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Homo sapiens: APBA1

Amyloid beta precursor protein-binding, family A, member 1

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens APBA1 X11, X11A, MINT1, D9S411E, X11ALPHA  9q13-q21.1  Predicted Paternal
1      gggtccgagcagcggctgcggagccggagctgggcgagggcggctgcggtcccggcggcg     60
       ............................................................
61     gcggcggcggcggcagctgcggcgggagaagatggtggcgctggaggcagcagcggctgg    120
       ............................................................
121    agcggagctttattcccaggcttggcaccagcgctgtcactagcgccgcctgctcccgcg    180
       ............................................................
181    ggcccgcggacccagctgtcaggcaagcccagtggagcaaaatgagagcgcagtgagccg    240
       ............................................................
241    ggcccagcttctctcctagccgttccgactcccaccATGAACCACTTGGAGGGGTCTGCG    300
       ....................................M--N--H--L--E--G--S--A--
301    GAGGTGGAGGTGACCGACGAGGCGGCAGGTGGGGAGGTGAACGAGTCGGTGGAGGCCGAC    360
       E--V--E--V--T--D--E--A--A--G--G--E--V--N--E--S--V--E--A--D--
361    CTGGAGCACCCCGAGGTGGAAGAGGAACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGCAGCACTATGTG    420
       L--E--H--P--E--V--E--E--E--Q--Q--Q--P--P--Q--Q--Q--H--Y--V--
421    GGCCGCCACCAGCGCGGGCGAGCCCTCGAGGACCTCCGCGCCCAGCTCGGCCAGGAGGAA    480
       G--R--H--Q--R--G--R--A--L--E--D--L--R--A--Q--L--G--Q--E--E--
481    GAGGAGCGCGGGGAATGCCTGGCGCGCTCAGCCAGCACGGAGAGCGGCTTCCACAACCAC    540
       E--E--R--G--E--C--L--A--R--S--A--S--T--E--S--G--F--H--N--H--
541    ACGGACACCGCCGAGGGCGACGTGATCGCCGCGGCCCGCGACGGCTACGATGCGGAGCGC    600
       T--D--T--A--E--G--D--V--I--A--A--A--R--D--G--Y--D--A--E--R--
601    GCGCAGGACCCCGAGGACGAGAGCGCCTATGCTGTGCAGTACCGGCCCGAGGCCGAGGAG    660
       A--Q--D--P--E--D--E--S--A--Y--A--V--Q--Y--R--P--E--A--E--E--
661    TACACGGAGCAGGCAGAGGCCGAGCACGCCGAGGCCACGCACCGCCGCGCGCTGCCCAAC    720
       Y--T--E--Q--A--E--A--E--H--A--E--A--T--H--R--R--A--L--P--N--
721    CACCTGCACTTCCACTCGCTGGAGCACGAGGAAGCCATGAATGCGGCCTACTCAGGCTAC    780
       H--L--H--F--H--S--L--E--H--E--E--A--M--N--A--A--Y--S--G--Y--
781    GTCTACACGCACCGGCTCTTCCACCGCGGTGAGGACGAGCCCTACTCCGAGCCCTATGCC    840
       V--Y--T--H--R--L--F--H--R--G--E--D--E--P--Y--S--E--P--Y--A--
841    GACTACGGCGGCCTCCAGGAGCACGTGTACGAGGAGATAGGGGACGCGCCCGAGCTGGAC    900
       D--Y--G--G--L--Q--E--H--V--Y--E--E--I--G--D--A--P--E--L--D--
