Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: RB1

RB transcriptional corepressor 1

Kanber et al. PLoS Genet 5:e1000790, 2009; Imprint Control Region(s): ICR_825 & ICR_826; Jima et al. Epigenetics 17: 1920-1943, 2022

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens RB1 RB, pRb, OSRC, pp110, p105-Rb, PPP1R130, p110-RB1  13q14.2  Imprinted Paternal
Mus musculus Rb1 Rb, pRb, Rb-1  14 41.0 cM  Not Imprinted Biallelic
Sus scrofa RB1   11  Not Imprinted Biallelic
1      agttgccgggcgggggagggcgcgtccggtttttctcaggggacgttgaaattatttttg     60
       ............................................................
61     taacgggagtcgggagaggacggggcgtgccccgacgtgcgcgcgcgtcgtcctccccgg    120
       ............................................................
121    cgctcctccacagctcgctggctcccgccgcggaaaggcgtcATGCCGCCCAAAACCCCC    180
       ..........................................M--P--P--K--T--P--
181    CGAAAAACGGCCGCCACCGCCGCCGCTGCCGCCGCGGAACCCCCGGCACCGCCGCCGCCG    240
       R--K--T--A--A--T--A--A--A--A--A--A--E--P--P--A--P--P--P--P--
241    CCCCCTCCTGAGGAGGACCCAGAGCAGGACAGCGGCCCGGAGGACCTGCCTCTCGTCAGG    300
       P--P--P--E--E--D--P--E--Q--D--S--G--P--E--D--L--P--L--V--R--
301    CTTGAGTTTGAAGAAACAGAAGAACCTGATTTTACTGCATTATGTCAGAAATTAAAGATA    360
       L--E--F--E--E--T--E--E--P--D--F--T--A--L--C--Q--K--L--K--I--
361    CCAGATCATGTCAGAGAGAGAGCTTGGTTAACTTGGGAGAAAGTTTCATCTGTGGATGGA    420
       P--D--H--V--R--E--R--A--W--L--T--W--E--K--V--S--S--V--D--G--
421    GTATTGGGAGGTTATATTCAAAAGAAAAAGGAACTGTGGGGAATCTGTATCTTTATTGCA    480
       V--L--G--G--Y--I--Q--K--K--K--E--L--W--G--I--C--I--F--I--A--
481    GCAGTTGACCTAGATGAGATGTCGTTCACTTTTACTGAGCTACAGAAAAACATAGAAATC    540
       A--V--D--L--D--E--M--S--F--T--F--T--E--L--Q--K--N--I--E--I--
541    AGTGTCCATAAATTCTTTAACTTACTAAAAGAAATTGATACCAGTACCAAAGTTGATAAT    600
       S--V--H--K--F--F--N--L--L--K--E--I--D--T--S--T--K--V--D--N--
601    GCTATGTCAAGACTGTTGAAGAAGTATGATGTATTGTTTGCACTCTTCAGCAAATTGGAA    660
       A--M--S--R--L--L--K--K--Y--D--V--L--F--A--L--F--S--K--L--E--
661    AGGACATGTGAACTTATATATTTGACACAACCCAGCAGTTCGATATCTACTGAAATAAAT    720
       R--T--C--E--L--I--Y--L--T--Q--P--S--S--S--I--S--T--E--I--N--
721    TCTGCATTGGTGCTAAAAGTTTCTTGGATCACATTTTTATTAGCTAAAGGGGAAGTATTA    780
       S--A--L--V--L--K--V--S--W--I--T--F--L--L--A--K--G--E--V--L--
781    CAAATGGAAGATGATCTGGTGATTTCATTTCAGTTAATGCTATGTGTCCTTGACTATTTT    840
       Q--M--E--D--D--L--V--I--S--F--Q--L--M--L--C--V--L--D--Y--F--
841    ATTAAACTCTCACCTCCCATGTTGCTCAAAGAACCATATAAAACAGCTGTTATACCCATT    900
