Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Gatm

Glycine amidinotransferase

Sandell et al. Proc Natl Acad Sci USA 100: 4622-4627, 2003

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Ovis aries GATM   Imprinted Maternal
Sus scrofa GATM AGAT  Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Gatm AT, AI314789, 1810003P21Rik  2 69.0 cM  Imprinted Maternal
Homo sapiens GATM AT, AGAT  15q21.1  Unknown Unknown
1      cccacgcgtccgcccacgcgtccggcgactaggaccttgtgcacgcggagcagcagagac     60
       ............................................................
61     ggggcgATGCTACGGGTGCGGTGTCTGCGCGGAGGCAGCCGAGGTGCCGAGGCGGTGCAC    120
       ......M--L--R--V--R--C--L--R--G--G--S--R--G--A--E--A--V--H--
121    TACATCGGCTCTCGGCTTGGAGGATCCTTAACAGGATGGGTGCAGCGAACTTTCCAGAGC    180
       Y--I--G--S--R--L--G--G--S--L--T--G--W--V--Q--R--T--F--Q--S--
181    ACCCAGGCAGCTACAGCTTCCTCCCGAAATTCCTGTGCAGCTGAAGACAAGGCCACCCAT    240
       T--Q--A--A--T--A--S--S--R--N--S--C--A--A--E--D--K--A--T--H--
241    CCTCTGCCCAAGGACTGCCCTGTCTCCTCTTACAACGAATGGGACCCTTTAGAGGAAGTG    300
       P--L--P--K--D--C--P--V--S--S--Y--N--E--W--D--P--L--E--E--V--
301    ATAGTGGGCAGAGCTGAAAATGCCTGTGTGCCACCATTCACAGTGGAGGTGAAGGCCAAT    360
       I--V--G--R--A--E--N--A--C--V--P--P--F--T--V--E--V--K--A--N--
361    ACATATGAAAAGTACTGGCCATTTTACCAAAAAAATGGAGGTCTTTATTTTCCCAAAGAT    420
       T--Y--E--K--Y--W--P--F--Y--Q--K--N--G--G--L--Y--F--P--K--D--
421    CATCTGAAGAAGGCTGTTGCTGAGGTCGAAGAGATGTGCAATATTTTATCAATGGAAGGA    480
       H--L--K--K--A--V--A--E--V--E--E--M--C--N--I--L--S--M--E--G--
481    GTGACCGTGAGGCGGCCTGACCCCATCGACTGGTCACTCAAGTATAAGACTCCTGATTTT    540
       V--T--V--R--R--P--D--P--I--D--W--S--L--K--Y--K--T--P--D--F--
541    GAGTCTACAGGTTTGTACAGCGCAATGCCTCGAGACATCCTGATGGTTGTGGGAAACGAG    600
       E--S--T--G--L--Y--S--A--M--P--R--D--I--L--M--V--V--G--N--E--
601    ATTATAGAAGCACCCATGGCATGGCGCTCACGCTTCTTTGAGTACCGAGCATACAGGTCA    660
       I--I--E--A--P--M--A--W--R--S--R--F--F--E--Y--R--A--Y--R--S--
661    ATTATCAAAGACTACTTCCATCGTGGTGCCAAGTGGACAACAGCACCCAAGCCCACAATG    720
       I--I--K--D--Y--F--H--R--G--A--K--W--T--T--A--P--K--P--T--M--
721    GCTGACGAACTGTATGACCAGAATTATCCCATCCATTCCGTGGAAGACAGACACAAATTG    780
       A--D--E--L--Y--D--Q--N--Y--P--I--H--S--V--E--D--R--H--K--L--
781    GCCGCTCAGGGAAAGTTCGTGACGACTGAGTTTGAGCCTTGCTTTGATGCTGCTGACTTC    840
       A--A--Q--G--K--F--V--T--T--E--F--E--P--C--F--D--A--A--D--F--
841    ATTCGAGCTGGAAGAGATATTTTTGCACAGAGAAGCCAGGTTACAAACTACCTGGGCATC    900
       I--R--A--G--R--D--I--F--A--Q--R--S--Q--V--T--N--Y--L--G--I--
901    GAGTGGATGCGTAGGCATCTTGCTCCAGACTACAGAGTACATATCATCTCTTTTAAAGAC    960
       E--W--M--R--R--H--L--A--P--D--Y--R--V--H--I--I--S--F--K--D--
961    CCCAATCCAATGCACATCGATGCCACCTTCAACATCATTGGACCTGGTCTTGTGCTCTCC   1020
       P--N--P--M--H--I--D--A--T--F--N--I--I--G--P--G--L--V--L--S--
1021   AACCCCGACCGTCCTTGTCATCAGATTGATCTTTTCAAGAAAGCAGGATGGACCATAGTT   1080
       N--P--D--R--P--C--H--Q--I--D--L--F--K--K--A--G--W--T--I--V--
1081   ACTCCTCCAACACCAGTCATCCCCGATGATCATCCCCTCTGGATGTCATCCAAATGGCTT   1140
       T--P--P--T--P--V--I--P--D--D--H--P--L--W--M--S--S--K--W--L--
