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Homo sapiens: HOXC4

Homeobox C4

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HOXC4 HOX3, cp19, HOX3E  12q13.3  Predicted Maternal
1      ttattgtggtttgtccgttccgagcgctccgcagaacagtcctccctgtaagagcctaac     60
       ............................................................
61     cattgccagggaaacctgccctgggcgctcccttcattagcagtattttttttaaattaa    120
       ............................................................
121    tctgattaataattatttttcccccatttaattttttttcctcccaggtggagttgccga    180
       ............................................................
181    agctgggggcagctggggagggtggggatgggaggggagagacagaagttgagggcatct    240
       ............................................................
241    ctctcttccttcccgaccctctggcccccaaggggcaggaggaatgcaggagcaggagtt    300
       ............................................................
301    gagcttgggagctgcagatgcctccgcccctcctctctcccaggctcttcctcctgcccc    360
       ............................................................
361    cttcttgcaactctccttaattttgtttggcttttggatgattataattatttttatttt    420
       ............................................................
421    tgaatttatataaagtatatgtgtgtgtgtgtggagctgagacaggctcggcagcggcac    480
       ............................................................
481    agaatgagggaagacgagaaagagagtgggagagagagaggcagagagggagagagggag    540
       ............................................................
541    agtgacagcagcgctcgcgggggctcaacccccagacctccagaaatgacgtcagaatca    600
       ............................................................
601    tttgcatcccgctgcctctacctgcctggtccagctgggaccctgcctcgccggccgcat    660
       ............................................................
661    ggccagagggttggaaattaATGATCATGAGCTCGTATTTGATGGACTCTAACTACATCG    720
       ....................M--I--M--S--S--Y--L--M--D--S--N--Y--I--D
721    ATCCGAAATTTCCTCCATGCGAAGAATATTCGCAAAATAGCTACATCCCTGAACACAGTC    780
       --P--K--F--P--P--C--E--E--Y--S--Q--N--S--Y--I--P--E--H--S--P
781    CGGAATATTACGGCCGGACCAGGGAATCGGGATTCCAGCATCACCACCAGGAGCTGTACC    840
       --E--Y--Y--G--R--T--R--E--S--G--F--Q--H--H--H--Q--E--L--Y--P
841    CACCACCGCCTCCGCGCCCTAGCTACCCTGAGCGCCAGTATAGCTGCACCAGTCTCCAGG    900
       --P--P--P--P--R--P--S--Y--P--E--R--Q--Y--S--C--T--S--L--Q--G
901    GGCCCGGCAATTCGCGAGGCCACGGGCCGGCCCAGGCGGGCCACCACCACCCCGAGAAAT    960
       --P--G--N--S--R--G--H--G--P--A--Q--A--G--H--H--H--P--E--K--S
961    CACAGTCGCTCTGCGAGCCGGCGCCTCTCTCAGGCGCCTCCGCCTCCCCGTCCCCAGCCC   1020
       --Q--S--L--C--E--P--A--P--L--S--G--A--S--A--S--P--S--P--A--P
1021   CGCCAGCCTGCAGCCAGCCAGCCCCCGACCATCCCTCCAGCGCCGCCAGCAAGCAACCCA   1080
       --P--A--C--S--Q--P--A--P--D--H--P--S--S--A--A--S--K--Q--P--I
1081   TAGTCTACCCATGGATGAAAAAAATTCACGTTAGCACGGTGAACCCCAATTATAACGGAG   1140
       --V--Y--P--W--M--K--K--I--H--V--S--T--V--N--P--N--Y--N--G--G
1141   GGGAACCCAAGCGCTCGAGGACAGCCTATACCCGGCAGCAAGTCCTGGAATTAGAGAAAG   1200
       --E--P--K--R--S--R--T--A--Y--T--R--Q--Q--V--L--E--L--E--K--E
1201   AGTTTCATTACAACCGCTACCTGACCCGAAGGAGAAGGATCGAGATCGCCCACTCGCTGT   1260
       --F--H--Y--N--R--Y--L--T--R--R--R--R--I--E--I--A--H--S--L--C
1261   GCCTCTCTGAGAGGCAGATCAAAATCTGGTTCCAAAACCGTCGCATGAAATGGAAGAAGG   1320
       --L--S--E--R--Q--I--K--I--W--F--Q--N--R--R--M--K--W--K--K--D
1321   ACCACCGACTCCCCAACACCAAAGTCAGGTCAGCACCCCCGGCCGGCGCTGCGCCCAGCA   1380
       --H--R--L--P--N--T--K--V--R--S--A--P--P--A--G--A--A--P--S--T
1381   CCCTTTCGGCAGCTACCCCGGGTACTTCTGAAGACCACTCCCAGAGCGCCACGCCGCCGG   1440
       --L--S--A--A--T--P--G--T--S--E--D--H--S--Q--S--A--T--P--P--E
1441   AGCAGCAACGGGCAGAGGACATTACCAGGTTATAAaacataactcacacccctgccccca   1500
       --Q--Q--R--A--E--D--I--T--R--L--***.........................
1501   ccccatgcccccaccctcccctcacacacaaattgactcttatttatagaatttaatata   1560
       ............................................................
1561   tatatatatatatatatatataggttcttttctctcttcctctcaccttgtcccttgtca   1620
       ............................................................
1621   gttccaaacagacaaaacagataaacaaacaagccccctgccctcctctccctcccactg   1680
       ............................................................
1681   ttaaggacccttttaagcatgtgatgttgtcttagcatggtacctgctgggtgttttttt   1740
       ............................................................
1741   ttaaaaggccattttggggggttatttattttttaagaaaaaaagctgcaaaaattatat   1800
       ............................................................
1801   attgcaaggtgtgatggtctggcttgggtgaatttcaggggaaatgaggaaaagaaaaaa   1860
       ............................................................
1861   ggaaagaaattttaaagccaattctcatccttctcctcctcctccttccccccctctttc   1920
       ............................................................
1921   cttaggccttttgcattgaaaatgcaccaggggaggttagtgagggggaagtcattttaa   1980
       ............................................................
1981   ggagaacaaagctatgaagttcttttgtattattgttgggggggggtgtgggaggagagg   2040
       ............................................................
2041   gggcgaagacagcagacaaagctaaatgcatctggagagcctctcagagctgttcagttt   2100
       ............................................................
2101   gaggagccaaaagaaaatcaaaatgaactttcagttcagagaggcagtctataggtagaa   2160
       ............................................................
2161   tctctccccacccctatcgtggttattgtgtttttggactgaatttacttgattattgta   2220
       ............................................................
2221   aaacttgcaataaagaattttagtgtcgatgtgaaatgccccgtgatcaataataaacca   2280
       ............................................................
2281   gtggatgtgaattagtttta                                           2340
       ....................