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Homo sapiens: NLRP2

NLR family, pyrin domain containing 2

Bjornsson et al., Genome Res. 18: 771-779, 2008

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Mus musculus Nlrp2 N, P, Nb, PYP, NBS1, PAN1, Nalp2, PYPAF2, E330007A02Rik  Imprinted Maternal
Homo sapiens NLRP2 NBS1, PAN1, NALP2, PYPAF2, CLR19.9  19q13.42  Imprinted Maternal
1      agtgctcagcaacgattacgccccgagggccaatcacagggctgcggccgagagagaagc     60
       ............................................................
61     cttattagagctttctcaacctgcagccctcatctccgccggcgagtagggccaggtgtt    120
       ............................................................
121    gggagctcccacgtgggacaagATGGTGTCTTCGGCGCAGATGGGCTTCAACCTGCAGGC    180
       ......................M--V--S--S--A--Q--M--G--F--N--L--Q--A-
181    TCTCCTGGAGCAGCTCAGCCAGGATGAGTTGAGCAAGTTCAAGTATCTGATCACGACCTT    240
       -L--L--E--Q--L--S--Q--D--E--L--S--K--F--K--Y--L--I--T--T--F-
241    CTCCCTGGCACACGAGCTCCAGAAGATCCCCCACAAGGAGGTAGACAAGGCTGATGGGAA    300
       -S--L--A--H--E--L--Q--K--I--P--H--K--E--V--D--K--A--D--G--K-
301    GCAACTGGTAGAAATCCTCACCACCCATTGTGACAGCTACTGGGTGGAGATGGCGAGCCT    360
       -Q--L--V--E--I--L--T--T--H--C--D--S--Y--W--V--E--M--A--S--L-
361    CCAGGTCTTTGAAAAGATGCACCGAATGGATCTGTCTGAGAGAGCAAAGGATGAAGTCAG    420
       -Q--V--F--E--K--M--H--R--M--D--L--S--E--R--A--K--D--E--V--R-
421    AGAAGCAGCTTTGAAATCCTTTAATAAAAGGAAGCCTCTATCATTAGGGATAACACGGAA    480
       -E--A--A--L--K--S--F--N--K--R--K--P--L--S--L--G--I--T--R--K-
481    AGAACGACCACCTCTAGACGTGGACGAAATGCTGGAGCGCTTCAAAACAGAAGCACAAGC    540
       -E--R--P--P--L--D--V--D--E--M--L--E--R--F--K--T--E--A--Q--A-
541    GTTTACAGAAACGAAAGGAAATGTCATCTGCCTGGGTAAAGAAGTCTTTAAAGGAAAAAA    600
       -F--T--E--T--K--G--N--V--I--C--L--G--K--E--V--F--K--G--K--K-
601    GCCAGACAAAGACAATAGGTGCAGGTATATATTGAAGACGAAGTTCCGGGAGATGTGGAA    660
       -P--D--K--D--N--R--C--R--Y--I--L--K--T--K--F--R--E--M--W--K-
661    GAGCTGGCCTGGAGATAGCAAAGAGGTCCAGGTTATGGCTGAGAGATACAAGATGCTGAT    720
       -S--W--P--G--D--S--K--E--V--Q--V--M--A--E--R--Y--K--M--L--I-
721    CCCATTCAGCAACCCCAGGGTGCTTCCCGGGCCCTTCTCATACACGGTGGTGCTGTATGG    780
       -P--F--S--N--P--R--V--L--P--G--P--F--S--Y--T--V--V--L--Y--G-
781    TCCTGCAGGCCTTGGGAAAACCACGCTGGCCCAGAAACTAATGCTAGACTGGGCAGAGGA    840
       -P--A--G--L--G--K--T--T--L--A--Q--K--L--M--L--D--W--A--E--D-
841    CAACCTCATCCACAAATTCAAATATGCGTTCTACCTCAGCTGCAGGGAGCTCAGCCGCCT    900
       -N--L--I--H--K--F--K--Y--A--F--Y--L--S--C--R--E--L--S--R--L-
901    GGGCCCGTGCAGTTTTGCAGAGCTGGTCTTCAGGGACTGGCCTGAATTGCAGGATGACAT    960
       -G--P--C--S--F--A--E--L--V--F--R--D--W--P--E--L--Q--D--D--I-
961    TCCACACATCCTAGCCCAAGCACGGAAAATCTTGTTCGTGATTGACGGCTTTGATGAGCT   1020
       -P--H--I--L--A--Q--A--R--K--I--L--F--V--I--D--G--F--D--E--L-
1021   GGGAGCCGCACCTGGGGCGCTGATCGAGGACATCTGCGGGGACTGGGAGAAGAAGAAGCC   1080
       -G--A--A--P--G--A--L--I--E--D--I--C--G--D--W--E--K--K--K--P-
