Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: LRRTM1

Leucine rich repeat transmembrane neuronal 1

Francks et al. Mol Psychiatry 12: 1129-1139, 2007

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Sus scrofa LRRTM1   Not Imprinted Biallelic
Homo sapiens LRRTM1   2p12  Imprinted Paternal
1      gacactcagtgagcagtaggtgcctgtgcaagctcgcgccgcacactgcctggtggaggg     60
       ............................................................
61     aaggagcccgggcgccgctcgccgctccccgcgccgccgtccgcacctccccaccgcccg    120
       ............................................................
121    ccgcccgccgcccgccgcccgcaaagcatgagtgagcccgctctctgcagctgcccgggg    180
       ............................................................
181    cgcgaatggcaggctgtttccgcggagtaaaaggtggcgccggtcagtggtcgtttccaa    240
       ............................................................
241    tgacggacattaaccagactgtcagatcctggggagtcgcgagccccgagtttggagttt    300
       ............................................................
301    tttccccccacaacgtcacagtccgaactgcagagggaaaggaaggcggcaggaaggcga    360
       ............................................................
361    agctcgggctccggcacgtagttgggaaacttgcgggtcctagaagtcgcctccccgcct    420
       ............................................................
421    tgccggccgcccttgcagccccgagccgagcagcaaagtgagacattgtgcgcctgccag    480
       ............................................................
481    atccgccggccgcggaccggggctgcctcggaaacacagaggggtcttctctcgccctgc    540
       ............................................................
541    atataattagcctgcacacaaagggagcagctgaatggaggttgtcactctctggaaaag    600
       ............................................................
601    gatttctgaccgagcgcttccaatggacattctccagtctctctggaaagattctcgcta    660
       ............................................................
661    ATGGATTTCCTGCTGCTCGGTCTCTGTCTATACTGGCTGCTGAGGAGGCCCTCGGGGGTG    720
       M--D--F--L--L--L--G--L--C--L--Y--W--L--L--R--R--P--S--G--V--
721    GTCTTGTGTCTGCTGGGGGCCTGCTTTCAGATGCTGCCCGCCGCCCCCAGCGGGTGCCCG    780
       V--L--C--L--L--G--A--C--F--Q--M--L--P--A--A--P--S--G--C--P--
781    CAGCTGTGCCGGTGCGAGGGGCGGCTGCTGTACTGCGAGGCGCTCAACCTCACCGAGGCG    840
       Q--L--C--R--C--E--G--R--L--L--Y--C--E--A--L--N--L--T--E--A--
841    CCCCACAACCTGTCCGGCCTGCTGGGCTTGTCCCTGCGCTACAACAGCCTCTCGGAGCTG    900
       P--H--N--L--S--G--L--L--G--L--S--L--R--Y--N--S--L--S--E--L--
901    CGCGCCGGCCAGTTCACGGGGTTAATGCAGCTCACGTGGCTCTATCTGGATCACAATCAC    960
       R--A--G--Q--F--T--G--L--M--Q--L--T--W--L--Y--L--D--H--N--H--
961    ATCTGCTCCGTGCAGGGGGACGCCTTTCAGAAACTGCGCCGAGTTAAGGAACTCACGCTG   1020
       I--C--S--V--Q--G--D--A--F--Q--K--L--R--R--V--K--E--L--T--L--
1021   AGTTCCAACCAGATCACCCAACTGCCCAACACCACCTTCCGGCCCATGCCCAACCTGCGC   1080
       S--S--N--Q--I--T--Q--L--P--N--T--T--F--R--P--M--P--N--L--R--
1081   AGCGTGGACCTCTCGTACAACAAGCTGCAGGCGCTCGCGCCCGACCTCTTCCACGGGCTG   1140
       S--V--D--L--S--Y--N--K--L--Q--A--L--A--P--D--L--F--H--G--L--
1141   CGGAAGCTCACCACGCTGCATATGCGGGCCAACGCCATCCAGTTTGTGCCCGTGCGCATC   1200
       R--K--L--T--T--L--H--M--R--A--N--A--I--Q--F--V--P--V--R--I--
1201   TTCCAGGACTGCCGCAGCCTCAAGTTTCTCGACATCGGATACAATCAGCTCAAGAGTCTG   1260
       F--Q--D--C--R--S--L--K--F--L--D--I--G--Y--N--Q--L--K--S--L--
