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Homo sapiens: OTX1

Orthodenticle homeobox 1

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens OTX1 FLJ38361, MGC15736  2p13  Predicted Maternal
1      gatcaatcttcatcaggctacatttccaatcacctaaacaaccgagcaagacaagccact     60
       ............................................................
61     ccgacaaggttggctgcccggcgggtctctgtgagagatccaggtagatggtgaacggcc    120
       ............................................................
121    ccggcagctgagggcaggccaggcccccagacgcatcagaccctgaaggactgcgtggtg    180
       ............................................................
181    ggagccctgcaccgctcctggccccgggccccctggatccgtcggggcgcctccacccag    240
       ............................................................
241    ctgttagcATGATGTCTTACCTCAAACAACCCCCATACGGCATGAACGGGCTGGGCCTGG    300
       ........M--M--S--Y--L--K--Q--P--P--Y--G--M--N--G--L--G--L--A
301    CCGGGCCCGCCATGGACCTCCTGCACCCATCCGTGGGCTATCCGGCCACTCCGCGGAAGC    360
       --G--P--A--M--D--L--L--H--P--S--V--G--Y--P--A--T--P--R--K--Q
361    AGCGGCGGGAGCGCACCACCTTCACGCGTTCACAGCTGGACGTGCTCGAGGCGCTCTTCG    420
       --R--R--E--R--T--T--F--T--R--S--Q--L--D--V--L--E--A--L--F--A
421    CCAAGACTCGCTACCCTGACATCTTCATGCGGGAGGAGGTGGCGCTCAAGATCAACCTGC    480
       --K--T--R--Y--P--D--I--F--M--R--E--E--V--A--L--K--I--N--L--P
481    CGGAGTCTAGAGTCCAGGTCTGGTTCAAGAACCGCCGCGCCAAATGCCGCCAGCAGCAGC    540
       --E--S--R--V--Q--V--W--F--K--N--R--R--A--K--C--R--Q--Q--Q--Q
541    AGAGCGGGAGCGGAACCAAGAGCCGCCCAGCCAAGAAGAAGTCCTCTCCAGTGCGGGAGA    600
       --S--G--S--G--T--K--S--R--P--A--K--K--K--S--S--P--V--R--E--S
601    GCTCGGGCTCCGAAAGCAGTGGCCAATTCACGCCGCCAGCTGTGTCCAGCTCTGCCTCGT    660
       --S--G--S--E--S--S--G--Q--F--T--P--P--A--V--S--S--S--A--S--S
661    CCTCTAGCTCGGCGTCCAGCTCTTCCGCCAACCCAGCGGCTGCAGCGGCTGCGGGACTAG    720
       --S--S--S--A--S--S--S--S--A--N--P--A--A--A--A--A--A--G--L--G
721    GTGGGAACCCGGTGGCGGCCGCGTCGTCGCTGAGTACACCAGCTGCCTCATCTATCTGGA    780
       --G--N--P--V--A--A--A--S--S--L--S--T--P--A--A--S--S--I--W--S
781    GCCCGGCCTCCATCTCGCCAGGCTCAGCGCCCGCGTCCGTGTCGGTGCCGGAGCCATTGG    840
       --P--A--S--I--S--P--G--S--A--P--A--S--V--S--V--P--E--P--L--A
841    CCGCGCCTAGCAACACCTCGTGTATGCAGCGCTCCGTAGCTGCAGGCGCCGCCACCGCAG    900
       --A--P--S--N--T--S--C--M--Q--R--S--V--A--A--G--A--A--T--A--A
901    CAGCCTCTTATCCCATGTCCTACGGCCAGGGCGGCAGCTACGGCCAAGGCTACCCTACGC    960
       --A--S--Y--P--M--S--Y--G--Q--G--G--S--Y--G--Q--G--Y--P--T--P
961    CCTCCTCTTCCTACTTTGGCGGCGTGGACTGCAGCTCATACCTAGCGCCCATGCACTCAC   1020
       --S--S--S--Y--F--G--G--V--D--C--S--S--Y--L--A--P--M--H--S--H
1021   ATCACCACCCGCACCAGCTCAGCCCCATGGCACCCTCCTCCATGGCGGGCCACCATCATC   1080
       --H--H--P--H--Q--L--S--P--M--A--P--S--S--M--A--G--H--H--H--H
1081   ACCACCCACATGCGCACCACCCGTTGAGCCAGTCCTCAGGCCACCACCACCACCATCACC   1140
       --H--P--H--A--H--H--P--L--S--Q--S--S--G--H--H--H--H--H--H--H
1141   ACCACCACCACCAAGGCTACGGTGGCTCTGGGCTTGCCTTCAACTCTGCCGACTGCTTGG   1200
       --H--H--H--Q--G--Y--G--G--S--G--L--A--F--N--S--A--D--C--L--D
1201   ATTACAAGGAGCCTGGCGCCGCTGCTGCTTCCTCCGCCTGGAAACTCAACTTCAACTCCC   1260
       --Y--K--E--P--G--A--A--A--A--S--S--A--W--K--L--N--F--N--S--P
1261   CCGACTGTCTGGACTATAAGGACCAAGCCTCATGGCGGTTCCAGGTCTTGTGAgcccagg   1320
       --D--C--L--D--Y--K--D--Q--A--S--W--R--F--Q--V--L--***.......
1321   aatgaaagaggagaagaaacgcaactacctgcgccctccgtggtcccgatcctgttgctg   1380
       ............................................................
1381   ctgctgcaccgcccgcctttgcctcgtcttctccaaaactgaattttcaccccccaaaaa   1440
       ............................................................
1441   gatgtccattgcctgcactgccgcccccatttttgtgccacttgcttggggggatgtgca   1500
       ............................................................
1501   aacccaccctgccccttggatggggggaccggtgcttcggcttggcctacacattctata   1560
       ............................................................
1561   caggagagatgtattatttccccccttcagcccctactaaactcttaagcctccccttcc   1620
       ............................................................
1621   agtctttctggacagctattaagcacttgcagccttcggaggctctgcgctctgatccgc   1680
       ............................................................
1681   tgtttgagcccaacactttaatttattctttctggacactggagtcactaactggcgtgt   1740
       ............................................................
1741   ttctgcccattggagcacccgcacactactccaaatcaaaaccactaagagttcctcccg   1800
       ............................................................
1801   cgcagactgctgccccttcagctgccctcgattttgctccacgcctgccggccagagcct   1860
       ............................................................
1861   cccggcgtttcttccgccccagcggagtgcgctggggcgcgccagggctaggcccgccgg   1920
       ............................................................
1921   aggagcgcgtccccagccttccgcgcacagagccgcatcccgccccgccctgcgctggac   1980
       ............................................................
1981   tggttcaagcttccgcctcggcgggaacgctgtacatagtcaggtccgttccagggacca   2040
       ............................................................
2041   cttaaactttttagttgctgttggttggttgaactgaacatatcttgtcttagcacccag   2100
       ............................................................
2101   gaaacagaactttaagatatatacagcacatatatatatatatacatatatatatacaca   2160
       ............................................................
2161   tatataaaaaacaaaa                                               2220
       ................