1081   GGTGCCCGTCCTCCTGGGGAGTTTGCTGAACAGGGTGATGTTACCCAAGGCCGCCCTGCT   1140
       -V--P--V--L--L--G--S--L--L--N--R--V--M--L--P--K--A--A--L--L-
1141   GGTCACCACGCGGCCCAGGGCCCTGAGGGACCTCCGGATCCTGGCGGAGGAGCCGATCTA   1200
       -V--T--T--R--P--R--A--L--R--D--L--R--I--L--A--E--E--P--I--Y-
1201   CATAAGGGTGGAGGGCTTCCTGGAGGAGGACAGGAGGGCCTATTTCCTGAGACACTTTGG   1260
       -I--R--V--E--G--F--L--E--E--D--R--R--A--Y--F--L--R--H--F--G-
1261   AGACGAGGACCAAGCCATGCGTGCCTTTGAGCTAATGAGGAGCAACGCGGCCCTGTTCCA   1320
       -D--E--D--Q--A--M--R--A--F--E--L--M--R--S--N--A--A--L--F--Q-
1321   GCTGGGCTCGGCCCCCGCGGTGTGCTGGATCGTGTGCACGACTCTGAAGCTGCAGATGGA   1380
       -L--G--S--A--P--A--V--C--W--I--V--C--T--T--L--K--L--Q--M--E-
1381   GAAGGGGGAGGACCCGGTCCCCACCTGCCTCACCCGCACGGGGCTGTTCCTGCGTTTCCT   1440
       -K--G--E--D--P--V--P--T--C--L--T--R--T--G--L--F--L--R--F--L-
1441   CTGCAGCCGGTTCCCGCAGGGCGCACAGCTGCGGGGCGCGCTGCGGACGCTGAGCCTCCT   1500
       -C--S--R--F--P--Q--G--A--Q--L--R--G--A--L--R--T--L--S--L--L-
1501   GGCCGCGCAGGGCCTGTGGGCGCAGACGTCCGTGCTTCACCGAGAGGATCTGGAAAGGCT   1560
       -A--A--Q--G--L--W--A--Q--T--S--V--L--H--R--E--D--L--E--R--L-
1561   CGGGGTGCAGGAGTCCGACCTCCGTCTGTTCCTGGACGGAGACATCCTCCGCCAGGACAG   1620
       -G--V--Q--E--S--D--L--R--L--F--L--D--G--D--I--L--R--Q--D--R-
1621   AGTCTCCAAAGGCTGCTACTCCTTCATCCACCTCAGCTTCCAGCAGTTTCTCACTGCCCT   1680
       -V--S--K--G--C--Y--S--F--I--H--L--S--F--Q--Q--F--L--T--A--L-
1681   GTTCTACACCCTGGAGAAGGAGGAGGAAGAGGATAGGGACGGCCACACCTGGGACATTGG   1740
       -F--Y--T--L--E--K--E--E--E--E--D--R--D--G--H--T--W--D--I--G-
1741   GGACGTACAGAAGCTGCTTTCCGGAGTAGAAAGACTCAGGAACCCCGACCTGATCCAAGC   1800
       -D--V--Q--K--L--L--S--G--V--E--R--L--R--N--P--D--L--I--Q--A-
1801   AGGCTACTACTCCTTTGGCCTCGCTAACGAGAAGAGAGCCAAGGAGTTGGAGGCCACTTT   1860
       -G--Y--Y--S--F--G--L--A--N--E--K--R--A--K--E--L--E--A--T--F-
1861   TGGCTGCCGGATGTCACCGGACATCAAACAGGAATTGCTGCGATGCGACATAAGTTGTAA   1920
       -G--C--R--M--S--P--D--I--K--Q--E--L--L--R--C--D--I--S--C--K-
1921   GGGTGGACATTCAACGGTGACAGACCTGCAGGAGCTCCTCGGCTGTCTGTACGAGTCTCA   1980
       -G--G--H--S--T--V--T--D--L--Q--E--L--L--G--C--L--Y--E--S--Q-
1981   GGAGGAGGAGCTGGTGAAGGAGGTGATGGCTCAGTTCAAAGAAATATCCCTGCACTTAAA   2040
       -E--E--E--L--V--K--E--V--M--A--Q--F--K--E--I--S--L--H--L--N-
2041   TGCAGTAGACGTTGTGCCATCTTCATTCTGCGTCAAGCACTGTCGAAACCTGCAGAAAAT   2100
       -A--V--D--V--V--P--S--S--F--C--V--K--H--C--R--N--L--Q--K--M-
2101   GTCACTGCAGGTAATAAAGGAGAATCTCCCGGAGAATGTCACTGCGTCTGAATCAGACGC   2160
       -S--L--Q--V--I--K--E--N--L--P--E--N--V--T--A--S--E--S--D--A-
2161   CGAGGTTGAGAGATCCCAGGATGATCAGCACATGCTTCCTTTCTGGACGGACCTTTGTTC   2220
       -E--V--E--R--S--Q--D--D--Q--H--M--L--P--F--W--T--D--L--C--S-
2221   CATATTTGGATCAAATAAGGATCTGATGGGTCTAGCAATCAATGATAGCTTTCTCAGTGC   2280
       -I--F--G--S--N--K--D--L--M--G--L--A--I--N--D--S--F--L--S--A-
2281   CTCCCTAGTAAGGATCCTGTGTGAACAAATAGCCTCTGACACCTGTCATCTCCAGAGAGT   2340
       -S--L--V--R--I--L--C--E--Q--I--A--S--D--T--C--H--L--Q--R--V-
