Imprinted Gene Databases

Homo sapiens: CDH18

Cadherin 18, type 2

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens CDH18 CDH14, CDH24, CDH14L, EY-CADHERIN  5p15.2-p15.1  Predicted Paternal 
1      agatagactgaagaggagcaagaacagaaacagggagccagttacagatctatcccaaga     60
       ............................................................
61     attctggggagagatgatggtgtctgcagcagagtgacagcagtggagattgagagaaaa    120
       ............................................................
121    ggttgaaaatggttgcttgtgttcaactactgtgaagagttggaatcagacaactacggc    180
       ............................................................
181    tttgattttccaagtggttcagaatgtaaatatgatctgacctttccctgatggacagtt    240
       ............................................................
241    aaatcatggacacgctaaacaatttactttggactgtccttcctaaagatgctctggctt    300
       ............................................................
301    ctctcttgaatgctcactaagcttttgtagctgacaaggaaaggaaggaaaactgtgaac    360
       ............................................................
361    tggaaagttatcttacaATGAAAATTACTAGCACATCTTGCATCTGTCCAGTCCTAGTGT    420
       .................M--K--I--T--S--T--S--C--I--C--P--V--L--V--C
421    GTCTCTGTTTTGTGCAGAGGTGTTATGGAACTGCTCACCACAGCTCCATCAAGGTGATGA    480
       --L--C--F--V--Q--R--C--Y--G--T--A--H--H--S--S--I--K--V--M--R
481    GAAACCAAACCAAACACATTGAAGGTGAAACCGAAGTCCATCATCGTCCCAAAAGGGGAT    540
       --N--Q--T--K--H--I--E--G--E--T--E--V--H--H--R--P--K--R--G--W
541    GGGTATGGAATCAGTTCTTTGTTTTAGAAGAACATATGGGACCAGATCCTCAGTATGTTG    600
       --V--W--N--Q--F--F--V--L--E--E--H--M--G--P--D--P--Q--Y--V--G
601    GAAAGCTGCACTCCAATTCTGACAAAGGTGATGGATCTGTCAAGTACATCCTTACTGGAG    660
       --K--L--H--S--N--S--D--K--G--D--G--S--V--K--Y--I--L--T--G--E
661    AGGGTGCTGGGACTATATTTATCATTGACGATACCACGGGTGATATCCACTCAACAAAAA    720
       --G--A--G--T--I--F--I--I--D--D--T--T--G--D--I--H--S--T--K--S
721    GCCTAGACAGAGAGCAGAAGACCCACTATGTGCTTCATGCTCAAGCTATTGATAGACGTA    780
       --L--D--R--E--Q--K--T--H--Y--V--L--H--A--Q--A--I--D--R--R--T
781    CAAACAAACCTCTTGAGCCTGAATCCGAGTTCATCATCAAAGTGCAAGACATCAATGACA    840
       --N--K--P--L--E--P--E--S--E--F--I--I--K--V--Q--D--I--N--D--N
841    ACGCTCCAAAATTCACAGATGGACCATACATTGTTACTGTGCCTGAAATGTCAGATATGG    900
       --A--P--K--F--T--D--G--P--Y--I--V--T--V--P--E--M--S--D--M--G
901    GTACCTCTGTTCTACAGGTGACAGCTACTGATGCAGATGACCCTACCTATGGAAACAGCG    960
