Imprinted Gene Databases

Mus musculus: Cdh15

Cadherin 15

Proudhon et al, Mol. Cell 47: 909–920, 2012

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Cdh15 Mca, Mcad, Cdh14, AI323380  8 71.99 cM  Imprinted Paternal
Homo sapiens CDH15 CDH3, CDHM, MCAD, MRD3, CDH14  16q24.3  Not Imprinted Biallelic
1      tccaatagtacattatcatatataaaaaagataatattaagaaatttcaattcttatagt     60
       ............................................................
61     atctataagtcaattcttatagtatctatcatataaaatttacaccttaatacaTTCATA    120
       ......................................................M--G--
121    CATTATCATATGACATTCCTCTACAACCATTAGATGAGAAAGTTAATATTACACAGATTA    180
       S--A--L--L--L--A--L--G--L--L--A--Q--S--L--G--L--S--W--A--V--
181    ATAGCCTCTACAACCATTAGATGAGAACTAACAACTTCATTATCATATATATAAAGTAAT    240
       P--E--P--K--P--S--T--L--Y--P--W--R--R--A--S--A--P--G--R--V--
241    TTTGTTAGTTATCATATCTACCTAAGAAGAGTTCACAATGATAGATGTACTCAGACCATA    300
       R--R--A--W--V--I--P--P--I--S--V--S--E--N--H--K--R--L--P--Y--
301    TAACACGCCATATATTTGTCACCAATCAACTAATCACTCAGCCATATACAGAATATATTC    360
       P--L--V--Q--I--K--S--D--K--Q--Q--L--G--S--V--I--Y--S--I--Q--
361    AATCATGACATTTATTACCACATACACACATATATTAATACAGGTAATACTTGCGAATAC    420
       G--P--G--V--D--E--E--P--R--N--V--F--S--I--D--K--F--T--G--R--
421    AAGTCAGACCACCTTCACATCTATCCAACAACCTCACATGCATCAACACTGCTTATATCA    480
       V--Y--L--N--A--T--L--D--R--E--K--T--D--R--F--R--L--R--A--F--
481    AGATAGTCTGTTCTTCTGATAATTATTGTACATTCACTATATTATTCTATATCTAGATCA    540
       A--L--D--L--G--G--S--T--L--E--D--P--T--D--L--E--I--V--V--V--
541    CGTCTAAAAACCTTACATTTCTGTCAACGTGACCTTTACTATGCCTATCCTTTTCGATGC    600
       D--Q--N--D--N--R--P--A--F--L--Q--D--V--F--R--G--R--I--L--E--
601    CATTTACTCATACTAGTCATTTCCATTCATTATAAAATGATGCTACCATACATCATATAT    660
       G--A--I--P--G--T--F--V--T--R--A--E--A--T--D--A--D--D--P--E--
661    TACTCATCCATGATATAACCATAATTTTATCTCTAAGTCGTACTATTTCTCTTAAATAAC    720
       T--D--N--A--A--L--R--F--S--I--L--E--Q--G--S--P--E--F--F--S--
721    ACACACACACACACACACACACACACACATCATACGACTATACACGGCGACCACATCAGG    780
       I--D--E--H--T--G--E--I--R--T--V--Q--V--G--L--D--R--E--V--V--
781    GGCGACCACACAGTGCATGCGACCACATTAATCCGCGACCACATCACACCACTATCTCAT    840
       A--V--Y--N--L--T--L--Q--V--A--D--M--S--G--D--G--L--T--A--T--
841    TCCCCGGGTAATGAAGAGATAAGAGGGTGATTAAGGTTAGGAGTTAATATAAGTGTGATA    900
       A--S--A--I--I--S--I--D--D--I--N--D--N--A--P--E--F--T--K--D--
901    GGTATAAATAAAGGGATGGTTGAAAAAGTTATAGAGTATATGATGTAGAAATATGTAAAG    960
       E--F--F--M--E--A--A--E--A--V--S--G--V--D--V--G--R--L--E--V--
961    CGGGATGAGAGGTTCCGGTCGAAAGGGGGAATAATGGGGGGAATGATAGAATAGGAGTGG   1020
       E--D--K--D--L--P--G--S--P--N--W--V--A--R--F--T--I--L--E--G--
1021   AAGGTGCGACCACACCATATCTGAATTGCGACCACACTCATAGATTTCATGCGACCACAT   1080
       D--P--D--G--Q--F--K--I--Y--T--D--P--K--T--N--E--G--V--L--S--
1081   GCACAAAGCCAGATTTGCATTCATGCGACCACATGCACAAAGCCAGATTTGCATTCATGC   1140
       V--V--K--P--L--D--Y--E--S--R--E--Q--Y--E--L--R--V--S--V--Q--
1141   GACCACATGCACAAAGCCAGATTTGCATTCATGCGACCACATGCACAAAGCCAGATTTGC   1200
       N--E--A--P--L--Q--A--A--A--P--R--A--R--R--G--Q--T--R--V--S--
