Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Htr2a

5-hydroxytryptamine receptor 2A

Kato et al. Genomics 47: 146-148, 1998

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HTR2A HTR2, 5-HT2A  13q14-q21  Conflicting Data Maternal
Monodelphis domestica HTR2A   Imprinted Maternal
Mus musculus Htr2a Htr2, Htr-2, MGC124301, MGC124302, E030013E04  14 41.5 cM  Imprinted Maternal
Bos taurus HTR2A 5HT2A, 5HTR2A  12  Not Imprinted Biallelic
1      gaggtctgagaaaggaggcaaccaggaggggcttattcttttggagctccgggagcctct     60
       ............................................................
61     tgatacagacagcgtttcctactttccctgcggctcttttgtgtgactttgagaggggct    120
       ............................................................
121    ccctagtgactgattcctctctgtgcgctcgcctcagcaagcagccaggctctgggaggg    180
       ............................................................
181    aagacccaaccaagctcagcagtagcagaagcagccagcacagacttcaaccgtgctgga    240
       ............................................................
241    accggcatgcggtttttgaagtcagcagaaacagaaatcaaattactatcatcttatgct    300
       ............................................................
301    gctagaagctcaaagagaggggattccacactggcctagtcaccatgcgacaggcaagtc    360
       ............................................................
361    acaggatagcggaccctggcgacaatgaatgtaagttcctcggctgctgtcctttactgc    420
       ............................................................
421    tgtgggattttctttctgcttaaagtcacgcttggctagaatgccgtcattgccgcgaga    480
       ............................................................
481    atttctgatgtggaaagttctctgctgcgcttcgggatgcgttttcctttcgttaactga    540
       ............................................................
541    gccagagatacaagctgaaattcctgaccatcgctgcggcgattctgcctgagactaaaa    600
       ............................................................
601    agggttaacccttatgatggcattaacattgcgtggatttttaattgacttccttaatta    660
       ............................................................
661    atatagagggcacacagccctccctcctcgttttggatctcatgctgttttaactttgtg    720
       ............................................................
721    atggctgaactcttgaaagcagcatatccaacccgagaattggctgaaagattctcaccg    780
       ............................................................
781    gatacaaaacttttcttccttaaccaggaacacgtttgtgtctccaaatgctccacactg    840
       ............................................................
841    ctttttttgcctttgcttccgtgagaacttacagctccgccgtggactctccctagcact    900
       ............................................................
901    gtgaagcgaggcataatcaagagccatcacacttctgtaactcttactatggaagaggag    960
       ............................................................
961    aaagcagccagaggagccacacaggtctccgcttcagcatgccctagctccaggacgtaa   1020
       ............................................................
1021   agatgaatggtgagccccggctatgactcgctagtctctccacacttcatctgctacaac   1080
       ............................................................
1081   ttccggcttagacATGGAAATTCTCTGTGAAGACAATATCTCCCTGAGCTCAATTCCAAA   1140
       .............M--E--I--L--C--E--D--N--I--S--L--S--S--I--P--N-
1141   CTCCTTAATGCAATTAGGTGACGACTCGAGGCTCTACCCTAATGACTTCAACTCCAGGGA   1200
       -S--L--M--Q--L--G--D--D--S--R--L--Y--P--N--D--F--N--S--R--D-
1201   TGCTAACACTTCCGAAGCCTCGAACTGGACAATTGATGCTGAAAACAGAACCAACCTCTC   1260
       -A--N--T--S--E--A--S--N--W--T--I--D--A--E--N--R--T--N--L--S-
1261   CTGCGAAGGGTACCTCCCACCGACATGCCTCTCCATTCTTCATCTCCAGGAAAAAAACTG   1320
       -C--E--G--Y--L--P--P--T--C--L--S--I--L--H--L--Q--E--K--N--W-
1321   GTCTGCTTTATTGACAACTGTCGTGATTATTCTCACCATTGCGGGAAACATACTGGTCAT   1380
       -S--A--L--L--T--T--V--V--I--I--L--T--I--A--G--N--I--L--V--I-
1381   CATGGCAGTGTCCCTAGAGAAAAAGCTGCAGAATGCCACCAACTATTTCCTGATGTCACT   1440
