Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: SVOPL

SVOP like

Hannula-Jouppi et al. Epigenetics 9: 351-365, 2014; Imprint Control Region(s): ICR_484; Jima et al. Epigenetics 17: 1920-1943, 2022

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SVOPL   7q34  Imprinted Maternal
1      caggacgtcttccagatggtgttttttggctacatggttttcagtatcctctttggcctc     60
       ............................................................
61     ctggctgacagatATGGCCGCTGGAAGGTTAATCATAAAGACTGAATTTTTGCCCACGAA    120
       .............M--A--A--G--R--L--I--I--K--T--E--F--L--P--T--K-
121    ATACCGAGGCTATATGTTACCCTTGTCTCAGGTGTTCTGGCTTGCGGGCTCCCTGCTCAT    180
       -Y--R--G--Y--M--L--P--L--S--Q--V--F--W--L--A--G--S--L--L--I-
181    CATTGGCTTGGCCTCTGTGATCATCCCCACCATCGGGTGGCGCTGGCTCATTCGCGTCGC    240
       -I--G--L--A--S--V--I--I--P--T--I--G--W--R--W--L--I--R--V--A-
241    CTCCATCCCGGGCATCATCCTCATCGTGGCCTTCAAGTTTATTCCTGAATCTGCCCGGTT    300
       -S--I--P--G--I--I--L--I--V--A--F--K--F--I--P--E--S--A--R--F-
301    CAATGTCTCCACTGGGAACACTCGGGCTGCCCTGGCCACTCTGGAGCGCGTTGCCAAGAT    360
       -N--V--S--T--G--N--T--R--A--A--L--A--T--L--E--R--V--A--K--M-
361    GAACCGCTCGGTCATGCCGGAGGGGAAGCTGGTGGAGCCCGTCCTGGAAAAAAGAGGAAG    420
       -N--R--S--V--M--P--E--G--K--L--V--E--P--V--L--E--K--R--G--R-
421    ATTTGCAGACCTATTGGATGCTAAATATTTACGGACCACATTACAGATCTGGGTCATATG    480
       -F--A--D--L--L--D--A--K--Y--L--R--T--T--L--Q--I--W--V--I--W-
481    GCTTGGAATCTCTTTTGCCTACTATGGGGTTATCCTGGCCAGTGCTGAGCTGCTGGAGCG    540
       -L--G--I--S--F--A--Y--Y--G--V--I--L--A--S--A--E--L--L--E--R-
541    GGACTTGGTCTGTGGTTCAAAGTCAGACTCTGCGGTGGTGGTGACTGGGGGGGACTCAGG    600
       -D--L--V--C--G--S--K--S--D--S--A--V--V--V--T--G--G--D--S--G-
601    GGAGAGCCAGAGCCCCTGCTACTGCCACATGTTTGCACCCTCTGACTATCGGACCATGAT    660
       -E--S--Q--S--P--C--Y--C--H--M--F--A--P--S--D--Y--R--T--M--I-
661    CATCAGCACCATCGGTGAAATTGCTTTGAATCCTTTAAATATACTGGGCATCAATTTCCT    720
       -I--S--T--I--G--E--I--A--L--N--P--L--N--I--L--G--I--N--F--L-
721    GGGAAGACGGCTGAGCCTTTCTATTACCATGGGATGCACGGCTTTATTCTTCCTTCTCCT    780
       -G--R--R--L--S--L--S--I--T--M--G--C--T--A--L--F--F--L--L--L-
781    CAACATTTGCACTTCAAGTGCCGGCCTGATTGGCTTCCTCTTCATGCTGAGGGCTCTGGT    840
       -N--I--C--T--S--S--A--G--L--I--G--F--L--F--M--L--R--A--L--V-
841    AGCTGCAAACTTCAACACCGTCTACATTTACACAGCTGAGGTCTACCCCACCACGATGCG    900
       -A--A--N--F--N--T--V--Y--I--Y--T--A--E--V--Y--P--T--T--M--R-
901    CGCTTTGGGGATGGGAACCAGCGGCTCCCTGTGTCGCATTGGTGCAATGGTGGCACCATT    960
       -A--L--G--M--G--T--S--G--S--L--C--R--I--G--A--M--V--A--P--F-
961    TATATCCCAGGTTCTTATGAGTGCATCAATACTGGGGGCCCTGTGTCTCTTCTCATCTGT   1020
       -I--S--Q--V--L--M--S--A--S--I--L--G--A--L--C--L--F--S--S--V-
1021   CTGTGTTGTATGCGCCATTTCTGCATTCACTCTCCCCATCGAAACCAAAGGACGGGCCCT   1080
       -C--V--V--C--A--I--S--A--F--T--L--P--I--E--T--K--G--R--A--L-
1081   CCAGCAAATTAAATGAagacctgcaaagctatgtctaccagatgagaaaaatgaattcta   1140
       -Q--Q--I--K--***............................................
1141   tcttcagaactgcggtgcatttttttaaaacttggttttacttctgtatgctactcggta   1200
       ............................................................
1201   attagtaaagtgattttttttttaaaggcatatatgggaatggggtaggtaactgtatat   1260
       ............................................................
1261   tgatctcttccttgaggaacaatatataaagtacttttataaaatataatttaagctttc   1320
       ............................................................
1321   aaaggggtgtgagagggagatggtgggggggaagatggcttttcttcattgaaatcaagt   1380
       ............................................................
1381   ctgtaaacctttatatgaataaatactaaattttaaacttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa   1440
       ............................................................
1441   a                                                              1500
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