1261   GCGCGCAACTCTTTCGCCGGCTTGTTTAAGCTCACCGAGCTGCACCTCGAGCACAACGAC   1320
       A--R--N--S--F--A--G--L--F--K--L--T--E--L--H--L--E--H--N--D--
1321   TTGGTCAAGGTGAACTTCGCCCACTTCCCGCGCCTCATCTCCCTGCACTCGCTCTGCCTG   1380
       L--V--K--V--N--F--A--H--F--P--R--L--I--S--L--H--S--L--C--L--
1381   CGGAGGAACAAGGTGGCCATTGTGGTCAGCTCGCTGGACTGGGTTTGGAACCTGGAGAAA   1440
       R--R--N--K--V--A--I--V--V--S--S--L--D--W--V--W--N--L--E--K--
1441   ATGGACTTGTCGGGCAACGAGATCGAGTACATGGAGCCCCATGTGTTCGAGACCGTGCCG   1500
       M--D--L--S--G--N--E--I--E--Y--M--E--P--H--V--F--E--T--V--P--
1501   CACCTGCAGTCCCTGCAGCTGGACTCCAACCGCCTCACCTACATCGAGCCCCGGATCCTC   1560
       H--L--Q--S--L--Q--L--D--S--N--R--L--T--Y--I--E--P--R--I--L--
1561   AACTCTTGGAAGTCCCTGACAAGCATCACCCTGGCCGGGAACCTGTGGGATTGCGGGCGC   1620
       N--S--W--K--S--L--T--S--I--T--L--A--G--N--L--W--D--C--G--R--
1621   AACGTGTGTGCCCTAGCCTCGTGGCTCAACAACTTCCAGGGGCGCTACGATGGCAACTTG   1680
       N--V--C--A--L--A--S--W--L--N--N--F--Q--G--R--Y--D--G--N--L--
1681   CAGTGCGCCAGCCCGGAGTACGCACAGGGCGAGGACGTCCTGGACGCCGTGTACGCCTTC   1740
       Q--C--A--S--P--E--Y--A--Q--G--E--D--V--L--D--A--V--Y--A--F--
1741   CACCTGTGCGAGGATGGGGCCGAGCCCACCAGCGGCCACCTGCTCTCGGCCGTCACCAAC   1800
       H--L--C--E--D--G--A--E--P--T--S--G--H--L--L--S--A--V--T--N--
1801   CGCAGTGATCTGGGGCCCCCTGCCAGCTCGGCCACCACGCTCGCGGACGGCGGGGAGGGG   1860
       R--S--D--L--G--P--P--A--S--S--A--T--T--L--A--D--G--G--E--G--
1861   CAGCACGACGGCACATTCGAGCCTGCCACCGTGGCTCTTCCAGGCGGCGAGCACGCCGAG   1920
       Q--H--D--G--T--F--E--P--A--T--V--A--L--P--G--G--E--H--A--E--
1921   AACGCCGTGCAGATCCACAAGGTGGTCACGGGCACCATGGCCCTCATCTTCTCCTTCCTC   1980
       N--A--V--Q--I--H--K--V--V--T--G--T--M--A--L--I--F--S--F--L--
1981   ATCGTGGTCCTGGTGCTCTACGTGTCCTGGAAGTGTTTCCCAGCCAGCCTCAGGCAGCTC   2040
       I--V--V--L--V--L--Y--V--S--W--K--C--F--P--A--S--L--R--Q--L--
2041   AGACAGTGCTTTGTCACGCAGCGCAGGAAGCAAAAGCAGAAACAGACCATGCATCAGATG   2100
       R--Q--C--F--V--T--Q--R--R--K--Q--K--Q--K--Q--T--M--H--Q--M--
2101   GCTGCCATGTCTGCCCAGGAATACTACGTTGATTACAAACCGAACCACATTGAGGGAGCC   2160
       A--A--M--S--A--Q--E--Y--Y--V--D--Y--K--P--N--H--I--E--G--A--
2161   CTGGTGATCATCAACGAGTATGGCTCGTGTACCTGCCACCAGCAGCCCGCGAGGGAATGC   2220
       L--V--I--I--N--E--Y--G--S--C--T--C--H--Q--Q--P--A--R--E--C--
2221   GAGGTGTGAttgtcccagtggctctcaacccatgcgctaccaaatacgcctgggcagccg   2280
       E--V--***...................................................
2281   ggacgggccggcgggcaccaggctggggtctccttgtctgtgctctgatatgctccttga   2340
       ............................................................
2341   ctgaaactttaaggggatctctcccagagacttgacattttagctttattgtgtcttaaa   2400
       ............................................................
2401   aacaaaagcgaattaaaacacaacaaaaaaccccaccccacaaccttcaggacagtctat   2460
       ............................................................
2461   cttaaatttcatatgagaactccttcctccctttgaagatctgtccatattcaggaatct   2520
       ............................................................
2521   gagagtgtaaaaaaggtaccaatcattgattttttttttttttgtaaactaaaatgttta   2580
       ............................................................
2581   aaataaaatagcatttacagtt                                         2640
       ......................