Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: HOXA5

Homeobox A5

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HOXA5 HOX1, HOX1C, HOX1.3, MGC9376  7p15-p14  Predicted Maternal
1      gggtgctatagacgcacaaacgaccgcgagccacaaatcaagcacacatatcaaaaaaca     60
       ............................................................
61     aATGAGCTCTTATTTTGTAAACTCATTTTGCGGTCGCTATCCAAATGGCCCGGACTACCA    120
       .M--S--S--Y--F--V--N--S--F--C--G--R--Y--P--N--G--P--D--Y--Q-
121    GTTGCATAATTATGGAGATCATAGTTCCGTGAGCGAGCAATTCAGGGACTCGGCGAGCAT    180
       -L--H--N--Y--G--D--H--S--S--V--S--E--Q--F--R--D--S--A--S--M-
181    GCACTCCGGCAGGTACGGCTACGGCTACAATGGCATGGATCTCAGCGTCGGCCGCTCGGG    240
       -H--S--G--R--Y--G--Y--G--Y--N--G--M--D--L--S--V--G--R--S--G-
241    CTCCGGCCACTTTGGCTCCGGAGAGCGCGCCCGCAGCTACGCTGCCAGCGCCAGCGCGGC    300
       -S--G--H--F--G--S--G--E--R--A--R--S--Y--A--A--S--A--S--A--A-
301    GCCCGCCGAGCCCAGGTACAGCCAGCCGGCCACGTCCACGCACTCTCCTCAGCCCGATCC    360
       -P--A--E--P--R--Y--S--Q--P--A--T--S--T--H--S--P--Q--P--D--P-
361    GCTGCCCTGCTCCGCCGTGGCCCCCTCGCCCGGCAGCGACAGCCACCACGGCGGGAAAAA    420
       -L--P--C--S--A--V--A--P--S--P--G--S--D--S--H--H--G--G--K--N-
421    CTCCCTAAGCAACTCCAGCGGCGCCTCGGCCGACGCCGGCAGCACCCACATCAGCAGCAG    480
       -S--L--S--N--S--S--G--A--S--A--D--A--G--S--T--H--I--S--S--R-
481    AGAGGGGGTTGGCACGGCGTCCGGAGCCGAGGAGGACGCCCCTGCCAGCAGCGAGCAGGC    540
       -E--G--V--G--T--A--S--G--A--E--E--D--A--P--A--S--S--E--Q--A-
541    GAGTGCGCAGAGCGAGCCGAGCCCGGCGCCGCCCGCCCAACCCCAGATCTACCCCTGGAT    600
       -S--A--Q--S--E--P--S--P--A--P--P--A--Q--P--Q--I--Y--P--W--M-
601    GCGCAAGCTGCACATAAGTCATGACAACATAGGCGGCCCGGAAGGCAAAAGGGCCCGGAC    660
       -R--K--L--H--I--S--H--D--N--I--G--G--P--E--G--K--R--A--R--T-
661    GGCCTACACGCGCTACCAGACCCTGGAGCTGGAGAAGGAGTTCCACTTCAACCGTTACCT    720
       -A--Y--T--R--Y--Q--T--L--E--L--E--K--E--F--H--F--N--R--Y--L-
721    GACCCGCAGAAGGAGGATTGAAATAGCACATGCTCTTTGCCTCTCCGAGAGACAAATTAA    780
       -T--R--R--R--R--I--E--I--A--H--A--L--C--L--S--E--R--Q--I--K-
781    AATCTGGTTCCAAAACCGGAGAATGAAGTGGAAAAAAGATAATAAGCTGAAAAGCATGAG    840
       -I--W--F--Q--N--R--R--M--K--W--K--K--D--N--K--L--K--S--M--S-
841    CATGGCCGCGGCAGGAGGGGCCTTCCGTCCCTGAgtatctgagcgtttaaagtactgagc    900
       -M--A--A--A--G--G--A--F--R--P--***..........................
901    agtattagcggatcccgcgtagtgtcagtactaaggtgactttctgaaactcccttgtgt    960
       ............................................................
961    tccttctgtgaagaagccctgttctcgttgccctaattcatcttttaatcatgagcctgt   1020
       ............................................................
1021   ttattgccattatagcgcctgtataagtagatctgctttctgttcatctctttgtcctga   1080
       ............................................................
1081   atggctttgtcttgaaaaaaaatagatgttttaacttatttatatgaagcaagctgtgtt   1140
       ............................................................
1141   acttgaagtaactataacaaaaaaagaaaagagaaaaaaaaacacacaaaaagtccccct   1200
       ............................................................
1201   tcaatctcgtttagtgccaatgttgtgtgttgcactcaagttgtttaactgtgcatgtgc   1260
       ............................................................
1261   gtggaagtgttcctgtctcaatagctccaagctgttaaagatatttttattcaaactacc   1320
       ............................................................
1321   tatattccttgt                                                   1380
       ............