901    GCACGCGACGGCCTGCGGCTCTACGAGCAGGAGCGCGACGAGGCGGCCGCGTACCGCCAG    960
       A--R--D--G--L--R--L--Y--E--Q--E--R--D--E--A--A--A--Y--R--Q--
961    GAGGCCCTGGGCGCGCGGCTGCACCATTACGACGAGCGCTCCGACGGCGAGTCCGACAGC   1020
       E--A--L--G--A--R--L--H--H--Y--D--E--R--S--D--G--E--S--D--S--
1021   CCCGAGAAGGAGGCCGAGTTCGCGCCCTACCCGCGCATGGACAGCTACGAGCAGGAGGAG   1080
       P--E--K--E--A--E--F--A--P--Y--P--R--M--D--S--Y--E--Q--E--E--
1081   GACATCGACCAGATAGTGGCCGAGGTGAAGCAGAGCATGAGCTCGCAGAGCCTCGACAAG   1140
       D--I--D--Q--I--V--A--E--V--K--Q--S--M--S--S--Q--S--L--D--K--
1141   GCAGCCGAGGACATGCCTGAGGCCGAGCAGGACCTGGAGCGTCCCCCTACCCCGGCCGGG   1200
       A--A--E--D--M--P--E--A--E--Q--D--L--E--R--P--P--T--P--A--G--
1201   GGTCGCCCCGACAGCCCCGGGCTGCAGGCGCCGGCGGGGCAGCAGCGGGCGGTGGGCCCC   1260
       G--R--P--D--S--P--G--L--Q--A--P--A--G--Q--Q--R--A--V--G--P--
1261   GCGGGCGGCGGCGAGGCGGGGCAGCGGTACAGCAAGGAGAAGCGCGATGCCATCTCGCTG   1320
       A--G--G--G--E--A--G--Q--R--Y--S--K--E--K--R--D--A--I--S--L--
1321   GCCATCAAGGACATCAAGGAGGCCATCGAGGAGGTGAAAACCAGGACCATCCGTTCGCCT   1380
       A--I--K--D--I--K--E--A--I--E--E--V--K--T--R--T--I--R--S--P--
1381   TACACCCCCGACGAGCCCAAAGAGCCCATCTGGGTCATGCGCCAGGACATTAGCCCCACC   1440
       Y--T--P--D--E--P--K--E--P--I--W--V--M--R--Q--D--I--S--P--T--
1441   AGGGACTGTGACGACCAGAGGCCGATGGACGGAGATTCTCCGTCTCCTGGCAGCTCCTCC   1500
       R--D--C--D--D--Q--R--P--M--D--G--D--S--P--S--P--G--S--S--S--
1501   CCCTTGGGTGCAGAGTCATCAAGCACATCTCTTCACCCCAGTGACCCTGTGGAAGCGTCC   1560
       P--L--G--A--E--S--S--S--T--S--L--H--P--S--D--P--V--E--A--S--
1561   ACTAATAAAGAGTCAAGAAAAAGCTTGGCTTCATTCCCAACCTACGTTGAAGTTCCGGGA   1620
       T--N--K--E--S--R--K--S--L--A--S--F--P--T--Y--V--E--V--P--G--
1621   CCCTGCGACCCCGAAGACTTGATCGATGGAATCATTTTTGCCGCCAATTACCTTGGCTCC   1680
       P--C--D--P--E--D--L--I--D--G--I--I--F--A--A--N--Y--L--G--S--
1681   ACTCAGCTGCTCTCAGACAAAACTCCTTCCAAAAACGTGCGCATGATGCAGGCCCAGGAA   1740
       T--Q--L--L--S--D--K--T--P--S--K--N--V--R--M--M--Q--A--Q--E--
1741   GCCGTAAGCAGGATCAAGATGGCCCAGAAATTAGCCAAAAGCAGGAAGAAGGCTCCTGAA   1800
       A--V--S--R--I--K--M--A--Q--K--L--A--K--S--R--K--K--A--P--E--
1801   GGCGAATCTCAGCCAATGACTGAAGTGGATCTCTTCATTTCTACCCAGAGAATCAAAGTG   1860
       G--E--S--Q--P--M--T--E--V--D--L--F--I--S--T--Q--R--I--K--V--
1861   CTGAACGCCGACACACAGGAGACAATGATGGACCACCCTCTGAGGACCATTTCCTACATT   1920
       L--N--A--D--T--Q--E--T--M--M--D--H--P--L--R--T--I--S--Y--I--
