Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: PKP3

Plakophilin 3

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement; ; Imprint Control Region(s): ICR_708, ICR_709 & ICR_710; Jima et al. Epigenetics 17: 1920-1943, 2022

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens PKP3   11p15  Predicted Maternal
1      ggcctcgagggacaggacgtgaagatagttgggtttggaggcggccgccaggcccaggcc     60
       ............................................................
61     cggtggacctgccgccATGCAGGACGGTAACTTCCTGCTGTCGGCCCTGCAGCCTGAGGC    120
       ................M--Q--D--G--N--F--L--L--S--A--L--Q--P--E--A-
121    CGGCGTGTGCTCCCTGGCGCTGCCCTCTGACCTGCAGCTGGACCGCCGGGGCGCCGAGGG    180
       -G--V--C--S--L--A--L--P--S--D--L--Q--L--D--R--R--G--A--E--G-
181    GCCGGAGGCCGAGCGGCTGCGGGCAGCCCGCGTCCAGGAGCAGGTCCGCGCCCGCCTCTT    240
       -P--E--A--E--R--L--R--A--A--R--V--Q--E--Q--V--R--A--R--L--L-
241    GCAGCTGGGACAGCAGCCGCGGCACAACGGGGCCGCTGAGCCCGAGCCTGAGGCCGAGAC    300
       -Q--L--G--Q--Q--P--R--H--N--G--A--A--E--P--E--P--E--A--E--T-
301    TGCCAGAGGCACATCCAGGGGGCAGTACCACACCCTGCAGGCTGGCTTCAGCTCTCGCTC    360
       -A--R--G--T--S--R--G--Q--Y--H--T--L--Q--A--G--F--S--S--R--S-
361    TCAGGGCCTGAGTGGGGACAAGACCTCGGGCTTCCGGCCCATCGCCAAGCCGGCCTACAG    420
       -Q--G--L--S--G--D--K--T--S--G--F--R--P--I--A--K--P--A--Y--S-
421    CCCAGCCTCCTGGTCCTCCCGCTCCGCCGTGGATCTGAGCTGCAGTCGGAGGCTGAGTTC    480
       -P--A--S--W--S--S--R--S--A--V--D--L--S--C--S--R--R--L--S--S-
481    AGCCCACAACGGGGGCAGCGCCTTTGGGGCCGCTGGGTACGGGGGTGCCCAGCCCACCCC    540
       -A--H--N--G--G--S--A--F--G--A--A--G--Y--G--G--A--Q--P--T--P-
541    TCCCATGCCCACCAGGCCCGTGTCCTTCCATGAGCGCGGTGGGGTTGGGAGCCGGGCCGA    600
       -P--M--P--T--R--P--V--S--F--H--E--R--G--G--V--G--S--R--A--D-
601    CTATGACACACTCTCCCTGCGCTCGCTGCGGCTGGGGCCCGGGGGCCTGGACGACCGCTA    660
       -Y--D--T--L--S--L--R--S--L--R--L--G--P--G--G--L--D--D--R--Y-
661    CAGCCTGGTGTCTGAGCAGCTGGAGCCCGCGGCCACCTCCACCTACAGGGCCTTTGCGTA    720
       -S--L--V--S--E--Q--L--E--P--A--A--T--S--T--Y--R--A--F--A--Y-
721    CGAGCGCCAGGCCAGCTCCAGCTCCAGCCGGGCAGGGGGGCTGGACTGGCCCGAGGCCAC    780
       -E--R--Q--A--S--S--S--S--S--R--A--G--G--L--D--W--P--E--A--T-
781    TGAGGTTTCCCCGAGCCGGACCATCCGTGCCCCTGCCGTGCGGACCCTGCAGCGATTCCA    840
       -E--V--S--P--S--R--T--I--R--A--P--A--V--R--T--L--Q--R--F--Q-
841    GAGCAGCCACCGGAGCCGCGGGGTAGGCGGGGCAGTGCCGGGGGCCGTCCTGGAGCCAGT    900