       I--K--L--S--P--P--M--L--L--K--E--P--Y--K--T--A--V--I--P--I--
901    AATGGTTCACCTCGAACACCCAGGCGAGGTCAGAACAGGAGTGCACGGATAGCAAAACAA    960
       N--G--S--P--R--T--P--R--R--G--Q--N--R--S--A--R--I--A--K--Q--
961    CTAGAAAATGATACAAGAATTATTGAAGTTCTCTGTAAAGAACATGAATGTAATATAGAT   1020
       L--E--N--D--T--R--I--I--E--V--L--C--K--E--H--E--C--N--I--D--
1021   GAGGTGAAAAATGTTTATTTCAAAAATTTTATACCTTTTATGAATTCTCTTGGACTTGTA   1080
       E--V--K--N--V--Y--F--K--N--F--I--P--F--M--N--S--L--G--L--V--
1081   ACATCTAATGGACTTCCAGAGGTTGAAAATCTTTCTAAACGATACGAAGAAATTTATCTT   1140
       T--S--N--G--L--P--E--V--E--N--L--S--K--R--Y--E--E--I--Y--L--
1141   AAAAATAAAGATCTAGATGCAAGATTATTTTTGGATCATGATAAAACTCTTCAGACTGAT   1200
       K--N--K--D--L--D--A--R--L--F--L--D--H--D--K--T--L--Q--T--D--
1201   TCTATAGACAGTTTTGAAACACAGAGAACACCACGAAAAAGTAACCTTGATGAAGAGGTG   1260
       S--I--D--S--F--E--T--Q--R--T--P--R--K--S--N--L--D--E--E--V--
1261   AATGTAATTCCTCCACACACTCCAGTTAGGACTGTTATGAACACTATCCAACAATTAATG   1320
       N--V--I--P--P--H--T--P--V--R--T--V--M--N--T--I--Q--Q--L--M--
1321   ATGATTTTAAATTCAGCAAGTGATCAACCTTCAGAAAATCTGATTTCCTATTTTAACAAC   1380
       M--I--L--N--S--A--S--D--Q--P--S--E--N--L--I--S--Y--F--N--N--
1381   TGCACAGTGAATCCAAAAGAAAGTATACTGAAAAGAGTGAAGGATATAGGATACATCTTT   1440
       C--T--V--N--P--K--E--S--I--L--K--R--V--K--D--I--G--Y--I--F--
1441   AAAGAGAAATTTGCTAAAGCTGTGGGACAGGGTTGTGTCGAAATTGGATCACAGCGATAC   1500
       K--E--K--F--A--K--A--V--G--Q--G--C--V--E--I--G--S--Q--R--Y--
1501   AAACTTGGAGTTCGCTTGTATTACCGAGTAATGGAATCCATGCTTAAATCAGAAGAAGAA   1560
       K--L--G--V--R--L--Y--Y--R--V--M--E--S--M--L--K--S--E--E--E--
1561   CGATTATCCATTCAAAATTTTAGCAAACTTCTGAATGACAACATTTTTCATATGTCTTTA   1620
       R--L--S--I--Q--N--F--S--K--L--L--N--D--N--I--F--H--M--S--L--
1621   TTGGCGTGCGCTCTTGAGGTTGTAATGGCCACATATAGCAGAAGTACATCTCAGAATCTT   1680
       L--A--C--A--L--E--V--V--M--A--T--Y--S--R--S--T--S--Q--N--L--
1681   GATTCTGGAACAGATTTGTCTTTCCCATGGATTCTGAATGTGCTTAATTTAAAAGCCTTT   1740
       D--S--G--T--D--L--S--F--P--W--I--L--N--V--L--N--L--K--A--F--
1741   GATTTTTACAAAGTGATCGAAAGTTTTATCAAAGCAGAAGGCAACTTGACAAGAGAAATG   1800
       D--F--Y--K--V--I--E--S--F--I--K--A--E--G--N--L--T--R--E--M--
1801   ATAAAACATTTAGAACGATGTGAACATCGAATCATGGAATCCCTTGCATGGCTCTCAGAT   1860
       I--K--H--L--E--R--C--E--H--R--I--M--E--S--L--A--W--L--S--D--
1861   TCACCTTTATTTGATCTTATTAAACAATCAAAGGACCGAGAAGGACCAACTGATCACCTT   1920
       S--P--L--F--D--L--I--K--Q--S--K--D--R--E--G--P--T--D--H--L--
