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Mus musculus: Ccdc40

Coiled-coil domain containing 40

Gregg et al. Science 329: 643-648, 2010; DeVeale et al. PLoS Genet 8: e1002600, 2012

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Ccdc40 B930008I02Rik  11 83.35 cM  Imprinted Paternal
1      gttgatggcgtagcctagcaacgagagATGGCGGAGCCGGAGGACCAGGCTGACGGGTCA     60
       ...........................M--A--E--P--E--D--Q--A--D--G--S--
61     CAGCAGGAAGGCCAACAGTCTTCTGCCGAAGAGGACTCGGAGCAGCAGTATACTGAAGGC    120
       Q--Q--E--G--Q--Q--S--S--A--E--E--D--S--E--Q--Q--Y--T--E--G--
121    CCTGAGGTATCACCACAGCTGGAAGACAATGGCCAAGAAATTGATGAGGGCAGAGACCCC    180
       P--E--V--S--P--Q--L--E--D--N--G--Q--E--I--D--E--G--R--D--P--
181    ACCAGAAGTCCTGAAGAGGACATTACAACTGAAGGCGGGGGCGGATCTGAAGGGGAAATG    240
       T--R--S--P--E--E--D--I--T--T--E--G--G--G--G--S--E--G--E--M--
241    ATGGATGCTGAGAAAGTCAGCACGGATGGGGAAGCCATCTCTGAAGGAGAAGTGGGGTCC    300
       M--D--A--E--K--V--S--T--D--G--E--A--I--S--E--G--E--V--G--S--
301    AATGGAGAGACTCCCCCAGAAACAGAAGTGGAATTCATTGGAGAGACCGCTCCAGACACA    360
       N--G--E--T--P--P--E--T--E--V--E--F--I--G--E--T--A--P--D--T--
361    GATGTGGAATTCATTGGAGAGACCTCCCCAGGAACAGACGTGGAACCCACTGGAGAGAGC    420
       D--V--E--F--I--G--E--T--S--P--G--T--D--V--E--P--T--G--E--S--
421    ATACAGGAAACAGAAGTTGAATCCATCGGAGAGGCTACCCCAGGAATGGACGTGGAACCC    480
       I--Q--E--T--E--V--E--S--I--G--E--A--T--P--G--M--D--V--E--P--
481    ATTAAAAAGACCATGACAGAACTCAACGTTGAATCCATCGGAGAAGAAACCTCAGAAACA    540
       I--K--K--T--M--T--E--L--N--V--E--S--I--G--E--E--T--S--E--T--
541    GACGTGGACTCCATTAGGAAGGCCCTCCGAGGAATAGACTTGGAATCTATCACAGTTGCC    600
       D--V--D--S--I--R--K--A--L--R--G--I--D--L--E--S--I--T--V--A--
601    TATCCGCCAAAAAAGGCTAAACACAGAAAGGTCAGACCCCAAGCGGAAGTTGAATCCACT    660
       Y--P--P--K--K--A--K--H--R--K--V--R--P--Q--A--E--V--E--S--T--
661    GGAAGAGCTGCCCCAGAAGGAGAATTAGAAGTTTCTGACCACGAGAAAGTAGAAGCCCTT    720
       G--R--A--A--P--E--G--E--L--E--V--S--D--H--E--K--V--E--A--L--
721    CTCGATGAGTTGGATGAGCTCTCTGAGATAGTCAGCTCTCCCGAGGTCTCCTACTCTGAC    780
       L--D--E--L--D--E--L--S--E--I--V--S--S--P--E--V--S--Y--S--D--
781    ATCAGTCCCTTGGAGATGGGTGAAGATGACACAAACGTCTCAGCCACATCAACCGACACA    840
       I--S--P--L--E--M--G--E--D--D--T--N--V--S--A--T--S--T--D--T--
841    TTCCAGCAAGGCATATATGAGCCCATAGAACCCATAGAGCCCACAGAGCCCCCAGAGCCT    900
       F--Q--Q--G--I--Y--E--P--I--E--P--I--E--P--T--E--P--P--E--P--
901    GCAGAGCCCCCAAAGCCTGCAGAGACCCCAGAGGACAGCACGGTGAGAGCCCCAGCGCAT    960
       A--E--P--P--K--P--A--E--T--P--E--D--S--T--V--R--A--P--A--H--
961    CCCTATCAAAGAGACTTCCCAATGGGGGCACGACACCGATTCAGACTGAGCATCATGGGA   1020
       P--Y--Q--R--D--F--P--M--G--A--R--H--R--F--R--L--S--I--M--G--
1021   AGTCTGACTCCCTCGGACACGGACGATCTTCCCCTGGAAACGGACGAGCCGCCTCAGCAA   1080
