Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: FAM50B

Family with sequence similarity 50, member B

Zhang et al., Nucleic Acids Res 39: 5388-5400, 2011; Imprint Control Region(s): ICR_366; Jima et al. Epigenetics 17: 1920-1943, 2022

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens FAM50B X5L, D6S2654E  6p25.2  Imprinted Paternal
Mus musculus Fam50b X5L, D0H6S2654E, XAP-5-like  13 14.18 cM  Not Imprinted Biallelic
1      agagcccggggcgagtgggcctctgctcgtgggtggttctcgtggaggtcagctcccgcg     60
       ............................................................
61     tgtctccgctcgacagggtgcttgggcagagcccatcgggtaggcgcgggccATGGCGCA    120
       ....................................................M--A--Q-
121    GTACAAGGGCACCATGCGCGAGGCAGGCCGTGCCATGCACCTCCTCAAGAAGCGCGAAAG    180
       -Y--K--G--T--M--R--E--A--G--R--A--M--H--L--L--K--K--R--E--R-
181    GCAGCGGGAGCAGATGGAGGTGCTGAAGCAGCGCATCGCCGAGGAGACCATCCTCAAGTC    240
       -Q--R--E--Q--M--E--V--L--K--Q--R--I--A--E--E--T--I--L--K--S-
241    GCAGGTGGACAAGAGGTTCTCGGCGCATTACGACGCCGTGGAGGCCGAGCTGAAGTCCAG    300
       -Q--V--D--K--R--F--S--A--H--Y--D--A--V--E--A--E--L--K--S--S-
301    CACGGTGGGCCTGGTGACCCTGAACGACATGAAGGCCCGGCAGGAGGCCCTGGTCAGGGA    360
       -T--V--G--L--V--T--L--N--D--M--K--A--R--Q--E--A--L--V--R--E-
361    GCGCGAGCGGCAGCTGGCCAAGCGCCAGCACCTGGAGGAGCAGCGGCTGCAGCAGGAGCG    420
       -R--E--R--Q--L--A--K--R--Q--H--L--E--E--Q--R--L--Q--Q--E--R-
421    GCAGCGGGAGCAGGAGCAGCGGCGCGAGCGCAAGCGTAAGATCTCCTGCCTGTCCTTTGC    480
       -Q--R--E--Q--E--Q--R--R--E--R--K--R--K--I--S--C--L--S--F--A-
481    ACTAGACGACCTCGATGACCAGGCCGACGCGGCCGAGGCCAGGCGCGCCGGAAACCTGGG    540
       -L--D--D--L--D--D--Q--A--D--A--A--E--A--R--R--A--G--N--L--G-
541    CAAGAACCCCGACGTGGACACCAGCTTCCTGCCAGACCGCGACCGCGAGGAGGAGGAGAA    600
       -K--N--P--D--V--D--T--S--F--L--P--D--R--D--R--E--E--E--E--N-
601    CCGGCTCCGAGAGGAGCTGCGCCAAGAGTGGGAGGCGCAGCGCGAGAAAGTGAAGGACGA    660
       -R--L--R--E--E--L--R--Q--E--W--E--A--Q--R--E--K--V--K--D--E-
661    GGAGATGGAGGTCACCTTCAGCTACTGGGACGGCTCGGGCCACCGGCGCACGGTGCGGGT    720
       -E--M--E--V--T--F--S--Y--W--D--G--S--G--H--R--R--T--V--R--V-
721    GCGCAAGGGCAACACGGTGCAGCAGTTCCTGAAGAAGGCGCTGCAGGGGCTGCGCAAGGA    780
       -R--K--G--N--T--V--Q--Q--F--L--K--K--A--L--Q--G--L--R--K--D-
781    CTTCCTGGAGCTGCGCTCCGCCGGCGTGGAGCAGCTCATGTTCATCAAGGAGGACCTCAT    840
       -F--L--E--L--R--S--A--G--V--E--Q--L--M--F--I--K--E--D--L--I-
841    CCTGCCGCACTACCACACCTTCTACGACTTCATCATCGCCAGGGCGAGGGGCAAGAGCGG    900
       -L--P--H--Y--H--T--F--Y--D--F--I--I--A--R--A--R--G--K--S--G-
901    GCCGCTCTTCAGCTTCGATGTGCACGATGACGTGCGCCTGCTCAGCGACGCCACCATGGA    960
       -P--L--F--S--F--D--V--H--D--D--V--R--L--L--S--D--A--T--M--E-
961    GAAGGACGAGTCGCACGCGGGCAAGGTGGTGCTGCGCAGCTGGTACGAGAAGAACAAGCA   1020
       -K--D--E--S--H--A--G--K--V--V--L--R--S--W--Y--E--K--N--K--H-
1021   CATCTTCCCCGCCAGCCGCTGGGAGGCCTATGACCCCGAGAAGAAGTGGGACAAGTACAC   1080
       -I--F--P--A--S--R--W--E--A--Y--D--P--E--K--K--W--D--K--Y--T-
1081   CATCCGCTAAcacccgcctgccagagcggaaaccgggggtggggggagacactcatttct   1140
       -I--R--***..................................................
1141   aggccccatcaccagtcacttgatttcgtgaccttgatttcttcccccaaatttaataaa   1200
       ............................................................
1201   gacagagggttctcatgattcacattggttgtgctattgctgatgttatgctttggttgc   1260
       ............................................................
1261   ttggttggtcttttctgagtattttagtgttgccacctggatttgctgcattgctctgct   1320
       ............................................................
1321   gagctgtattgaaaccatgactgggcccactgtcagacagaaattagaataggaggcaca   1380
       ............................................................
1381   ttttttacctggtggttatgagcatggacttgggggccacagtgactgagtttgattccc   1440
       ............................................................
1441   gacacagcctcctccttgctgtgtagttttgggtaagcttattaaacccccatgcctcag   1500
       ............................................................
1501   tttggtcacctgtaaaaggaaataacaagagcacttactttataagattgatgtgagtat   1560
       ............................................................
1561   taagtgaattaatatttgtaaaacgcttagctcttaataaatgtttctgttgttatta     1620
       ..........................................................