1921   GCGGACATTGGGAACATCGTTGTGCTGATGGCCCGCCGGCGGATGCCTCGCTCCAACTCC   1980
       A--D--I--G--N--I--V--V--L--M--A--R--R--R--M--P--R--S--N--S--
1981   CAGGAGAACGTGGAAGCGTCCCACCCATCCCAGGATGGGAAAAGGCAGTACAAGATGATC   2040
       Q--E--N--V--E--A--S--H--P--S--Q--D--G--K--R--Q--Y--K--M--I--
2041   TGCCACGTCTTCGAGTCTGAGGATGCTCAGCTGATTGCACAGTCCATCGGACAGGCATTT   2100
       C--H--V--F--E--S--E--D--A--Q--L--I--A--Q--S--I--G--Q--A--F--
2101   AGCGTGGCATACCAGGAATTCCTCAGGGCCAATGGGATTAACCCCGAAGATCTCAGCCAG   2160
       S--V--A--Y--Q--E--F--L--R--A--N--G--I--N--P--E--D--L--S--Q--
2161   AAGGAGTATAGTGACCTGCTCAATACCCAGGACATGTACAACGATGACCTGATCCACTTC   2220
       K--E--Y--S--D--L--L--N--T--Q--D--M--Y--N--D--D--L--I--H--F--
2221   TCCAAGTCGGAAAACTGTAAAGATGTTTTCATAGAGAAGCAGAAAGGAGAAATCCTAGGT   2280
       S--K--S--E--N--C--K--D--V--F--I--E--K--Q--K--G--E--I--L--G--
2281   GTGGTGATTGTGGAGTCTGGCTGGGGATCCATCCTCCCCACCGTGATCATTGCCAACATG   2340
       V--V--I--V--E--S--G--W--G--S--I--L--P--T--V--I--I--A--N--M--
2341   ATGCATGGTGGCCCTGCGGAGAAATCTGGGAAGCTGAATATCGGTGACCAGATCATGTCC   2400
       M--H--G--G--P--A--E--K--S--G--K--L--N--I--G--D--Q--I--M--S--
2401   ATTAATGGCACCAGCCTGGTGGGCCTGCCTCTGTCCACCTGCCAGAGCATTATTAAGGGC   2460
       I--N--G--T--S--L--V--G--L--P--L--S--T--C--Q--S--I--I--K--G--
2461   TTAAAGAATCAGTCCCGAGTCAAGCTGAATATCGTGAGATGTCCTCCGGTGACCACCGTG   2520
       L--K--N--Q--S--R--V--K--L--N--I--V--R--C--P--P--V--T--T--V--
2521   TTAATCAGAAGACCAGACCTTCGCTACCAGCTCGGTTTCAGCGTCCAGAATGGAATTATC   2580
       L--I--R--R--P--D--L--R--Y--Q--L--G--F--S--V--Q--N--G--I--I--
2581   TGCAGCCTCATGCGAGGGGGAATAGCTGAGAGAGGAGGCGTCCGTGTGGGGCACCGGATC   2640
       C--S--L--M--R--G--G--I--A--E--R--G--G--V--R--V--G--H--R--I--
2641   ATTGAAATCAATGGACAGAGCGTCGTGGCCACCCCCCACGAGAAGATCGTCCACATTCTC   2700
       I--E--I--N--G--Q--S--V--V--A--T--P--H--E--K--I--V--H--I--L--
2701   TCCAATGCTGTTGGGGAGATTCATATGAAGACAATGCCAGCCGCGATGTACAGGCTGCTG   2760
       S--N--A--V--G--E--I--H--M--K--T--M--P--A--A--M--Y--R--L--L--
2761   ACGGCCCAGGAGCAGCCTGTTTACATCTGAccgcggccacacgcggtggcatgcatggag   2820
       T--A--Q--E--Q--P--V--Y--I--***..............................
2821   gactctcctcttcgtggttgtgtttctcgtgctgcatccctgtgtccactgagactttcc   2880
       ............................................................
2881   cctctcgcgcccagcatttggttttacacaggaagagaagaatccacaaggacctcttta   2940
       ............................................................
