Imprinted Gene Databases

Bos taurus: TSSC4

Tumor suppressing subtransferable candidate 4

Zaitoun & Khatib, J Anim Sci 86: 25-32, 2007

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens TSSC4   11p15.5  Not Imprinted Biallelic
Bos taurus TSSC4   29  Imprinted Maternal
Rattus norvegicus Tssc4   1q42  Imprinted Maternal
Mus musculus Tssc4 AA241958, ESTM671070  7 69.3 cM  Imprinted Maternal
1      ctcaagatggaggcagccaggccgaagtgagccgtctgatggctggctgtccctccctgc     60
       ............................................................
61     ccttagccggtcaccgagccgctgagcagagccgtgcgcaggggcctttgccaccaagaa    120
       ............................................................
121    ccttcgtcagcattcaatccacctgccctccagcgtccagcaggcgcccatcagacgggg    180
       ............................................................
181    aggtgtggcgtgacctggtgacacATGGCAGAGGCAGGGCACAGCCAACACTTCCTTGAC    240
       ........................M--A--E--A--G--H--S--Q--H--F--L--D--
241    CCGGAGGTCGACGCCCTGCCTCCCGACACTGTCTCCCTCAGCGACTCGGACTCTGACCTC    300
       P--E--V--D--A--L--P--P--D--T--V--S--L--S--D--S--D--S--D--L--
301    AGTCTGCCCGATGGTGTTGGGGTGGACGCCCTGTCCCCGGGGGGGCTGCCTGGGGAGGCT    360
       S--L--P--D--G--V--G--V--D--A--L--S--P--G--G--L--P--G--E--A--
361    TCTGGGGATTCAGGCCCCGATGAGCCCCCCTCGCCCCCCAGGGGCCTCCCCACAGAGGCG    420
       S--G--D--S--G--P--D--E--P--P--S--P--P--R--G--L--P--T--E--A--
421    GTGCAACCCTTCCACCTGAGAGGCACGAGCTCCACCTTCTCTCAGCGCAGCCACAGCATC    480
       V--Q--P--F--H--L--R--G--T--S--S--T--F--S--Q--R--S--H--S--I--
481    TTCGATGGGCTGGAGGGGGCCGCCAGGCGGGCTGTGCCTGCTGTGACTCCAGCCAGCCCG    540
       F--D--G--L--E--G--A--A--R--R--A--V--P--A--V--T--P--A--S--P--
541    GGTGATGGGGGGGGCTTCCAGCAGCTGCTGACACCCTCCAGCCAGCCTGCAGCGGGGGTC    600
       G--D--G--G--G--F--Q--Q--L--L--T--P--S--S--Q--P--A--A--G--V--
601    CCAGGTAGGGCTGCTGGGAGCCCTGCTGCCCAAAGGGCGCCCCCTGTCCCTGACTACGTG    660
       P--G--R--A--A--G--S--P--A--A--Q--R--A--P--P--V--P--D--Y--V--
661    ACCCACCCTGAGCGCTGGACCAGGTACAGCCTGGACGATGTGGCCGAGGCCAGCGAGCAG    720
       T--H--P--E--R--W--T--R--Y--S--L--D--D--V--A--E--A--S--E--Q--
721    AGCAACCGGGCTGCCGCCCTGGCCTTCCTGGGGCCGCAGAACCTGGCTGCCCCCGGCAAC    780
       S--N--R--A--A--A--L--A--F--L--G--P--Q--N--L--A--A--P--G--N--
781    TACATGCCTTCCTTCAACCAGGACCCCTCCAGCTGCGGGGAGGGCCGGCTTGTCTTCACC    840
       Y--M--P--S--F--N--Q--D--P--S--S--C--G--E--G--R--L--V--F--T--
841    AAACCCACCCGAGCCAGCGAGGCTCGGCCCGACAGGAAGAGGGTATCCAGGAAGGTGGGG    900
       K--P--T--R--A--S--E--A--R--P--D--R--K--R--V--S--R--K--V--G--
901    GAACCGGGCAGGGGCGACCCTGGGGTTCCAGGAGCGGCAGGGGGCGAGGGCCCCGTGGAG    960
       E--P--G--R--G--D--P--G--V--P--G--A--A--G--G--E--G--P--V--E--
961    CTTGCCCACCTGGCCAGGCCCGGGAGCCCCGAAGCCGAGGAGTGGAGTGGACCCCGAGGG   1020
       L--A--H--L--A--R--P--G--S--P--E--A--E--E--W--S--G--P--R--G--
1021   GGCCTGCAGGAGGTGGGTGCCTCTGCAGGCGTGGCCCACGCCAGGCCTGGGTCCAGCCCC   1080
       G--L--Q--E--V--G--A--S--A--G--V--A--H--A--R--P--G--S--S--P--
1081   CCGCTGGTGGAGACAGTGGGTTTCCATGGCAGCAAGAAGCGGAGCAGGGACCACTTCCGG   1140
       P--L--V--E--T--V--G--F--H--G--S--K--K--R--S--R--D--H--F--R--
1141   AGCAGGGGTGGCAGCCCCGAGGCCCCAGGTGCAGAGCTGTGAgctgggagactgcctggc   1200
       S--R--G--G--S--P--E--A--P--G--A--E--L--***..................
1201   cgcctccctgacctggctgtgctagaaggctggccaccgctgcccccagggcggcttcag   1260
       ............................................................
1261   ggctggagcgggctcagggctccagggcagcgagctggcccgccggctgcctgtaggtgc   1320
       ............................................................
1321   caccagggaaccgagacctcgccagggtgtgggccaggggtgatggaggcccaacccgtt   1380
       ............................................................
1381   tctgcccgggagacagtaaaggctctacacgttcctctgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa   1440
       ............................................................
1441   aaaa                                                           1500
       ....