       S--L--T--P--S--D--T--D--D--L--P--L--E--T--D--E--P--P--Q--Q--
1081   GAGTCAGTGCAGTCAACTCCCAGAGCCCTTGAAGAAACCCGGATACAGTTCCTAGACCAG   1140
       E--S--V--Q--S--T--P--R--A--L--E--E--T--R--I--Q--F--L--D--Q--
1141   GTCCAGAGCCTCAGCCCGGAGGCCCTGCTCGATAGAGCAACTGAAGGGAGTGATGAAGCA   1200
       V--Q--S--L--S--P--E--A--L--L--D--R--A--T--E--G--S--D--E--A--
1201   GAGGAGGAAGGCTCCCAGCTGATCGTGCTGGACCCAGACCATCCTCTGATGATCAGATTC   1260
       E--E--E--G--S--Q--L--I--V--L--D--P--D--H--P--L--M--I--R--F--
1261   CAGGAGGCTCTGAAGGGCTACCTCAACCGGCAGATGGACAAACTGAAGCTGGACGTCCAA   1320
       Q--E--A--L--K--G--Y--L--N--R--Q--M--D--K--L--K--L--D--V--Q--
1321   GAGCTGGATGTGGCCACCAAGCAAACCCGAAGCCAGAGGCAGGAGCTGGGCGTGAACCTC   1380
       E--L--D--V--A--T--K--Q--T--R--S--Q--R--Q--E--L--G--V--N--L--
1381   TACGGGGTCCAGCAGCACCTGGCCCGCCTGCAGATGCAGCTGGAGAAGAGCCATGACCGG   1440
       Y--G--V--Q--Q--H--L--A--R--L--Q--M--Q--L--E--K--S--H--D--R--
1441   CACTCTCTGGTGGCCTGTGAGCGGAGAAGGAAGGAGGAGGAGCTGCAATGCGCACGCTCC   1500
       H--S--L--V--A--C--E--R--R--R--K--E--E--E--L--Q--C--A--R--S--
1501   GTCTACAACAAGACCTGCCAGACCGCCAATGAGGAACGAAAGAAGTTGGCCGCCCTGCAG   1560
       V--Y--N--K--T--C--Q--T--A--N--E--E--R--K--K--L--A--A--L--Q--
1561   ACAGAGGTGGAGAGCCTGGCCCTGCACCTCTTCTACATGCAGAACATAGAGCAGGACGTG   1620
       T--E--V--E--S--L--A--L--H--L--F--Y--M--Q--N--I--E--Q--D--V--
1621   CGCGATGACATCCAAGTCATGAAGCAGGTGGTGAGGAAGACCGAGACGGAGAAGATGCAC   1680
       R--D--D--I--Q--V--M--K--Q--V--V--R--K--T--E--T--E--K--M--H--
1681   GCCGAGGTGGAGAAGAAAAAGCAGGACCTGTTTGTGGACCAGCTCACCGAAAGGTCACAC   1740
       A--E--V--E--K--K--K--Q--D--L--F--V--D--Q--L--T--E--R--S--H--
1741   CAGCTAGAAGAAAACATCGCCCTGTTTGAGGCTCAATACTTGTCCCAGGCTGAGGACACC   1800
       Q--L--E--E--N--I--A--L--F--E--A--Q--Y--L--S--Q--A--E--D--T--
1801   CGGGTCCTCAAGAAAGCAGTGACTGAGGCCATCACAGAGATTGACACCATTGCCGTGGAG   1860
       R--V--L--K--K--A--V--T--E--A--I--T--E--I--D--T--I--A--V--E--
1861   AAGAAGCGAATCCTACAGCAGTGGACCACCAGCCTAGTGGGCATGAAGCACCGTAACGAG   1920
       K--K--R--I--L--Q--Q--W--T--T--S--L--V--G--M--K--H--R--N--E--
1921   GCATACAAGACAGTGATGGATGCGCTCAGGGAGTGTCAGCATCAGGTGAAGTCCACCGAC   1980
       A--Y--K--T--V--M--D--A--L--R--E--C--Q--H--Q--V--K--S--T--D--
1981   AGTGAGATCGAAGTCTGCAAGAAGTCCATCATGCAGGAGGAAGAGAAGAATGAGAAGCTG   2040
       S--E--I--E--V--C--K--K--S--I--M--Q--E--E--E--K--N--E--K--L--
2041   GCCCGTCTCCTGAACCGCGCAGAGACAGAAGCCACACTGGTGCAGAAAATGACCGCCCAG   2100
       A--R--L--L--N--R--A--E--T--E--A--T--L--V--Q--K--M--T--A--Q--
2101   TGCTTAAGCAAGCAAGAGGCTCTGCAGACGGAGTTTAACACGTACCAGCTCGCCCTGCAG   2160
       C--L--S--K--Q--E--A--L--Q--T--E--F--N--T--Y--Q--L--A--L--Q--
2161   GACACGGAGGAGATGCTGAACAAGGGCTATGTGGAACACTCGGCAGTCTTGAGCGAGCTC   2220
       D--T--E--E--M--L--N--K--G--Y--V--E--H--S--A--V--L--S--E--L--