1921   GAATCTGCTTGTCCTCTTAATCTTCCTCTCCAGAATAATCACACTGCAGCAGATATGTAT   1980
       E--S--A--C--P--L--N--L--P--L--Q--N--N--H--T--A--A--D--M--Y--
1981   CTTTCTCCTGTAAGATCTCCAAAGAAAAAAGGTTCAACTACGCGTGTAAATTCTACTGCA   2040
       L--S--P--V--R--S--P--K--K--K--G--S--T--T--R--V--N--S--T--A--
2041   AATGCAGAGACACAAGCAACCTCAGCCTTCCAGACCCAGAAGCCATTGAAATCTACCTCT   2100
       N--A--E--T--Q--A--T--S--A--F--Q--T--Q--K--P--L--K--S--T--S--
2101   CTTTCACTGTTTTATAAAAAAGTGTATCGGCTAGCCTATCTCCGGCTAAATACACTTTGT   2160
       L--S--L--F--Y--K--K--V--Y--R--L--A--Y--L--R--L--N--T--L--C--
2161   GAACGCCTTCTGTCTGAGCACCCAGAATTAGAACATATCATCTGGACCCTTTTCCAGCAC   2220
       E--R--L--L--S--E--H--P--E--L--E--H--I--I--W--T--L--F--Q--H--
2221   ACCCTGCAGAATGAGTATGAACTCATGAGAGACAGGCATTTGGACCAAATTATGATGTGT   2280
       T--L--Q--N--E--Y--E--L--M--R--D--R--H--L--D--Q--I--M--M--C--
2281   TCCATGTATGGCATATGCAAAGTGAAGAATATAGACCTTAAATTCAAAATCATTGTAACA   2340
       S--M--Y--G--I--C--K--V--K--N--I--D--L--K--F--K--I--I--V--T--
2341   GCATACAAGGATCTTCCTCATGCTGTTCAGGAGACATTCAAACGTGTTTTGATCAAAGAA   2400
       A--Y--K--D--L--P--H--A--V--Q--E--T--F--K--R--V--L--I--K--E--
2401   GAGGAGTATGATTCTATTATAGTATTCTATAACTCGGTCTTCATGCAGAGACTGAAAACA   2460
       E--E--Y--D--S--I--I--V--F--Y--N--S--V--F--M--Q--R--L--K--T--
2461   AATATTTTGCAGTATGCTTCCACCAGGCCCCCTACCTTGTCACCAATACCTCACATTCCT   2520
       N--I--L--Q--Y--A--S--T--R--P--P--T--L--S--P--I--P--H--I--P--
2521   CGAAGCCCTTACAAGTTTCCTAGTTCACCCTTACGGATTCCTGGAGGGAACATCTATATT   2580
       R--S--P--Y--K--F--P--S--S--P--L--R--I--P--G--G--N--I--Y--I--
2581   TCACCCCTGAAGAGTCCATATAAAATTTCAGAAGGTCTGCCAACACCAACAAAAATGACT   2640
       S--P--L--K--S--P--Y--K--I--S--E--G--L--P--T--P--T--K--M--T--
2641   CCAAGATCAAGAATCTTAGTATCAATTGGTGAATCATTCGGGACTTCTGAGAAGTTCCAG   2700
       P--R--S--R--I--L--V--S--I--G--E--S--F--G--T--S--E--K--F--Q--
2701   AAAATAAATCAGATGGTATGTAACAGCGACCGTGTGCTCAAAAGAAGTGCTGAAGGAAGC   2760
       K--I--N--Q--M--V--C--N--S--D--R--V--L--K--R--S--A--E--G--S--
2761   AACCCTCCTAAACCACTGAAAAAACTACGCTTTGATATTGAAGGATCAGATGAAGCAGAT   2820
       N--P--P--K--P--L--K--K--L--R--F--D--I--E--G--S--D--E--A--D--
2821   GGAAGTAAACATCTCCCAGGAGAGTCCAAATTTCAGCAGAAACTGGCAGAAATGACTTCT   2880
       G--S--K--H--L--P--G--E--S--K--F--Q--Q--K--L--A--E--M--T--S--
2881   ACTCGAACACGAATGCAAAAGCAGAAAATGAATGATAGCATGGATACCTCAAACAAGGAA   2940
       T--R--T--R--M--Q--K--Q--K--M--N--D--S--M--D--T--S--N--K--E--
2941   GAGAAATGAggatctcaggaccttggtggacactgtgtacacctctggattcattgtctc   3000
       E--K--***...................................................