1201   ATTCATGCGACCACATGCACAAAGCCAGATTTGCATTCATGCGACCACATAGATTTTAAG   1260
       V--W--V--Q--D--T--N--E--A--P--V--F--P--E--N--P--L--R--T--S--
1261   CATGCGACCACATAGATTTGCCATGCGACCACACAGTGGCGACCACACAGTGGCGACCAC   1320
       I--A--E--G--A--P--P--G--T--S--V--A--T--F--S--A--R--D--P--D--
1321   ACAGTGGCGACCACACAGTGGCGACCACACAGTGGCGACCACACAGTGGCGACCACACAG   1380
       T--E--Q--L--Q--R--I--S--Y--S--K--D--Y--D--P--E--D--W--L--Q--
1381   TGGCGACCACACAGTGGCGACCACACAGTGGCGACCACACAGTGGCGACCACACAGTGGC   1440
       V--D--G--A--T--G--R--I--Q--T--Q--R--V--L--S--P--A--S--P--F--
1441   GACCACACAGTGGCGACCACACAGTGGATGATCAAGACGCGACCACAATGCGACCACAGC   1500
       L--K--D--G--W--Y--R--A--I--I--L--A--L--D--N--A--I--P--P--S--
1501   TTGCGCTGTCACTCAGCCCAATGCTCTCAGCGTGGGGGTAGAAGAAGCACCACCGCCCGT   1560
       T--A--T--G--T--L--S--I--E--I--L--E--V--N--D--H--A--P--A--L--
1561   TCCACCGGCCGCCCAGTCGGCCACTTGTCCTCGGCTCTTCCGCCACTGCCTCAATGGGTT   1620
       A--L--P--P--S--G--S--L--C--S--E--P--D--Q--G--P--G--L--L--L--
1621   CTGCTCTGCTCCTCGCCCTCGGGCTGCTTGCCCAGAGCCTTGGCCTGTCCTGGGCAGTCC   1680
       G--A--T--D--E--D--L--P--P--H--G--A--P--F--H--F--Q--L--N--P--
1681   CTGAGCCCAAACCCAGCACCCTGTACCCCTGGCGCCGGGCATCAGCCCCAGGCCGTGTGC   1740
       R--V--P--D--L--G--R--N--W--S--V--S--Q--I--N--V--S--H--A--R--
1741   GGAGAGCCTGGGTCATCCCACCCATTAGTGTGTCTGAGAACCACAAACGCCTCCCCTACC   1800
       L--R--L--R--H--Q--V--S--E--G--L--H--R--L--S--L--L--L--Q--D--
1801   CACTTGTGCAGATCAAGTCTGACAAACAGCAGCTAGGCAGTGTCATCTACAGCATCCAGG   1860
       S--G--E--P--P--Q--Q--R--E--Q--T--L--N--V--T--V--C--R--C--G--
1861   GTCCCGGAGTGGATGAGGAGCCCCGAAATGTCTTCTCCATCGACAAGTTCACCGGGAGGG   1920
       S--D--G--T--C--L--P--G--A--A--A--L--R--G--G--G--V--G--V--S--
1921   TGTACCTCAATGCCACGCTGGACCGCGAGAAGACGGACCGCTTCAGGCTAAGGGCCTTTG   1980
       L--G--A--L--V--I--V--L--A--S--T--V--V--L--L--V--L--I--L--L--
1981   CCTTGGACTTGGGTGGCTCTACCCTGGAGGACCCCACGGACCTGGAGATCGTTGTGGTGG   2040
       A--A--L--R--T--R--F--R--G--H--S--R--G--K--S--L--L--H--G--L--
2041   ATCAAAATGACAACCGGCCAGCCTTCCTACAGGATGTGTTCAGAGGCCGCATCCTGGAGG   2100
       Q--E--D--L--R--D--N--I--L--N--Y--D--E--Q--G--G--G--E--E--D--
2101   GTGCCATCCCAGGCACCTTCGTCACCAGGGCTGAGGCCACAGATGCCGACGACCCAGAGA   2160
       Q--D--A--Y--D--I--N--Q--L--R--H--P--V--E--P--R--A--T--S--R--
2161   CAGACAATGCAGCCCTCAGGTTCTCCATCCTGGAGCAGGGCAGCCCTGAGTTCTTCAGCA   2220
       S--L--G--R--P--P--L--R--R--D--A--P--F--S--Y--V--P--Q--P--H--
2221   TCGACGAGCACACGGGAGAGATCCGCACGGTGCAAGTGGGGCTGGACCGTGAGGTGGTGG   2280
       R--V--L--P--T--S--P--S--D--I--A--N--F--I--S--D--G--L--E--A--
2281   CTGTGTATAATCTGACCTTGCAAGTGGCAGACATGTCGGGAGACGGACTCACTGCCACAG   2340
       A--D--S--D--P--S--V--P--P--Y--D--T--A--L--I--Y--D--Y--E--G--
2341   CCTCGGCCATCATCTCCATAGATGACATCAACGACAATGCCCCCGAGTTCACCAAGGATG   2400
       D--G--S--V--A--G--T--L--S--S--I--L--S--S--L--G--D--E--D--Q--
2401   AGTTCTTTATGGAGGCTGCAGAGGCTGTCAGTGGAGTGGACGTGGGACGGCTCGAGGTGG   2460
       D--Y--D--Y--L--R--D--W--G--P--R--F--A--R--L--A--D--M--Y--G--
2461   AAGACAAGGacctgcctggttcccccaactgggtggccaggttcaccatccttgaaggtg   2520
       H--Q--***...................................................
