Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: GATA3

GATA binding protein 3

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens GATA3 HDR, MGC2346, MGC5199, MGC5445  10p15  Predicted Paternal
1      ggcgccgtcttgatactttcagaaagaatgcattccctgtaaaaaaaaaaaaaaaatact     60
       ............................................................
61     gagagagggagagagagagagaagaagagagagagacggagggagagcgagacagagcga    120
       ............................................................
121    gcaacgcaatctgaccgagcaggtcgtacgccgccgcctcctcctcctctctgctcttcg    180
       ............................................................
181    ctacccaggtgacccgaggagggactccgcctccgagcggctgaggaccccggtgcagag    240
       ............................................................
241    gagcctggctcgcagaattgcagagtcgtcgcccctttttacaacctggtcccgttttat    300
       ............................................................
301    tctgccgtacccagtttttggatttttgtcttccccttcttctctttgctaaacgacccc    360
       ............................................................
361    tccaagataatttttaaaaaaccttctcctttgctcacctttgcttcccagccttcccat    420
       ............................................................
421    ccccccaccgaaagcaaatcattcaacgacccccgaccctccgacggcaggagccccccg    480
       ............................................................
481    acctcccaggcggaccgccctccctccccgcgcgcgggttccgggcccggcgagagggcg    540
       ............................................................
541    cgagcacagccgaggccATGGAGGTGACGGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCACC    600
       .................M--E--V--T--A--D--Q--P--R--W--V--S--H--H--H
601    ACCCCGCCGTGCTCAACGGGCAGCACCCGGACACGCACCACCCGGGCCTCAGCCACTCCT    660
       --P--A--V--L--N--G--Q--H--P--D--T--H--H--P--G--L--S--H--S--Y
661    ACATGGACGCGGCGCAGTACCCGCTGCCGGAGGAGGTGGATGTGCTTTTTAACATCGACG    720
       --M--D--A--A--Q--Y--P--L--P--E--E--V--D--V--L--F--N--I--D--G
721    GTCAAGGCAACCACGTCCCGCCCTACTACGGAAACTCGGTCAGGGCCACGGTGCAGAGGT    780
       --Q--G--N--H--V--P--P--Y--Y--G--N--S--V--R--A--T--V--Q--R--Y
781    ACCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTGTGCCGCCCGCCTCTGCTTCATGGATCCCTAC    840
       --P--P--T--H--H--G--S--Q--V--C--R--P--P--L--L--H--G--S--L--P
841    CCTGGCTGGACGGCGGCAAAGCCCTGGGCAGCCACCACACCGCCTCCCCCTGGAATCTCA    900
       --W--L--D--G--G--K--A--L--G--S--H--H--T--A--S--P--W--N--L--S
901    GCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACCACGGCTCCCCGGGGCCCCTCTCCGTCTACCCCC    960
       --P--F--S--K--T--S--I--H--H--G--S--P--G--P--L--S--V--Y--P--P
961    CGGCCTCGTCCTCCTCCTTGTCGGGGGGCCACGCCAGCCCGCACCTCTTCACCTTCCCGC   1020
       --A--S--S--S--S--L--S--G--G--H--A--S--P--H--L--F--T--F--P--P
1021   CCACCCCGCCGAAGGACGTCTCCCCGGACCCATCGCTGTCCACCCCAGGCTCGGCCGGCT   1080
       --T--P--P--K--D--V--S--P--D--P--S--L--S--T--P--G--S--A--G--S
1081   CGGCCCGGCAGGACGAGAAAGAGTGCCTCAAGTACCAGGTGCCCCTGCCCGACAGCATGA   1140
       --A--R--Q--D--E--K--E--C--L--K--Y--Q--V--P--L--P--D--S--M--K
1141   AGCTGGAGTCGTCCCACTCCCGTGGCAGCATGACCGCCCTGGGTGGAGCCTCCTCGTCGA   1200
       --L--E--S--S--H--S--R--G--S--M--T--A--L--G--G--A--S--S--S--T
1201   CCCACCACCCCATCACCACCTACCCGCCCTACGTGCCCGAGTACAGCTCCGGACTCTTCC   1260
       --H--H--P--I--T--T--Y--P--P--Y--V--P--E--Y--S--S--G--L--F--P
1261   CCCCCAGCAGCCTGCTGGGCGGCTCCCCCACCGGCTTCGGATGCAAGTCCAGGCCCAAGG   1320
       --P--S--S--L--L--G--G--S--P--T--G--F--G--C--K--S--R--P--K--A
1321   CCCGGTCCAGCACAGGCAGGGAGTGTGTGAACTGTGGGGCAACCTCGACCCCACTGTGGC   1380
       --R--S--S--T--G--R--E--C--V--N--C--G--A--T--S--T--P--L--W--R
1381   GGCGAGATGGCACGGGACACTACCTGTGCAACGCCTGCGGGCTCTATCACAAAATGAACG   1440
       --R--D--G--T--G--H--Y--L--C--N--A--C--G--L--Y--H--K--M--N--G
1441   GACAGAACCGGCCCCTCATTAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCTGCAGCCAGGAGAGCAGGGA   1500
       --Q--N--R--P--L--I--K--P--K--R--R--L--S--A--A--R--R--A--G--T