       -M--A--V--S--L--E--K--K--L--Q--N--A--T--N--Y--F--L--M--S--L-
1441   TGCCATAGCTGATATGCTGCTGGGTTTCCTTGTCATGCCCGTGTCCATGTTAACCATCCT   1500
       -A--I--A--D--M--L--L--G--F--L--V--M--P--V--S--M--L--T--I--L-
1501   GTATGGGTACCGGTGGCCTTTGCCCAGCAAGCTCTGTGCCGTCTGGATTTACCTGGATGT   1560
       -Y--G--Y--R--W--P--L--P--S--K--L--C--A--V--W--I--Y--L--D--V-
1561   GCTCTTCTCCACGGCGTCCATCATGCACCTCTGCGCCATCTCCCTGGACCGCTACGTGGC   1620
       -L--F--S--T--A--S--I--M--H--L--C--A--I--S--L--D--R--Y--V--A-
1621   TATCCAGAACCCCATTCACCATAGCCGCTTCAACTCCAGAACCAAAGCCTTCCTGAAAAT   1680
       -I--Q--N--P--I--H--H--S--R--F--N--S--R--T--K--A--F--L--K--I-
1681   CATTGCGGTGTGGACCATATCCGTAGGTATATCCATGCCAATCCCAGTCTTCGGGCTACA   1740
       -I--A--V--W--T--I--S--V--G--I--S--M--P--I--P--V--F--G--L--Q-
1741   GGATGATTCGAAGGTCTTTAAGGAAGGGAGCTGCCTGCTCGCCGATGACAACTTTGTCCT   1800
       -D--D--S--K--V--F--K--E--G--S--C--L--L--A--D--D--N--F--V--L-
1801   CATAGGCTCTTTTGTGGCATTTTTCATCCCCCTAACCATCATGGTGATCACCTACTTCCT   1860
       -I--G--S--F--V--A--F--F--I--P--L--T--I--M--V--I--T--Y--F--L-
1861   GACTATCAAGTCACTTCAGAAAGAAGCCACCTTGTGTGTGAGTGACCTCAGCACTCGGGC   1920
       -T--I--K--S--L--Q--K--E--A--T--L--C--V--S--D--L--S--T--R--A-
1921   CAAATTATCCTCCTTCAGCTTCCTCCCTCAGAGTTCTCTGTCATCAGAAAAGCTCTTCCA   1980
       -K--L--S--S--F--S--F--L--P--Q--S--S--L--S--S--E--K--L--F--Q-
1981   GCGGTCCATCCACAGAGAGCCAGGCTCCTACGCAGGCCGAAGGACGATGCAGTCCATCAG   2040
       -R--S--I--H--R--E--P--G--S--Y--A--G--R--R--T--M--Q--S--I--S-
2041   CAACGAGCAAAAAGCATGCAAGGTGCTGGGCATCGTGTTCTTTCTGTTTGTTGTAATGTG   2100
       -N--E--Q--K--A--C--K--V--L--G--I--V--F--F--L--F--V--V--M--W-
2101   GTGCCCATTCTTCATCACCAATATCATGGCCGTCATCTGCAAAGAATCCTGCAATGAAAA   2160
       -C--P--F--F--I--T--N--I--M--A--V--I--C--K--E--S--C--N--E--N-
2161   TGTCATTGGAGCCCTGCTCAATGTGTTTGTCTGGATTGGTTATCTCTCCTCAGCCGTCAA   2220
       -V--I--G--A--L--L--N--V--F--V--W--I--G--Y--L--S--S--A--V--N-
2221   CCCACTGGTATATACGTTGTTCAATAAAACTTATAGGTCCGCCTTCTCACGGTACATTCA   2280
       -P--L--V--Y--T--L--F--N--K--T--Y--R--S--A--F--S--R--Y--I--Q-
2281   GTGCCAGTACAAGGAGAACAGAAAGCCGCTGCAGTTAATTTTAGTGAACACTATACCAAC   2340
       -C--Q--Y--K--E--N--R--K--P--L--Q--L--I--L--V--N--T--I--P--T-
2341   ATTGGCCTACAAGTCTAGTCAGCTCCAGGTGGGACAAAAAAAGAACTCACAGGAAGATGC   2400
       -L--A--Y--K--S--S--Q--L--Q--V--G--Q--K--K--N--S--Q--E--D--A-
2401   TGAGCCGACAGCTAATGACTGCTCCATGGTTACACTAGGGAACCAACACTCGGAAGAGAT   2460
       -E--P--T--A--N--D--C--S--M--V--T--L--G--N--Q--H--S--E--E--M-
2461   GTGTACAGACAATATTGAAACCGTGAATGAAAAGGTTAGCTGTGTGTGAtggaccggatg   2520
       -C--T--D--N--I--E--T--V--N--E--K--V--S--C--V--***...........
2521   ctgggacgattgcccagggtgtgtgaacaagtttacacccacgtgtgtgggggcaggata   2580
       ............................................................
2581   aggaggctcagatcaaattagactactccagtggaccaactataatgtccggacagcatt   2640
       ............................................................
2641   tgaactaggagtgttgtgatgcttttaacattgccaatgagatctttaaaatcattggcc   2700
       ............................................................
2701   tttattgtacaattgtaatgaggcataaaatccatctaattaacttctattgtcaaatag   2760
       ............................................................
2761   aaaccgggctgccatgttgttgatgggtagcatgggagtaagttggtgacatattgttgt   2820
       ............................................................
2821   atataaaaatagctataaatactgaaaataatgaatagcctctttaaaaacaaaaatgag   2880
       ............................................................
2881   tgtttcaaattcaccacaacatatattttgaaaagaaaaatagacagtattatgacattt   2940
       ............................................................
2941   gtattgctaatacaattcattgaaatacttgg                               3000
       ................................