1141   TCCATGAACGTCTTAATGCTAGATGAGAAGCGCGTGATGGTAGATGCCAATGAAGTTCCA   1200
       S--M--N--V--L--M--L--D--E--K--R--V--M--V--D--A--N--E--V--P--
1201   ATTCAAAAGATGTTTGAGAAGCTGGGTATCAGTACCATTAAGGTTAACATTCGAAATGCC   1260
       I--Q--K--M--F--E--K--L--G--I--S--T--I--K--V--N--I--R--N--A--
1261   AATTCCCTGGGAGGTGGCTTCCACTGCTGGACCTGCGACGTCCGGCGCCGAGGCACCCTT   1320
       N--S--L--G--G--G--F--H--C--W--T--C--D--V--R--R--R--G--T--L--
1321   CAGTCCTACTTTGACTGAgcaggcgtggtgtggcttggggcatagcctcagatataccta   1380
       Q--S--Y--F--D--***..........................................
1381   agaagcagcaaggcccttctctcgctttaacaaatgcatgaactgtagtgctttgaacaa   1440
       ............................................................
1441   tcacatccttaacagggtttccaagcctgggttactttttgttgacgtaaggaagataac   1500
       ............................................................
1501   ttttgataggtcttactttcttctcctaaagttatttacgatttggctttaaatataaaa   1560
       ............................................................
1561   gttcagtaagtgtataccgaagcaaaaattagtcacttgagtaacttggccgctaatatt   1620
       ............................................................
1621   taaccatctacctctgtttttaattttctttcctaaaggcagcttgagatgtcggtccta   1680
       ............................................................
1681   accttgtctttttttttttcctctttggtagacttatgaatgtccatattacttcttttt   1740
       ............................................................
1741   tcctaaatgggacaaagacttaggcaaaaaacatggatcctaagtagaatcagatattta   1800
       ............................................................
1801   tctctttttctaaaaaaataaaataaataaatttgggtgtttttttttttaatttgcttt   1860
       ............................................................
1861   tatcagatatttatctctttttctaaaaaaataaaataaataaatttgggtgtttttttt   1920
       ............................................................
1921   tttttttaatttgcttttaaacaacctcgactatgcaaacactgaaaaaaaaaaaatgaa   1980
       ............................................................
1981   gtgactttccatgaatgcctttaacattcttgtgtcaacatttggtactaaactcttact   2040
       ............................................................
2041   cttacctcatctcaagtgggttatccttccttctgtccttccttccgtccttccctcctt   2100
       ............................................................
2101   ccttcagagtagcgcttagtgtaatagagtgaaacttgtagttcccattcctaaaggttg   2160
       ............................................................
2161   atgttcaatatctaacaggtataatggcatcttcggtaatctaagatttgtttacatata   2220
       ............................................................
2221   tgcaaaattatttaaggtatagagttttaaagcatttttttggaaaaactaatgcaggta   2280
       ............................................................
2281   aaacatgtgacatgagataattttaatgttggatattatatatgtatttttattctaata   2340
       ............................................................
2341   aacttttgtgttccagattggaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa   2400
       ............................................................
2401   aaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                            2460
       ...................