Imprinted Gene Databases

Bos taurus: SLC38A4

Solute carrier family 38, member 4

Zaitoun & Khatib, BMC Genet 7: 49, 2006

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens SLC38A4 ATA3, NAT3, PAAT, FLJ10191, MGC126876  12q13  Unknown Unknown
Mus musculus Slc38a4 At, SN, Ata3, SNAT4, mATA3, mNAT3, 1110012E16Rik, 1700012A18Rik  15  Imprinted Paternal
Rattus norvegicus Slc38a4 Ata3  7q35  Imprinted Paternal
Sus scrofa SLC38A4   Imprinted Isoform Dependent
Bos taurus SLC38A4 Ata3  Not Imprinted Biallelic
1      ATGGATCCCATGGAACTGAGCAATGTCAACATCGAGCCTGATGATGAGAGCATCAGTGGA     60
       M--D--P--M--E--L--S--N--V--N--I--E--P--D--D--E--S--I--S--G--
61     GAAAGTATTCAAGATAGCTACACCGGGATGGGAAATTTAGAAAAGGCAGCAATGAGCAGT    120
       E--S--I--Q--D--S--Y--T--G--M--G--N--L--E--K--A--A--M--S--S--
121    CAGTTTACTAATGAAGATGCTGAAAGTCAGAAATTCCTGACAAATGGATTTTTGGGGAAA    180
       Q--F--T--N--E--D--A--E--S--Q--K--F--L--T--N--G--F--L--G--K--
181    AAGAAGTTGGCAGATTATGACGATGAACATCATCCTGGGACCACCTCCTTTGGAATGTCT    240
       K--K--L--A--D--Y--D--D--E--H--H--P--G--T--T--S--F--G--M--S--
241    TCATTCAACCTGAGTAATGCCATCATGGGCAGTGGAATCCTGGGCCTGTCCTATGCCATG    300
       S--F--N--L--S--N--A--I--M--G--S--G--I--L--G--L--S--Y--A--M--
301    GCCAACACAGGGATCATACTTTTCATAATCATGCTGCTTGCTGTGGCGGTCCTATCTCTT    360
       A--N--T--G--I--I--L--F--I--I--M--L--L--A--V--A--V--L--S--L--
361    TATTCAGTTCATCTTTTATTAAAGACTGCCAAAGAAGGAGGGTCTTTAATTTATGAAAAA    420
       Y--S--V--H--L--L--L--K--T--A--K--E--G--G--S--L--I--Y--E--K--
421    CTAGGTGAAAAGGCATTTGGATGGCCTGGGAAAATCGGAGCTTTTATCTCCATTACAATG    480
       L--G--E--K--A--F--G--W--P--G--K--I--G--A--F--I--S--I--T--M--
481    CAGAACATTGGAGCCATGTCAAGCTACCTCTTTATCATTAAATATGAACTACCTGAAGTA    540
       Q--N--I--G--A--M--S--S--Y--L--F--I--I--K--Y--E--L--P--E--V--
541    ATCAGAGCATTCATGGGACTCGAAGAAAATACTGGAGAATGGTATCTCAATGGCAACTAC    600
       I--R--A--F--M--G--L--E--E--N--T--G--E--W--Y--L--N--G--N--Y--
601    CTCGTCATATTTGTGTCTGTTGGAATAATTCTTCCACTTTCTCTTCTTAAAAATTTAGGT    660
       L--V--I--F--V--S--V--G--I--I--L--P--L--S--L--L--K--N--L--G--
661    TACCTTGGTTATACCAGCGGATTTTCTCTTACTTGCATGGTGTTTTTTGTCAGTGTGGTG    720
       Y--L--G--Y--T--S--G--F--S--L--T--C--M--V--F--F--V--S--V--V--
721    ATTTACAAGAAATTCCAAATACCCTGTCCTCTGCCCATTCTGGATCACAGTGTTGGGAAT    780
       I--Y--K--K--F--Q--I--P--C--P--L--P--I--L--D--H--S--V--G--N--
781    CTGACTTTCAACAATACCGTTCCAATGCACGTGGTGATGTTACTCAACAACACTGAGAGT    840
       L--T--F--N--N--T--V--P--M--H--V--V--M--L--L--N--N--T--E--S--