1501   CGTCCTGTGCGAACTGTCAGACCACCACAACCACACTCTGGAGGAGGAATGCCAATGGGG   1560
       --S--C--A--N--C--Q--T--T--T--T--T--L--W--R--R--N--A--N--G--D
1561   ACCCTGTCTGCAATGCCTGTGGGCTCTACTACAAGCTTCACAATATTAACAGACCCCTGA   1620
       --P--V--C--N--A--C--G--L--Y--Y--K--L--H--N--I--N--R--P--L--T
1621   CTATGAAGAAGGAAGGCATCCAGACCAGAAACCGAAAAATGTCTAGCAAATCCAAAAAGT   1680
       --M--K--K--E--G--I--Q--T--R--N--R--K--M--S--S--K--S--K--K--C
1681   GCAAAAAAGTGCATGACTCACTGGAGGACTTCCCCAAGAACAGCTCGTTTAACCCGGCCG   1740
       --K--K--V--H--D--S--L--E--D--F--P--K--N--S--S--F--N--P--A--A
1741   CCCTCTCCAGACACATGTCCTCCCTGAGCCACATCTCGCCCTTCAGCCACTCCAGCCACA   1800
       --L--S--R--H--M--S--S--L--S--H--I--S--P--F--S--H--S--S--H--M
1801   TGCTGACCACGCCCACGCCGATGCACCCGCCATCCAGCCTGTCCTTTGGACCACACCACC   1860
       --L--T--T--P--T--P--M--H--P--P--S--S--L--S--F--G--P--H--H--P
1861   CCTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGTTAGagccctgctcgatgctcacagggcccccagc   1920
       --S--S--M--V--T--A--M--G--***...............................
1921   gagagtccctgcagtccctttcgacttgcatttttgcaggagcagtatcatgaagcctaa   1980
       ............................................................
1981   acgcgatggatatatgtttttgaaggcagaaagcaaaattatgtttgccactttgcaaag   2040
       ............................................................
2041   gagctcactgtggtgtctgtgttccaaccactgaatctggaccccatctgtgaataagcc   2100
       ............................................................
2101   attctgactcatatcccctatttaacagggtctctagtgctgtgaaaaaaaaaatgctga   2160
       ............................................................
2161   acattgcatataacttatattgtaagaaatactgtacaatgactttattgcatctgggta   2220
       ............................................................
2221   gctgtaaggcatgaaggatgccaagaagtttaaggaatatgggagaaatagtgtggaaat   2280
       ............................................................
2281   taagaagaaactaggtctgatattcaaatggacaaactgccagttttgtttcctttcact   2340
       ............................................................
2341   ggccacagttgtttgatgcattaaaagaaaataaaaaaaagaaaaaagagaaaagaaaaa   2400
       ............................................................
2401   aaaagaaaaaagttgtaggcgaatcatttgttcaaagctgttggcctctgcaaaggaaat   2460
       ............................................................
2461   accagttctgggcaatcagtgttaccgttcaccagttgccgttgagggtttcagagagcc   2520
       ............................................................
2521   tttttctaggcctacatgctttgtgaacaagtccctgtaattgttgtttgtatgtataat   2580
       ............................................................
2581   tcaaagcaccaaaataagaaaagatgtagatttatttcatcatattatacagaccgaact   2640
       ............................................................
2641   gttgtataaatttatttactgctagtcttaagaactgctttctttcgtttgtttgtttca   2700
       ............................................................
2701   atattttccttctctctcaatttttggttgaataaactagattacattcagttggcctaa   2760
       ............................................................
2761   ggtggttgtgctcggagggtttcttgtttcttttccattttgtttttggatgatatttat   2820
       ............................................................
2821   taaatagcttctaagagtccggcggcatctgtcttgtccctattcctgcagcctgtgctg   2880
       ............................................................
2881   agggtagcagtgtatgagctaccagcgtgcatgtcagcgaccctggcccgacaggccacg   2940
       ............................................................
2941   tcctgcaatcggcccggctgcctcttcgccctgtcgtgttctgtgttagtgatcactgcc   3000
       ............................................................
3001   tttaatacagtctgttggaataatattataagcataataataaagtgaaaatattttaaa   3060
       ............................................................
3061   actacaa                                                        3120
       .......