2221   CAGGCCACACGCCAGGCTTTCCACCAGGAACAGGAGCTACGGCAAAAGATGGACATGTCC   2280
       Q--A--T--R--Q--A--F--H--Q--E--Q--E--L--R--Q--K--M--D--M--S--
2281   ATGGTGGACAAGCTGCAGGAACAGGGGACCTCCAGCAAGATGACCAAGTACTTTCATCAG   2340
       M--V--D--K--L--Q--E--Q--G--T--S--S--K--M--T--K--Y--F--H--Q--
2341   CTCCTTCGGAAGCTGCAAAAGGAAAACACCAACCTGGTGACACATCTTTCAAAAATTGAC   2400
       L--L--R--K--L--Q--K--E--N--T--N--L--V--T--H--L--S--K--I--D--
2401   GGCGATATCGCCCAGGCCACCCTGGACATCACCAACACCAACTGCAAAATAGACATGCAT   2460
       G--D--I--A--Q--A--T--L--D--I--T--N--T--N--C--K--I--D--M--H--
2461   AAGAAGACGCTGGCAGAGATGGACAAGGAGGTAAAGAGGTTCAACGATCTCATCACCAAC   2520
       K--K--T--L--A--E--M--D--K--E--V--K--R--F--N--D--L--I--T--N--
2521   AGCGAGAGCGAGATCGCCCGGCGCACCATCCTCATTGAGAGGAAGCAGAGCCTCATCAAC   2580
       S--E--S--E--I--A--R--R--T--I--L--I--E--R--K--Q--S--L--I--N--
2581   TTCTTCAACAAGCAGCTGGAACAGATGGTGTCGGAGCTGGGGGGGGAAGAAGCTGGACCC   2640
       F--F--N--K--Q--L--E--Q--M--V--S--E--L--G--G--E--E--A--G--P--
2641   CTGGAACTGGAGATCAAAAGGCTGTCGAAGCTGACAGAAGAGTACAACACGGGAGTGGCT   2700
       L--E--L--E--I--K--R--L--S--K--L--T--E--E--Y--N--T--G--V--A--
2701   GAGGCGCAGATGACCTGGTTGCGCCTGCAGCAGGAACTGGTCCAGGTCACGCATGAGCGC   2760
       E--A--Q--M--T--W--L--R--L--Q--Q--E--L--V--Q--V--T--H--E--R--
2761   GAGGAGCAGCTGGTGTCCGTGGACCAACTGAAGAAGGAGGTGCACATCATGGAACAAAAG   2820
       E--E--Q--L--V--S--V--D--Q--L--K--K--E--V--H--I--M--E--Q--K--
2821   AAGCTTCGCATAGAGAGCAAGATTGCACATGAGAAGAAGGAACAAAAGATAGTGAGCCGC   2880
       K--L--R--I--E--S--K--I--A--H--E--K--K--E--Q--K--I--V--S--R--
2881   CACATGAGGGACCTGGACAACGACCTGAGCAAGCTCAACATGCTGTTGGACAAGAACCGA   2940
       H--M--R--D--L--D--N--D--L--S--K--L--N--M--L--L--D--K--N--R--
2941   TGCAGTTCGGAAGAGCTGGAGCAGAACAATATAGCAACTGAGACGGAGTTTCTGCGCACG   3000
       C--S--S--E--E--L--E--Q--N--N--I--A--T--E--T--E--F--L--R--T--
3001   CTGAAGGACTCAGAAAGAGAGACCATTCAAATGCAGGAAAAGCTGATGGAACTCTCTGAG   3060
       L--K--D--S--E--R--E--T--I--Q--M--Q--E--K--L--M--E--L--S--E--
3061   GAAAAGGCCACCCTCCTCAACAGCTTCATGGAGGCAGAGCACCAAATCATGCTGTGGGAG   3120
       E--K--A--T--L--L--N--S--F--M--E--A--E--H--Q--I--M--L--W--E--
3121   AAGAAAATCCAACTGGCCAAGGAGATGCGCAGCTCGGTGGATTCTGAGACCGGGCAGACA   3180
       K--K--I--Q--L--A--K--E--M--R--S--S--V--D--S--E--T--G--Q--T--
3181   GAGATCCGTGCTATGAAGGCCGAGATCCACAGGATGAAGGTTAGGCACGGGCAGCTACTG   3240
       E--I--R--A--M--K--A--E--I--H--R--M--K--V--R--H--G--Q--L--L--
3241   AAGCAGCAGGAGAAGATGATCCGTGACATGGAGTTGGCTGTGGCCCGCAGGGAGACCATC   3300
       K--Q--Q--E--K--M--I--R--D--M--E--L--A--V--A--R--R--E--T--I--
3301   GTCGTCCAGGCTGAAGGGCAGAGCAAGATAGACAAGAAAGTAATCACCAAGACAGAGTTC   3360
       V--V--Q--A--E--G--Q--S--K--I--D--K--K--V--I--T--K--T--E--F--
3361   CACTACCAGCAGCGCGAGCTGCAGAAGAAAGTCAGGGAGATGCACAAGGCCACAGATGAC   3420
