCCACCAGCCCCAGAGTCCAGCCCGGCCGATCCCAGCACCGCCAGCCC    360
       --E--G--R--A--H--Q--P--Q--S--P--A--R--P--I--P--A--P--P--A--P
361    CTGCCCAGCTGGTGCAGAAGGCGCACGAGCTCATGTGGTACGTGTTGGTGAAGGACCAGA    420
       --A--Q--L--V--Q--K--A--H--E--L--M--W--Y--V--L--V--K--D--Q--K
421    AGAGGATGGTCCTCTGGTTTCCAGACATGGTGAAAGAGGTCATGGGCAGCTACAAGAAAT    480
       --R--M--V--L--W--F--P--D--M--V--K--E--V--M--G--S--Y--K--K--W
481    GGTGCAGAAGCATCCTCAGGCGCACCAGCGTCATCCTCGCCAGAGTGTTCGGGCTGCACC    540
       --C--R--S--I--L--R--R--T--S--V--I--L--A--R--V--F--G--L--H--L
541    TGAGGCTGACCAATCTCCACACCATGGAGTTTGCCCTGGTCAAAGCCCTCAGCCCAGAGG    600
       --R--L--T--N--L--H--T--M--E--F--A--L--V--K--A--L--S--P--E--E
601    AGCTAGACAGGGTGGCGCTCAACAACCGTATGCCCATGACAGGCCTCCTGCTCATGATCC    660
       --L--D--R--V--A--L--N--N--R--M--P--M--T--G--L--L--L--M--I--L
661    TGAGCCTCATCTATGTGAAGGGCCGCGGGGCCAGAGAGGGTGCGGTCTGGAATGTGCTGC    720
       --S--L--I--Y--V--K--G--R--G--A--R--E--G--A--V--W--N--V--L--R
721    GCATCCTGGGGCTGAGGCCCTGGAAGAAGCACTCCACCTTCGGAGACGTGAGGAAGATAA    780
       --I--L--G--L--R--P--W--K--K--H--S--T--F--G--D--V--R--K--I--I
781    TCACCGAGGAGTTCGTCCAGCAGAATTACCTGAAGTACCAGCGTGTGCCCCACATCGAGC    840
       --T--E--E--F--V--Q--Q--N--Y--L--K--Y--Q--R--V--P--H--I--E--P
841    CTCCCGAGTACGAGTTCTTCTGGGGGTCCAGAGCTAACCGTGAAATCACCAAGATGCAGA    900
       --P--E--Y--E--F--F--W--G--S--R--A--N--R--E--I--T--K--M--Q--I
901    TCATGGAGTTCCTGGCCAGAGTCTTCAAGAAAGATCCCCAGGCGTGGCCTTCCCGATACA    960
       --M--E--F--L--A--R--V--F--K--K--D--P--Q--A--W--P--S--R--Y--R
961    GGGAGGCTCTGGAGCAGGCCAGAGCTCTGCGGGAGGCTAATCTTGCTGCCCAGGCCCCCC   1020
       --E--A--L--E--Q--A--R--A--L--R--E--A--N--L--A--A--Q--A--P--R
1021   GCAGCAGTGTCTCTGAGGACTAAaaaggtccaggggcacactgatagtttctgacccata   1080
       --S--S--V--S--E--D--***.....................................
1081   ctagggctgtgtaagggtggggttgagtcattagagtatcccaaatccacagtgcagtat   1140
       ............................................................
1141   ttcatgtataatttttaagttttccatacagtgcttttgtaccttgtaatgctattcatt   1200
       ............................................................
1201   tgtgtactcgtgtagtgtttaagattgatgcatgtgtgataagtatttggtactttcact   1260
       ............................................................
1261   tttgtgctttcgtgcatttttgtacaagagatgtgctgtgctaaacttgtgaaatacatt   1320
       ............................................................
1321   gaggtgttctgtatcttgttctttgtatgggactgatgatctgtatcgacaaagaaggcc   1380
       ............................................................
1381   ctggagagttagcaggacttaacagcaacgcagacctgagcaagagaaaggtcaaggcct   1440
       ............................................................
1441   ttctccatatgacttcaactggcacaggaagcatccatgtggaatggactgatttgaact   1500
       ............................................................
1501   ggactgttctcagtgtaggcacttagcaccctttacaaaacatgtatgcaaccccaccat   1560
       ............................................................
1561   aaataaacgttaaaatgagcattaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagggcggccgctcg   1620
       ............................................................
1621   cgatctagaactagtcttaagcggggtgggagggcaagggagggtgccctcctagtgggg   1680
       ............................................................
1681   tttggggggattgggttcctgaatgcaccataattgctgtatgaaatattaaaaaaaagt   1740
       ............................................................
1741   ctaaagttcaaaaaaaaaaaaaaaa                                      1800
       .........................