       --T--S--V--L--Q--V--T--A--T--D--A--D--D--P--T--Y--G--N--S--A
961    CTCGGGTGGTTTACAGCATTCTCCAAGGACAACCCTACTTCTCCGTCGACCCTAAAACAG   1020
       --R--V--V--Y--S--I--L--Q--G--Q--P--Y--F--S--V--D--P--K--T--G
1021   GAGTTATTAGAACGGCCTTACATAACATGGACAGAGAAGCCAGAGAACATTACTCCGTAG   1080
       --V--I--R--T--A--L--H--N--M--D--R--E--A--R--E--H--Y--S--V--V
1081   TCATTCAAGCCAAAGACATGGCTGGGCAAGTTGGAGGGCTTTCAGGATCTACAACAGTCA   1140
       --I--Q--A--K--D--M--A--G--Q--V--G--G--L--S--G--S--T--T--V--N
1141   ACATCACCTTAACCGATGTCAATGACAACCCACCACGCTTTCCTCAAAAACACTATCAGC   1200
       --I--T--L--T--D--V--N--D--N--P--P--R--F--P--Q--K--H--Y--Q--L
1201   TATATGTTCCTGAGTCAGCTCAAGTTGGTTCAGCTGTTGGGAAAATCAAGGCAAATGATG   1260
       --Y--V--P--E--S--A--Q--V--G--S--A--V--G--K--I--K--A--N--D--A
1261   CTGACACTGGCTCAAATGCTGACATGACCTACTCCATCATAAATGGTGATGGCATGGGAA   1320
       --D--T--G--S--N--A--D--M--T--Y--S--I--I--N--G--D--G--M--G--I
1321   TATTCTCAATCTCCACTGACAAAGAGACCAGAGAAGGAATCCTTTCTTTAAAGAAGCCAC   1380
       --F--S--I--S--T--D--K--E--T--R--E--G--I--L--S--L--K--K--P--L
1381   TGAACTATGAGAAAAAGAAGTCATATACCCTCAACATAGAAGGAGCAAATACACATCTTG   1440
       --N--Y--E--K--K--K--S--Y--T--L--N--I--E--G--A--N--T--H--L--D
1441   ATTTTCGCTTTTCTCACTTGGGTCCTTTTAAAGATGCTACTATGCTGAAGATCATTGTTG   1500
       --F--R--F--S--H--L--G--P--F--K--D--A--T--M--L--K--I--I--V--G
1501   GGGATGTAGATGAACCACCACTATTTTCCATGCCTTCCTACCTCATGGAAGTCTACGAAA   1560
       --D--V--D--E--P--P--L--F--S--M--P--S--Y--L--M--E--V--Y--E--N
1561   ATGCCAAGATTGGGACCGTCGTTGGTACAGTTTTGGCACAAGATCCTGACAGTACTAACA   1620
       --A--K--I--G--T--V--V--G--T--V--L--A--Q--D--P--D--S--T--N--S
1621   GCTTAGTAAGATACTTCATCAACTACAATGTTGAAGACGACAGATTTTTCAACATTGATG   1680
       --L--V--R--Y--F--I--N--Y--N--V--E--D--D--R--F--F--N--I--D--A
1681   CCAATACTGGGACCATTAGGACTACAAAGGTTCTCGACAGAGAAGAAACTCCATGGTACA   1740
       --N--T--G--T--I--R--T--T--K--V--L--D--R--E--E--T--P--W--Y--N
1741   ACATCACAGTCACTGCTTCAGAAATTGATAATCCTGATTTGCTGAGCCATGTCACAGTGG   1800
       --I--T--V--T--A--S--E--I--D--N--P--D--L--L--S--H--V--T--V--G
1801   GTATTAGAGTTCTGGATGTCAATGACAATCCACCCGAACTTGCCAGGGAATATGATATTA   1860
       --I--R--V--L--D--V--N--D--N--P--P--E--L--A--R--E--Y--D--I--I
1861   TTGTATGTGAAAATTCTAAGCCTGGCCAGGTTATTCATACCATCAGTGCCACTGATAAAG   1920
       --V--C--E--N--S--K--P--G--Q--V--I--H--T--I--S--A--T--D--K--D
1921   ATGATTTTGCCAATGGACCAAGGTTTAACTTCTTTCTTGATGAACGCCTGCCTGTAAATC   1980
