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Homo sapiens: HOXA11

Homeobox A11

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens HOXA11 HOX1, HOX1I  7p15-p14  Predicted Maternal
1      cttcaaagaggcagctgcagtggagaatcatgttaagctcggctactgcggagagcccaa     60
       ............................................................
61     ggtagcccaataATGGATTTTGATGAGCGTGGTCCCTGCTCCTCTAACATGTATTTGCCA    120
       ............M--D--F--D--E--R--G--P--C--S--S--N--M--Y--L--P--
121    AGTTGTACTTACTACGTCTCGGGTCCAGATTTCTCCAGCCTCCCTTCTTTTCTGCCCCAG    180
       S--C--T--Y--Y--V--S--G--P--D--F--S--S--L--P--S--F--L--P--Q--
181    ACCCCGTCTTCGCGCCCAATGACATACTCCTACTCCTCCAACCTGCCCCAGGTCCAACCC    240
       T--P--S--S--R--P--M--T--Y--S--Y--S--S--N--L--P--Q--V--Q--P--
241    GTGCGCGAAGTGACCTTCAGAGAGTACGCCATTGAGCCCGCCACTAAATGGCACCCCCGC    300
       V--R--E--V--T--F--R--E--Y--A--I--E--P--A--T--K--W--H--P--R--
301    GGCAATCTGGCCCACTGCTACTCCGCGGAGGAGCTCGTGCACAGAGACTGCCTGCAGGCG    360
       G--N--L--A--H--C--Y--S--A--E--E--L--V--H--R--D--C--L--Q--A--
361    CCCAGCGCGGCCGGCGTGCCTGGCGACGTGCTGGCCAAGAGCTCGGCCAACGTCTACCAC    420
       P--S--A--A--G--V--P--G--D--V--L--A--K--S--S--A--N--V--Y--H--
421    CACCCCACCCCCGCAGTCTCGTCCAATTTCTATAGCACCGTGGGCAGGAACGGCGTCCTG    480
       H--P--T--P--A--V--S--S--N--F--Y--S--T--V--G--R--N--G--V--L--
481    CCACAGGCTTTCGACCAGTTTTTCGAGACAGCCTACGGCACCCCGGAAAACCTCGCCTCC    540
       P--Q--A--F--D--Q--F--F--E--T--A--Y--G--T--P--E--N--L--A--S--
541    TCCGACTACCCCGGGGACAAGAGCGCCGAGAAGGGGCCCCCGGCGGCCACGGCGACCTCC    600
       S--D--Y--P--G--D--K--S--A--E--K--G--P--P--A--A--T--A--T--S--
601    GCGGCGGCGGCGGCGGCTGCAACGGGCGCGCCGGCAACTTCAAGTTCGGACAGCGGCGGC    660
       A--A--A--A--A--A--A--T--G--A--P--A--T--S--S--S--D--S--G--G--
661    GGCGGCGGCTGCCGGGAGACGGCGGCGGCAGCAGAGGAGAAAGAGCGGCGGCGGCGCCCC    720
       G--G--G--C--R--E--T--A--A--A--A--E--E--K--E--R--R--R--R--P--
721    GAGAGCAGCAGCAGCCCCGAGTCGTCTTCCGGCCACACTGAGGACAAGGCCGGCGGCTCC    780
       E--S--S--S--S--P--E--S--S--S--G--H--T--E--D--K--A--G--G--S--
781    AGTGGCCAACGCACCCGCAAAAAGCGCTGCCCCTATACCAAGTACCAGATCCGAGAGCTG    840
       S--G--Q--R--T--R--K--K--R--C--P--Y--T--K--Y--Q--I--R--E--L--
841    GAACGGGAGTTCTTCTTCAGCGTCTACATTAACAAAGAGAAGCGCCTGCAACTGTCCCGC    900
       E--R--E--F--F--F--S--V--Y--I--N--K--E--K--R--L--Q--L--S--R--
901    ATGCTCAACCTCACTGATCGTCAAGTCAAAATCTGGTTTCAGAACAGGAGAATGAAGGAA    960
       M--L--N--L--T--D--R--Q--V--K--I--W--F--Q--N--R--R--M--K--E--
961    AAAAAAATTAACAGAGACCGTTTACAGTACTACTCAGCAAATCCACTCCTCTAAgactcc   1020
       K--K--I--N--R--D--R--L--Q--Y--Y--S--A--N--P--L--L--***......
