Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: CMTM1

CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1

Sanchez-Delgado et al. PLoS Genet, 11: e1005644, 2015; Hamada et al. Am J Hum Genet, 99: 1045-1058, 2016

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens CMTM1 CKLFH, CKLFH1, CKLFSF1  16q21  Imprinted Paternal
1      gcgacgctggttcccaggggagagccagccgctgccgcggcactggttcagacggccagg     60
       ............................................................
61     ccctagggacccaccATGGATCCTGAACACGCCAAACCTGAGTCATCCGAGGCACCTTCA    120
       ...............M--D--P--E--H--A--K--P--E--S--S--E--A--P--S--
121    GGGAACTTGAAACAACCGGAGACTGCCGCAGCCCTGGCAAGTAGCGGCAGCGTAGTGAGT    180
       G--N--L--K--Q--P--E--T--A--A--A--L--A--S--S--G--S--V--V--S--
181    TCTGTACCCAAGGCACAGCGCAACATCTCAGCGAAGACCGCACCCCGGAAGCACCCCGCA    240
       S--V--P--K--A--Q--R--N--I--S--A--K--T--A--P--R--K--H--P--A--
241    GTCTCAATTCGCAGTGCGCAGTCCGCAGCCGCCGCACGTCCCCAAGGCAGTGAGGGCACC    300
       V--S--I--R--S--A--Q--S--A--A--A--A--R--P--Q--G--S--E--G--T--
301    GCACCCTCAAGGAAAGCCACCACACGCCCACCCCCAAAGCCCACACTCCCACCCCCCACG    360
       A--P--S--R--K--A--T--T--R--P--P--P--K--P--T--L--P--P--P--T--
361    CCCTCTGCACACACTGAATCCAAACTCTTAAATGAGATGGCGATCAAAGAGCGCGTGGAG    420
       P--S--A--H--T--E--S--K--L--L--N--E--M--A--I--K--E--R--V--E--
421    GGCCGAGCCAAAGTCCCGTACAAATTCAGGGACAGCCTCAAACGTTTCTCCTTCTCGCCC    480
       G--R--A--K--V--P--Y--K--F--R--D--S--L--K--R--F--S--F--S--P--
481    ACTGGAATGTTGAAGATCCTGAGACTGAGTCTTATCTTAGGAGCATTAGCTTGTTTCATC    540
       T--G--M--L--K--I--L--R--L--S--L--I--L--G--A--L--A--C--F--I--
541    ATCACCCAAGCCAATGAGTCATTTATAACAATCACAAGTCTGGAAATCTGCATTGTCGTT    600
       I--T--Q--A--N--E--S--F--I--T--I--T--S--L--E--I--C--I--V--V--
601    TTTTTTATTCTAATATATGTGCTAACCCTTCACCACTTGCTGACCTATTTACATTGGCCC    660
       F--F--I--L--I--Y--V--L--T--L--H--H--L--L--T--Y--L--H--W--P--
661    TTACTTGATCTTACCAACAGTATCATTACAGCTGTGTTCCTTTCAGTAGTTGCCATCTTG    720
       L--L--D--L--T--N--S--I--I--T--A--V--F--L--S--V--V--A--I--L--
721    GCCATGCAAGAAAAGAAAAGAAGGCATTTACTCTATGTCGGGGGGTCCCTGTGTCTCACA    780
       A--M--Q--E--K--K--R--R--H--L--L--Y--V--G--G--S--L--C--L--T--
781    GCGGTAATCGTGTGTTGCATCGATGCGTTTGTGGTCACCACGAAGATGAGGACCAACTTG    840
       A--V--I--V--C--C--I--D--A--F--V--V--T--T--K--M--R--T--N--L--
841    AAAAGATTCCTGGGAGTCGAAGTTGAAAGGAAGCTTTCCCCCGCCAAGGACGCCTACCCC    900
       K--R--F--L--G--V--E--V--E--R--K--L--S--P--A--K--D--A--Y--P--
901    GAAACCGGCCCCGACGCCCCGCAGAGGCCCGCCTGAagccagcccggcgccctagcagat    960
       E--T--G--P--D--A--P--Q--R--P--A--***........................
961    gcacgtgtctgtcgaatcgctgcctccgagcccacccccgagctcgcatgctgtcaccca   1020
       ............................................................
1021   ttccagcctaaatgtgaccataaaattagggctgctgcttttatcgagaa             1080
       ..................................................