2941   ctctctccgatttgcttttttttttttttttttttcaataccagggaagtttcgtatgca   3000
       ............................................................
3001   ctcccttgaggatggagagcagccagcacccacctggtactgacccaggaccatcctgga   3060
       ............................................................
3061   gggctttctgggtgtgtccagggggtgggctgtcactgcttgagggagaatcctcccttc   3120
       ............................................................
3121   ccaggaggtgcagacttcttaaaaggagctcgcggggcagcaaagcagctgattcagcag   3180
       ............................................................
3181   tgcctaaaacccagttgctgatccctgctctctgagtttatctgtgggaatgtggtagta   3240
       ............................................................
3241   cccagggccagcccacgtcattaaggttatgcactgcctgccatgtagttggggcaccat   3300
       ............................................................
3301   acattatttcttcccagaatctctgagccaaccttaaacctcttctattgctagttctaa   3360
       ............................................................
3361   tttcaacgtatgtgtgttttctaatacgagccttctcaccccaggataaaaggggaaata   3420
       ............................................................
3421   actgccttgggcaaggacaccatagtgtcacagagagcttggcaattcatggggcatctg   3480
       ............................................................
3481   aagctttaccaggttgtcctcaagttatcaaccattagataaacacaggcaggtactgtc   3540
       ............................................................
3541   tgcttctctctctctcacacacacacacacacacacagtcccatttgcatatcacccttc   3600
       ............................................................
3601   cctgctcccaccaccagtgagacaagctgaagattaggcacacagatcccctggaaaccc   3660
       ............................................................
3661   acctctctggaaggccccttccctggcaggtggccaggcaggcgggggctgctcagcctc   3720
       ............................................................
3721   atcctgagagacctgccctctctgcgctgaggcccagcccctccagcaccactttggctt   3780
       ............................................................
3781   aaagcatcctcctcctggactcccctccctgccgaacacacatcccaggagtctgggaag   3840
       ............................................................
3841   gagggactgttcccaagaaggcaagctgcaggtgcaattgcgtcttgttttctggcccaa   3900
       ............................................................
3901   ggcaagaccaactttcttctctgctcagggccactaggcggatgtgatattggaaaggcc   3960
       ............................................................
3961   agaatagtacataaaccacaaaattaaggagacaatagcaacctcaagttatgcctcaga   4020
       ............................................................
4021   atccccagatgtggtccataaacaccctcttgctgccttgtgggcctgagagcatttttg   4080
       ............................................................
4081   gctggtgtggaattgttccgtgttttcatcaggtgcctcatatttatgcttccgtctcag   4140
       ............................................................
4141   ttcagtgtagatgttttagtaatattataattctgagccagttttcacttggtccaaaga   4200
       ............................................................
4201   gcattttgtgttcatgtgaggtgtgatttggctttgcttttgttttgtttcattcatgac   4260
       ............................................................
4261   ctcagtagagacaggggaagagaaactattatattttgtaattaatatagtccctgttct   4320
       ............................................................
4321   ctgcatccgagatatttatgttgtgtctatggaaataggaactcagtgagcaaatggtgg   4380
       ............................................................
4381   gtagcatgtatttatagagagaatggagggattctaaggagggagcaaagtgactataac   4440
       ............................................................
4441   aagattagggacaagagacttcaaccagagagttctgtgatcaattccccgagatctctg   4500
       ............................................................
4501   catcttctgagttttctgcttagaatcagggaagctcagtgcttgacaggaacgagcagt   4560
       ............................................................
4561   ggcactctcagtttcactgtgttacaaaggagccctgaggaagggaggccgctggctgcc   4620
       ............................................................
4621   caggtgccctggggggaaagggacttctgctgctgcagagagtggcacccggtggggcca   4680
       ............................................................
4681   ggggctctgggatggtccgtaaagctccccaggacttctttgaaggatgctttacagaat   4740
       ............................................................
4741   gtttctgggagaccagcctcaaggtcaacccatcacaaacgtgaggaccaggaaggaacc   4800
       ............................................................
