Imprinted Gene Databases

Bos taurus: SGCE

Sarcoglycan epsilon

Chen et al. Epigenetics, 11: 501–516, 2016

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Equus caballus SGCE   4  Imprinted Paternal
Homo sapiens SGCE ESG, DYT11  7q21-q22  Imprinted Paternal
Sus scrofa SGCE   9  Imprinted Paternal
Bos taurus SGCE   4  Imprinted Paternal
Rattus norvegicus Sgce   4q21  Imprinted Paternal
Macropus eugenii SGCE     Not Imprinted Biallelic
Mus musculus Sgce e-SG  6 1.0 cM  Imprinted Paternal 
1      ggacggccggcctagccaggccaagaATGCAATTGCCCTGGTGGTGGGAGCTGGGAGACC     60
       ..........................M--Q--L--P--W--W--W--E--L--G--D--P
61     CTTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGATGAGCCCCGCGACCACTGGCA    120
       --C--A--W--T--G--Q--G--R--G--T--R--R--M--S--P--A--T--T--G--T
121    CCTTCTTGCTGACAGTGTACACTATTTTCTCCAAGGTACACTCTGATCGGAATGTCTACC    180
       --F--L--L--T--V--Y--T--I--F--S--K--V--H--S--D--R--N--V--Y--P
181    CCTCCGCAGGCGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAGTATTTTAAGGGGGAATTTC    240
       --S--A--G--V--L--F--V--H--V--L--E--R--E--Y--F--K--G--E--F--P
241    CACCTTACCCCAAACCTGGTGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAACACAAATTTAA    300
       --P--Y--P--K--P--G--E--I--S--N--D--P--I--T--F--N--T--N--L--M
301    TGGGTTACCCAGACCGTCCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGAACACCATATAGCGATG    360
       --G--Y--P--D--R--P--G--W--L--R--Y--I--Q--R--T--P--Y--S--D--G
361    GAGTCCTTTATGGGTCTCCAACAGCCGAAAATGTGGGGAAACCAACGGTCATTGAGATAA    420
       --V--L--Y--G--S--P--T--A--E--N--V--G--K--P--T--V--I--E--I--T
421    CAGCCTATAATAGGCGTACCTTTGAGACCGCAAGGCACAATTTGATAATTAATATAATGT    480
       --A--Y--N--R--R--T--F--E--T--A--R--H--N--L--I--I--N--I--M--S
481    CAGCAGAAGACTTCCCGTTACCCTATCAAGCAGAATTCTTCATTAAAAATATGAACGTAG    540
       --A--E--D--F--P--L--P--Y--Q--A--E--F--F--I--K--N--M--N--V--E
541    AAGAAATGCTGGCCAGCGAGGTTCTTGGAGACTTCCTGGGGGCCGTGAAAAATGTGTGGC    600
       --E--M--L--A--S--E--V--L--G--D--F--L--G--A--V--K--N--V--W--Q
601    AGCCCGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACGTCAGCCCTCGACCGGGGTGGCCGGGTCC    660
       --P--E--R--L--N--A--I--N--I--T--S--A--L--D--R--G--G--R--V--P
661    CACTGCCCATCAACGACATGAAGGAGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCCGACGTCCCAT    720
       --L--P--I--N--D--M--K--E--G--V--Y--V--M--V--G--A--D--V--P--F
721    TTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCTCAGAATCAATTGAGATGCAGTCAAGAAA    780
       --S--S--C--L--R--E--V--E--N--P--Q--N--Q--L--R--C--S--Q--E--M
781    TGGAGCCTGTAATAACGTGTGACAAAAAATTCCGTACTCAGTTTTACATTGACTGGTGCA    840
       --E--P--V--I--T--C--D--K--K--F--R--T--Q--F--Y--I--D--W--C--K
841    AAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAG    900
       --I--S--L--V--D--K--T--K--Q--V--S--T--Y--Q--E--V--I--R--G--E
901    AAGGGATTTTGCCTGATGGTGGAGAGTACAAACCCCCTTCTGACTCTTTGAAAAGCAGAG    960
       --G--I--L--P--D--G--G--E--Y--K--P--P--S--D--S--L--K--S--R--D
961    ACTATTACACGGATTTCCTAGTTACCCTGGCTGTGCCCTCGGCGGTAGCACTGGTCCTTT   1020
       --Y--Y--T--D--F--L--V--T--L--A--V--P--S--A--V--A--L--V--L--F
1021   TTCTAATACTCGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGAGTGGAAAAGAGAAACATGC   1080
       --L--I--L--A--Y--I--M--C--C--R--R--E--G--V--E--K--R--N--M--Q
1081   AAACACCAGACATCCAACTGGTCCATCATAGTGCTATTCAGAAATCCACCAAAGAACTTC   1140
       --T--P--D--I--Q--L--V--H--H--S--A--I--Q--K--S--T--K--E--L--R
1141   GTGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCCACACTTCCTGTATTTCACC   1200
       --D--M--S--K--N--R--E--I--A--W--P--L--S--T--L--P--V--F--H--P
1201   CTGTGACTGGAGAAATCATACCCCCTCTACACACAGACAATTATGAGAGCACCAATATGC   1260
       --V--T--G--E--I--I--P--P--L--H--T--D--N--Y--E--S--T--N--M--P
1261   CGTTGATGCAAACGCAGCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTA   1320
       --L--M--Q--T--Q--Q--N--L--P--H--Q--T--Q--I--P--Q--Q--Q--T--T
1321   CAGGTAAATGGTATTCCTGAagaaagaaaactaaccgaagcgatgaatttgtaatcagat   1380
       --G--K--W--Y--S--***........................................
1381   aatatagcacttttgcgtgtgtgagtgctcagtcactcaattgtgtccaactctttggga   1440
       ............................................................
1441   ccccatggaatgtagcccaccaggttcctctgtccatggggttttccaggcaagaatact   1500
       ............................................................
1501   ggagtgggttgccataccctcctccaggaaatcttcctgacccaggaattgaacccatat   1560
       ............................................................
1561   ctcctgcattgcaagtggattctttaccacttaagccacctgggaagtcttaatatagca   1620
       ............................................................
1621   cttttatttttttctctcttccaataatgcatgagcttttctgacatatggtatgcatgt   1680
       ............................................................
1681   tgacagtattaagtatataccaaataatatacaatataacattcattttactaatttttt   1740
       ............................................................
1741   ttgtacttaaggcatttttgacaatttgtaaaacattgatgactttatatttgttacgat   1800
       ............................................................
1801   aaaaagtgatctttaaaataaatattattaatgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa    1860
       ...........................................................