       H--Y--Q--Q--R--E--L--Q--K--K--V--R--E--M--H--K--A--T--D--D--
3421   TGCACCAACACCATCTCAGAACTGGAAGAAACTCAAAAGTTCCTAAGCAGCTCCCTCCAG   3480
       C--T--N--T--I--S--E--L--E--E--T--Q--K--F--L--S--S--S--L--Q--
3481   GAGAAGCAGCAACTGCTGTCAGAAATGCAGGCTACCACAGATGTTCTTGAAGAGGAGATC   3540
       E--K--Q--Q--L--L--S--E--M--Q--A--T--T--D--V--L--E--E--E--I--
3541   AACCAGCTAACAGCTCTCAAACGGCAGAACCTTCTGGAGATCGTGACCCTGCAGACCCGT   3600
       N--Q--L--T--A--L--K--R--Q--N--L--L--E--I--V--T--L--Q--T--R--
3601   GGCAAGCACCTGCAGGCCGCCATTGAGGGGAAATATGTGTTCCTGCACCGCAACAGCAGG   3660
       G--K--H--L--Q--A--A--I--E--G--K--Y--V--F--L--H--R--N--S--R--
3661   TCCCAGCTGATGGAGCGTAAGCGCCTGAGCGTCCGGCTGTCCCAGCTCAACAAGGTCCTC   3720
       S--Q--L--M--E--R--K--R--L--S--V--R--L--S--Q--L--N--K--V--L--
3721   TCCAGCGTGCAGGAAGACTACCCCCAGTACCAGGAGGTGCTGCAGAGCATTCAACAGAAG   3780
       S--S--V--Q--E--D--Y--P--Q--Y--Q--E--V--L--Q--S--I--Q--Q--K--
3781   ATCGCCACCAAGCTGGAGACCCCAGAGCCCTCCTAGacagcaccgggcctgcacctttca   3840
       I--A--T--K--L--E--T--P--E--P--S--***........................
3841   gggctgacttgcgggcagacccagggagtcaccacatgttctgaaaaagccacgtgtctc   3900
       ............................................................
3901   ctagagcgacacccagtctaagaaacaccggcaggccagacacgtgattcaaagcctctc   3960
       ............................................................
3961   tgctgttcacaccaggtgtaaagcagccaccggatccgacgctctgagcacgcccacatt   4020
       ............................................................
4021   acctgggtgtgaaaaaaacccactctcctgttggacttaaaaccatcctgttggcagtcc   4080
       ............................................................
4081   tacggtcacatcagtgcctctcactgtcctgggacagaccctcaattttgcggagcaagt   4140
       ............................................................
4141   aatgcagagaagaagccaggagtaaggtggacttatttgagccctgggaatgcctgttcc   4200
       ............................................................
4201   agccctctgaagcccagaagataccctcattctccactccacagaaagctcggccttctc   4260
       ............................................................
4261   ctgcccccatttcccaggaagccttaaattagacagaaacccaaagaccgaagccgtggg   4320
       ............................................................
4321   acccagaagtccaaggatagcaaatgcctatggagcagaaactacttcagaaaagggaca   4380
       ............................................................
4381   cctgtctctcatccaccgacctctgacctctcttcttcacctctgcctcccctaccctgg   4440
       ............................................................
4441   ggtttctgggcaccagttacctttttccttgtgtagatgagaaacggattatttcagttt   4500
       ............................................................
4501   taaacttgaacagcagaaaaaataaagtttacaaaagctg                       4560
       ........................................