2521   atcctgatgggcagttcaagatctacacagaccctaagaccaatgaaggtgtgctgtccg   2580
       ............................................................
2581   tggtcaagcccctggactatgagagccgtgagcagtatgagctcagagtgtctgtacaaa   2640
       ............................................................
2641   acgaggccccgctgcaggcagctgcccctcgggctcggcggggccagaccagggtcagcg   2700
       ............................................................
2701   tgtgggttcaggacaccaacgaagctccagtgtttccagagaacccactgaggacgagca   2760
       ............................................................
2761   tagctgaaggagcccccccaggcacctctgtggccaccttctctgccagagaccctgaca   2820
       ............................................................
2821   cagaacagctgcagagaatcagctactccaaagactacgacccagaagactggctgcaag   2880
       ............................................................
2881   tggacggggccacaggcaggatccagacccagcgagtgctgagccctgcttcaccctttt   2940
       ............................................................
2941   tgaaggacggctggtacagagccatcatcctagccctggacaatgccattcctcctagca   3000
       ............................................................
3001   cagccacaggcaccctgtccatcgagatcctagaagtcaacgaccatgcccctgcactgg   3060
       ............................................................
3061   ctcttcctccatctggcagcctgtgcagtgaaccagaccagggccctggcctcctcttgg   3120
       ............................................................
3121   gtgccacggatgaggacctgcccccacacggggcccctttccacttccagctgaacccca   3180
       ............................................................
3181   gagtaccagatctgggccggaactggagcgtcagccagattaacgtgagccatgcacgct   3240
       ............................................................
3241   tgcggctccgacatcaggtctccgagggcctgcatcgcctgagcctgctactccaggact   3300
       ............................................................
3301   ctggggagccaccccagcagcgagagcaaacgctgaacgtcaccgtgtgtcgctgtgggt   3360
       ............................................................
3361   cggatggcacttgcctgcccggggctgccgcgcttcgaggaggaggtgtaggcgtcagct   3420
       ............................................................
3421   tgggggcactggtcattgtgctggccagcaccgtggtcttactagttctcatcctgcttg   3480
       ............................................................
3481   ccgcgctccgcacacggttccgggggcattcccggggcaagagtctgttgcatggcctac   3540
       ............................................................
3541   aagaggaccttcgggacaacatccttaactatgatgagcaaggaggcggggaggaggacc   3600
       ............................................................
3601   aggatgcgtacgacataaaccagctgcgccacccagtggagccgagggccacaagtcgct   3660
       ............................................................
3661   ctttgggcaggccacccctgcgcagggatgcccccttcagctatgtgccacagccacatc   3720
       ............................................................
3721   gagtgcttcccaccagcccatctgacattgccaacttcatcagtgatggcttggaggctg   3780
       ............................................................
3781   cggacagcgaccccagcgtgcctccctacgacacagctctcatctatgactacgagggag   3840
       ............................................................
3841   atggctctgtggcagggacgctgagctccattctgtccagcctgggagatgaagaccagg   3900
       ............................................................
3901   actatgactacctccgggactggggaccccgctttgctcggctggcggacatgtatggac   3960
       ............................................................
3961   atcagtgagagccagggccaagggcagatgtgctgtgtggatacgcccacttggcccaac   4020
       ............................................................
4021   taaggggctctctcttgggatgtgcacccagaaatcctatgagggtcaacagcatggccc   4080
       ............................................................
4081   atccttggctccatggcagataaactcaaggaggtcatctctgtgaggtccaagagagga   4140
       ............................................................
4141   ctgagtcaggagtggtgggagaatctggagcatggactaggcagctagagggagcactgt   4200
       ............................................................
4201   cctggcagagtgcagaagccacccttagtcgccctgctagggctcatcccatctttgatt   4260
       ............................................................
4261   cccagttgtgactcttgcctctgtatgaaaagcaggcgtctaaagagtggatttcaatta   4320
       ............................................................
4321   aaagcatactatttggtggatc                                         4380
       ......................