       -S--S--H--R--S--R--G--V--G--G--A--V--P--G--A--V--L--E--P--V-
901    GGCTCGAGCGCCATCTGTGCGCAGCCTCAGCCTCAGCCTGGCTGACTCGGGCCACCTGCC    960
       -A--R--A--P--S--V--R--S--L--S--L--S--L--A--D--S--G--H--L--P-
961    GGACGTGCATGGGTTCAACAGCTACGGTAGCCACCGAACCCTGCAGAGACTCAGCAGCGG   1020
       -D--V--H--G--F--N--S--Y--G--S--H--R--T--L--Q--R--L--S--S--G-
1021   TTTTGATGACATTGACCTGCCCTCAGCAGTCAAGTACCTCATGGCTTCAGACCCCAACCT   1080
       -F--D--D--I--D--L--P--S--A--V--K--Y--L--M--A--S--D--P--N--L-
1081   GCAGGTGCTGGGAGCGGCCTACATCCAGCACAAGTGCTACAGCGATGCAGCCGCCAAGAA   1140
       -Q--V--L--G--A--A--Y--I--Q--H--K--C--Y--S--D--A--A--A--K--K-
1141   GCAGGCCCGCAGCCTTCAGGCCGTGCCTAGGCTGGTGAAGCTCTTCAACCACGCCAACCA   1200
       -Q--A--R--S--L--Q--A--V--P--R--L--V--K--L--F--N--H--A--N--Q-
1201   GGAAGTGCAGCGCCATGCCACAGGTGCCATGCGCAACCTCATCTACGACAACGCTGACAA   1260
       -E--V--Q--R--H--A--T--G--A--M--R--N--L--I--Y--D--N--A--D--N-
1261   CAAGCTGGCCCTGGTGGAGGAGAACGGGATCTTCGAGCTGCTGCGGACACTGCGGGAGCA   1320
       -K--L--A--L--V--E--E--N--G--I--F--E--L--L--R--T--L--R--E--Q-
1321   GGATGATGAGCTTCGCAAAAATGTCACAGGGATCCTGTGGAACCTTTCATCCAGCGACCA   1380
       -D--D--E--L--R--K--N--V--T--G--I--L--W--N--L--S--S--S--D--H-
1381   CCTGAAGGACCGCCTGGCCAGAGACACGCTGGAGCAGCTCACAGACCTGGTGTTGAGCCC   1440
       -L--K--D--R--L--A--R--D--T--L--E--Q--L--T--D--L--V--L--S--P-
1441   CCTGTCGGGGGCTGGGGGTCCCCCCCTCATCCAGCAGAACGCCTCGGAGGCGGAGATCTT   1500
       -L--S--G--A--G--G--P--P--L--I--Q--Q--N--A--S--E--A--E--I--F-
1501   CTACAACGCCACCGGCTTCCTCAGGAACCTCAGCTCAGCCTCTCAGGCCACTCGCCAGAA   1560
       -Y--N--A--T--G--F--L--R--N--L--S--S--A--S--Q--A--T--R--Q--K-
1561   GATGCGGGAGTGCCACGGGCTGGTGGACGCCCTGGTCACCTCTATCAACCACGCCCTGGA   1620
       -M--R--E--C--H--G--L--V--D--A--L--V--T--S--I--N--H--A--L--D-
1621   CGCGGGCAAATGCGAGGACAAGAGCGTGGAGAACGCGGTGTGCGTCCTGCGGAACCTGTC   1680
       -A--G--K--C--E--D--K--S--V--E--N--A--V--C--V--L--R--N--L--S-
1681   CTACCGCCTCTACGACGAGATGCCGCCGTCCGCGCTGCAGCGGCTGGAGGGTCGCGGCCG   1740
       -Y--R--L--Y--D--E--M--P--P--S--A--L--Q--R--L--E--G--R--G--R-
1741   CAGGGACCTGGCGGGGGCGCCGCCGGGAGAGGTCGTGGGCTGCTTCACGCCGCAGAGCCG   1800
       -R--D--L--A--G--A--P--P--G--E--V--V--G--C--F--T--P--Q--S--R-
1801   GCGGCTGCGCGAGCTGCCCCTCGCCGCCGATGCGCTCACCTTCGCGGAGGTGTCCAAGGA   1860
       -R--L--R--E--L--P--L--A--A--D--A--L--T--F--A--E--V--S--K--D-
