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Homo sapiens: HOXA2

Homeobox A2

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HOXA2 HOX1K  7p15-p14  Predicted Maternal
1      tcttttgattaaagcccaaattgtcattgggcagaagcaatcatgtgacagccaattcgg     60
       ............................................................
61     tccaatttcaaccttgtctccatgaattcaatagtttaatagtagcgcggtccccatacg    120
       ............................................................
121    gctgtaatcagtgaattagaaaaaaaacaccctagcagcgatattctatgatagattttt    180
       ............................................................
181    tttcctctgcgctcgcctttttcctaggccttgcccccccaaagcccctccaaaagaggg    240
       ............................................................
241    aactttttctctgagggggctccaaggagaaggccATGAATTACGAATTTGAGCGAGAGA    300
       ...................................M--N--Y--E--F--E--R--E--I
301    TTGGTTTTATCAATAGCCAGCCGTCGCTCGCTGAGTGCCTGACATCTTTTCCCCCTGTCG    360
       --G--F--I--N--S--Q--P--S--L--A--E--C--L--T--S--F--P--P--V--A
361    CTGATACATTTCAAAGTTCATCAATCAAGACCTCGACGCTTTCACACTCGACACTGATTC    420
       --D--T--F--Q--S--S--S--I--K--T--S--T--L--S--H--S--T--L--I--P
421    CTCCTCCTTTTGAGCAGACCATTCCCAGCCTGAACCCCGGCAGTCACCCTCGCCACGGCG    480
       --P--P--F--E--Q--T--I--P--S--L--N--P--G--S--H--P--R--H--G--A
481    CTGGCGGCCGCCCCAAGCCGAGCCCCGCGGGCAGCCGCGGCAGCCCGGTGCCCGCCGGCG    540
       --G--G--R--P--K--P--S--P--A--G--S--R--G--S--P--V--P--A--G--A
541    CCCTGCAGCCGCCCGAGTACCCCTGGATGAAGGAGAAGAAGGCGGCCAAGAAAACCGCAC    600
       --L--Q--P--P--E--Y--P--W--M--K--E--K--K--A--A--K--K--T--A--L
601    TTCTGCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCAGCCACCGGCCCTGCTTGCCTCAGCC    660
       --L--P--A--A--A--A--A--A--T--A--A--A--T--G--P--A--C--L--S--H
661    ACAAAGAATCCCTGGAAATCGCCGATGGCAGCGGCGGGGGATCGCGGCGCCTGAGAACTG    720
       --K--E--S--L--E--I--A--D--G--S--G--G--G--S--R--R--L--R--T--A
721    CTTACACCAACACACAGCTTCTAGAGCTGGAAAAAGAATTTCATTTCAACAAGTACCTTT    780
       --Y--T--N--T--Q--L--L--E--L--E--K--E--F--H--F--N--K--Y--L--C
781    GCAGACCCCGAAGGGTGGAGATTGCAGCGCTGCTGGATTTGACTGAGAGACAAGTGAAAG    840
       --R--P--R--R--V--E--I--A--A--L--L--D--L--T--E--R--Q--V--K--V
841    TGTGGTTTCAGAACCGGAGGATGAAGCACAAGAGGCAGACCCAGTGCAAGGAAAACCAAA    900
       --W--F--Q--N--R--R--M--K--H--K--R--Q--T--Q--C--K--E--N--Q--N
901    ACAGCGAAGGGAAATGTAAAAGCCTTGAGGACTCCGAGAAAGTAGAGGAGGACGAGGAAG    960
       --S--E--G--K--C--K--S--L--E--D--S--E--K--V--E--E--D--E--E--E
961    AGAAGACGCTCTTTGAGCAAGCCCTTAGCGTCTCTGGGGCCCTTCTGGAGAGGGAAGGCT   1020
       --K--T--L--F--E--Q--A--L--S--V--S--G--A--L--L--E--R--E--G--Y
1021   ACACTTTTCAGCAAAATGCCCTCTCTCAGCAGCAGGCTCCCAATGGACACAATGGCGACT   1080
       --T--F--Q--Q--N--A--L--S--Q--Q--Q--A--P--N--G--H--N--G--D--S
1081   CCCAAAGTTTCCCAGTCTCGCCTTTAACCAGCAATGAGAAAAATCTGAAACATTTTCAGC   1140
       --Q--S--F--P--V--S--P--L--T--S--N--E--K--N--L--K--H--F--Q--H
1141   ACCAGTCACCCACTGTTCCCAACTGCTTGTCAACAATGGGCCAGAACTGTGGAGCTGGCC   1200
       --Q--S--P--T--V--P--N--C--L--S--T--M--G--Q--N--C--G--A--G--L
1201   TAAACAATGACAGTCCTGAGGCCCTTGAGGTCCCCTCTTTGCAGGACTTTAGCGTTTTCT   1260
       --N--N--D--S--P--E--A--L--E--V--P--S--L--Q--D--F--S--V--F--S
1261   CCACAGATTCCTGCCTGCAGCTTTCAGATGCAGTTTCACCCAGTTTGCCAGGTTCCCTCG   1320
       --T--D--S--C--L--Q--L--S--D--A--V--S--P--S--L--P--G--S--L--D
1321   ACAGTCCCGTAGATATTTCAGCTGACAGCTTAGACTTTTTTACAGACACACTCACCACAA   1380
       --S--P--V--D--I--S--A--D--S--L--D--F--F--T--D--T--L--T--T--I
1381   TCGACTTGCAGCATCTGAATTACTAAaaacattaaagcaaaacaaagcatcaccaaacaa   1440
       --D--L--Q--H--L--N--Y--***..................................
1441   aaactcctttgaccaggtggttttgccttcttttatttgggagtttattttttattttct   1500
       ............................................................
1501   tcttgacctaccccttccctcctttaagtgttgaggattttctgtttagtgattccctga   1560
       ............................................................
1561   cccagtttcaaacagagccatcttttacagattattttggagttttagttgttttaaacc   1620
       ............................................................
1621   taactcaacaaccctttatgtgattcctgagagcagtatgaggcctgcaagaaagtgatc   1680
       ............................................................
1681   atataattgtatcttcactttctttttatttttgtattacattgggatgcattgtcatgc   1740
       ............................................................
1741   atattttttgtagaataaattctcctttgctataagtaaaaaaaaaaaaaa            1800
       ...................................................