Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: PRIM2

DNA primase subunit 2

Pant et al., Genome Res.16: 331-339, 2006; Chung et al., Epigenetics 7: 429-431, 2012; Santoni et al. Am J Hum Genet 100: 444-453, 2017

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens PRIM2 p58, PRIM2A  6p11.2  Conflicting Data Biallelic
1      ctcttccggtttcatatgaactctcccgccacccgggaacagtggctgccaccgtttgtg     60
       ............................................................
61     ttttcccgagtttgaattcttgcaggtgaccaagATGGAGTTTTCTGGAAGAAAGTGGAG    120
       ..................................M--E--F--S--G--R--K--W--R-
121    GAAGCTGAGGTTGGCAGGTGACCAGAGGAATGCTTCCTACCCTCATTGCCTTCAGTTTTA    180
       -K--L--R--L--A--G--D--Q--R--N--A--S--Y--P--H--C--L--Q--F--Y-
181    CTTGCAGCCACCTTCTGAAAACATATCTTTAATAGAATTTGAAAACTTGGCTATTGATAG    240
       -L--Q--P--P--S--E--N--I--S--L--I--E--F--E--N--L--A--I--D--R-
241    AGTTAAATTGTTAAAATCAGTTGAAAATCTTGGAGTGAGCTATGTGAAAGGAACTGAACA    300
       -V--K--L--L--K--S--V--E--N--L--G--V--S--Y--V--K--G--T--E--Q-
301    ATACCAGAGTAAGTTGGAGAGTGAGCTTCGGAAGCTCAAGTTTTCCTACAGAGAAAACTT    360
       -Y--Q--S--K--L--E--S--E--L--R--K--L--K--F--S--Y--R--E--N--L-
361    AGAAGATGAATATGAACCACGAAGAAGAGATCATATTTCTCATTTTATTTTGCGGCTTGC    420
       -E--D--E--Y--E--P--R--R--R--D--H--I--S--H--F--I--L--R--L--A-
421    TTATTGCCAGTCTGAAGAACTTAGACGCTGGTTCATTCAACAAGAAATGGATCTCCTTCG    480
       -Y--C--Q--S--E--E--L--R--R--W--F--I--Q--Q--E--M--D--L--L--R-
481    ATTTAGATTTAGTATTTTACCCAAGGATAAAATTCAGGATTTCTTAAAGGATAGCCAATT    540
       -F--R--F--S--I--L--P--K--D--K--I--Q--D--F--L--K--D--S--Q--L-
541    GCAGTTTGAGGCTATAAGTGATGAAGAGAAGACTCTTCGAGAACAGGAGATTGTTGCCTC    600
       -Q--F--E--A--I--S--D--E--E--K--T--L--R--E--Q--E--I--V--A--S-
601    ATCACCAAGTTTAAGTGGACTTAAGTTGGGGTTCGAGTCCATTTATAAGATCCCTTTTGC    660
       -S--P--S--L--S--G--L--K--L--G--F--E--S--I--Y--K--I--P--F--A-
661    TGATGCTCTGGATTTGTTTCGAGGAAGGAAAGTCTATTTGGAAGATGGCTTTGCTTACGT    720
       -D--A--L--D--L--F--R--G--R--K--V--Y--L--E--D--G--F--A--Y--V-
721    ACCACTTAAGGACATTGTGGCAATCATCCTGAATGAATTTAGAGCCAAACTGTCCAAGGC    780
       -P--L--K--D--I--V--A--I--I--L--N--E--F--R--A--K--L--S--K--A-
781    TTTGGCATTAACAGCCAGGTCCTTGCCTGCTGTGCAGTCTGATGAAAGACTTCAGCCTCT    840
       -L--A--L--T--A--R--S--L--P--A--V--Q--S--D--E--R--L--Q--P--L-
841    GCTCAATCACCTCAGTCATTCCTACACTGGCCAAGATTACAGTACCCAGGGAAATGTTGG    900
       -L--N--H--L--S--H--S--Y--T--G--Q--D--Y--S--T--Q--G--N--V--G-
901    GAAGATTTCTTTAGATCAGATTGATTTGCTTTCTACCAAATCCTTCCCACCTTGCATGCG    960
       -K--I--S--L--D--Q--I--D--L--L--S--T--K--S--F--P--P--C--M--R-
961    TCAGTTACATAAAGCCTTGCGGGAAAATCACCATCTTCGTCATGGAGGCCGAATGCAGTA   1020
       -Q--L--H--K--A--L--R--E--N--H--H--L--R--H--G--G--R--M--Q--Y-
1021   TGGCCTATTTCTGAAGGGCATTGGTTTAACTTTGGAACAGGCATTGCAGTTCTGGAAGCA   1080
       -G--L--F--L--K--G--I--G--L--T--L--E--Q--A--L--Q--F--W--K--Q-
1081   AGAATTTATCAAAGGAAAGATGGATCCAGACAAGTTTGATAAAGGTTACTCTTACAACAT   1140
