Imprinted Gene Databases

Bos taurus: CDA

Cytidine deaminase

Chen et al. Epigenetics, 11: 501-516, 2016

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Bos taurus CDA   Imprinted Maternal
1      tgggacgagcgcacacacacaccttctgtccccagccctctccctcacccgccctgccca     60
       ............................................................
61     gcacccccaggggcgcgcacctggccgcctcccggcaaggacacaccccggggggaggag    120
       ............................................................
121    ctgccgtcgcggtggggcccagcccacaccggctgcgagctcgcgttccgcttctccgcc    180
       ............................................................
181    ggccccggtggatcgacATGGCCCAGGAGCGTCCCAGCCTCGCCCTGGAGCCCCAGCACG    240
       .................M--A--Q--E--R--P--S--L--A--L--E--P--Q--H--V
241    TCCAGCGGTTGCTGCTGTCCTGCCAAGAGGCCAAGAAGTCCGCCTACTGCCCCTACAGCC    300
       --Q--R--L--L--L--S--C--Q--E--A--K--K--S--A--Y--C--P--Y--S--R
301    GCTTCCCCGTGGGGGCCGCTCTTCTCACCGGGGACGGCAGGATCTTCTCGGGGTGCAACA    360
       --F--P--V--G--A--A--L--L--T--G--D--G--R--I--F--S--G--C--N--I
361    TAGAGAATGCCTGCTACCCGCTGAGCGTCTGTGCTGAACGAACTGCCATCCAGAAGGCCA    420
       --E--N--A--C--Y--P--L--S--V--C--A--E--R--T--A--I--Q--K--A--I
421    TCTCAGAAGGGTACAAAGAGTTCAGGGCAATCGCTATTGCCAGTGACTTGCAAGATGATT    480
       --S--E--G--Y--K--E--F--R--A--I--A--I--A--S--D--L--Q--D--D--F
481    TTATCTCACCCTGTGGGGCTTGCAGACAGGTCATGAGAGAGTTTGGCACCGACTGGGCTG    540
       --I--S--P--C--G--A--C--R--Q--V--M--R--E--F--G--T--D--W--A--V
541    TCTACATGACCAAGCTGGACGGCACGTATGTTGTCAGGACAGTCCGGGAACTGCTGCCTG    600
       --Y--M--T--K--L--D--G--T--Y--V--V--R--T--V--R--E--L--L--P--E
601    AATCTTTTGGGCCCGAGGACCTGCAGAAGATCCAGTGAgggatggagagcaccctctgcc    660
       --S--F--G--P--E--D--L--Q--K--I--Q--***......................
661    ccggagcccctgcattcctacacaggctaaaggggatgaccacctggaggacttcatgaa    720
       ............................................................
721    gacattctcacaaaccgggggacatctgccaaacaggcccaaccccccaggcactgggag    780
       ............................................................
781    gagactgtttttgcaattaacactggagccccaggtttctcctgaagtgatacagcgttt    840
       ............................................................
841    ccattccagcccttccttgcaaccccttcttgtcctccccagaactcagggcaccccggc    900
       ............................................................
901    cttctctctccttcccatgggccctctttcaaattccaacctagtctggactgcttcacc    960
       ............................................................
961    atctgccttcccaaggttctgtcctgctctgggtgacttttctaatgataaacatcacaa   1020
       ............................................................
1021   aacattcca                                                      1080
       .........