1861   CCCCAAGGGCCTCGAGTGGCTGTGGAGCCCCCAGATCGTGGGGCTGTACAACCGGCTGCT   1920
       -P--K--G--L--E--W--L--W--S--P--Q--I--V--G--L--Y--N--R--L--L-
1921   GCAGCGCTGCGAGCTCAACCGGCACACGACGGAGGCGGCCGCCGGGGCGCTGCAGAACAT   1980
       -Q--R--C--E--L--N--R--H--T--T--E--A--A--A--G--A--L--Q--N--I-
1981   CACGGCAGGCGACCGCAGGTGGGCGGGGGTGCTGAGCCGCCTGGCCCTGGAGCAGGAGCG   2040
       -T--A--G--D--R--R--W--A--G--V--L--S--R--L--A--L--E--Q--E--R-
2041   TATTCTGAACCCCCTGCTAGACCGTGTCAGGACCGCCGACCACCACCAGCTGCGCTCACT   2100
       -I--L--N--P--L--L--D--R--V--R--T--A--D--H--H--Q--L--R--S--L-
2101   GACTGGCCTCATCCGAAACCTGTCTCGGAACGCTAGGAACAAGGACGAGATGTCCACGAA   2160
       -T--G--L--I--R--N--L--S--R--N--A--R--N--K--D--E--M--S--T--K-
2161   GGTGGTGAGCCACCTGATCGAGAAGCTGCCGGGCAGCGTGGGTGAGAAGTCGCCCCCAGC   2220
       -V--V--S--H--L--I--E--K--L--P--G--S--V--G--E--K--S--P--P--A-
2221   CGAGGTGCTGGTCAACATCATAGCTGTGCTCAACAACCTGGTGGTGGCCAGCCCCATCGC   2280
       -E--V--L--V--N--I--I--A--V--L--N--N--L--V--V--A--S--P--I--A-
2281   TGCCCGAGACCTGCTGTATTTTGACGGACTCCGAAAGCTCATCTTCATCAAGAAGAAGCG   2340
       -A--R--D--L--L--Y--F--D--G--L--R--K--L--I--F--I--K--K--K--R-
2341   GGACAGCCCCGACAGTGAGAAGTCCTCCCGGGCAGCATCCAGCCTCCTGGCCAACCTGTG   2400
       -D--S--P--D--S--E--K--S--S--R--A--A--S--S--L--L--A--N--L--W-
2401   GCAGTACAACAAGCTCCACCGTGACTTCCGGGCGAAGGGCTATCGGAAGGAGGACTTCCT   2460
       -Q--Y--N--K--L--H--R--D--F--R--A--K--G--Y--R--K--E--D--F--L-
2461   GGGCCCATAGgtgaagccttctggaggagaaggtgacgtggcccagcgtccaagggacag   2520
       -G--P--***..................................................
2521   actcagctccaggctgcttggcagcccagcctggaggagaaggctaatgacggaggggcc   2580
       ............................................................
2581   cctcgctggggcccctgtgtgcatctttgagggtcctgggccaccaggaggggcagggtc   2640
       ............................................................
2641   ttatagctggggacttggcttccgcagggcagggggtggggcagggctcaaggctgctct   2700
       ............................................................
2701   ggtgtatggggtggtgacccagtcacattggcagaggtgggggttggctgtggcctggca   2760
       ............................................................
2761   gtatcttgggatagccagcactgggaataaagatggccatgaacagtcaaaaaaaaaaaa   2820
       ............................................................
2821   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                      2880
       .........................