       -E--F--I--K--G--K--M--D--P--D--K--F--D--K--G--Y--S--Y--N--I-
1141   CCGTCACAGCTTTGGAAAGGAAGGCAAGAGGACAGACTATACACCTTTCAGTTGCCTGAA   1200
       -R--H--S--F--G--K--E--G--K--R--T--D--Y--T--P--F--S--C--L--K-
1201   GATTATTCTGTCCAATCCACCAAGCCAAGGGGATTATCATGGGTGCCCATTCCGTCACAG   1260
       -I--I--L--S--N--P--P--S--Q--G--D--Y--H--G--C--P--F--R--H--S-
1261   TGATCCAGAGCTGCTGAAGCAAAAGTTGCAGTCATACAAGATCTCTCCTGGAGGGATAAG   1320
       -D--P--E--L--L--K--Q--K--L--Q--S--Y--K--I--S--P--G--G--I--S-
1321   CCAGATTTTGGATTTAGTAAAGGGGACACATTACCAGGTAGCCTGTCAAAAATACTTTGA   1380
       -Q--I--L--D--L--V--K--G--T--H--Y--Q--V--A--C--Q--K--Y--F--E-
1381   GATGATACACAATGTGGATGATTGTGGCTTTTCTTTGAATCATCCTAATCAGTTCTTTTG   1440
       -M--I--H--N--V--D--D--C--G--F--S--L--N--H--P--N--Q--F--F--C-
1441   TGAGAGCCAACGTATTCTAAATGGTGGTAAAGACATAAAGAAGGAACCTATCCAACCAGA   1500
       -E--S--Q--R--I--L--N--G--G--K--D--I--K--K--E--P--I--Q--P--E-
1501   AACTCCTCAACCCAAACCAAGTGTCCAGAAAACCAAGGATGCATCATCTGCTCTGGCCTC   1560
       -T--P--Q--P--K--P--S--V--Q--K--T--K--D--A--S--S--A--L--A--S-
1561   TTTAAATTCCTCTCTGGAAATGGATATGGAAGGACTAGAAGATTACTTTAGTGAAGATTC   1620
       -L--N--S--S--L--E--M--D--M--E--G--L--E--D--Y--F--S--E--D--S-
1621   TTAGgcagttttataaccctttttcctcaatagcctgtttcctgtttttaagattttgcc   1680
       -***........................................................
1681   tttgttgttgaaaaagggtttcactctgtcaccaaggcttagtgcagtgacacaattaca   1740
       ............................................................
1741   gctgattgcagccttgaccttcccagctcaagtgatcctcctacctcagcctcccaagta   1800
       ............................................................
1801   gttaggaccacaggtgtgcacctcatatccagataatttttttcaatttttttttgtaga   1860
       ............................................................
1861   ggtggggggtctccctatgttgcccaggcagatctcagactcctgggctcaagcgatcct   1920
       ............................................................
1921   cacacctcagcgtcccagagtgctgggattacggttgtgagccactgtgcctggcctttt   1980
       ............................................................
1981   ttttttttttaacctttttgtttaacttctctcttcactgcatcccaatccatctacagg   2040
       ............................................................
2041   catgcacacttattaggaaaggaggtttgaggtaacaacagagactttcactatattttg   2100
       ............................................................
2101   ctttgacagaaggaaagaggaggagtttctattaaaatctgtcacttgagtgatgtcatt   2160
       ............................................................
2161   taagtcctattttaggagataaaaacagctttggggactggttaaagtcccccagaaact   2220
       ............................................................
2221   acaataaagaacaacttttgttttaactcttaatcactttgtaattttgactcaatcctt   2280
       ............................................................
2281   ttctggaccatttttgttaataaatatcaaagtgtaaaaaaa                     2340
       ..........................................