       --D--F--A--N--G--P--R--F--N--F--F--L--D--E--R--L--P--V--N--P
1981   CAAACTTCACTCTGAAGGACAATGAAGATAACACAGCCAGCATTCTGACAAGGCGGAGGA   2040
       --N--F--T--L--K--D--N--E--D--N--T--A--S--I--L--T--R--R--R--R
2041   GATTTAGTCGAACTGTTCAGGATGTGTATTATCTGCCCATTATGATCTCTGATGGTGGAA   2100
       --F--S--R--T--V--Q--D--V--Y--Y--L--P--I--M--I--S--D--G--G--I
2101   TCCCCTCTCTCAGCAGCAGCAGCACCCTCACCATCAGGGTTTGTGCATGCGAGAGAGATG   2160
       --P--S--L--S--S--S--S--T--L--T--I--R--V--C--A--C--E--R--D--G
2161   GGCGTGTGCGGACCTGCCATGCAGAAGCCTTCCTGTCCTCGGCTGGTTTGAGTACAGGAG   2220
       --R--V--R--T--C--H--A--E--A--F--L--S--S--A--G--L--S--T--G--A
2221   CCTTAATCGCTATTCTTCTCTGTGTTCTCATTCTCCTGGCAATTGTGGTACTTTTTATCA   2280
       --L--I--A--I--L--L--C--V--L--I--L--L--A--I--V--V--L--F--I--T
2281   CCCTGAGGCGCAGCAAAAAAGAGCCCTTGATCATTTCAGAAGAGGATGTACGGGAGAACG   2340
       --L--R--R--S--K--K--E--P--L--I--I--S--E--E--D--V--R--E--N--V
2341   TGGTCACCTATGATGATGAAGGAGGCGGAGAGGAAGACACAGAGGCCTTTGACATCACAG   2400
       --V--T--Y--D--D--E--G--G--G--E--E--D--T--E--A--F--D--I--T--A
2401   CCTTGAGGAATCCTTCTGCTGCTGAGGAGCTCAAGTACCGGAGGGATATCAGACCTGAAG   2460
       --L--R--N--P--S--A--A--E--E--L--K--Y--R--R--D--I--R--P--E--V
2461   TGAAGCTCACTCCCAGACACCAGACATCATCCACCCTGGAAAGCATAGATGTTCAGGAAT   2520
       --K--L--T--P--R--H--Q--T--S--S--T--L--E--S--I--D--V--Q--E--F
2521   TTATTAAGCAAAGACTGGCAGAAGCAGACCTAGACCCTAGCGTTCCCCCTTATGACTCTC   2580
       --I--K--Q--R--L--A--E--A--D--L--D--P--S--V--P--P--Y--D--S--L
2581   TTCAGACTTATGCCTATGAGGGTCAGAGATCAGAAGCTGGGTCTATCAGCTCGCTGGATT   2640
       --Q--T--Y--A--Y--E--G--Q--R--S--E--A--G--S--I--S--S--L--D--S
2641   CAGCAACGACACAATCAGACCAGGATTATCACTACCTTGGAGACTGGGGACCCGAGTTTA   2700
       --A--T--T--Q--S--D--Q--D--Y--H--Y--L--G--D--W--G--P--E--F--K
2701   AAAAGTTAGCTGAACTCTATGGAGAAATAGAATCTGAAAGAACAACTTAGggggtcagtt   2760
       --K--L--A--E--L--Y--G--E--I--E--S--E--R--T--T--***..........
2761   cttgcaaccttgtggaatttgcttcctgagtaagtggatatacaacctcagcaatgacaa   2820
       ............................................................
2821   ggaagaagtgtggaaacagtacttggaactgaggaagctggacacagctcctgtagaaac   2880
       ............................................................
2881   aagtgcccttttcatgatcgaaactgggttatttaattggaagaaagtaaaaaaaaaaaa   2940
       ............................................................
2941   aaaa                                                           3000
       ....