Homo sapiens: SNORD114-1
Small nucleolar RNA, C/D box 114-1
Santoni et al. Am J Hum Genet 100: 444-453, 2017; Girardot et al. Epigenetics 7: 1341-1348, 2012; There are 31 tandem SNORD114 genes on chromosome 14q32 (Hum Mol Genet. 2002 Jun 15;11(13):1527-38). The sequence for only SNORD114-1 is provided here. The imprint status has not been experimentally assessed for all of these genes.
Species | Gene | Aliases | Location | Status | Expressed Allele |
---|---|---|---|---|---|
Homo sapiens | SNORD114-1 | 14q(II-1) | 14q32.31 | Imprinted | Maternal |
- Ensembl
- NCBI Databases [ Gene | SNPs ]
- Pubmed [ PubMed Central ]
Options
Key
- Non-coding: acgtacgt
- Exon: AGCTACGT
- Primer site: acgtacgt
- CpG island: acgtacgt
- CpG: **
Export
*CpG island algorithm based on that described in: Takai D and Jones PA. Comprehensive analysis of CpG islands in human chromoseme 21 and 22. PNAS 2002 99(6):3740-5. For more options, visit the CpG Island Searcher.
1 acaattttga ggttcttagt cccaataaat tagtggctaa ggctctattc attttggtaa 60 61 ggagcatatg gtcatctgtg cacaagactg aatgtttttg ttctgtgttg aggcaggtta 120 121 ctggttgatc attttattaa ggaaaaagaa atacatttac ataaataaat agttgactga 180 181 gtaactgtaa ttgagagagg gagagcatgg aatgatgatg agatctatat acaacgacac 240 241 tcatgattaa ttcagtcttt tatggaattt tacttaagca aacagacaag tttggtacta 300 301 gattcacagc gtttattata ttatctaaaa caaaaaattt catggtgaga gatatttcat 360 361 cttgacaaaa acaatttatg taagttaata aatagaagtg ttctctcttc tcaagtgttc 420 421 agaatagggt acaaaacaag gtttatgatt gtttactaca gagctatgat tcattttaaa 480 481 gagctaaaca tatagtattt gattcttttt aaaatttgcg ttttatgctg cagaatgaac 540 541 gcactctacc tgatttaatt atagtcttct ggtgaagatc ttgctgttat ctctgtgaat 600 601 caggagagaa gagattgatg taagtaaaaa tcaaactttg tgttctcgct tgggaaactt 660 661 gatcaagttt attcattgaa ttatttcaaa ggaataaaag gctacataca taaatgagtc 720 721 aaaggtggtt atgcatggaa caatggtaga aatgtgttat gaattaagaa ttatgattaa 780 781 tccatttcag cacaacgaaa ttcattagga 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