Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: DGCR6

DiGeorge syndrome critical region gene 6

Radhika Das, PhD Thesis: Identification of Novel Imprinted Domains in the Therian Lineage

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens DGCR6   22q11.21  Imprinted Random
1      cgcgaggcgcgccgcgatcggggactgtcctaagacgggcggggcgcgctgcgctaggga     60
       ............................................................
61     ctgtcataaaaggggcgggacgcgccgcggtcgggatgacgtgagctgggggcgctcgtc    120
       ............................................................
121    gctgcagccggcggctagcgggcgtccgcgccATGGAGCGCTACGCGGGCGCCTTGGAGG    180
       ................................M--E--R--Y--A--G--A--L--E--E
181    AGGTGGCGGACGGTGCCCGGCAGCAGGAGCGACACTACCAGCTGCTGTCGGCGTTACAGA    240
       --V--A--D--G--A--R--Q--Q--E--R--H--Y--Q--L--L--S--A--L--Q--S
241    GCCTGGTGAAGGAGTTGCCCAGCTCATTCCAGCAGCGCTTGTCCTACACCACGCTGAGCG    300
       --L--V--K--E--L--P--S--S--F--Q--Q--R--L--S--Y--T--T--L--S--D
301    ACCTGGCCCTGGCGCTTCTCGACGGCACCGTGTTCGAAATCGTGCAGGGGCTACTGGAGA    360
       --L--A--L--A--L--L--D--G--T--V--F--E--I--V--Q--G--L--L--E--I
361    TCCAGCACCTCACCGAAAAGAGCCTGTACAACCAGCGCCTGCGCCTACAGAACGAGCATC    420
       --Q--H--L--T--E--K--S--L--Y--N--Q--R--L--R--L--Q--N--E--H--R
421    GAGTGCTCAGGCAGGCGCTGCGGCAGAAGCACCAGGAAGCCCAGCAGGCCTGCCGGCCCC    480
       --V--L--R--Q--A--L--R--Q--K--H--Q--E--A--Q--Q--A--C--R--P--H
481    ATAACCTGCCTGTGCTTCAGGCGGCTCAGCAGCGAGAACTAGAGGCGGTGGAGCACCGGA    540
       --N--L--P--V--L--Q--A--A--Q--Q--R--E--L--E--A--V--E--H--R--I
541    TCCGTGAGGAGCAGCGGGCGATGGACCAGAAGATCGTCCTGGAGCTGGACCGGAAGGTGG    600
       --R--E--E--Q--R--A--M--D--Q--K--I--V--L--E--L--D--R--K--V--A
601    CTGACCAGCAGAGCACACTGGAGAAGGCGGGGGTGGCTGGCTTCTACGTGACCACCAACC    660
       --D--Q--Q--S--T--L--E--K--A--G--V--A--G--F--Y--V--T--T--N--P
661    CACAGGAGCTGATGCTGCAGATGAACCTGCTGGAACTCATCCGGAAGCTGCAGCAGAGGG    720
       --Q--E--L--M--L--Q--M--N--L--L--E--L--I--R--K--L--Q--Q--R--G
721    GCTGCTGGGCAGGGAAGGCAGCCCTGGGGCTAGGAGGTCCCTGGCAGTTGCCTGCTGCCC    780
       --C--W--A--G--K--A--A--L--G--L--G--G--P--W--Q--L--P--A--A--Q
781    AGTGTGACCAGAAAGGCAGCCCTGTCCCACCATAGccacaggcagcagaagtctgggcag    840
       --C--D--Q--K--G--S--P--V--P--P--***.........................
841    agttcatcttcttgacctttggccactgccttcccagctgcccgcagggggttccccctg    900
       ............................................................
901    ctgaggagagaccaggtggaccccagctgcctgtcacccttcatctgggacttgctgtca    960
       ............................................................
961    aaccctaggatagtctcataaaggggaggctgggccagcctgctgctgtctgcttcaggg   1020
       ............................................................
1021   ccaggcagagagtgaggctgggggttctcacaccttactccaccgggcacatcccaacct   1080
       ............................................................
1081   gcactggggcccactcgagcgcttgttctggtctcagccgctcccttggcagctgcagcc   1140
       ............................................................
1141   cccatgcagaagaggctcccaggcccaagctctgtgtgacccagagaaataaagatgcct   1200
       ............................................................
1201   cagtgtggcccgcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                  1260
       .............................................