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Homo sapiens: COL9A3

Collagen, type IX, alpha 3

Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 PDF; Luedi et al. Genome Res. 17: , 2007 Supplement

Species Gene Aliases Location Status Expressed Allele
Homo sapiens COL9A3 IDD, MED, EDM3, FLJ90759, DJ885L7.4.1  20q13.3  Predicted Maternal
1      gccATGGCCGGGCCGCGCGCGTGCGCCCCGCTCCTGCTCCTGCTCCTGCTCGGGGAGCTT     60
       ...M--A--G--P--R--A--C--A--P--L--L--L--L--L--L--L--G--E--L--
61     CTGGCGGCCGCCGGGGCGCAGAGAGTGGGACTCCCCGGCCCCCCCGGCCCCCCAGGGCCG    120
       L--A--A--A--G--A--Q--R--V--G--L--P--G--P--P--G--P--P--G--P--
121    CCCGGGAAGCCCGGCCAGGACGGCATTGACGGAGAAGCTGGTCCTCCAGGTCTGCCTGGG    180
       P--G--K--P--G--Q--D--G--I--D--G--E--A--G--P--P--G--L--P--G--
181    CCCCCGGGACCAAAGGGGGCCCCAGGAAAGCCGGGGAAACCAGGAGAGGCTGGGCTGCCG    240
       P--P--G--P--K--G--A--P--G--K--P--G--K--P--G--E--A--G--L--P--
241    GGACTGCCGGGTGTGGATGGTCTGACTGGACGAGATGGACCCCCTGGACCCAAGGGTGCC    300
       G--L--P--G--V--D--G--L--T--G--R--D--G--P--P--G--P--K--G--A--
301    CCTGGGGAACGGGGAAGTCTGGGACCCCCGGGGCCGCCCGGGCTGGGGGGCAAAGGCCTC    360
       P--G--E--R--G--S--L--G--P--P--G--P--P--G--L--G--G--K--G--L--
361    CCTGGACCCCCCGGAGAGGCAGGAGTGAGCGGCCCCCCAGGTGGGATCGGCCTCCGCGGC    420
       P--G--P--P--G--E--A--G--V--S--G--P--P--G--G--I--G--L--R--G--
421    CCCCCGGGACCTTCTGGACTCCCCGGCCTCCCTGGTCCCCCAGGACCTCCCGGACCCCCT    480
       P--P--G--P--S--G--L--P--G--L--P--G--P--P--G--P--P--G--P--P--
481    GGACACCCAGGAGTCCTCCCTGAAGGCGCTACTGACCTTCAGTGCCCAAGTATCTGCCCG    540
       G--H--P--G--V--L--P--E--G--A--T--D--L--Q--C--P--S--I--C--P--
541    CCAGGTCCCCCAGGGCCCCCTGGAATGCCAGGGTTCAAGGGACCCACTGGCTACAAAGGC    600
       P--G--P--P--G--P--P--G--M--P--G--F--K--G--P--T--G--Y--K--G--
601    GAGCAGGGGGAAGTCGGCAAGGACGGCGAGAAGGGTGACCCTGGCCCCCCTGGGCCCGCC    660
       E--Q--G--E--V--G--K--D--G--E--K--G--D--P--G--P--P--G--P--A--
661    GGCCTCCCGGGCAGCGTGGGGCTGCAGGGCCCCCGGGGATTACGAGGACTGCCAGGGCCA    720
       G--L--P--G--S--V--G--L--Q--G--P--R--G--L--R--G--L--P--G--P--
721    CTCGGGCCCCCTGGGGACCGGGGTCCCATTGGGTTCCGAGGGCCGCCTGGGATCCCAGGA    780
       L--G--P--P--G--D--R--G--P--I--G--F--R--G--P--P--G--I--P--G--
781    GCGCCTGGGAAAGCGGGTGACCGAGGCGAGAGGGGCCCAGAAGGGTTCCGCGGCCCCAAG    840
       A--P--G--K--A--G--D--R--G--E--R--G--P--E--G--F--R--G--P--K--
841    GGTGACCTCGGCAGACCTGGTCCCAAGGGAACCCCCGGAGTGGCCGGGCCAAGCGGAGAG    900
       G--D--L--G--R--P--G--P--K--G--T--P--G--V--A--G--P--S--G--E--
901    CCGGGCATGCCGGGCAAGGACGGCCAGAATGGCGTGCCAGGACTCGATGGCCAGAAGGGA    960
       P--G--M--P--G--K--D--G--Q--N--G--V--P--G--L--D--G--Q--K--G--
961    GAGGCTGGTCGCAACGGTGCTCCGGGAGAGAAGGGCCCCAACGGGCTGCCGGGCCTCCCT   1020
       E--A--G--R--N--G--A--P--G--E--K--G--P--N--G--L--P--G--L--P--
1021   GGACGAGCGGGGTCCAAAGGCGAGAAGGGAGAACGGGGCAGAGCTGGGGAGCTGGGTGAG   1080
       G--R--A--G--S--K--G--E--K--G--E--R--G--R--A--G--E--L--G--E--
1081   GCCGGCCCCTCTGGAGAGCCAGGCGTCCCTGGAGATGCTGGCATGCCTGGGGAGCGCGGT   1140
       A--G--P--S--G--E--P--G--V--P--G--D--A--G--M--P--G--E--R--G--
1141   GAGGCTGGCCACCGGGGCTCAGCGGGGGCCCTCGGCCCACAAGGCCCTCCCGGAGCCCCT   1200