1021   agcggctggaattgggtggggggcttcatacacatgagataatatgcagattttgccctt   1080
       ............................................................
1081   gacaaagtcaagccacatggtgacttttgaaaagaggtgtgcaagagagggatgcatgga   1140
       ............................................................
1141   gatagccccacaggaggtggtctgggactctcttgattaagatctcagtggttaagattc   1200
       ............................................................
1201   ctaataatcattggattctgagagctgtgcatcagctagaatgacaggtttgggacccct   1260
       ............................................................
1261   ggtggttcactcttggagcctgcagagctgcgggctgggtgtggtctccactggggattg   1320
       ............................................................
1321   ggcccctgccagaccccctggagactaaccccaccacaccctccctctactgggagccta   1380
       ............................................................
1381   cccacccccaggacccctgagtaaaaaagctgtgtgctctccaagcccagttcagcttgg   1440
       ............................................................
1441   ggacaggggcaggaggaaggggtaggattactaggtgcccagaatgaggctgctttccaa   1500
       ............................................................
1501   agccaatgtgaacagcggctggacttggaggtagctttgaggtggaagagggctgcaaat   1560
       ............................................................
1561   ccttgtgggaaaagaaatctatgattccaggtggcatcagtgtctttccactcctcctag   1620
       ............................................................
1621   ccacccaccacactgatccagccctgagttcctagccaccgcctcctacagcccacctgg   1680
       ............................................................
1681   cttttctttctaccaaatgagggtcttggttccagcctgccactcaggcccaaagcctcg   1740
       ............................................................
1741   acacagagtggactgttccctgaggtgggagatgtggaaaagccaagaggctgcagccag   1800
       ............................................................
1801   gccactggcccctgagatctctgcaggaaatggctgtggagtgtggcagtttggcaaact   1860
       ............................................................
1861   ctccaccacacgtaatgaaacttggatttgctcagtgtctggctgcagagcagtgggcct   1920
       ............................................................
1921   ggccagcaggtccccagctttggctatgagggccttgagtcccccaaaacaccgggttcc   1980
       ............................................................
1981   agcaccacactcagccctcattggctcttgaactgagcttggaagcttctggtgaccttc   2040
       ............................................................
2041   caagagcctgagagtgaggtggaattattttaaaagataaatattatattatatatatat   2100
       ............................................................
2101   atatttccctgaaggaaccaaagcgaattttaaaagatgcaatgtagaggggaaaagaga   2160
       ............................................................
2161   tgatgaaaatatttaaaggccctatctgtttacagtgttccgtggttaaactcgctcact   2220
       ............................................................
2221   gctaagaatatttgaatgtatgcttcatacagggatggtgttcaaaaaacttgtaaataa   2280
       ............................................................
2281   aggaaccataatcaattttcttttctttctttctctttttcttttttcttttgccattag   2340
       ............................................................
2341   ttgatttcctttagggtgttggagggggtggaaaaggtattgagaatggtctttttaatc   2400
       ............................................................
2401   tcttgcaacatttggaaagagttagggaaatgctcagaggcagtcggcctggccggcctg   2460
       ............................................................
2461   gggatctcatctgggaaagccaggcaccctcccattgaatctcctttgcctccctgtgtt   2520
       ............................................................
2521   aagaaatgtctgttggctccatttgtactgggagtgttggcctgtcctcaattctggttc   2580
       ............................................................
2581   ttacccaccgtgtgtgttgcagcacttatacaggcaactgggcacaaggaaaataaagac   2640
       ............................................................
2641   ggtggaaatttga                                                  2700
       .............