2341   GGTGTTCAAAAACATTTCCCCAGCTGATGCTCATCGGAACCTCTGCCTAGCTCTTCGAGG   2400
       -V--F--K--N--I--S--P--A--D--A--H--R--N--L--C--L--A--L--R--G-
2401   TCACAAGACTGTAACGTATCTGACCCTTCAAGGCAATGACCAGGATGATATGTTTCCCGC   2460
       -H--K--T--V--T--Y--L--T--L--Q--G--N--D--Q--D--D--M--F--P--A-
2461   ATTGTGTGAGGTCTTGAGACATCCAGAATGTAACCTGCGATATCTCGGGTTGGTGTCTTG   2520
       -L--C--E--V--L--R--H--P--E--C--N--L--R--Y--L--G--L--V--S--C-
2521   TTCCGCTACCACTCAGCAGTGGGCTGATCTCTCCTTGGCCCTTGAAGTCAACCAGTCCCT   2580
       -S--A--T--T--Q--Q--W--A--D--L--S--L--A--L--E--V--N--Q--S--L-
2581   GACGTGCGTAAACCTCTCCGACAATGAGCTTCTGGATGAGGGTGCTAAGTTGCTGTACAC   2640
       -T--C--V--N--L--S--D--N--E--L--L--D--E--G--A--K--L--L--Y--T-
2641   AACTTTGAGACACCCCAAGTGCTTTCTGCAGAGGTTGTCGTTGGAAAACTGTCACCTTAC   2700
       -T--L--R--H--P--K--C--F--L--Q--R--L--S--L--E--N--C--H--L--T-
2701   AGAAGCCAATTGCAAGGACCTTGCTGCTGTGTTGGTTGTCAGCCGGGAGCTGACACACCT   2760
       -E--A--N--C--K--D--L--A--A--V--L--V--V--S--R--E--L--T--H--L-
2761   GTGCTTGGCCAAGAACCCCATTGGGAATACAGGGGTGAAGTTTCTGTGTGAGGGCTTGAG   2820
       -C--L--A--K--N--P--I--G--N--T--G--V--K--F--L--C--E--G--L--R-
2821   GTACCCCGAGTGTAAACTGCAGACCTTGGTGCTTTGGAACTGCGACATAACTAGCGATGG   2880
       -Y--P--E--C--K--L--Q--T--L--V--L--W--N--C--D--I--T--S--D--G-
2881   CTGCTGCGATCTCACAAAGCTTCTCCAAGAAAAATCAAGCCTGTTGTGTTTGGATCTGGG   2940
       -C--C--D--L--T--K--L--L--Q--E--K--S--S--L--L--C--L--D--L--G-
2941   GCTGAATCACATAGGAGTTAAGGGAATGAAGTTCCTGTGTGAGGCTTTGAGGAAACCACT   3000
       -L--N--H--I--G--V--K--G--M--K--F--L--C--E--A--L--R--K--P--L-
3001   GTGCAACTTGAGATGTCTGTGGTTGTGGGGATGTTCCATCCCTCCGTTCAGTTGTGAAGA   3060
       -C--N--L--R--C--L--W--L--W--G--C--S--I--P--P--F--S--C--E--D-
3061   CCTCTGCTCTGCCCTCAGCTGCAACCAGAGCCTCGTCACTCTGGACCTGGGTCAGAATCC   3120
       -L--C--S--A--L--S--C--N--Q--S--L--V--T--L--D--L--G--Q--N--P-
3121   CTTGGGGTCTAGTGGAGTGAAGATGCTGTTTGAAACCTTGACATGTTCCAGTGGCACCCT   3180
       -L--G--S--S--G--V--K--M--L--F--E--T--L--T--C--S--S--G--T--L-
3181   CCGGACACTCAGGTTGAAAATCGATGACTTTAATGATGAACTCAATAAGCTGCTGGAAGA   3240
       -R--T--L--R--L--K--I--D--D--F--N--D--E--L--N--K--L--L--E--E-
3241   AATAGAAGAAAAAAACCCACAACTGATTATTGATACTGAGAAACATCATCCCTGGGCAGA   3300
       -I--E--E--K--N--P--Q--L--I--I--D--T--E--K--H--H--P--W--A--E-
3301   AAGGCCTTCTTCTCATGACTTCATGATCTGAatccccccgagtcattcattctccatgaa   3360
       -R--P--S--S--H--D--F--M--I--***.............................
3361   gtcatcgattttccaggtgttggtgaactgcctgtgactcctctcctccccggcccctac   3420
       ............................................................
3421   ccctcagggataatgagttcattgctgggctagatgttttagccatgattctgcctctgt   3480
       ............................................................
3481   tttatacctgcacacatccttatctttgttacatatgaaatatctgtatcacgggtatat   3540
       ............................................................
3541   tgagagaaataaaggtgagagcattcacaaatgaaaaaaaaaaaaaaaaa             3600
       ..................................................