3001   tcacagatgtgactgtataactttcccaggttctgtttatggccacatttaatatcttca   3060
       ............................................................
3061   gctctttttgtggatataaaatgtgcagatgcaattgtttgggtgattcctaagccactt   3120
       ............................................................
3121   gaaatgttagtcattgttatttatacaagattgaaaatcttgtgtaaatcctgccattta   3180
       ............................................................
3181   aaaagttgtagcagattgtttcctcttccaaagtaaaattgctgtgctttatggatagta   3240
       ............................................................
3241   agaatggccctagagtgggagtcctgataacccaggcctgtctgactactttgccttctt   3300
       ............................................................
3301   ttgtagcatataggtgatgtttgctcttgtttttattaatttatatgtatatttttttaa   3360
       ............................................................
3361   tttaacatgaacacccttagaaaatgtgtcctatctatcttccaaatgcaatttgattga   3420
       ............................................................
3421   ctgcccattcaccaaaattatcctgaactcttctgcaaaaatggatattattagaaatta   3480
       ............................................................
3481   gaaaaaaattactaattttacacattagattttattttactattggaatctgatatactg   3540
       ............................................................
3541   tgtgcttgttttataaaattttgcttttaattaaataaaagctggaagcaaagtataacc   3600
       ............................................................
3601   atatgatactatcatactactgaaacagatttcatacctcagaatgtaaaagaacttact   3660
       ............................................................
3661   gattattttcttcatccaacttatgtttttaaatgaggattattgatagtactcttggtt   3720
       ............................................................
3721   tttataccattcagatcactgaatttataaagtacccatctagtacttgaaaaagtaaag   3780
       ............................................................
3781   tgttctgccagatcttaggtatagaggaccctaacacagtatatcccaagtgcactttct   3840
       ............................................................
3841   aatgtttctgggtcctgaagaattaagatacaaattaattttactccataaacagactgt   3900
       ............................................................
3901   taattataggagccttaatttttttttcatagagatttgtctaattgcatctcaaaatta   3960
       ............................................................
3961   ttctgccctccttaatttgggaaggtttgtgttttctctggaatggtacatgtcttccat   4020
       ............................................................
4021   gtatcttttgaactggcaattgtctatttatcttttatttttttaagtcagtatggtcta   4080
       ............................................................
4081   acactggcatgttcaaagccacattatttctagtccaaaattacaagtaatcaagggtca   4140
       ............................................................
4141   ttatgggttaggcattaatgtttctatctgattttgtgcaaaagcttcaaattaaaacag   4200
       ............................................................
4201   ctgcattagaaaaagaggcgcttctcccctcccctacacctaaaggtgtatttaaactat   4260
       ............................................................
4261   cttgtgtgattaacttatttagagatgctgtaacttaaaataggggatatttaaggtagc   4320
       ............................................................
4321   ttcagctagcttttaggaaaatcactttgtctaactcagaattatttttaaaaagaaatc   4380
       ............................................................
4381   tggtcttgttagaaaacaaaattttattttgtgctcatttaagtttcaaacttactattt   4440
       ............................................................
4441   tgacagttattttgataacaatgacactagaaaacttgactccatttcatcattgtttct   4500
       ............................................................
4501   gcatgaatatcatacaaatcagttagtttttaggtcaagggcttactatttctgggtctt   4560
       ............................................................
4561   ttgctactaagttcacattagaattagtgccagaattttaggaacttcagagatcgtgta   4620
       ............................................................
4621   ttgagatttcttaaataatgcttcagatattattgctttattgcttttttgtattggtta   4680
       ............................................................
4681   aaactgtacatttaaaattgctatgttactattttctacaattaatagtttgtctatttt   4740
       ............................................................
4741   aaaataaattagttgttaagagtcttaa                                   4800
       ............................