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Homo sapiens: LDB1

LIM domain binding 1

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens LDB1 NLI, CLIM2  10q24-q25  Predicted Maternal
1      gagggaggcagggagagaaagggagaaaggcaggcagccggcgggcgctgcgtgtgtgtt     60
       ............................................................
61     tgagtgtgcgagtgtgagtgagtgtgagtgccgggtcctgcctctcctggtgcccccagc    120
       ............................................................
121    agaggggcccggtggcctggggagggcgggcgggctgctcggaggcagaggcagcaagag    180
       ............................................................
181    gcggcggcggggagagccgagaaggaggaggaggagagaggaaagagcggagcagccatt    240
       ............................................................
241    gttgagggaaaccttgcaaacaaagaaggctccggactccccgcggccccccgcccccca    300
       ............................................................
301    ggccggccccctggcccccggcccccggcccagtggccattgtaactttcccccgggaca    360
       ............................................................
361    gcggccgccgcggggcgggccgaggcagtgcgtgcgagtctttgtgcggccggcggactg    420
       ............................................................
421    gagctcccagtcgggcctgcccgtcccactcgggacatgagctgctgaagttgtcccccc    480
       ............................................................
481    gtcagccctcacccctgccaggactcctctgggcttgcagtcgctcccccgtacctctcc    540
       ............................................................
541    tggccccctcagttctcccaggttgttcctcaaagtcattcaagctgtactcgccgaagg    600
       ............................................................
601    agcccccgaacggcaacgcctttccccccttccatcccggcaccATGCTGGATAGGGATG    660
       ............................................M--L--D--R--D--V
661    TGGGCCCAACTCCCATGTATCCGCCTACATACCTGGAGCCAGGGATTGGGAGGCACACAC    720
       --G--P--T--P--M--Y--P--P--T--Y--L--E--P--G--I--G--R--H--T--P
721    CATATGGCAACCAAACTGACTACAGAATATTTGAGCTTAACAAACGGCTTCAGAACTGGA    780
       --Y--G--N--Q--T--D--Y--R--I--F--E--L--N--K--R--L--Q--N--W--T
781    CAGAGGAGTGTGACAATCTCTGGTGGGATGCATTCACGACTGAGTTCTTTGAGGATGATG    840
       --E--E--C--D--N--L--W--W--D--A--F--T--T--E--F--F--E--D--D--A
841    CCATGTTGACCATCACTTTCTGCCTGGAGGATGGACCAAAGAGATATACCATTGGCCGGA    900
       --M--L--T--I--T--F--C--L--E--D--G--P--K--R--Y--T--I--G--R--T
901    CCCTGATCCCACGCTACTTCCGCAGCATCTTTGAGGGGGGTGCTACGGAGCTGTACTATG    960
       --L--I--P--R--Y--F--R--S--I--F--E--G--G--A--T--E--L--Y--Y--V
961    TTCTTAAGCACCCCAAGGAGGCATTCCACAGCAACTTTGTGTCCCTCGACTGTGACCAGG   1020
       --L--K--H--P--K--E--A--F--H--S--N--F--V--S--L--D--C--D--Q--G
1021   GCAGCATGGTGACCCAGCATGGCAAGCCCATGTTCACCCAGGTGTGTGTGGAGGGCCGGT   1080
       --S--M--V--T--Q--H--G--K--P--M--F--T--Q--V--C--V--E--G--R--L
1081   TGTACCTGGAGTTCATGTTTGACGACATGATGCGGATAAAGACGTGGCACTTCAGCATCC   1140
       --Y--L--E--F--M--F--D--D--M--M--R--I--K--T--W--H--F--S--I--R
1141   GGCAGCACCGAGAGCTCATCCCCCGCAGCATCCTTGCCATGCATGCCCAAGACCCCCAGA   1200
       --Q--H--R--E--L--I--P--R--S--I--L--A--M--H--A--Q--D--P--Q--M
1201   TGTTGGATCAGCTCTCCAAAAACATCACTCGGTGTGGGCTGTCCAATTCCACTCTCAACT   1260
       --L--D--Q--L--S--K--N--I--T--R--C--G--L--S--N--S--T--L--N--Y
1261   ACCTCCGACTCTGTGTGATACTCGAGCCCATGCAAGAGCTCATGTCACGCCACAAGACCT   1320
       --L--R--L--C--V--I--L--E--P--M--Q--E--L--M--S--R--H--K--T--Y
1321   ACAGCCTCAGCCCCCGCGACTGCCTCAAGACCTGCCTTTTCCAGAAGTGGCAGCGCATGG   1380
       --S--L--S--P--R--D--C--L--K--T--C--L--F--Q--K--W--Q--R--M--V
1381   TAGCACCCCCTGCGGAGCCCACACGTCAGCAGCCCAGCAAACGGCGGAAACGGAAGATGT   1440
       --A--P--P--A--E--P--T--R--Q--Q--P--S--K--R--R--K--R--K--M--S
1441   CAGGGGGCAGCACCATGAGCTCTGGTGGTGGCAACACCAACAACAGCAACAGCAAGAAGA   1500
       --G--G--S--T--M--S--S--G--G--G--N--T--N--N--S--N--S--K--K--K
1501   AGAGCCCAGCTAGCACCTTCGCCCTCTCCAGCCAGGTACCTGATGTGATGGTGGTGGGGG   1560
       --S--P--A--S--T--F--A--L--S--S--Q--V--P--D--V--M--V--V--G--E
1561   AGCCCACCCTGATGGGCGGGGAGTTCGGGGACGAGGACGAGAGGCTCATCACCCGGCTGG   1620
       --P--T--L--M--G--G--E--F--G--D--E--D--E--R--L--I--T--R--L--E
1621   AGAACACCCAGTTTGACGCAGCCAACGGCATTGACGACGAGGACAGCTTTAACAACTCCC   1680
       --N--T--Q--F--D--A--A--N--G--I--D--D--E--D--S--F--N--N--S--P
1681   CTGCACTGGGCGCCAACAGCCCCTGGAACAGCAAGCCTCCGTCCAGCCAAGAAAGCAAAT   1740
       --A--L--G--A--N--S--P--W--N--S--K--P--P--S--S--Q--E--S--K--S
1741   CGGAGAACCCCACGTCACAGGCCTCCCAGTAAaaggccctgctgtggccacccagtgctc   1800
       --E--N--P--T--S--Q--A--S--Q--***............................
1801   tgcctacctgccccacccctcacagccccagggagcagaagacagaatgaagagactgag   1860
       ............................................................
1861   catctaaaatgggcagcctccatccacccgcttcagggaggaactggactctctgggggc   1920
       ............................................................
1921   aggtgccaagatttgcccccccagtggccctgggctgggcctggcctctacagagccttt   1980
       ............................................................
1981   tagggggagggggtactcatgtggatgcctacttggaacctgggcctctgagacatgtcc   2040
       ............................................................
2041   tgaccaccccccagggcatttgcctccatcttcaccccagattgtgggtttcccatcccc   2100
       ............................................................
2101   ctgactttacccctttcaagcctggggttgtctatacccacagcccttagggacttaaag   2160
       ............................................................
2161   ttacggggcttcgttgaatgctccttcccctaggcagctggtaatagaggggtaaagctc   2220
       ............................................................
2221   tgggcccctcctccctgctgccacttatcccagctccaagtttttttaaaaataatatta   2280
       ............................................................
2281   ttaaaaatgtaagttaaaaaaaaaa                                      2340
       .........................