4801   atggccagggttctccatttgctgtagagtatctggtgatacagtgagacactaaagagt   4860
       ............................................................
4861   catcagccagttcatctttcctctgccaataagagtggatagaacaggaatgaagtgtta   4920
       ............................................................
4921   ctggtggtatttcaggcatcaggagccttggaaaatcatcgtaggggcccatgcctgtct   4980
       ............................................................
4981   gtccctaggcacctgggcagtgccacagaggcccgcccacgactggccaggggacagaac   5040
       ............................................................
5041   tccagtagtgcatccctgtacaacctgcacataacggttatgtatgttcacctaaaggag   5100
       ............................................................
5101   agaatatactttctattcctattgcacaaaaaccttgtaaactttgagaggtgctgaaaa   5160
       ............................................................
5161   agccaattctgcaagctctcctagaggactgacattgtaacattagagtgagaagatttc   5220
       ............................................................
5221   tctgccacattcttttgtgttaatccaggtgtgtcttcacacccagtgagtggaagttgc   5280
       ............................................................
5281   tggagctcggtacaggtccacccagctgaagtgggttctttttcccactaccactggggc   5340
       ............................................................
5341   aagggagtgagcctaggtatggtcacctcagcagccacagtcttaaaagcaagtcgctag   5400
       ............................................................
5401   attttttgaaagtcccaagagaagtggtggtcttcccttctgtcatcccagtatatatag   5460
       ............................................................
5461   ttatacatgtaaatatctaaataccccatgtaatgggaaggctatgtacagggcagcctt   5520
       ............................................................
5521   cccaaacgctgtgagggcacagagctgctgtggctgctccaccagggtgtgctggtggct   5580
       ............................................................
5581   cagctttggggttggactcccacgttcacctccccctcctggtccaggcagaggcaccag   5640
       ............................................................
5641   aacccatcctgccttttctccagtgtgagcatttcagggagccaccatcagccttgggtt   5700
       ............................................................
5701   catgagaggaagaaacccccaaagaccaatgcctggagcccacttctccagcgacacctt   5760
       ............................................................
5761   ccctcgccagagcaggctcctaggagtgcatggcaggggtgccgggtccctgtgcacggg   5820
       ............................................................
5821   tttgctttctgaacattgcccatcaacaccgccttcagggagtcccagagtaacctacta   5880
       ............................................................
5881   cctcccccatcgctcctctgcccccctcaccctgtgggcaccaacacctcccgcacacag   5940
       ............................................................
5941   atgaaaaccatctacagagcccttcccgggtccctcgacccagtggtgtagccgttacca   6000
       ............................................................
6001   atgtttacaaccaggggccgcccctccttagatgtgtttactcgcattcacaggccacct   6060
       ............................................................
6061   gttggtttgagtttcatgtgtctccttccctggcctaggttgacttgagcacacaactcg   6120
       ............................................................
6121   atctttcttcccctccatcaaggcagtgtgtgaggactgtgtgggaatgacatttcttgt   6180
       ............................................................
6181   acatacttagcacagcacctagagtatgaacttgtactattgttctgtaaagagggtgaa   6240
       ............................................................
6241   atagagcttattgtaaagtgtcgggagaagtatagtattgtatttgtaacaatatcgttc   6300
       ............................................................
6301   tttgtatacacaaaactcaatgatctatatataaatataaataaatatataaataaaata   6360
       ............................................................
6361   tatctacacgtgagcctggaatgtggacaccgcacacccactgaatgtacttccttgaca   6420
       ............................................................
6421   gtctggtcactggtccctccctccctccctcctccgtcccgtggccacagtcatccagtt   6480
       ............................................................
6481   tggggttgtgatgtatttactgtgctatctatcttcctttatttaactgaacgctaatgt   6540
       ............................................................
6541   ctgtataagagttgctgcaacaataaacaagaacttcacctcttaaaaaaaaaaaaaaaa   6600
       ............................................................
6601   aaa                                                            6660
       ...