       E--A--G--H--R--G--S--A--G--A--L--G--P--Q--G--P--P--G--A--P--
1201   GGTGTCCGAGGCTTCCAGGGCCAGAAGGGCAGCATGGGAGACCCCGGCCTTCCAGGCCCC   1260
       G--V--R--G--F--Q--G--Q--K--G--S--M--G--D--P--G--L--P--G--P--
1261   CAGGGCCTCCGAGGTGACGTGGGCGACCGGGGTCCGGGAGGTGCCGCAGGCCCTAAGGGA   1320
       Q--G--L--R--G--D--V--G--D--R--G--P--G--G--A--A--G--P--K--G--
1321   GACCAGGGTATTGCAGGTTCCGACGGTCTTCCTGGGGATAAAGGAGAACTGGGTCCCAGC   1380
       D--Q--G--I--A--G--S--D--G--L--P--G--D--K--G--E--L--G--P--S--
1381   GGCCTGGTCGGACCCAAAGGAGAGTCTGGCAGTCGAGGGGAGCTGGGCCCCAAAGGCACC   1440
       G--L--V--G--P--K--G--E--S--G--S--R--G--E--L--G--P--K--G--T--
1441   CAGGGTCCCAACGGCACCAGCGGTGTTCAGGGTGTCCCCGGGCCCCCCGGTCCTCTGGGC   1500
       Q--G--P--N--G--T--S--G--V--Q--G--V--P--G--P--P--G--P--L--G--
1501   CTGCAGGGCGTCCCGGGTGTTCCTGGCATCACGGGGAAGCCGGGAGTTCCGGGGAAGGAG   1560
       L--Q--G--V--P--G--V--P--G--I--T--G--K--P--G--V--P--G--K--E--
1561   GCCAGCGAGCAGCGCATCAGGGAGCTGTGTGGGGGGATGATCAGCGAACAAATTGCACAG   1620
       A--S--E--Q--R--I--R--E--L--C--G--G--M--I--S--E--Q--I--A--Q--
1621   TTAGCCGCGCACCTAAGGAAGCCTTTGGCACCCGGGTCCATTGGTCGGCCCGGTCCAGCT   1680
       L--A--A--H--L--R--K--P--L--A--P--G--S--I--G--R--P--G--P--A--
1681   GGCCCCCCTGGGCCCCCAGGACCCCCAGGCTCCATTGGTCACCCTGGCGCTCGAGGACCC   1740
       G--P--P--G--P--P--G--P--P--G--S--I--G--H--P--G--A--R--G--P--
1741   CCTGGATACCGCGGTCCCACTGGGGAGCTGGGAGACCCCGGGCCCAGAGGAAACCAGGGT   1800
       P--G--Y--R--G--P--T--G--E--L--G--D--P--G--P--R--G--N--Q--G--
1801   GACAGAGGAGACAAAGGCGCGGCAGGAGCAGGGCTGGACGGGCCTGAAGGAGACCAGGGG   1860
       D--R--G--D--K--G--A--A--G--A--G--L--D--G--P--E--G--D--Q--G--
1861   CCCCAAGGACCCCAAGGCGTGCCCGGCACCAGCAAGGACGGCCAGGACGGTGCTCCCGGC   1920
       P--Q--G--P--Q--G--V--P--G--T--S--K--D--G--Q--D--G--A--P--G--
1921   GAGCCTGGGCCTCCCGGAGATCCTGGGCTTCCAGGTGCCATTGGGGCCCAGGGGACACCG   1980
       E--P--G--P--P--G--D--P--G--L--P--G--A--I--G--A--Q--G--T--P--
1981   GGGATCTGCGACACCTCAGCCTGCCAAGGAGCCGTGTTAGGAGGGGTCGGGGAGAAATCA   2040
       G--I--C--D--T--S--A--C--Q--G--A--V--L--G--G--V--G--E--K--S--
2041   GGCTCTCGAAGCTCATAAaattcaacgtgaggaagcaagtgacaaggacgcccgaagcac   2100
       G--S--R--S--S--***..........................................
2101   agtggacggtcatgaaggagcgggggtgtggcaggcgggtgacgtccaggagagggagcg   2160
       ............................................................
2161   cccctggctgcccctcggccgccgactggacgcgcgggccttgccagcgagcaccctcat   2220
       ............................................................
2221   cgggctgtcgcctgacagcatacctcaaaaggccctagctaataaacctgtaagcccagc   2280
       ............................................................
2281   atttgagagaaggtagggtgtgtatatataaaaggttgtgtacaactccacgaggtgaaa   2340
       ............................................................
2341   aatattcagtaacttgtttacatagcatttgtgtaaagactatgatctcatcccaataaa   2400
       ............................................................
2401   atgatatattaaaccttcagattaatgactggctacagagtaacaaaaaataaagaattt   2460
       ............................................................
2461   aatgtacagtaaattctctcccata                                      2520
       .........................