841    AGTGGTGTGAACTTCATGATGGATTACACCCACCAGAATGCTGCCGGACTCGATGAGAAC    900
       S--G--V--N--F--M--M--D--Y--T--H--Q--N--A--A--G--L--D--E--N--
901    CAGGCCAAGGGCTCTCTTCATGGCAGTGGAGTAGAGTTTGAAGCACACAGTGATGACAAG    960
       Q--A--K--G--S--L--H--G--S--G--V--E--F--E--A--H--S--D--D--K--
961    TGTCAGCCCAAATACTTTGTCTTCAACTCCAGGACGGCCTATGCAATTCCCATCCTAGCA   1020
       C--Q--P--K--Y--F--V--F--N--S--R--T--A--Y--A--I--P--I--L--A--
1021   TTTGCTTTTGTATGCCACCCTGAGGTCCTTCCTATCTACAGTGAACTTAAAGATCGGTCC   1080
       F--A--F--V--C--H--P--E--V--L--P--I--Y--S--E--L--K--D--R--S--
1081   CGGAGGAAGATGCAAACAGTGTCGAATGTCTCCATCACAGGGATGCTCGTCATGTATCTG   1140
       R--R--K--M--Q--T--V--S--N--V--S--I--T--G--M--L--V--M--Y--L--
1141   CTTGCTGCCCTCTTTGGTTACCTAACCTTTTATGGAGAAGTTGAAGATGAATTGCTTCAT   1200
       L--A--A--L--F--G--Y--L--T--F--Y--G--E--V--E--D--E--L--L--H--
1201   GCTTACAGCAAAGTGTACACATTTGACACCCCTCTCCTCATGGTACGCCTGGCTGTTCTT   1260
       A--Y--S--K--V--Y--T--F--D--T--P--L--L--M--V--R--L--A--V--L--
1261   ATGGCAGTAACACTAACTGTGCCCATAGTGCTATTCCCTATTCGCACATCAGTGACCACA   1320
       M--A--V--T--L--T--V--P--I--V--L--F--P--I--R--T--S--V--T--T--
1321   CTGTTATTTCCCAAAAGACCATTCAGCTGGATAAGGCATTTCCTGATTGCAGCCATAATT   1380
       L--L--F--P--K--R--P--F--S--W--I--R--H--F--L--I--A--A--I--I--
1381   ATTGCTCTTAATAATGTTTTGGTCATCCTTGTGCCAACTATAAAATACATCTTTGGATTC   1440
       I--A--L--N--N--V--L--V--I--L--V--P--T--I--K--Y--I--F--G--F--
1441   ATAGGGGCTTCTTCTGCCACTATGCTGATCTTCATCCTTCCAGCAGTTTTCTATCTTAAA   1500
       I--G--A--S--S--A--T--M--L--I--F--I--L--P--A--V--F--Y--L--K--
1501   CTTGTCAAGAAAGAACCTTTTAGGTCACCCCAAAAGGTCGGGGCTTTAATTTTCCTCGTG   1560
       L--V--K--K--E--P--F--R--S--P--Q--K--V--G--A--L--I--F--L--V--
1561   GTTGGCATCATCTTCATGATGGGAAGCATGGCACTCATTATAATTGACTGGATTTATGAT   1620
       V--G--I--I--F--M--M--G--S--M--A--L--I--I--I--D--W--I--Y--D--
1621   CCTCCAAATTCCAAGCATCACTAAcccaaggaaaaatactatcttttcctgttggagatg   1680
       P--P--N--S--K--H--H--***....................................
1681   gttaccaattatgctcccaaagacattttagttatcttgtttggaatgttattcatagga   1740
       ............................................................
1741   agtaacaggaagattccaaagatgtttaccagcaatattaccaagcacctacagaagaga   1800
       ............................................................
1801   aaatcatcatttttgtcacaaatggctatttatatgtttaaaatctgtggtgcacatttc   1860
       ............................................................
1861   cacccaggttttactagagcagtgtgtgatgatgtatttttgcttttgcgtatgc        1920
       .......................................................